MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Dichelobacter nodosus VCS1703A chromosome

Total Repeats: 923

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009446	GATCA	2	10	117	126	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_009446	TTTGC	2	10	322	331	0 %	60 %	20 %	20 %	146328959
3	NC_009446	ATTAC	2	10	1258	1267	40 %	40 %	0 %	20 %	146328959
4	NC_009446	GTTGG	2	10	6437	6446	0 %	40 %	60 %	0 %	146329819
5	NC_009446	GCATC	2	10	11751	11760	20 %	20 %	20 %	40 %	146329561
6	NC_009446	CGCGG	2	10	11800	11809	0 %	0 %	60 %	40 %	146329561
7	NC_009446	TGTTA	2	10	11979	11988	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009446	GGTTG	2	10	12727	12736	0 %	40 %	60 %	0 %	146329262
9	NC_009446	TTGCG	2	10	13964	13973	0 %	40 %	40 %	20 %	146328674
10	NC_009446	TTTTC	2	10	14524	14533	0 %	80 %	0 %	20 %	146328674
11	NC_009446	CAAAC	2	10	20687	20696	60 %	0 %	0 %	40 %	146329246
12	NC_009446	TGCAA	2	10	21319	21328	40 %	20 %	20 %	20 %	146329246
13	NC_009446	GCGCA	2	10	21683	21692	20 %	0 %	40 %	40 %	146329246
14	NC_009446	ATTTC	2	10	22098	22107	20 %	60 %	0 %	20 %	146329246
15	NC_009446	CTTTG	2	10	22584	22593	0 %	60 %	20 %	20 %	146328875
16	NC_009446	TGGCA	2	10	27733	27742	20 %	20 %	40 %	20 %	146329366
17	NC_009446	GCGCC	2	10	29365	29374	0 %	0 %	40 %	60 %	146329642
18	NC_009446	GCATT	2	10	30500	30509	20 %	40 %	20 %	20 %	146329774
19	NC_009446	AAAAG	2	10	31221	31230	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009446	GCGTC	2	10	33551	33560	0 %	20 %	40 %	40 %	146328987
21	NC_009446	ATTTT	2	10	35093	35102	20 %	80 %	0 %	0 %	146329713
22	NC_009446	GTTTT	2	10	38515	38524	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009446	TAAAT	2	10	39194	39203	60 %	40 %	0 %	0 %	146329480
24	NC_009446	ATTGA	2	10	40037	40046	40 %	40 %	20 %	0 %	146328869
25	NC_009446	CCGCG	2	10	42469	42478	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
26	NC_009446	ACGGT	2	10	42976	42985	20 %	20 %	40 %	20 %	146329143
27	NC_009446	CAATT	2	10	44306	44315	40 %	40 %	0 %	20 %	146329873
28	NC_009446	GCGAT	2	10	46177	46186	20 %	20 %	40 %	20 %	146329406
29	NC_009446	TACCA	2	10	46244	46253	40 %	20 %	0 %	40 %	146329406
30	NC_009446	AAAAT	2	10	49686	49695	80 %	20 %	0 %	0 %	146328806
31	NC_009446	TTATT	2	10	51953	51962	20 %	80 %	0 %	0 %	146329167
32	NC_009446	TAAAA	2	10	52957	52966	80 %	20 %	0 %	0 %	146329631
33	NC_009446	AACGC	2	10	53616	53625	40 %	0 %	20 %	40 %	146329700
34	NC_009446	TGGAC	2	10	56247	56256	20 %	20 %	40 %	20 %	146328805
35	NC_009446	ATAGG	2	10	56559	56568	40 %	20 %	40 %	0 %	146328805
36	NC_009446	GGGCA	2	10	59386	59395	20 %	0 %	60 %	20 %	146329379
37	NC_009446	TTTGG	2	10	59818	59827	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009446	TGGCG	2	10	60292	60301	0 %	20 %	60 %	20 %	146328929
39	NC_009446	AACAA	2	10	60375	60384	80 %	0 %	0 %	20 %	146328929
40	NC_009446	AAATG	2	10	60484	60493	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009446	GAATT	2	10	60621	60630	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009446	TAAAA	2	10	60795	60804	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009446	GATAA	2	10	61685	61694	60 %	20 %	20 %	0 %	146328921
44	NC_009446	ATGTA	2	10	63868	63877	40 %	40 %	20 %	0 %	146328681
45	NC_009446	TGGAA	2	10	64097	64106	40 %	20 %	40 %	0 %	146329368
46	NC_009446	TGGAT	2	10	65459	65468	20 %	40 %	40 %	0 %	146329838
47	NC_009446	TGATT	2	10	66015	66024	20 %	60 %	20 %	0 %	146329833
48	NC_009446	ATTAA	2	10	67473	67482	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009446	ATCAA	2	10	70922	70931	60 %	20 %	0 %	20 %	146329305
50	NC_009446	GCCAC	2	10	73401	73410	20 %	0 %	20 %	60 %	146329858
51	NC_009446	TGCGC	2	10	73980	73989	0 %	20 %	40 %	40 %	146328800
52	NC_009446	TTAAA	2	10	74286	74295	60 %	40 %	0 %	0 %	146328800
53	NC_009446	TGCGC	2	10	76799	76808	0 %	20 %	40 %	40 %	146329227
54	NC_009446	TTGCA	2	10	81855	81864	20 %	40 %	20 %	20 %	146329527
55	NC_009446	GTTTG	2	10	83054	83063	0 %	60 %	40 %	0 %	146329527
56	NC_009446	ATTTT	2	10	84356	84365	20 %	80 %	0 %	0 %	146329202
57	NC_009446	ATAAA	2	10	84983	84992	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009446	TAAAA	2	10	85000	85009	80 %	20 %	0 %	0 %	146329771
59	NC_009446	TTCAT	2	10	85902	85911	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_009446	ATTTA	2	10	86748	86757	40 %	60 %	0 %	0 %	146329030
61	NC_009446	GCGCC	2	10	88716	88725	0 %	0 %	40 %	60 %	146329901
62	NC_009446	TATTG	2	10	89706	89715	20 %	60 %	20 %	0 %	146329187
63	NC_009446	TTGGT	2	10	91841	91850	0 %	60 %	40 %	0 %	146328658
64	NC_009446	CGGCG	2	10	93478	93487	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
65	NC_009446	CGATC	2	10	95551	95560	20 %	20 %	20 %	40 %	146328856
66	NC_009446	TGATT	6	30	101054	101083	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009446	CAACG	2	10	102045	102054	40 %	0 %	20 %	40 %	146329493
68	NC_009446	GGCGT	2	10	103061	103070	0 %	20 %	60 %	20 %	146328926
69	NC_009446	TTTGC	2	10	106917	106926	0 %	60 %	20 %	20 %	146329835
70	NC_009446	AAAAT	2	10	108773	108782	80 %	20 %	0 %	0 %	146329373
71	NC_009446	GGAAG	2	10	113740	113749	40 %	0 %	60 %	0 %	146328652
72	NC_009446	TGCAT	2	10	115009	115018	20 %	40 %	20 %	20 %	146329388
73	NC_009446	CGGCG	2	10	115557	115566	0 %	0 %	60 %	40 %	146329388
74	NC_009446	AAAAG	2	10	115610	115619	80 %	0 %	20 %	0 %	146329388
75	NC_009446	GCGTG	2	10	119424	119433	0 %	20 %	60 %	20 %	146328798
76	NC_009446	CAATC	2	10	121403	121412	40 %	20 %	0 %	40 %	146329586
77	NC_009446	GCGCG	2	10	125537	125546	0 %	0 %	60 %	40 %	146329696
78	NC_009446	CTGCC	2	10	126729	126738	0 %	20 %	20 %	60 %	146328964
79	NC_009446	GGCGG	2	10	127593	127602	0 %	0 %	80 %	20 %	146329831
80	NC_009446	TTACG	2	10	127789	127798	20 %	40 %	20 %	20 %	146329831
81	NC_009446	CGTTG	2	10	130405	130414	0 %	40 %	40 %	20 %	146329809
82	NC_009446	TGAAA	2	10	130769	130778	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009446	TTCGG	2	10	131675	131684	0 %	40 %	40 %	20 %	146329311
84	NC_009446	GCACG	2	10	133467	133476	20 %	0 %	40 %	40 %	146329392
85	NC_009446	TGCCG	2	10	134591	134600	0 %	20 %	40 %	40 %	146329416
86	NC_009446	TGATG	2	10	135207	135216	20 %	40 %	40 %	0 %	146328678
87	NC_009446	TTTGC	2	10	135217	135226	0 %	60 %	20 %	20 %	146328678
88	NC_009446	CCACG	2	10	136889	136898	20 %	0 %	20 %	60 %	146329123
89	NC_009446	GTTTT	2	10	136945	136954	0 %	80 %	20 %	0 %	146329123
90	NC_009446	CAAAC	2	10	137323	137332	60 %	0 %	0 %	40 %	146329123
91	NC_009446	TTATG	2	10	137344	137353	20 %	60 %	20 %	0 %	146329123
92	NC_009446	TTTAA	2	10	137744	137753	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009446	TATTT	2	10	138385	138394	20 %	80 %	0 %	0 %	146329737
94	NC_009446	ATTTT	2	10	141818	141827	20 %	80 %	0 %	0 %	146329115
95	NC_009446	ATCGT	2	10	142699	142708	20 %	40 %	20 %	20 %	146329115
96	NC_009446	GAATC	2	10	143167	143176	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_009446	ATAAA	2	10	148410	148419	80 %	20 %	0 %	0 %	146328918
98	NC_009446	ATAAA	2	10	149489	149498	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009446	CGCGG	2	10	154791	154800	0 %	0 %	60 %	40 %	146328774
100	NC_009446	AAATT	2	10	154871	154880	60 %	40 %	0 %	0 %	146328774
101	NC_009446	AATAA	2	10	155292	155301	80 %	20 %	0 %	0 %	146329497
102	NC_009446	CACCG	2	10	159008	159017	20 %	0 %	20 %	60 %	146329048
103	NC_009446	TTGAA	2	10	159398	159407	40 %	40 %	20 %	0 %	146329048
104	NC_009446	CGCAG	2	10	161809	161818	20 %	0 %	40 %	40 %	146329347
105	NC_009446	GCCGA	2	10	164651	164660	20 %	0 %	40 %	40 %	146328740
106	NC_009446	GCGCC	2	10	165537	165546	0 %	0 %	40 %	60 %	146329783
107	NC_009446	GCAAA	2	10	167365	167374	60 %	0 %	20 %	20 %	146328823
108	NC_009446	GATTT	2	10	167386	167395	20 %	60 %	20 %	0 %	146328823
109	NC_009446	AAAGT	2	10	171152	171161	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009446	CAATT	2	10	174185	174194	40 %	40 %	0 %	20 %	146329148
111	NC_009446	GCCGC	2	10	174513	174522	0 %	0 %	40 %	60 %	146329148
112	NC_009446	ACGCC	2	10	180427	180436	20 %	0 %	20 %	60 %	146329180
113	NC_009446	CGGTT	2	10	181489	181498	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_009446	CCATC	2	10	181713	181722	20 %	20 %	0 %	60 %	146329710
115	NC_009446	AAGCC	2	10	181871	181880	40 %	0 %	20 %	40 %	146329710
116	NC_009446	GCATG	2	10	183171	183180	20 %	20 %	40 %	20 %	146329710
117	NC_009446	TCAGT	2	10	184110	184119	20 %	40 %	20 %	20 %	146329710
118	NC_009446	GTCCA	2	10	185831	185840	20 %	20 %	20 %	40 %	146328877
119	NC_009446	CGCTG	2	10	185863	185872	0 %	20 %	40 %	40 %	146328877
120	NC_009446	GGAAT	2	10	186313	186322	40 %	20 %	40 %	0 %	146328877
121	NC_009446	AGGCC	2	10	187320	187329	20 %	0 %	40 %	40 %	146329856
122	NC_009446	CGAGG	2	10	188766	188775	20 %	0 %	60 %	20 %	146329165
123	NC_009446	GCCGC	2	10	190800	190809	0 %	0 %	40 %	60 %	146329165
124	NC_009446	AGCGG	2	10	191313	191322	20 %	0 %	60 %	20 %	146329165
125	NC_009446	GCAAC	2	10	191498	191507	40 %	0 %	20 %	40 %	146328733
126	NC_009446	TGGTC	2	10	191979	191988	0 %	40 %	40 %	20 %	146328764
127	NC_009446	CATCG	2	10	192044	192053	20 %	20 %	20 %	40 %	146328764
128	NC_009446	GGTCG	2	10	193336	193345	0 %	20 %	60 %	20 %	146329329
129	NC_009446	CCTTT	2	10	194946	194955	0 %	60 %	0 %	40 %	146329329
130	NC_009446	CTTTC	2	10	195037	195046	0 %	60 %	0 %	40 %	146329329
131	NC_009446	GGCCG	2	10	196013	196022	0 %	0 %	60 %	40 %	146329396
132	NC_009446	CTGGC	2	10	196914	196923	0 %	20 %	40 %	40 %	146329396
133	NC_009446	AAGCG	2	10	198967	198976	40 %	0 %	40 %	20 %	146329396
134	NC_009446	TCGGC	2	10	200151	200160	0 %	20 %	40 %	40 %	146328698
135	NC_009446	CCCGG	2	10	201531	201540	0 %	0 %	40 %	60 %	146328955
136	NC_009446	CGGCG	2	10	203034	203043	0 %	0 %	60 %	40 %	146329023
137	NC_009446	CTTCG	2	10	203671	203680	0 %	40 %	20 %	40 %	146329559
138	NC_009446	ACACC	2	10	204717	204726	40 %	0 %	0 %	60 %	146329075
139	NC_009446	CGCAG	2	10	205113	205122	20 %	0 %	40 %	40 %	146329075
140	NC_009446	GCCGC	2	10	205180	205189	0 %	0 %	40 %	60 %	146329075
141	NC_009446	GAGCC	2	10	206297	206306	20 %	0 %	40 %	40 %	146329075
142	NC_009446	GGTCG	2	10	207363	207372	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
143	NC_009446	CCATT	2	10	209682	209691	20 %	40 %	0 %	40 %	146329528
144	NC_009446	ATTAA	2	10	211286	211295	60 %	40 %	0 %	0 %	146328841
145	NC_009446	CTCAA	2	10	213762	213771	40 %	20 %	0 %	40 %	146329683
146	NC_009446	GGAAA	2	10	219294	219303	60 %	0 %	40 %	0 %	146329759
147	NC_009446	CGCGC	2	10	220339	220348	0 %	0 %	40 %	60 %	146329458
148	NC_009446	GCTGT	2	10	222268	222277	0 %	40 %	40 %	20 %	146329645
149	NC_009446	CACAA	2	10	225076	225085	60 %	0 %	0 %	40 %	146328731
150	NC_009446	CAAAA	2	10	226777	226786	80 %	0 %	0 %	20 %	146328637
151	NC_009446	GGCGA	2	10	230500	230509	20 %	0 %	60 %	20 %	146329122
152	NC_009446	TTTTG	2	10	231226	231235	0 %	80 %	20 %	0 %	146328684
153	NC_009446	AAAAT	2	10	231949	231958	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_009446	TAAAA	2	10	232170	232179	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_009446	GGCAA	2	10	232363	232372	40 %	0 %	40 %	20 %	146329166
156	NC_009446	GGTGA	2	10	235868	235877	20 %	20 %	60 %	0 %	146328807
157	NC_009446	CGTAA	2	10	238443	238452	40 %	20 %	20 %	20 %	146329854
158	NC_009446	CCAAA	2	10	238665	238674	60 %	0 %	0 %	40 %	146329854
159	NC_009446	TTTGT	2	10	243501	243510	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
160	NC_009446	AACCA	2	10	249413	249422	60 %	0 %	0 %	40 %	146329429
161	NC_009446	TCAAT	2	10	251264	251273	40 %	40 %	0 %	20 %	146329491
162	NC_009446	ATCTC	2	10	251335	251344	20 %	40 %	0 %	40 %	146329491
163	NC_009446	CGGCG	2	10	252486	252495	0 %	0 %	60 %	40 %	146329011
164	NC_009446	CGGCG	2	10	252717	252726	0 %	0 %	60 %	40 %	146329011
165	NC_009446	CGAAG	2	10	252924	252933	40 %	0 %	40 %	20 %	146329011
166	NC_009446	CAAAA	2	10	255648	255657	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
167	NC_009446	GCGCG	2	10	258903	258912	0 %	0 %	60 %	40 %	146329617
168	NC_009446	AATAA	2	10	259614	259623	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_009446	ATTCG	2	10	262709	262718	20 %	40 %	20 %	20 %	146329760
170	NC_009446	GCGAT	2	10	266023	266032	20 %	20 %	40 %	20 %	146329581
171	NC_009446	AAAAT	2	10	266384	266393	80 %	20 %	0 %	0 %	146329581
172	NC_009446	CCAAT	2	10	269147	269156	40 %	20 %	0 %	40 %	146328949
173	NC_009446	CCATG	2	10	273014	273023	20 %	20 %	20 %	40 %	146328671
174	NC_009446	AACAT	2	10	273926	273935	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
175	NC_009446	AATCC	2	10	274228	274237	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
176	NC_009446	TCCAT	2	10	277334	277343	20 %	40 %	0 %	40 %	146329264
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178	NC_009446	TTCCG	2	10	279220	279229	0 %	40 %	20 %	40 %	146329884
179	NC_009446	ATTTG	2	10	279345	279354	20 %	60 %	20 %	0 %	146329884
180	NC_009446	ATTTT	2	10	279743	279752	20 %	80 %	0 %	0 %	146329781
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184	NC_009446	TGCGG	2	10	284030	284039	0 %	20 %	60 %	20 %	146329676
185	NC_009446	CAAAA	2	10	284619	284628	80 %	0 %	0 %	20 %	146329676
186	NC_009446	AATTA	2	10	290471	290480	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_009446	AATGT	2	10	292999	293008	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
188	NC_009446	CATTT	2	10	294088	294097	20 %	60 %	0 %	20 %	146329565
189	NC_009446	AAATA	2	10	296182	296191	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_009446	TGATC	2	10	301682	301691	20 %	40 %	20 %	20 %	146328881
191	NC_009446	TAACA	2	10	301731	301740	60 %	20 %	0 %	20 %	146328881
192	NC_009446	TTTTA	2	10	309002	309011	20 %	80 %	0 %	0 %	146329164
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195	NC_009446	TGCTT	2	10	314637	314646	0 %	60 %	20 %	20 %	146329746
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198	NC_009446	GGCGC	2	10	319795	319804	0 %	0 %	60 %	40 %	146329280
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201	NC_009446	TTTAT	2	10	327866	327875	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
202	NC_009446	TGCGT	2	10	328954	328963	0 %	40 %	40 %	20 %	146329861
203	NC_009446	TACAA	2	10	331441	331450	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
204	NC_009446	TGCTT	2	10	331823	331832	0 %	60 %	20 %	20 %	146328657
205	NC_009446	GGAAT	2	10	333874	333883	40 %	20 %	40 %	0 %	146329173
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213	NC_009446	GGATC	2	10	348112	348121	20 %	20 %	40 %	20 %	146328630
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220	NC_009446	GCGGT	2	10	356259	356268	0 %	20 %	60 %	20 %	146329232
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224	NC_009446	TTGCG	2	10	365014	365023	0 %	40 %	40 %	20 %	146328651
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234	NC_009446	ACAGC	2	10	377934	377943	40 %	0 %	20 %	40 %	146328722
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236	NC_009446	TGCGA	2	10	380328	380337	20 %	20 %	40 %	20 %	146329294
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238	NC_009446	TTATT	2	10	386113	386122	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
239	NC_009446	GCAAA	2	10	387509	387518	60 %	0 %	20 %	20 %	146329715
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241	NC_009446	TTTTA	2	10	388186	388195	20 %	80 %	0 %	0 %	146329243
242	NC_009446	CGGCG	2	10	388451	388460	0 %	0 %	60 %	40 %	146329371
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250	NC_009446	ATTCC	2	10	399305	399314	20 %	40 %	0 %	40 %	146329714
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252	NC_009446	TTGGT	2	10	402514	402523	0 %	60 %	40 %	0 %	146329817
253	NC_009446	CACGC	2	10	405139	405148	20 %	0 %	20 %	60 %	146329428
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255	NC_009446	TTTGC	2	10	407653	407662	0 %	60 %	20 %	20 %	146329461
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257	NC_009446	CGCGC	2	10	411567	411576	0 %	0 %	40 %	60 %	146329761
258	NC_009446	GCAAA	2	10	412401	412410	60 %	0 %	20 %	20 %	146329879
259	NC_009446	CATCG	2	10	412981	412990	20 %	20 %	20 %	40 %	146329484
260	NC_009446	ATTCC	2	10	413412	413421	20 %	40 %	0 %	40 %	146329484
261	NC_009446	AAAAT	2	10	413580	413589	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_009446	GCATT	2	10	414109	414118	20 %	40 %	20 %	20 %	146329008
263	NC_009446	TGCAC	2	10	414240	414249	20 %	20 %	20 %	40 %	146329093
264	NC_009446	ATAAA	2	10	419967	419976	80 %	20 %	0 %	0 %	146329276
265	NC_009446	ATTAA	2	10	422834	422843	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NC_009446	TGATT	2	10	424574	424583	20 %	60 %	20 %	0 %	146328903
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