MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bradyrhizobium sp. ORS 278 chromosome

Total Repeats: 6458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009445	GCATC	2	10	1157	1166	20 %	20 %	20 %	40 %	146337176
2	NC_009445	TGCGC	2	10	1189	1198	0 %	20 %	40 %	40 %	146337176
3	NC_009445	ACCAC	2	10	2260	2269	40 %	0 %	0 %	60 %	146337176
4	NC_009445	GCTTC	2	10	3958	3967	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_009445	CCTCG	2	10	5988	5997	0 %	20 %	20 %	60 %	146337179
6	NC_009445	GTGCT	2	10	6280	6289	0 %	40 %	40 %	20 %	146337179
7	NC_009445	TCGCT	2	10	6677	6686	0 %	40 %	20 %	40 %	146337179
8	NC_009445	GCCGC	2	10	7818	7827	0 %	0 %	40 %	60 %	146337179
9	NC_009445	GACCA	2	10	8895	8904	40 %	0 %	20 %	40 %	146337180
10	NC_009445	CCGCG	2	10	10229	10238	0 %	0 %	40 %	60 %	146337182
11	NC_009445	GCGAT	2	10	11188	11197	20 %	20 %	40 %	20 %	146337183
12	NC_009445	CTCGC	2	10	12006	12015	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
13	NC_009445	GCGCC	2	10	14764	14773	0 %	0 %	40 %	60 %	146337185
14	NC_009445	GGCGA	2	10	15701	15710	20 %	0 %	60 %	20 %	146337186
15	NC_009445	GCCGA	2	10	19376	19385	20 %	0 %	40 %	40 %	146337188
16	NC_009445	TCCCC	2	10	21721	21730	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
17	NC_009445	ATCGC	2	10	22040	22049	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_009445	CGGTC	2	10	22538	22547	0 %	20 %	40 %	40 %	146337191
19	NC_009445	GCCTC	2	10	23360	23369	0 %	20 %	20 %	60 %	146337192
20	NC_009445	CGCGC	2	10	26724	26733	0 %	0 %	40 %	60 %	146337196
21	NC_009445	CGTGC	2	10	27691	27700	0 %	20 %	40 %	40 %	146337197
22	NC_009445	CCGCG	2	10	27916	27925	0 %	0 %	40 %	60 %	146337197
23	NC_009445	CGGGC	2	10	28659	28668	0 %	0 %	60 %	40 %	146337198
24	NC_009445	CGCGG	2	10	28997	29006	0 %	0 %	60 %	40 %	146337198
25	NC_009445	TTGCG	2	10	29352	29361	0 %	40 %	40 %	20 %	146337199
26	NC_009445	CGCGC	2	10	29688	29697	0 %	0 %	40 %	60 %	146337199
27	NC_009445	CGCGG	2	10	32433	32442	0 %	0 %	60 %	40 %	146337201
28	NC_009445	GAACA	2	10	32625	32634	60 %	0 %	20 %	20 %	146337201
29	NC_009445	GCCGC	2	10	34579	34588	0 %	0 %	40 %	60 %	146337203
30	NC_009445	ACGGC	2	10	35992	36001	20 %	0 %	40 %	40 %	146337204
31	NC_009445	GCGCC	2	10	37337	37346	0 %	0 %	40 %	60 %	146337205
32	NC_009445	GGCCG	2	10	37407	37416	0 %	0 %	60 %	40 %	146337205
33	NC_009445	GGCCG	2	10	38031	38040	0 %	0 %	60 %	40 %	146337206
34	NC_009445	TGCTG	2	10	38115	38124	0 %	40 %	40 %	20 %	146337206
35	NC_009445	TCGCC	2	10	38453	38462	0 %	20 %	20 %	60 %	146337206
36	NC_009445	AGCGA	2	10	40511	40520	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_009445	TCGCT	2	10	40560	40569	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_009445	CATCG	2	10	43705	43714	20 %	20 %	20 %	40 %	146337210
39	NC_009445	CGGCG	2	10	44678	44687	0 %	0 %	60 %	40 %	146337211
40	NC_009445	GGCTT	2	10	48541	48550	0 %	40 %	40 %	20 %	146337216
41	NC_009445	CAGGT	2	10	48897	48906	20 %	20 %	40 %	20 %	146337216
42	NC_009445	CGCGC	2	10	49313	49322	0 %	0 %	40 %	60 %	146337217
43	NC_009445	AGCCG	2	10	50659	50668	20 %	0 %	40 %	40 %	146337218
44	NC_009445	CCTGG	2	10	50790	50799	0 %	20 %	40 %	40 %	146337219
45	NC_009445	GCGCT	2	10	54234	54243	0 %	20 %	40 %	40 %	146337221
46	NC_009445	GTCGC	2	10	55157	55166	0 %	20 %	40 %	40 %	146337222
47	NC_009445	TGCGC	2	10	55556	55565	0 %	20 %	40 %	40 %	146337223
48	NC_009445	GCGCC	2	10	56400	56409	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
49	NC_009445	CCGGT	2	10	56631	56640	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_009445	TCGCC	2	10	57426	57435	0 %	20 %	20 %	60 %	146337224
51	NC_009445	GGCGA	2	10	57972	57981	20 %	0 %	60 %	20 %	146337225
52	NC_009445	CGCCT	2	10	58482	58491	0 %	20 %	20 %	60 %	146337225
53	NC_009445	GGTCA	2	10	59508	59517	20 %	20 %	40 %	20 %	146337226
54	NC_009445	GCGTC	2	10	60138	60147	0 %	20 %	40 %	40 %	146337227
55	NC_009445	AGGCG	2	10	60528	60537	20 %	0 %	60 %	20 %	146337227
56	NC_009445	GCCCG	2	10	60846	60855	0 %	0 %	40 %	60 %	146337227
57	NC_009445	GCCGC	2	10	63474	63483	0 %	0 %	40 %	60 %	146337229
58	NC_009445	CCGTT	2	10	63659	63668	0 %	40 %	20 %	40 %	146337229
59	NC_009445	TGGCG	2	10	66279	66288	0 %	20 %	60 %	20 %	146337231
60	NC_009445	GACCA	2	10	67139	67148	40 %	0 %	20 %	40 %	146337231
61	NC_009445	GCTGC	2	10	67748	67757	0 %	20 %	40 %	40 %	146337232
62	NC_009445	ACATC	2	10	72710	72719	40 %	20 %	0 %	40 %	146337236
63	NC_009445	CGCCT	2	10	73266	73275	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
64	NC_009445	CGGCG	2	10	73342	73351	0 %	0 %	60 %	40 %	146337237
65	NC_009445	AACTC	2	10	75381	75390	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_009445	CGCAG	2	10	75494	75503	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_009445	CATCG	2	10	76175	76184	20 %	20 %	20 %	40 %	146337240
68	NC_009445	TGACC	2	10	77152	77161	20 %	20 %	20 %	40 %	146337241
69	NC_009445	CGCCT	2	10	77594	77603	0 %	20 %	20 %	60 %	146337241
70	NC_009445	CGAGC	2	10	79298	79307	20 %	0 %	40 %	40 %	146337243
71	NC_009445	CGTGC	2	10	80391	80400	0 %	20 %	40 %	40 %	146337244
72	NC_009445	CGACG	2	10	82301	82310	20 %	0 %	40 %	40 %	146337245
73	NC_009445	CGCGC	2	10	82328	82337	0 %	0 %	40 %	60 %	146337245
74	NC_009445	CGGCG	2	10	83794	83803	0 %	0 %	60 %	40 %	146337247
75	NC_009445	GACCA	2	10	84514	84523	40 %	0 %	20 %	40 %	146337248
76	NC_009445	GGCGC	2	10	85808	85817	0 %	0 %	60 %	40 %	146337249
77	NC_009445	ACCGC	2	10	85960	85969	20 %	0 %	20 %	60 %	146337249
78	NC_009445	CTCGC	2	10	86023	86032	0 %	20 %	20 %	60 %	146337249
79	NC_009445	GCATT	2	10	87104	87113	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_009445	GCCGA	2	10	87839	87848	20 %	0 %	40 %	40 %	146337250
81	NC_009445	GCGCC	2	10	87890	87899	0 %	0 %	40 %	60 %	146337250
82	NC_009445	TCTCT	2	10	89357	89366	0 %	60 %	0 %	40 %	146337252
83	NC_009445	TGCGC	2	10	90978	90987	0 %	20 %	40 %	40 %	146337252
84	NC_009445	CGCAA	2	10	91700	91709	40 %	0 %	20 %	40 %	146337252
85	NC_009445	GGGAC	2	10	93319	93328	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
86	NC_009445	GGCCT	2	10	93746	93755	0 %	20 %	40 %	40 %	146337254
87	NC_009445	GATCA	2	10	94202	94211	40 %	20 %	20 %	20 %	146337255
88	NC_009445	CTCAA	2	10	94986	94995	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_009445	CTCGC	2	10	96477	96486	0 %	20 %	20 %	60 %	146337256
90	NC_009445	GGCGC	2	10	96932	96941	0 %	0 %	60 %	40 %	146337256
91	NC_009445	TGCGC	2	10	97696	97705	0 %	20 %	40 %	40 %	146337256
92	NC_009445	GCCCC	2	10	98367	98376	0 %	0 %	20 %	80 %	146337257
93	NC_009445	GCGCC	2	10	99366	99375	0 %	0 %	40 %	60 %	146337257
94	NC_009445	GGCTC	2	10	100554	100563	0 %	20 %	40 %	40 %	146337257
95	NC_009445	CGACA	2	10	100773	100782	40 %	0 %	20 %	40 %	146337257
96	NC_009445	CGGTC	2	10	101988	101997	0 %	20 %	40 %	40 %	146337258
97	NC_009445	GCGCC	2	10	102203	102212	0 %	0 %	40 %	60 %	146337258
98	NC_009445	GCGCG	2	10	102367	102376	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
99	NC_009445	TAGCG	2	10	103678	103687	20 %	20 %	40 %	20 %	146337260
100	NC_009445	AGACG	2	10	104906	104915	40 %	0 %	40 %	20 %	146337261
101	NC_009445	TCGCC	2	10	106147	106156	0 %	20 %	20 %	60 %	146337262
102	NC_009445	CCGAC	2	10	106916	106925	20 %	0 %	20 %	60 %	146337263
103	NC_009445	ATCGG	2	10	107329	107338	20 %	20 %	40 %	20 %	146337263
104	NC_009445	CGCGC	2	10	108749	108758	0 %	0 %	40 %	60 %	146337265
105	NC_009445	GCCGG	2	10	109503	109512	0 %	0 %	60 %	40 %	146337266
106	NC_009445	GCCCG	2	10	110064	110073	0 %	0 %	40 %	60 %	146337267
107	NC_009445	AGGTC	2	10	110564	110573	20 %	20 %	40 %	20 %	146337268
108	NC_009445	TGACC	2	10	112910	112919	20 %	20 %	20 %	40 %	146337269
109	NC_009445	GCATG	2	10	116435	116444	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_009445	CGCAG	2	10	118064	118073	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
111	NC_009445	CGCAG	2	10	119414	119423	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
112	NC_009445	AATTC	2	10	120244	120253	40 %	40 %	0 %	20 %	146337277
113	NC_009445	CGGCC	2	10	121675	121684	0 %	0 %	40 %	60 %	146337278
114	NC_009445	GGCGC	2	10	125220	125229	0 %	0 %	60 %	40 %	146337283
115	NC_009445	CAACG	2	10	126018	126027	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_009445	CGGCG	2	10	126275	126284	0 %	0 %	60 %	40 %	146337285
117	NC_009445	CGTGA	2	10	126711	126720	20 %	20 %	40 %	20 %	146337285
118	NC_009445	TGATG	2	10	127154	127163	20 %	40 %	40 %	0 %	146337286
119	NC_009445	CGGCG	2	10	128139	128148	0 %	0 %	60 %	40 %	146337286
120	NC_009445	GATCG	2	10	128989	128998	20 %	20 %	40 %	20 %	146337287
121	NC_009445	CGCTT	2	10	129829	129838	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_009445	CGCGA	2	10	132062	132071	20 %	0 %	40 %	40 %	146337290
123	NC_009445	GCCGC	2	10	132532	132541	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
124	NC_009445	GCCCG	2	10	132592	132601	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
125	NC_009445	TCCGC	2	10	132941	132950	0 %	20 %	20 %	60 %	146337291
126	NC_009445	TGCGT	2	10	137069	137078	0 %	40 %	40 %	20 %	146337295
127	NC_009445	CTTCG	2	10	138355	138364	0 %	40 %	20 %	40 %	146337296
128	NC_009445	CGGCC	2	10	138800	138809	0 %	0 %	40 %	60 %	146337296
129	NC_009445	AGTCG	2	10	140080	140089	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_009445	CGGCG	2	10	142322	142331	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
131	NC_009445	CGAGA	2	10	142621	142630	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_009445	CTCCC	2	10	142813	142822	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
133	NC_009445	AAATC	2	10	143127	143136	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_009445	AAGCG	2	10	144483	144492	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_009445	TCGGC	2	10	146483	146492	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
136	NC_009445	TCGCC	2	10	147964	147973	0 %	20 %	20 %	60 %	146337303
137	NC_009445	CGCGG	2	10	149600	149609	0 %	0 %	60 %	40 %	146337305
138	NC_009445	CCTCG	2	10	150728	150737	0 %	20 %	20 %	60 %	146337308
139	NC_009445	CGCGC	2	10	153657	153666	0 %	0 %	40 %	60 %	146337310
140	NC_009445	CGGCG	2	10	160600	160609	0 %	0 %	60 %	40 %	146337316
141	NC_009445	GTGGG	2	10	162266	162275	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009445	CGGGC	2	10	162521	162530	0 %	0 %	60 %	40 %	146337317
143	NC_009445	GCCCT	2	10	162780	162789	0 %	20 %	20 %	60 %	146337317
144	NC_009445	GGCGC	2	10	163842	163851	0 %	0 %	60 %	40 %	146337318
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147	NC_009445	GCTCA	2	10	165676	165685	20 %	20 %	20 %	40 %	146337320
148	NC_009445	GCCGG	2	10	165739	165748	0 %	0 %	60 %	40 %	146337320
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152	NC_009445	GCCGG	2	10	172350	172359	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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199	NC_009445	CCAGC	2	10	220143	220152	20 %	0 %	20 %	60 %	146337372
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236	NC_009445	GCCGC	2	10	258612	258621	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
237	NC_009445	GCCAC	2	10	258750	258759	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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249	NC_009445	CGGTC	2	10	271680	271689	0 %	20 %	40 %	40 %	146337417
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254	NC_009445	GGCGA	2	10	282864	282873	20 %	0 %	60 %	20 %	146337428
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256	NC_009445	GTCTG	2	10	283864	283873	0 %	40 %	40 %	20 %	146337429
257	NC_009445	CGTCG	2	10	284303	284312	0 %	20 %	40 %	40 %	146337430
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260	NC_009445	TCGCC	2	10	292029	292038	0 %	20 %	20 %	60 %	146337438
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262	NC_009445	TCGAG	2	10	293711	293720	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
263	NC_009445	CCGAG	2	10	294363	294372	20 %	0 %	40 %	40 %	146337441
264	NC_009445	GCCGT	2	10	298007	298016	0 %	20 %	40 %	40 %	146337444
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267	NC_009445	CGAGC	2	10	299338	299347	20 %	0 %	40 %	40 %	146337445
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270	NC_009445	GCCGC	2	10	301693	301702	0 %	0 %	40 %	60 %	146337448
271	NC_009445	GCTGC	2	10	302758	302767	0 %	20 %	40 %	40 %	146337449
272	NC_009445	CGGGT	2	10	305544	305553	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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274	NC_009445	CGGGC	2	10	308887	308896	0 %	0 %	60 %	40 %	146337455
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276	NC_009445	CGGCG	2	10	311972	311981	0 %	0 %	60 %	40 %	146337456
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284	NC_009445	GCCGA	2	10	318602	318611	20 %	0 %	40 %	40 %	146337461
285	NC_009445	GCCGC	2	10	318712	318721	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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287	NC_009445	GCCGA	2	10	319149	319158	20 %	0 %	40 %	40 %	146337462
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293	NC_009445	GCAGG	2	10	325410	325419	20 %	0 %	60 %	20 %	146337468
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332	NC_009445	GCCCT	2	10	366955	366964	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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383	NC_009445	AACTC	2	10	426572	426581	40 %	20 %	0 %	40 %	146337561
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400	NC_009445	GACCG	2	10	436863	436872	20 %	0 %	40 %	40 %	146337570
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