MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. ORS 278 chromosome

Total Repeats: 15109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009445	GAA	2	6	93	98	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009445	TGT	2	6	114	119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009445	GAT	2	6	143	148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009445	GCA	2	6	182	187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009445	CGG	3	9	326	334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009445	CAT	2	6	431	436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_009445	ACC	2	6	703	708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_009445	TCC	2	6	723	728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_009445	GCA	2	6	2449	2454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009445	GCT	2	6	2600	2605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009445	CCG	2	6	2611	2616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_009445	CAC	2	6	3824	3829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_009445	GGC	2	6	3842	3847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009445	CGG	2	6	3853	3858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009445	GAG	2	6	3895	3900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009445	CGA	2	6	3906	3911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009445	GCA	2	6	5139	5144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_009445	CGG	2	6	5222	5227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009445	ATG	2	6	9988	9993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009445	GCC	2	6	10040	10045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_009445	CAG	2	6	10048	10053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009445	CCA	2	6	10061	10066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_009445	GCG	2	6	10071	10076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009445	ACG	2	6	11060	11065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009445	CCG	2	6	11868	11873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_009445	CAT	2	6	11896	11901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009445	ACC	2	6	11997	12002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_009445	TGG	2	6	12136	12141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009445	CGC	2	6	12147	12152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_009445	CGG	2	6	12368	12373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009445	CGG	2	6	12478	12483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009445	CCG	2	6	12489	12494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_009445	CAA	2	6	12506	12511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009445	GAG	2	6	12524	12529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009445	GCC	2	6	12596	12601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_009445	CTT	2	6	12607	12612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009445	GCA	2	6	12733	12738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_009445	TCG	2	6	12784	12789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009445	CGC	2	6	12803	12808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_009445	ATG	2	6	12835	12840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009445	CAA	2	6	15489	15494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_009445	CGA	2	6	18321	18326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009445	CCG	3	9	18369	18377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_009445	CGG	2	6	19530	19535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009445	GCT	2	6	19615	19620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009445	CAC	2	6	19631	19636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_009445	GTA	2	6	21567	21572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009445	TCC	2	6	21616	21621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_009445	TCA	2	6	21772	21777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009445	CGG	2	6	21912	21917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_009445	CAC	2	6	21919	21924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_009445	GAC	2	6	22176	22181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009445	CTG	2	6	23272	23277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009445	GCG	2	6	24674	24679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009445	GCC	2	6	24707	24712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_009445	GGC	2	6	24716	24721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009445	ATC	2	6	25475	25480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009445	CGT	2	6	26259	26264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009445	CAC	2	6	27169	27174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_009445	CAG	3	9	27246	27254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009445	GCA	2	6	28402	28407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009445	GTC	2	6	29118	29123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009445	CCG	2	6	29157	29162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_009445	GCC	2	6	29843	29848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_009445	GGC	2	6	34529	34534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009445	CGT	2	6	34561	34566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_009445	GCC	2	6	34917	34922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_009445	GTT	2	6	34952	34957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009445	GTG	2	6	35006	35011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009445	CGC	2	6	35126	35131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_009445	ATC	2	6	35132	35137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_009445	ACC	2	6	35149	35154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_009445	GCC	2	6	35174	35179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_009445	GGA	2	6	35227	35232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009445	CGA	2	6	36463	36468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009445	TCA	2	6	36501	36506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_009445	TTG	2	6	36513	36518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009445	GCA	2	6	36534	36539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009445	AGC	2	6	36592	36597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_009445	GCG	2	6	37794	37799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009445	ACG	2	6	39405	39410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_009445	CAT	2	6	39420	39425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_009445	ACC	2	6	40585	40590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_009445	GCA	2	6	40669	40674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_009445	ACC	2	6	40708	40713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_009445	GAC	2	6	41271	41276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_009445	CGC	2	6	41920	41925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_009445	CGT	2	6	42017	42022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_009445	CGT	2	6	42047	42052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_009445	GAC	2	6	42066	42071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009445	GAC	2	6	42099	42104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_009445	GTG	2	6	42105	42110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009445	AGT	2	6	43966	43971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009445	AAG	2	6	44021	44026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009445	TGG	2	6	45283	45288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009445	GCT	2	6	52432	52437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_009445	GCA	2	6	52458	52463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009445	TGC	2	6	52478	52483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_009445	GAG	2	6	52576	52581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009445	GTC	2	6	56289	56294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_009445	GAG	2	6	56394	56399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009445	GAC	2	6	56494	56499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009445	GGC	2	6	56675	56680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_009445	CGC	2	6	59108	59113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_009445	GAG	2	6	59148	59153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009445	CAC	2	6	59157	59162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_009445	CGA	2	6	59922	59927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_009445	GAC	2	6	59980	59985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_009445	CGG	2	6	62808	62813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_009445	CGT	2	6	62843	62848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_009445	GAT	2	6	62893	62898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009445	CGC	2	6	64762	64767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_009445	AAG	2	6	64819	64824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009445	CAG	2	6	64871	64876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_009445	ACG	2	6	64914	64919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_009445	AGA	2	6	65049	65054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009445	GCG	2	6	67220	67225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_009445	GGC	2	6	67250	67255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_009445	GCC	2	6	67262	67267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_009445	GCG	2	6	67314	67319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_009445	GGA	2	6	67376	67381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009445	TGC	2	6	70884	70889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_009445	GCC	2	6	70974	70979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_009445	GCC	2	6	71049	71054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_009445	CCG	2	6	71059	71064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_009445	CGG	2	6	71066	71071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_009445	GAT	2	6	71936	71941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009445	TGT	2	6	71995	72000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009445	GTT	2	6	72023	72028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009445	GTG	2	6	73296	73301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009445	CCG	2	6	73328	73333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_009445	TGA	2	6	73861	73866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009445	GCG	2	6	74079	74084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_009445	TTC	2	6	74205	74210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_009445	CAA	2	6	74263	74268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_009445	AGC	2	6	74821	74826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_009445	CGG	2	6	74830	74835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_009445	CGC	2	6	75410	75415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_009445	CCG	2	6	75418	75423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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