MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. ORS 278 chromosome

Total Repeats: 124609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009445	CGC	2	6	1220	1225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337176
2	NC_009445	GCC	2	6	1302	1307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337176
3	NC_009445	ATG	2	6	1312	1317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337176
4	NC_009445	CGC	2	6	1330	1335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337176
5	NC_009445	CTG	2	6	1491	1496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337176
6	NC_009445	CGG	2	6	1523	1528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337176
7	NC_009445	CCG	2	6	1552	1557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337176
8	NC_009445	TCG	2	6	1576	1581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337176
9	NC_009445	AGG	2	6	1615	1620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146337176
10	NC_009445	CGA	2	6	1649	1654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337176
11	NC_009445	GGT	2	6	1733	1738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337176
12	NC_009445	CGC	2	6	1742	1747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337176
13	NC_009445	GCC	2	6	1754	1759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337176
14	NC_009445	CGA	2	6	1778	1783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337176
15	NC_009445	CGG	2	6	1805	1810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337176
16	NC_009445	TCG	3	9	1813	1821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337176
17	NC_009445	CGG	2	6	1876	1881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337176
18	NC_009445	CAT	2	6	1890	1895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337176
19	NC_009445	CTG	2	6	1986	1991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337176
20	NC_009445	CAA	2	6	2006	2011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146337176
21	NC_009445	CGT	2	6	2105	2110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337176
22	NC_009445	CCT	2	6	2141	2146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146337176
23	NC_009445	CGC	2	6	2154	2159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337176
24	NC_009445	GCC	2	6	2239	2244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337176
25	NC_009445	CGG	2	6	2249	2254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337176
26	NC_009445	TGC	2	6	2272	2277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337176
27	NC_009445	ACG	2	6	2326	2331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337176
28	NC_009445	GCT	2	6	2685	2690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337177
29	NC_009445	GCC	2	6	2830	2835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337177
30	NC_009445	CCA	2	6	2855	2860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337177
31	NC_009445	CGC	2	6	3018	3023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337177
32	NC_009445	GAG	2	6	3106	3111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146337177
33	NC_009445	CGG	2	6	3147	3152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337177
34	NC_009445	AGC	2	6	3161	3166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337177
35	NC_009445	AAC	2	6	3427	3432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146337177
36	NC_009445	TCG	3	9	3443	3451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337177
37	NC_009445	CGC	3	9	3465	3473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337177
38	NC_009445	CCA	2	6	3488	3493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337177
39	NC_009445	CCG	2	6	3533	3538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337177
40	NC_009445	CGC	2	6	3657	3662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337177
41	NC_009445	TGG	2	6	4080	4085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337178
42	NC_009445	TTC	2	6	4139	4144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337178
43	NC_009445	GCG	2	6	4162	4167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337178
44	NC_009445	CGG	2	6	4221	4226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337178
45	NC_009445	GCC	2	6	4273	4278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337178
46	NC_009445	ACG	2	6	4295	4300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337178
47	NC_009445	GCC	2	6	4406	4411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337178
48	NC_009445	GCC	2	6	4419	4424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337178
49	NC_009445	CTT	2	6	4426	4431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337178
50	NC_009445	GCT	2	6	4513	4518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337178
51	NC_009445	CGA	2	6	4534	4539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337178
52	NC_009445	CCG	2	6	4569	4574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337178
53	NC_009445	CGC	2	6	4624	4629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337178
54	NC_009445	TGC	2	6	4632	4637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337178
55	NC_009445	GCC	2	6	4649	4654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337178
56	NC_009445	GCT	2	6	4705	4710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337178
57	NC_009445	CTG	2	6	4751	4756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337178
58	NC_009445	TGC	2	6	4777	4782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337178
59	NC_009445	GAA	2	6	4840	4845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146337178
60	NC_009445	GCT	2	6	4885	4890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337178
61	NC_009445	ACC	2	6	4931	4936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337178
62	NC_009445	TGC	3	9	4950	4958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337178
63	NC_009445	CGA	2	6	4960	4965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337178
64	NC_009445	TCG	2	6	4968	4973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337178
65	NC_009445	GTT	2	6	5002	5007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146337178
66	NC_009445	GGC	2	6	5108	5113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337178
67	NC_009445	GTC	2	6	5605	5610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337179
68	NC_009445	CGA	2	6	5622	5627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337179
69	NC_009445	CGA	2	6	5694	5699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337179
70	NC_009445	TCA	2	6	5756	5761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337179
71	NC_009445	CGG	2	6	5778	5783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337179
72	NC_009445	CGG	2	6	5814	5819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337179
73	NC_009445	CGT	2	6	5841	5846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337179
74	NC_009445	CGC	2	6	5933	5938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337179
75	NC_009445	GGT	2	6	5943	5948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337179
76	NC_009445	CAT	2	6	6084	6089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337179
77	NC_009445	GAG	2	6	6124	6129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146337179
78	NC_009445	CGG	2	6	6141	6146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337179
79	NC_009445	GAG	2	6	6151	6156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146337179
80	NC_009445	CAA	2	6	6177	6182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146337179
81	NC_009445	TGG	2	6	6253	6258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337179
82	NC_009445	CAA	2	6	6294	6299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146337179
83	NC_009445	CGG	2	6	6315	6320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337179
84	NC_009445	GAA	2	6	6387	6392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146337179
85	NC_009445	CGA	2	6	6414	6419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337179
86	NC_009445	TCG	2	6	6475	6480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337179
87	NC_009445	CGT	2	6	6519	6524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337179
88	NC_009445	TCA	2	6	6533	6538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337179
89	NC_009445	GAG	2	6	6562	6567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146337179
90	NC_009445	CGT	2	6	6588	6593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337179
91	NC_009445	GCC	2	6	6610	6615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337179
92	NC_009445	CAA	2	6	6669	6674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146337179
93	NC_009445	TCG	2	6	6743	6748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337179
94	NC_009445	TGC	2	6	6806	6811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337179
95	NC_009445	CGA	2	6	6915	6920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337179
96	NC_009445	ATC	2	6	6952	6957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337179
97	NC_009445	TGA	2	6	6959	6964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337179
98	NC_009445	CTG	3	9	7000	7008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337179
99	NC_009445	TTC	2	6	7012	7017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337179
100	NC_009445	ATC	2	6	7036	7041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337179
101	NC_009445	GCC	2	6	7068	7073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337179
102	NC_009445	CGA	2	6	7158	7163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337179
103	NC_009445	CCG	2	6	7178	7183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337179
104	NC_009445	GAG	2	6	7189	7194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146337179
105	NC_009445	CTG	2	6	7210	7215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337179
106	NC_009445	GTC	2	6	7285	7290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337179
107	NC_009445	GGC	2	6	7296	7301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337179
108	NC_009445	TGC	2	6	7313	7318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337179
109	NC_009445	CGC	3	9	7353	7361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337179
110	NC_009445	TCG	2	6	7427	7432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337179
111	NC_009445	GCG	2	6	7466	7471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337179
112	NC_009445	CGA	2	6	7491	7496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337179
113	NC_009445	GCT	2	6	7500	7505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337179
114	NC_009445	CGA	2	6	7530	7535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337179
115	NC_009445	GCA	2	6	7701	7706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337179
116	NC_009445	AGG	2	6	7763	7768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146337179
117	NC_009445	CGA	2	6	7770	7775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337179
118	NC_009445	CGA	2	6	7779	7784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337179
119	NC_009445	CGT	2	6	7809	7814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337179
120	NC_009445	TCG	2	6	8056	8061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337180
121	NC_009445	GGT	2	6	8064	8069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337180
122	NC_009445	CAA	2	6	8102	8107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146337180
123	NC_009445	ATC	2	6	8124	8129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337180
124	NC_009445	GCT	2	6	8138	8143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337180
125	NC_009445	CGC	2	6	8282	8287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337180
126	NC_009445	GCG	2	6	8359	8364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337180
127	NC_009445	GCC	3	9	8375	8383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337180
128	NC_009445	GCG	2	6	8386	8391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337180
129	NC_009445	GCC	4	12	8401	8412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337180
130	NC_009445	AGC	2	6	8437	8442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337180
131	NC_009445	CGA	2	6	8516	8521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337180
132	NC_009445	CGC	2	6	8564	8569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337180
133	NC_009445	CGC	2	6	8594	8599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337180
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163	NC_009445	GCG	2	6	10544	10549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337182
164	NC_009445	TGG	2	6	10557	10562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337182
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253	NC_009445	GGC	2	6	16081	16086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337186
254	NC_009445	TCG	2	6	16191	16196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337186
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499	NC_009445	CGG	2	6	30925	30930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337200
500	NC_009445	CGG	2	6	30979	30984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337200

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