MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus suis 98HAH33

Total Repeats: 804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009443	TTGG	2	8	5624	5631	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009443	GAAG	2	8	9838	9845	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009443	TTAT	2	8	15774	15781	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009443	GTGA	2	8	17377	17384	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009443	AGCG	2	8	17548	17555	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_009443	AGCC	2	8	18430	18437	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009443	GTAA	2	8	19009	19016	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009443	TCAC	2	8	19066	19073	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009443	GCGA	2	8	19165	19172	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009443	ATTC	2	8	20030	20037	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009443	CTAA	2	8	20387	20394	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009443	TAGG	2	8	21041	21048	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009443	AATC	2	8	22187	22194	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_009443	GCGT	2	8	23098	23105	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009443	GGTC	2	8	24482	24489	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009443	AACA	2	8	24891	24898	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009443	TTTG	2	8	26286	26293	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009443	ATTT	2	8	27353	27360	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009443	AATA	2	8	43613	43620	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009443	AATA	2	8	46213	46220	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009443	CTCC	2	8	46239	46246	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
22	NC_009443	TTCG	2	8	46340	46347	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_009443	AAGC	2	8	46462	46469	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009443	ATCA	2	8	46734	46741	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_009443	GCTT	2	8	47872	47879	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009443	CCTA	2	8	47958	47965	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009443	GACC	2	8	52226	52233	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009443	ATAG	2	8	52294	52301	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009443	GAAT	2	8	52534	52541	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009443	ACTC	2	8	56608	56615	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009443	AGGG	2	8	57918	57925	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009443	AAGG	2	8	58385	58392	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009443	GTTA	2	8	59418	59425	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009443	AATA	2	8	60728	60735	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009443	AGTC	2	8	61321	61328	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009443	TATT	2	8	61367	61374	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009443	AAGT	2	8	71372	71379	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009443	GTTT	2	8	71451	71458	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009443	TAGG	2	8	71473	71480	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009443	GACT	2	8	74915	74922	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009443	TTGA	2	8	74939	74946	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009443	AAAC	2	8	77790	77797	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009443	CAAC	2	8	78958	78965	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_009443	ATCT	2	8	79008	79015	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009443	TAGA	2	8	79115	79122	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009443	TACA	2	8	81890	81897	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009443	GTGA	2	8	88076	88083	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009443	AGCG	2	8	88247	88254	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009443	AGCC	2	8	89129	89136	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009443	GTAA	2	8	89708	89715	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009443	TCAC	2	8	89765	89772	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009443	GCGA	2	8	89864	89871	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009443	ATTC	2	8	90731	90738	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_009443	CTAA	2	8	91088	91095	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_009443	TAGG	2	8	91744	91751	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009443	GCGT	2	8	93132	93139	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_009443	TAGT	2	8	95218	95225	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009443	ATGT	2	8	96831	96838	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009443	ATGT	2	8	96865	96872	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009443	ATAA	2	8	98409	98416	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009443	ACAA	2	8	98462	98469	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_009443	TATT	2	8	98951	98958	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009443	TAAA	2	8	98996	99003	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009443	TGCT	2	8	100793	100800	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_009443	CTTT	2	8	100856	100863	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009443	GCTG	2	8	101053	101060	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_009443	TTTA	2	8	101271	101278	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009443	TACT	2	8	101382	101389	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_009443	TTAA	2	8	101454	101461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009443	TGGT	2	8	101556	101563	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009443	TCTT	2	8	104984	104991	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_009443	TCTT	2	8	110520	110527	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_009443	ATGG	2	8	114235	114242	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009443	GAAA	2	8	118103	118110	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009443	AACT	2	8	125529	125536	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_009443	TTTG	2	8	129147	129154	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009443	TCTA	2	8	129520	129527	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_009443	CAAT	2	8	136922	136929	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_009443	TCTA	2	8	139382	139389	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_009443	ACCT	2	8	139391	139398	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_009443	AAAC	2	8	139807	139814	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_009443	AAAT	2	8	140138	140145	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009443	TTTG	2	8	140168	140175	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009443	ATAG	2	8	140204	140211	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009443	TTTG	2	8	145826	145833	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009443	GTCT	2	8	150530	150537	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_009443	AAAG	2	8	151061	151068	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009443	TAGT	2	8	162006	162013	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009443	ATAA	2	8	162233	162240	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009443	GGTA	2	8	166144	166151	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009443	TAGA	2	8	168852	168859	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009443	CGGT	2	8	169809	169816	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_009443	TGTA	2	8	170279	170286	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009443	GAAA	2	8	170352	170359	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009443	GTAG	2	8	170360	170367	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009443	TGAA	2	8	176886	176893	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009443	TTGG	2	8	177039	177046	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009443	AAGT	2	8	177112	177119	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009443	GACA	2	8	177284	177291	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_009443	CTTG	2	8	177855	177862	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_009443	CTTA	2	8	178133	178140	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_009443	TTCA	2	8	178321	178328	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_009443	AAAT	2	8	191008	191015	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009443	AAAT	2	8	191070	191077	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009443	TAAA	2	8	192951	192958	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009443	TAAA	2	8	193693	193700	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009443	GTTG	2	8	195586	195593	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009443	AAAT	3	12	196889	196900	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009443	TAAA	2	8	196923	196930	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009443	ATTT	2	8	200248	200255	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009443	ATAG	2	8	200279	200286	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009443	ATTT	2	8	200295	200302	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009443	ATTT	2	8	200316	200323	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009443	TAAT	2	8	200392	200399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009443	AAAT	2	8	200569	200576	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009443	CATC	2	8	208722	208729	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_009443	TTGT	2	8	213565	213572	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009443	GAGT	2	8	216202	216209	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009443	ATTG	2	8	216387	216394	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009443	TTTA	2	8	216433	216440	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009443	GAAT	2	8	217619	217626	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009443	ATAG	2	8	222648	222655	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009443	ACTT	2	8	227264	227271	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_009443	TTTA	2	8	230089	230096	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009443	AACG	2	8	231074	231081	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_009443	ACTG	2	8	235992	235999	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_009443	CAAA	2	8	238478	238485	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_009443	GTTT	2	8	240817	240824	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009443	AAGA	2	8	240839	240846	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009443	ATAA	2	8	252304	252311	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009443	GCTG	2	8	260421	260428	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_009443	GGAA	2	8	261299	261306	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009443	AGAA	2	8	266284	266291	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009443	CAAA	2	8	266332	266339	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_009443	TAGG	2	8	269317	269324	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009443	TTGT	2	8	269422	269429	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009443	TCTA	2	8	269507	269514	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_009443	ATTT	2	8	271068	271075	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009443	GTTT	2	8	271101	271108	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009443	TTGG	2	8	274663	274670	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009443	CTTT	2	8	294625	294632	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_009443	GTCA	2	8	298045	298052	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_009443	GGTT	2	8	298774	298781	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009443	AAAG	2	8	301692	301699	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009443	TTAT	2	8	301705	301712	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009443	GAAT	2	8	306634	306641	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009443	TTGT	2	8	313617	313624	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009443	AAAG	2	8	317163	317170	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009443	CAAA	2	8	325375	325382	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_009443	TTTC	2	8	325415	325422	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_009443	ATGG	2	8	325569	325576	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_009443	GTGA	2	8	326948	326955	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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