MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 816

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009442	TTGG	2	8	5627	5634	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009442	TTAT	2	8	15777	15784	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009442	AAAT	2	8	16631	16638	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009442	GTGA	2	8	17380	17387	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009442	AGCG	2	8	17551	17558	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_009442	AGCC	2	8	18433	18440	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009442	GTAA	2	8	19012	19019	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009442	TCAC	2	8	19069	19076	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009442	GCGA	2	8	19168	19175	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009442	ATTC	2	8	20034	20041	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009442	CTAA	2	8	20389	20396	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009442	TAGG	2	8	21045	21052	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009442	AATC	2	8	22192	22199	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_009442	GCGT	2	8	23103	23110	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009442	GGTC	2	8	24487	24494	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009442	AACA	2	8	24896	24903	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009442	TTTG	2	8	26291	26298	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009442	ATTT	2	8	27354	27361	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009442	AATA	2	8	43615	43622	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009442	AATA	2	8	46215	46222	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009442	CTCC	2	8	46241	46248	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
22	NC_009442	TTCG	2	8	46342	46349	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_009442	AAGC	2	8	46464	46471	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009442	ATCA	2	8	46736	46743	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_009442	GACC	2	8	52231	52238	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009442	ATAG	2	8	52299	52306	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009442	GAAT	2	8	52539	52546	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009442	ACTC	2	8	56612	56619	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009442	AGGG	2	8	57922	57929	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009442	AAGG	2	8	58389	58396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009442	GTTA	2	8	59422	59429	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009442	AATA	2	8	60732	60739	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009442	AAGT	2	8	71377	71384	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009442	GTTT	2	8	71456	71463	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009442	TAGG	2	8	71478	71485	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009442	GACT	2	8	74919	74926	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009442	TTGA	2	8	74943	74950	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009442	AAAC	2	8	77793	77800	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009442	CAAC	2	8	78962	78969	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009442	ATCT	2	8	79012	79019	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009442	TAGA	2	8	79119	79126	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009442	TACA	2	8	81894	81901	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009442	GTGA	2	8	88169	88176	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009442	AGCG	2	8	88340	88347	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009442	AGCC	2	8	89222	89229	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009442	GTAA	2	8	89801	89808	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009442	TCAC	2	8	89858	89865	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_009442	GCGA	2	8	89957	89964	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009442	ATTC	2	8	90823	90830	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_009442	CTAA	2	8	91179	91186	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_009442	TAGG	2	8	91835	91842	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009442	GCGT	2	8	93223	93230	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009442	TAGT	2	8	95307	95314	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009442	ATGT	2	8	96920	96927	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009442	ATGT	2	8	96954	96961	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009442	ATAA	2	8	98498	98505	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009442	ACAA	2	8	98551	98558	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009442	TATT	2	8	99040	99047	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009442	TAAA	2	8	99085	99092	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009442	TGCT	2	8	100882	100889	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009442	CTTT	2	8	100945	100952	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_009442	GCTG	2	8	101142	101149	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_009442	TTTA	2	8	101360	101367	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009442	TACT	2	8	101471	101478	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_009442	TTAA	2	8	101543	101550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009442	TCTT	2	8	105075	105082	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_009442	TCTT	2	8	110614	110621	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_009442	ATGG	2	8	114329	114336	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009442	GAAA	2	8	118197	118204	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009442	AACT	2	8	125626	125633	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_009442	TTTG	2	8	129244	129251	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009442	TCTA	2	8	129617	129624	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_009442	CAAT	2	8	137021	137028	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_009442	TCTA	2	8	139481	139488	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_009442	ACCT	2	8	139490	139497	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009442	AAAC	2	8	139906	139913	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009442	AAAT	2	8	140237	140244	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009442	TTTG	2	8	140267	140274	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009442	ATAG	2	8	140303	140310	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009442	ATGT	2	8	142420	142427	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009442	TATT	2	8	142634	142641	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009442	TTTG	2	8	145924	145931	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009442	ACTT	2	8	146851	146858	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_009442	GTCT	2	8	150626	150633	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_009442	AAAG	2	8	151157	151164	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009442	TAGT	2	8	162104	162111	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009442	ATAA	2	8	162331	162338	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009442	GGTA	2	8	166242	166249	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009442	TAGA	2	8	168949	168956	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009442	TGTA	2	8	170368	170375	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009442	GAAA	2	8	170441	170448	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009442	GTAG	2	8	170449	170456	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009442	TGAA	2	8	177025	177032	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009442	TTGG	2	8	177178	177185	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009442	AAGT	2	8	177251	177258	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009442	GACA	2	8	177423	177430	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_009442	CTTG	2	8	177994	178001	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_009442	CTTA	2	8	178272	178279	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_009442	AAAT	2	8	191148	191155	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009442	AAAT	2	8	191210	191217	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009442	TCAG	2	8	192831	192838	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_009442	TAAA	2	8	193097	193104	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009442	TAAA	2	8	193840	193847	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009442	GTTG	2	8	195739	195746	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009442	AAAT	2	8	196457	196464	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009442	AAAT	3	12	197043	197054	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009442	TAAA	2	8	197077	197084	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009442	ATTT	2	8	200402	200409	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009442	ATAG	2	8	200433	200440	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009442	ATTT	2	8	200449	200456	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009442	ATTT	2	8	200470	200477	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009442	CATC	2	8	208877	208884	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_009442	TTGT	2	8	213721	213728	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009442	GAGT	2	8	216357	216364	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009442	ATTG	2	8	216542	216549	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009442	TTTA	2	8	216588	216595	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009442	GAAT	2	8	217774	217781	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009442	ATAG	2	8	222803	222810	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009442	ACTT	2	8	227419	227426	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_009442	TTTA	2	8	230245	230252	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009442	AGAA	2	8	230581	230588	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009442	AACG	2	8	231230	231237	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_009442	TGGA	2	8	231926	231933	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009442	GTCA	2	8	233393	233400	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_009442	ACTG	2	8	236147	236154	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_009442	GTTT	2	8	240970	240977	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009442	AAGA	2	8	240992	240999	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009442	AAAT	2	8	252431	252438	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009442	ATAA	2	8	252460	252467	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009442	GGAA	2	8	257199	257206	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009442	TAGT	2	8	257279	257286	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009442	GCTG	2	8	260567	260574	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_009442	GGAA	2	8	261445	261452	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009442	AGAA	2	8	266430	266437	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009442	CAAA	2	8	266478	266485	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_009442	GAAA	2	8	266687	266694	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009442	TAGG	2	8	269463	269470	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009442	TTGT	2	8	269568	269575	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009442	TCTA	2	8	269653	269660	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_009442	ATTT	2	8	271215	271222	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009442	GTTT	2	8	271248	271255	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009442	CTTT	2	8	294771	294778	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_009442	GTCA	2	8	298191	298198	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_009442	GGTT	2	8	298920	298927	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009442	AAAG	2	8	301837	301844	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009442	TTAT	2	8	301850	301857	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009442	GAAT	2	8	306779	306786	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009442	TTGT	2	8	313762	313769	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009442	CAAT	2	8	314885	314892	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_009442	ATTT	2	8	317120	317127	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009442	AAAG	2	8	317310	317317	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_009442	CAAA	2	8	325531	325538	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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