MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 2922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009442	TCA	2	6	1454	1459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009442	ACT	2	6	1482	1487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009442	ATA	2	6	1507	1512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009442	ATA	2	6	2665	2670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009442	ACT	2	6	3863	3868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009442	GAG	2	6	3938	3943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009442	ATT	2	6	4288	4293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009442	ATT	2	6	4302	4307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009442	TCG	2	6	4418	4423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009442	TTC	2	6	5533	5538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009442	GTT	2	6	5539	5544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009442	GAT	2	6	5618	5623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009442	AAT	2	6	9765	9770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009442	AGG	2	6	10526	10531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009442	AAC	2	6	13086	13091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009442	CTA	2	6	13647	13652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009442	CAA	2	6	15948	15953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_009442	ATA	2	6	16625	16630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009442	TAA	2	6	16723	16728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009442	GGC	2	6	17008	17013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_009442	GCA	2	6	17327	17332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009442	CGC	2	6	17374	17379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_009442	TGT	2	6	17413	17418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009442	AGA	2	6	17422	17427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009442	AGA	2	6	17434	17439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009442	CAG	2	6	17496	17501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009442	GGA	2	6	17686	17691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009442	GAA	2	6	17950	17955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009442	GGT	2	6	18024	18029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009442	GTC	2	6	18038	18043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009442	CAT	2	6	18106	18111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009442	TAA	2	6	18141	18146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009442	GGA	2	6	18150	18155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009442	ATC	2	6	18174	18179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_009442	CGC	2	6	18340	18345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_009442	CAC	2	6	18385	18390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_009442	GAT	2	6	18456	18461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009442	CCT	2	6	18512	18517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_009442	TCT	2	6	18547	18552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009442	AGG	2	6	18613	18618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009442	AAC	2	6	18648	18653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_009442	GTT	2	6	18658	18663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009442	ATC	2	6	18851	18856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009442	AGT	2	6	18859	18864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009442	ACG	2	6	18989	18994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009442	TAG	2	6	19160	19165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009442	AGG	2	6	19182	19187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009442	GAG	2	6	19195	19200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009442	CTC	2	6	19205	19210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_009442	AGA	2	6	19247	19252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009442	TCG	2	6	19350	19355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009442	GGA	2	6	19363	19368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009442	ACA	2	6	19481	19486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009442	ATG	2	6	19548	19553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009442	TAT	2	6	19613	19618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009442	GGA	2	6	19681	19686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009442	ACC	2	6	19947	19952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_009442	AAT	2	6	19967	19972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009442	AGC	2	6	20027	20032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009442	AAG	2	6	20164	20169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009442	GAG	2	6	20179	20184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009442	ACA	2	6	20334	20339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009442	GAT	2	6	20738	20743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009442	AGG	2	6	20783	20788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009442	CGG	2	6	20829	20834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009442	TAC	2	6	21099	21104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_009442	CCT	2	6	21187	21192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_009442	GGT	2	6	21323	21328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009442	TCG	2	6	21438	21443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009442	CGT	2	6	21518	21523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009442	AGT	2	6	21909	21914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009442	CAG	2	6	21961	21966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009442	AGT	2	6	21987	21992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009442	ACC	2	6	22510	22515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_009442	CGT	2	6	22547	22552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009442	CGC	2	6	22940	22945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_009442	GGA	2	6	23044	23049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009442	TCC	2	6	23127	23132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_009442	CTA	2	6	23137	23142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_009442	AGC	2	6	23154	23159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009442	TCG	2	6	23168	23173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_009442	CGG	2	6	23280	23285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_009442	TAT	2	6	23328	23333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009442	GGT	2	6	23386	23391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009442	ATT	2	6	24497	24502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009442	ATT	2	6	24572	24577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009442	CTA	2	6	24637	24642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_009442	TCT	2	6	24676	24681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_009442	TAG	2	6	24727	24732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009442	TTA	2	6	24751	24756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009442	TAA	2	6	24815	24820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009442	ATT	2	6	24872	24877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009442	TAA	2	6	24917	24922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009442	AGG	2	6	26343	26348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009442	CTT	2	6	27342	27347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_009442	TAT	2	6	27370	27375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009442	AAC	2	6	30629	30634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009442	TGT	2	6	30643	30648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009442	GGA	2	6	42748	42753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009442	TTA	2	6	42788	42793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009442	GAA	2	6	44091	44096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009442	AGG	2	6	46767	46772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009442	TAT	2	6	46828	46833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009442	TCG	2	6	46846	46851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_009442	GTC	2	6	46854	46859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_009442	ATT	2	6	46888	46893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009442	ATT	2	6	46931	46936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009442	AAG	2	6	46938	46943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009442	ATC	2	6	46971	46976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_009442	CGC	2	6	46989	46994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_009442	GTC	2	6	46996	47001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009442	TAA	3	9	52259	52267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009442	TGA	2	6	52278	52283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009442	TAA	2	6	55314	55319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009442	AAG	2	6	55343	55348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009442	GAA	2	6	56335	56340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009442	GTC	2	6	56416	56421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_009442	GAA	2	6	56448	56453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009442	ATT	2	6	56458	56463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009442	ATG	2	6	56488	56493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009442	AAT	2	6	56513	56518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009442	ATG	2	6	56584	56589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009442	AGG	2	6	56705	56710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009442	CAA	2	6	57988	57993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_009442	GTT	2	6	58007	58012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009442	AGT	2	6	58138	58143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009442	TGA	2	6	58346	58351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009442	ATA	2	6	60877	60882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009442	GAA	2	6	60902	60907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009442	AGG	2	6	62473	62478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009442	ATT	2	6	62524	62529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009442	ATG	2	6	65333	65338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009442	AAT	2	6	65557	65562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009442	CTA	2	6	67684	67689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_009442	GTT	2	6	68894	68899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009442	TAA	2	6	68942	68947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009442	ATA	2	6	69019	69024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009442	TAA	2	6	69039	69044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009442	AAT	2	6	69513	69518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009442	AAG	2	6	69551	69556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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442	NC_009442	ATT	2	6	240859	240864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_009442	AGA	2	6	240890	240895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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