MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Flavobacterium johnsoniae UW101 chromosome

Total Repeats: 431

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009441	GGTACT	2	12	25644	25655	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_009441	AAAACT	2	12	29565	29576	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_009441	GGTTTG	2	12	29977	29988	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009441	ATTGTA	2	12	58016	58027	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009441	TAATTT	2	12	64767	64778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009441	TAAAAT	2	12	73920	73931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009441	TCAATT	2	12	90775	90786	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_009441	ATTGAT	2	12	90897	90908	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009441	TTGAAA	2	12	90911	90922	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009441	CAATAT	2	12	135065	135076	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_009441	TTTTTG	2	12	140695	140706	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009441	TCTGTA	2	12	150177	150188	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_009441	AAAATA	2	12	163827	163838	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009441	TAGAAA	2	12	177290	177301	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009441	AATTGA	2	12	184411	184422	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009441	AAGACA	2	12	185983	185994	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_009441	ATGAAA	2	12	187898	187909	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009441	GACTTC	2	12	274751	274762	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009441	TTAAAA	2	12	283178	283189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009441	TAAAAT	2	12	346351	346362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009441	TAAAAA	2	12	396111	396122	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009441	CAAAAA	2	12	407840	407851	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_009441	AAACAC	2	12	413165	413176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009441	ATTTCT	2	12	438098	438109	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_009441	ATCTTA	2	12	449848	449859	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_009441	GACTGA	2	12	465622	465633	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_009441	CGATAA	2	12	473030	473041	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_009441	ACAAAA	2	12	500430	500441	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_009441	GGTACT	2	12	501984	501995	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_009441	AAAACT	2	12	505905	505916	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_009441	CAATTG	2	12	507740	507751	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_009441	ATTTTT	2	12	516397	516408	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009441	TGTTTT	2	12	534054	534065	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009441	TTTTAA	2	12	563277	563288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009441	TCAAAA	2	12	618050	618061	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_009441	AAATTC	2	12	687702	687713	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_009441	AATATA	2	12	689785	689796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009441	TGAAAT	2	12	691196	691207	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009441	GATTTT	2	12	693410	693421	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009441	CCCCAA	2	12	698869	698880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_009441	ATCAAA	2	12	704698	704709	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_009441	TTTCTA	2	12	717331	717342	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_009441	GTTTGA	2	12	740772	740783	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009441	ATACAA	2	12	747069	747080	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_009441	TAAAAA	2	12	752220	752231	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009441	AATTTA	2	12	753284	753295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009441	TTGATT	2	12	761121	761132	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009441	TAAAAA	2	12	763920	763931	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009441	ATTTTT	2	12	804469	804480	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009441	AAATTC	2	12	811124	811135	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_009441	ACTGAG	2	12	845940	845951	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_009441	TAAATT	2	12	854638	854649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009441	TTTTAT	2	12	882603	882614	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009441	CAAAAA	2	12	912465	912476	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_009441	TGAAAT	2	12	922854	922865	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009441	TGCAAA	2	12	947266	947277	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_009441	TGCAAA	2	12	947915	947926	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_009441	TAAATG	2	12	948798	948809	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009441	CGAAGT	2	12	967478	967489	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_009441	GACAAG	2	12	979894	979905	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_009441	AAAAAG	2	12	979915	979926	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009441	AATCAA	2	12	1011345	1011356	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_009441	ACTTTT	2	12	1030987	1030998	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_009441	ATTTTT	2	12	1038559	1038570	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009441	TCGTTA	2	12	1039134	1039145	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_009441	GTTTTT	2	12	1051387	1051398	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009441	TAAAAA	2	12	1056747	1056758	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009441	AAAATT	2	12	1062900	1062911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009441	CAAAGA	2	12	1074065	1074076	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_009441	AACCTG	2	12	1074135	1074146	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009441	TTTTCA	2	12	1078139	1078150	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_009441	AGAAAA	2	12	1078694	1078705	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009441	TTTTAA	2	12	1079000	1079011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009441	CAATGG	2	12	1083377	1083388	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_009441	ATCAAT	2	12	1083394	1083405	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_009441	GCAATG	3	18	1083407	1083424	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_009441	CAATGG	2	12	1083438	1083449	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_009441	TCAATT	2	12	1083456	1083467	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_009441	TTAAAA	2	12	1089453	1089464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009441	AACGAG	2	12	1123348	1123359	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_009441	AAACAA	2	12	1130233	1130244	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_009441	TTTTAG	2	12	1139988	1139999	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009441	CAAAAA	2	12	1141021	1141032	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_009441	ATATTT	2	12	1153080	1153091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009441	TTGATA	2	12	1162789	1162800	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009441	CTTTTT	2	12	1182071	1182082	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_009441	TTAAAA	2	12	1207217	1207228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009441	CCTAAT	2	12	1214041	1214052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_009441	TAATTG	2	12	1258518	1258529	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009441	CCGGAG	2	12	1273957	1273968	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009441	TCGTTT	2	12	1287192	1287203	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_009441	ATTTTG	2	12	1292463	1292474	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009441	CAAAAA	2	12	1300270	1300281	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_009441	AAAATA	2	12	1318036	1318047	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009441	GTTTTT	2	12	1329053	1329064	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009441	ACTAAA	2	12	1331310	1331321	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_009441	TTCAAA	2	12	1412514	1412525	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_009441	AGATTT	2	12	1416742	1416753	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009441	TTAATA	2	12	1423470	1423481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009441	TTATTC	2	12	1427371	1427382	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_009441	TTGTTT	2	12	1428738	1428749	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009441	TTTGAC	2	12	1460953	1460964	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_009441	TTTTTG	2	12	1466711	1466722	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009441	CTTTTT	2	12	1491877	1491888	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_009441	ATTTCT	2	12	1569229	1569240	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_009441	GTTTTT	2	12	1571210	1571221	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009441	ATTTTA	2	12	1596093	1596104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009441	CAAACT	2	12	1604407	1604418	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_009441	CAAAAA	2	12	1617421	1617432	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_009441	TATTGA	2	12	1624416	1624427	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009441	AACCAA	2	12	1633042	1633053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009441	TAAATT	2	12	1633513	1633524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009441	AAACCA	2	12	1633762	1633773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_009441	TGATTT	2	12	1648523	1648534	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009441	CAAAAA	2	12	1653858	1653869	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_009441	ATCAAT	2	12	1664686	1664697	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_009441	CAATAT	2	12	1664724	1664735	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_009441	GTTTTT	2	12	1673559	1673570	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009441	TAAAAA	2	12	1675821	1675832	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009441	AATTTT	2	12	1683133	1683144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009441	TAAAAA	2	12	1688508	1688519	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009441	TAAAAG	2	12	1692658	1692669	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009441	AACCAA	2	12	1694028	1694039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_009441	AAGAAA	2	12	1731693	1731704	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009441	ATGAAA	2	12	1751774	1751785	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009441	ATATTA	2	12	1815508	1815519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009441	TTTTTA	2	12	1832483	1832494	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009441	TTTTAC	2	12	1834857	1834868	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_009441	GTTTTT	2	12	1848833	1848844	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009441	TGATTT	2	12	1870058	1870069	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009441	TAAAAA	2	12	1874079	1874090	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009441	GAATTT	2	12	1878316	1878327	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009441	AATATT	2	12	1884246	1884257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009441	AAGGCT	2	12	1980837	1980848	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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137	NC_009441	AGGTCG	2	12	1998033	1998044	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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139	NC_009441	TTTTAA	2	12	2049292	2049303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_009441	TTAATT	2	12	2061683	2061694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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145	NC_009441	CTTAGT	2	12	2152531	2152542	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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242	NC_009441	TTTATT	2	12	3490768	3490779	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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246	NC_009441	TAATTA	2	12	3521904	3521915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
247	NC_009441	TTGAAG	2	12	3527928	3527939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
248	NC_009441	AGATTT	2	12	3528892	3528903	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
249	NC_009441	AAAGAC	2	12	3533706	3533717	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
250	NC_009441	TTGAAA	2	12	3536589	3536600	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
251	NC_009441	GCCCGC	2	12	3577524	3577535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
252	NC_009441	TTCATT	2	12	3627202	3627213	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
253	NC_009441	TAATTA	2	12	3636148	3636159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_009441	CGTGAT	2	12	3637269	3637280	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
255	NC_009441	CTTCAT	2	12	3650740	3650751	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
256	NC_009441	AATATA	2	12	3650803	3650814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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373	NC_009441	GGTATT	2	12	5368893	5368904	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.