MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Flavobacterium johnsoniae UW101 chromosome

Total Repeats: 3005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009441	GGAAAT	2	12	2421	2432	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	146297769
2	NC_009441	TAAAAT	2	12	3410	3421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146297771
3	NC_009441	ATTCTG	2	12	17642	17653	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	146297785
4	NC_009441	AAAACT	2	12	18214	18225	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	146297785
5	NC_009441	TAAAAG	2	12	21129	21140	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	146297788
6	NC_009441	CTAAGT	2	12	36175	36186	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	146297796
7	NC_009441	GAAAAA	2	12	39776	39787	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	146297798
8	NC_009441	TAGTAT	2	12	40421	40432	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	146297799
9	NC_009441	CTGAAA	2	12	41884	41895	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	146297800
10	NC_009441	CAAAAA	2	12	42024	42035	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	146297800
11	NC_009441	TTCCTT	2	12	42388	42399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146297801
12	NC_009441	ATTTCT	2	12	44004	44015	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	146297802
13	NC_009441	TCCTTT	2	12	44618	44629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146297803
14	NC_009441	CTAATT	2	12	47859	47870	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	146297807
15	NC_009441	TTTTTC	2	12	50766	50777	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	146297810
16	NC_009441	GATTTT	2	12	53512	53523	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	146297812
17	NC_009441	TGAAGA	2	12	53967	53978	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	146297813
18	NC_009441	ACGGAG	2	12	54705	54716	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	146297814
19	NC_009441	AGGAAA	2	12	54955	54966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146297814
20	NC_009441	ACCATC	2	12	56611	56622	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	146297816
21	NC_009441	TCAAAA	2	12	56753	56764	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	146297816
22	NC_009441	CTGTTA	2	12	57324	57335	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	146297816
23	NC_009441	AAATTT	2	12	57966	57977	50 %	50 %	0 %	0 %	146297817
24	NC_009441	TTCAGA	2	12	61824	61835	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	146297822
25	NC_009441	CAAAAA	2	12	62771	62782	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	146297823
26	NC_009441	CTGAAA	2	12	70520	70531	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	146297831
27	NC_009441	TCAAAT	2	12	71632	71643	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	146297832
28	NC_009441	ATCTTT	2	12	71944	71955	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	146297833
29	NC_009441	ATCAAA	2	12	75846	75857	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	146297837
30	NC_009441	AAACAG	2	12	76327	76338	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	146297838
31	NC_009441	GAAAAA	2	12	77174	77185	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	146297838
32	NC_009441	TTTTGT	2	12	78542	78553	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	146297840
33	NC_009441	CTGAAC	2	12	81549	81560	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	146297840
34	NC_009441	TTCATT	2	12	83340	83351	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	146297842
35	NC_009441	TTTAAA	2	12	86510	86521	50 %	50 %	0 %	0 %	146297846
36	NC_009441	AATTAA	2	12	86767	86778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146297847
37	NC_009441	TCCTTA	2	12	86922	86933	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	146297847
38	NC_009441	ATTTTT	2	12	88373	88384	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	146297849
39	NC_009441	AAAATT	2	12	89464	89475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146297850
40	NC_009441	TCATTG	2	12	92832	92843	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	146297854
41	NC_009441	CAGTAT	2	12	92972	92983	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	146297854
42	NC_009441	AGTAAA	2	12	93835	93846	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	146297855
43	NC_009441	TATAAA	2	12	95218	95229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146297857
44	NC_009441	TCCTCA	2	12	99308	99319	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	146297859
45	NC_009441	TGCATT	2	12	102031	102042	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	146297864
46	NC_009441	TATGGA	2	12	105869	105880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146297867
47	NC_009441	ATTTAT	2	12	106334	106345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297868
48	NC_009441	ACTTTT	2	12	110681	110692	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	146297872
49	NC_009441	TTTGTG	2	12	112014	112025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146297872
50	NC_009441	ATTGAA	2	12	112548	112559	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	146297873
51	NC_009441	GTAAAA	2	12	114027	114038	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	146297874
52	NC_009441	GCAAAA	2	12	115706	115717	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	146297877
53	NC_009441	GCTTTA	2	12	117387	117398	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	146297878
54	NC_009441	CAATTT	2	12	123152	123163	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	146297883
55	NC_009441	CCATAT	2	12	124160	124171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146297884
56	NC_009441	TGTTCT	2	12	124717	124728	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	146297884
57	NC_009441	GACTTC	2	12	125313	125324	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146297884
58	NC_009441	AAAAAC	2	12	125565	125576	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	146297884
59	NC_009441	AACAAA	2	12	128212	128223	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	146297887
60	NC_009441	CGAAAT	2	12	129735	129746	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	146297888
61	NC_009441	ATTCTA	2	12	131110	131121	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	146297889
62	NC_009441	AAGTGA	2	12	131129	131140	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	146297889
63	NC_009441	ATCCCA	2	12	131168	131179	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	146297889
64	NC_009441	TAAACC	2	12	133728	133739	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	146297892
65	NC_009441	GCAAAT	2	12	134080	134091	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	146297892
66	NC_009441	TAAAAG	2	12	136096	136107	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	146297895
67	NC_009441	GACCAT	2	12	138986	138997	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	146297896
68	NC_009441	TAGATT	2	12	142289	142300	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	146297900
69	NC_009441	TTTATA	2	12	143257	143268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297901
70	NC_009441	TTGAAG	2	12	144763	144774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146297903
71	NC_009441	AAAGAG	2	12	145581	145592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146297903
72	NC_009441	TTTTAA	2	12	149837	149848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297909
73	NC_009441	TTAGAA	2	12	150767	150778	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	146297911
74	NC_009441	AAAGAA	2	12	153665	153676	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	146297915
75	NC_009441	AAATTG	2	12	153907	153918	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	146297915
76	NC_009441	ACAACC	2	12	153984	153995	50 %	0 %	0 %	50 %	146297915
77	NC_009441	TCTTCA	2	12	158133	158144	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	146297918
78	NC_009441	AACCGT	2	12	165549	165560	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	146297925
79	NC_009441	ATATTT	2	12	165772	165783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297925
80	NC_009441	AATTGA	2	12	171484	171495	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	146297929
81	NC_009441	AAAACA	2	12	173028	173039	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	146297932
82	NC_009441	TGTCCA	2	12	189646	189657	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146297949
83	NC_009441	ATCGTA	2	12	190282	190293	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	146297949
84	NC_009441	TAATGC	2	12	190540	190551	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	146297949
85	NC_009441	TGTAGC	2	12	192009	192020	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	146297950
86	NC_009441	TTAAGG	2	12	195253	195264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146297951
87	NC_009441	TCTGAA	2	12	199711	199722	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	146297956
88	NC_009441	GAAAAT	2	12	199752	199763	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	146297956
89	NC_009441	TTACGA	2	12	201700	201711	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	146297956
90	NC_009441	TTGGAT	2	12	203948	203959	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	146297957
91	NC_009441	TGAATT	2	12	203960	203971	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	146297957
92	NC_009441	AAAAGA	2	12	205810	205821	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	146297960
93	NC_009441	AATCAA	2	12	206060	206071	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	146297960
94	NC_009441	GAATTT	2	12	207227	207238	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	146297961
95	NC_009441	TGACAA	2	12	207658	207669	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	146297961
96	NC_009441	TTAAAT	2	12	209196	209207	50 %	50 %	0 %	0 %	146297963
97	NC_009441	ATTGCT	2	12	214069	214080	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	146297967
98	NC_009441	CTAAAA	2	12	220771	220782	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	146297974
99	NC_009441	AATTGG	2	12	221520	221531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146297975
100	NC_009441	GAACCT	2	12	222810	222821	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	146297976
101	NC_009441	AACCAG	2	12	222853	222864	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	146297976
102	NC_009441	CAATAA	2	12	224489	224500	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	146297977
103	NC_009441	CTAAAG	2	12	224933	224944	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	146297978
104	NC_009441	GTTTTG	2	12	228336	228347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146297981
105	NC_009441	TTTAGA	2	12	229213	229224	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	146297982
106	NC_009441	AAGCCA	2	12	230434	230445	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	146297983
107	NC_009441	TTTGGT	2	12	231272	231283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146297983
108	NC_009441	ATTTGT	2	12	231581	231592	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	146297984
109	NC_009441	TTGAAA	2	12	232367	232378	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	146297985
110	NC_009441	TTTGCT	2	12	232681	232692	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	146297986
111	NC_009441	TTTCAA	2	12	233509	233520	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	146297986
112	NC_009441	AAAACA	2	12	234456	234467	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	146297988
113	NC_009441	ATGTTG	2	12	238790	238801	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	146297992
114	NC_009441	ACTTTT	2	12	241804	241815	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	146297994
115	NC_009441	GTTTTC	2	12	243762	243773	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	146297997
116	NC_009441	TTTTAA	2	12	246686	246697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146298000
117	NC_009441	CTCCAA	2	12	247760	247771	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	146298001
118	NC_009441	TTCTTT	2	12	248473	248484	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	146298002
119	NC_009441	GATTAA	2	12	250805	250816	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	146298003
120	NC_009441	AATATC	2	12	250823	250834	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	146298003
121	NC_009441	GCAAAA	2	12	251139	251150	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	146298003
122	NC_009441	AATGCA	2	12	252050	252061	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	146298005
123	NC_009441	TTCAAT	2	12	256328	256339	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	146298007
124	NC_009441	TGGCAA	2	12	257518	257529	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146298008
125	NC_009441	TTTGTT	2	12	257817	257828	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	146298008
126	NC_009441	TTAAAA	2	12	259661	259672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146298010
127	NC_009441	TTGTCC	2	12	265074	265085	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	146298013
128	NC_009441	TTCTTT	2	12	266514	266525	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	146298014
129	NC_009441	TTTCTT	2	12	266748	266759	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	146298014
130	NC_009441	TTCTTT	2	12	269055	269066	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	146298015
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134	NC_009441	TATCCT	2	12	273175	273186	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	146298016
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136	NC_009441	CAGCTT	2	12	278028	278039	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146298022
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139	NC_009441	GATCTC	2	12	283019	283030	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146298026
140	NC_009441	TGCTTT	2	12	286363	286374	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	146298030
141	NC_009441	AAAGAG	2	12	290692	290703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146298036
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148	NC_009441	GTTGCA	2	12	301123	301134	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	146298045
149	NC_009441	TTACAT	2	12	302686	302697	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	146298046
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220	NC_009441	GATGGT	2	12	414514	414525	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	146298167
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222	NC_009441	TCCATA	2	12	415485	415496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146298167
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229	NC_009441	CTTTTC	2	12	426369	426380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146298178
230	NC_009441	TAATGC	2	12	427261	427272	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	146298178
231	NC_009441	TGAATT	2	12	429417	429428	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	146298179
232	NC_009441	ACAATT	2	12	431848	431859	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	146298179
233	NC_009441	AAAACA	2	12	432417	432428	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	146298179
234	NC_009441	TGGTAT	2	12	432928	432939	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	146298179
235	NC_009441	CAAAAT	2	12	438644	438655	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	146298183
236	NC_009441	CTTATT	2	12	441767	441778	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	146298186
237	NC_009441	GAAGTT	2	12	446600	446611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146298190
238	NC_009441	TGAATC	2	12	448078	448089	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	146298193
239	NC_009441	TTGATA	2	12	448852	448863	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	146298193
240	NC_009441	GCTTTG	2	12	449241	449252	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	146298193
241	NC_009441	GGATGC	2	12	449558	449569	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	146298193
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245	NC_009441	TATTGA	2	12	458120	458131	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	146298204
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260	NC_009441	TCAATA	2	12	495813	495824	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	146298240
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263	NC_009441	CTTTCG	2	12	519242	519253	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	146298258
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344	NC_009441	TATGAT	2	12	665893	665904	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	146298369
345	NC_009441	TTTAGT	2	12	666406	666417	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	146298369
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462	NC_009441	CATCAG	2	12	854429	854440	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	146298535
463	NC_009441	ACTTTT	2	12	858783	858794	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	146298538
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