MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Flavobacterium johnsoniae UW101 chromosome

Total Repeats: 5683

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009441	TGATT	2	10	359	368	20 %	60 %	20 %	0 %	146297767
2	NC_009441	GTTTT	2	10	805	814	0 %	80 %	20 %	0 %	146297767
3	NC_009441	GAATG	2	10	1231	1240	40 %	20 %	40 %	0 %	146297768
4	NC_009441	TAGAT	2	10	1389	1398	40 %	40 %	20 %	0 %	146297768
5	NC_009441	AATCA	2	10	3266	3275	60 %	20 %	0 %	20 %	146297771
6	NC_009441	AAAGT	2	10	4917	4926	60 %	20 %	20 %	0 %	146297772
7	NC_009441	TAAAA	2	10	6030	6039	80 %	20 %	0 %	0 %	146297774
8	NC_009441	GCAAA	2	10	6741	6750	60 %	0 %	20 %	20 %	146297775
9	NC_009441	TTTGC	2	10	7428	7437	0 %	60 %	20 %	20 %	146297775
10	NC_009441	ATTTC	2	10	7874	7883	20 %	60 %	0 %	20 %	146297776
11	NC_009441	ACAAA	2	10	7987	7996	80 %	0 %	0 %	20 %	146297776
12	NC_009441	AATTT	2	10	8366	8375	40 %	60 %	0 %	0 %	146297776
13	NC_009441	AATAC	2	10	9259	9268	60 %	20 %	0 %	20 %	146297777
14	NC_009441	CAAAC	2	10	10306	10315	60 %	0 %	0 %	40 %	146297779
15	NC_009441	GGTTT	2	10	13917	13926	0 %	60 %	40 %	0 %	146297781
16	NC_009441	TAAAA	2	10	14445	14454	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009441	TAAAA	2	10	15502	15511	80 %	20 %	0 %	0 %	146297782
18	NC_009441	TCCAT	2	10	16044	16053	20 %	40 %	0 %	40 %	146297783
19	NC_009441	TTTTC	2	10	20244	20253	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_009441	AGTGT	2	10	20651	20660	20 %	40 %	40 %	0 %	146297787
21	NC_009441	TGAAA	2	10	20986	20995	60 %	20 %	20 %	0 %	146297788
22	NC_009441	ATCCC	2	10	23146	23155	20 %	20 %	0 %	60 %	146297789
23	NC_009441	TTAAA	2	10	24040	24049	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009441	TTCAA	2	10	25386	25395	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_009441	TTTTC	2	10	26001	26010	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_009441	TTCAG	2	10	27102	27111	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_009441	TCCGA	2	10	28107	28116	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_009441	CTACA	2	10	28722	28731	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_009441	TTACC	2	10	29142	29151	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_009441	TCAAT	2	10	29503	29512	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_009441	AATTA	2	10	30643	30652	60 %	40 %	0 %	0 %	146297790
32	NC_009441	TTGTA	2	10	31587	31596	20 %	60 %	20 %	0 %	146297790
33	NC_009441	ATTCA	2	10	33342	33351	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_009441	GTATT	2	10	36196	36205	20 %	60 %	20 %	0 %	146297796
35	NC_009441	CAAAA	2	10	36547	36556	80 %	0 %	0 %	20 %	146297796
36	NC_009441	TTTTA	2	10	37947	37956	20 %	80 %	0 %	0 %	146297797
37	NC_009441	GACTT	2	10	40163	40172	20 %	40 %	20 %	20 %	146297798
38	NC_009441	AAGTA	2	10	41738	41747	60 %	20 %	20 %	0 %	146297800
39	NC_009441	CAAAT	2	10	42101	42110	60 %	20 %	0 %	20 %	146297800
40	NC_009441	TTAAA	2	10	42219	42228	60 %	40 %	0 %	0 %	146297800
41	NC_009441	ACATA	2	10	42533	42542	60 %	20 %	0 %	20 %	146297801
42	NC_009441	TAAAA	2	10	42665	42674	80 %	20 %	0 %	0 %	146297801
43	NC_009441	TAATT	2	10	42699	42708	40 %	60 %	0 %	0 %	146297801
44	NC_009441	TTATT	2	10	44562	44571	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009441	ATCTA	2	10	46190	46199	40 %	40 %	0 %	20 %	146297806
46	NC_009441	TAAAA	2	10	46545	46554	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009441	GTAAT	2	10	48389	48398	40 %	40 %	20 %	0 %	146297808
48	NC_009441	TTGTA	2	10	48888	48897	20 %	60 %	20 %	0 %	146297808
49	NC_009441	CAATG	2	10	50013	50022	40 %	20 %	20 %	20 %	146297809
50	NC_009441	AAAAT	2	10	50836	50845	80 %	20 %	0 %	0 %	146297810
51	NC_009441	TAACA	2	10	51321	51330	60 %	20 %	0 %	20 %	146297810
52	NC_009441	AAATG	2	10	52672	52681	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009441	ACAAT	2	10	53295	53304	60 %	20 %	0 %	20 %	146297812
54	NC_009441	GCAAA	2	10	53540	53549	60 %	0 %	20 %	20 %	146297812
55	NC_009441	AACAG	2	10	53888	53897	60 %	0 %	20 %	20 %	146297813
56	NC_009441	CTTTT	2	10	56183	56192	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_009441	ACAAT	2	10	59040	59049	60 %	20 %	0 %	20 %	146297819
58	NC_009441	AAATT	2	10	59275	59284	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009441	CCAAT	2	10	60046	60055	40 %	20 %	0 %	40 %	146297820
60	NC_009441	AACAA	2	10	60837	60846	80 %	0 %	0 %	20 %	146297821
61	NC_009441	ATTTT	2	10	61275	61284	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009441	ATCCT	2	10	63965	63974	20 %	40 %	0 %	40 %	146297824
63	NC_009441	TTATT	2	10	64979	64988	20 %	80 %	0 %	0 %	146297825
64	NC_009441	ACAAA	2	10	65970	65979	80 %	0 %	0 %	20 %	146297827
65	NC_009441	ATCCA	2	10	68021	68030	40 %	20 %	0 %	40 %	146297828
66	NC_009441	TTTTG	2	10	70258	70267	0 %	80 %	20 %	0 %	146297830
67	NC_009441	TTTTA	2	10	70402	70411	20 %	80 %	0 %	0 %	146297831
68	NC_009441	AATTA	2	10	70452	70461	60 %	40 %	0 %	0 %	146297831
69	NC_009441	CAAAA	2	10	72921	72930	80 %	0 %	0 %	20 %	146297834
70	NC_009441	AAACA	2	10	76313	76322	80 %	0 %	0 %	20 %	146297838
71	NC_009441	AAATC	2	10	76880	76889	60 %	20 %	0 %	20 %	146297838
72	NC_009441	AAAAC	2	10	77266	77275	80 %	0 %	0 %	20 %	146297838
73	NC_009441	GAAGA	2	10	79739	79748	60 %	0 %	40 %	0 %	146297840
74	NC_009441	CGTAA	2	10	82009	82018	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_009441	ACAAA	2	10	84245	84254	80 %	0 %	0 %	20 %	146297843
76	NC_009441	GATTG	2	10	84972	84981	20 %	40 %	40 %	0 %	146297844
77	NC_009441	GATTA	2	10	85630	85639	40 %	40 %	20 %	0 %	146297845
78	NC_009441	AATTG	2	10	85973	85982	40 %	40 %	20 %	0 %	146297846
79	NC_009441	AAAAT	2	10	86004	86013	80 %	20 %	0 %	0 %	146297846
80	NC_009441	CAAAA	2	10	87341	87350	80 %	0 %	0 %	20 %	146297848
81	NC_009441	AAAGC	2	10	87528	87537	60 %	0 %	20 %	20 %	146297848
82	NC_009441	AAATA	2	10	88180	88189	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009441	TCGTT	2	10	89281	89290	0 %	60 %	20 %	20 %	146297849
84	NC_009441	AACTA	2	10	89694	89703	60 %	20 %	0 %	20 %	146297850
85	NC_009441	AGTTC	2	10	91294	91303	20 %	40 %	20 %	20 %	146297853
86	NC_009441	AAAAC	2	10	91641	91650	80 %	0 %	0 %	20 %	146297853
87	NC_009441	TCTTT	2	10	91965	91974	0 %	80 %	0 %	20 %	146297853
88	NC_009441	ACAAT	2	10	92881	92890	60 %	20 %	0 %	20 %	146297854
89	NC_009441	ATTTC	2	10	93457	93466	20 %	60 %	0 %	20 %	146297855
90	NC_009441	TTGGT	2	10	93662	93671	0 %	60 %	40 %	0 %	146297855
91	NC_009441	CTTTT	2	10	96051	96060	0 %	80 %	0 %	20 %	146297857
92	NC_009441	CTTTA	2	10	96235	96244	20 %	60 %	0 %	20 %	146297857
93	NC_009441	TTTCG	2	10	97956	97965	0 %	60 %	20 %	20 %	146297859
94	NC_009441	ATTTA	2	10	98647	98656	40 %	60 %	0 %	0 %	146297859
95	NC_009441	GTATT	2	10	99396	99405	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009441	TCAAA	2	10	100862	100871	60 %	20 %	0 %	20 %	146297862
97	NC_009441	AACAA	2	10	101647	101656	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_009441	TAAAA	2	10	102135	102144	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009441	CTTTT	2	10	102166	102175	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_009441	ATTTC	2	10	102284	102293	20 %	60 %	0 %	20 %	146297865
101	NC_009441	TTTTC	2	10	105318	105327	0 %	80 %	0 %	20 %	146297866
102	NC_009441	GAAAA	2	10	107352	107361	80 %	0 %	20 %	0 %	146297869
103	NC_009441	ACCAA	2	10	108060	108069	60 %	0 %	0 %	40 %	146297870
104	NC_009441	AAATC	2	10	111459	111468	60 %	20 %	0 %	20 %	146297872
105	NC_009441	ATTTA	2	10	114088	114097	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009441	ATTTG	2	10	114108	114117	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009441	TGGAA	2	10	116086	116095	40 %	20 %	40 %	0 %	146297877
108	NC_009441	AAATT	2	10	118144	118153	60 %	40 %	0 %	0 %	146297878
109	NC_009441	TAAAC	2	10	118255	118264	60 %	20 %	0 %	20 %	146297878
110	NC_009441	TATAC	2	10	118717	118726	40 %	40 %	0 %	20 %	146297879
111	NC_009441	TTTAA	2	10	118803	118812	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009441	TGAAA	2	10	119398	119407	60 %	20 %	20 %	0 %	146297880
113	NC_009441	CTATT	2	10	120591	120600	20 %	60 %	0 %	20 %	146297881
114	NC_009441	TATTT	2	10	121081	121090	20 %	80 %	0 %	0 %	146297881
115	NC_009441	CAGAA	2	10	121382	121391	60 %	0 %	20 %	20 %	146297881
116	NC_009441	TTTTA	2	10	121629	121638	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009441	AATCC	2	10	123884	123893	40 %	20 %	0 %	40 %	146297884
118	NC_009441	CAGGT	2	10	130016	130025	20 %	20 %	40 %	20 %	146297888
119	NC_009441	TTTCT	2	10	131392	131401	0 %	80 %	0 %	20 %	146297889
120	NC_009441	GTCCT	2	10	131435	131444	0 %	40 %	20 %	40 %	146297889
121	NC_009441	AAATC	2	10	131575	131584	60 %	20 %	0 %	20 %	146297889
122	NC_009441	CAGAT	2	10	132222	132231	40 %	20 %	20 %	20 %	146297890
123	NC_009441	AAATA	2	10	133437	133446	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009441	GTTAA	2	10	133465	133474	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009441	CCAAG	2	10	133681	133690	40 %	0 %	20 %	40 %	146297892
126	NC_009441	TTTAC	2	10	133780	133789	20 %	60 %	0 %	20 %	146297892
127	NC_009441	TACAC	2	10	134639	134648	40 %	20 %	0 %	40 %	146297893
128	NC_009441	AAATG	2	10	134686	134695	60 %	20 %	20 %	0 %	146297893
129	NC_009441	TTTGA	2	10	136773	136782	20 %	60 %	20 %	0 %	146297895
130	NC_009441	GTGTT	2	10	138118	138127	0 %	60 %	40 %	0 %	146297895
131	NC_009441	TCGAT	2	10	139076	139085	20 %	40 %	20 %	20 %	146297896
132	NC_009441	CATAA	2	10	139495	139504	60 %	20 %	0 %	20 %	146297897
133	NC_009441	ATCTA	2	10	140202	140211	40 %	40 %	0 %	20 %	146297897
134	NC_009441	CTGTG	2	10	140918	140927	0 %	40 %	40 %	20 %	146297898
135	NC_009441	AAATT	2	10	143320	143329	60 %	40 %	0 %	0 %	146297901
136	NC_009441	ATGAA	2	10	145492	145501	60 %	20 %	20 %	0 %	146297903
137	NC_009441	TATTT	2	10	145628	145637	20 %	80 %	0 %	0 %	146297903
138	NC_009441	TATAT	2	10	145732	145741	40 %	60 %	0 %	0 %	146297903
139	NC_009441	AAATT	2	10	145930	145939	60 %	40 %	0 %	0 %	146297903
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