MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Flavobacterium johnsoniae UW101 chromosome

Total Repeats: 1044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009441	TAAAA	2	10	14445	14454	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009441	TTTTC	2	10	20244	20253	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_009441	TTAAA	2	10	24040	24049	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009441	TTCAA	2	10	25386	25395	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_009441	TTTTC	2	10	26001	26010	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_009441	TTCAG	2	10	27102	27111	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_009441	TCCGA	2	10	28107	28116	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_009441	CTACA	2	10	28722	28731	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_009441	TTACC	2	10	29142	29151	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_009441	TCAAT	2	10	29503	29512	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_009441	ATTCA	2	10	33342	33351	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_009441	TTATT	2	10	44562	44571	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009441	TAAAA	2	10	46545	46554	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009441	AAATG	2	10	52672	52681	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009441	CTTTT	2	10	56183	56192	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_009441	AAATT	2	10	59275	59284	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009441	ATTTT	2	10	61275	61284	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009441	CGTAA	2	10	82009	82018	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_009441	AAATA	2	10	88180	88189	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009441	GTATT	2	10	99396	99405	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009441	AACAA	2	10	101647	101656	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_009441	TAAAA	2	10	102135	102144	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009441	CTTTT	2	10	102166	102175	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_009441	ATTTA	2	10	114088	114097	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009441	ATTTG	2	10	114108	114117	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009441	TTTAA	2	10	118803	118812	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009441	TTTTA	2	10	121629	121638	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009441	AAATA	2	10	133437	133446	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009441	GTTAA	2	10	133465	133474	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009441	CTAAA	2	10	147447	147456	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_009441	CTTTT	2	10	150068	150077	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_009441	AAATT	2	10	152634	152643	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009441	TTAAA	2	10	163858	163867	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009441	ATGGA	2	10	168192	168201	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009441	TAAAA	2	10	184288	184297	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009441	GTAGC	2	10	210759	210768	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_009441	AAAAT	2	10	225633	225642	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009441	TAATT	2	10	229086	229095	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009441	TATTT	2	10	235369	235378	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009441	CATAA	2	10	236770	236779	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_009441	ATTTC	2	10	236784	236793	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_009441	AAATG	2	10	238014	238023	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009441	TTGTA	2	10	255489	255498	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009441	TAAAT	2	10	267373	267382	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009441	TAAAA	2	10	268315	268324	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009441	AAATT	2	10	270824	270833	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009441	AATCA	2	10	270878	270887	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_009441	ATTGT	2	10	275845	275854	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009441	TTATT	2	10	276896	276905	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009441	ATTTT	2	10	278001	278010	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009441	TATTT	2	10	279382	279391	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009441	TAATC	2	10	283257	283266	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_009441	ATTTT	2	10	284147	284156	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009441	TTTGT	2	10	293346	293355	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009441	TAAAA	2	10	293502	293511	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009441	ATATG	2	10	303920	303929	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009441	TTTGA	2	10	350550	350559	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009441	AAATT	2	10	352780	352789	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009441	ATTCA	2	10	353671	353680	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_009441	TTTTA	2	10	360496	360505	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009441	AAAAT	2	10	372006	372015	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009441	AAAAT	2	10	379898	379907	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009441	CTTAT	2	10	386901	386910	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_009441	TCTAA	2	10	407661	407670	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_009441	AACAA	2	10	407723	407732	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_009441	TTTTG	2	10	436975	436984	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009441	TATTT	2	10	438116	438125	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009441	TGTTT	2	10	440173	440182	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009441	ATTTG	2	10	454927	454936	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009441	GTTTT	2	10	464180	464189	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009441	TTTTA	2	10	472872	472881	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009441	CTTTT	2	10	473975	473984	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_009441	TTTAG	2	10	479704	479713	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009441	TATCT	2	10	482544	482553	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_009441	AAACT	2	10	485608	485617	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_009441	CATTT	2	10	499955	499964	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_009441	TTCAA	2	10	501726	501735	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_009441	TTTTC	2	10	502341	502350	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_009441	TTCAG	2	10	503442	503451	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_009441	TCCGA	2	10	504447	504456	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_009441	CTACA	2	10	505062	505071	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_009441	TTACC	2	10	505482	505491	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_009441	TCAAT	2	10	505843	505852	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_009441	TTAAT	2	10	510511	510520	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009441	GTTTA	2	10	516445	516454	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009441	TTATT	2	10	519824	519833	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009441	TTTTA	2	10	535780	535789	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009441	TTATA	2	10	543185	543194	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009441	TAAAA	2	10	547613	547622	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009441	AAAGA	2	10	556218	556227	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009441	TTTTA	2	10	558459	558468	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009441	ACACA	2	10	579197	579206	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
93	NC_009441	TTATT	2	10	584957	584966	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009441	TTCTA	2	10	593470	593479	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_009441	ACAAA	2	10	594881	594890	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_009441	ATAAA	2	10	600392	600401	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009441	AAATC	2	10	611000	611009	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_009441	AATTA	2	10	628390	628399	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009441	TTTAA	2	10	635391	635400	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009441	GTTTT	2	10	636664	636673	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009441	AATAA	2	10	636820	636829	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009441	AAAAT	2	10	637003	637012	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009441	TTTGT	2	10	671615	671624	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009441	AGCTA	2	10	673247	673256	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_009441	AATTT	2	10	686653	686662	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009441	AAATT	2	10	687730	687739	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009441	ATATA	2	10	691269	691278	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009441	TAGAT	2	10	693232	693241	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009441	TAAAA	2	10	693294	693303	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009441	TTATT	2	10	698761	698770	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009441	TTAAT	2	10	704083	704092	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009441	TAAAA	2	10	709860	709869	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009441	TTAAT	2	10	717258	717267	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009441	TAAAA	2	10	717547	717556	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009441	TTAAT	2	10	721320	721329	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009441	TAAAA	2	10	722547	722556	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009441	TTAAA	2	10	728522	728531	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009441	AACAA	2	10	737371	737380	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_009441	TTATT	2	10	743781	743790	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009441	TTTAT	2	10	748256	748265	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009441	ACAAA	2	10	753434	753443	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_009441	GAAAA	2	10	753668	753677	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009441	AAACA	2	10	753697	753706	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_009441	ACAAA	2	10	753755	753764	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_009441	ATTTT	2	10	770829	770838	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009441	TAATT	2	10	771123	771132	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009441	TAAAA	2	10	776180	776189	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009441	ATGTT	2	10	807255	807264	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009441	ATTTT	2	10	817991	818000	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009441	ATTAC	2	10	821217	821226	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_009441	TTTAT	2	10	832697	832706	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009441	AAAAC	2	10	834944	834953	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_009441	TTTAA	2	10	837605	837614	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009441	TAAAT	2	10	839072	839081	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009441	TAAAA	2	10	845902	845911	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009441	CAAAG	2	10	846417	846426	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_009441	AATTC	2	10	848582	848591	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_009441	ATTTG	2	10	848624	848633	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009441	ACCAA	2	10	848768	848777	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
140	NC_009441	TGTGT	2	10	860100	860109	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009441	ATTTT	2	10	862056	862065	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009441	CTTAT	2	10	873854	873863	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_009441	CAATA	2	10	873960	873969	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_009441	TAAAA	2	10	903993	904002	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009441	ATTAA	2	10	931625	931634	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009441	AAATT	2	10	935289	935298	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009441	TTTTC	2	10	956520	956529	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_009441	TAAAT	2	10	962650	962659	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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