MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Flavobacterium johnsoniae UW101 chromosome

Total Repeats: 77891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009441	CAA	2	6	42	47	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009441	AAC	2	6	155	160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146297767
3	NC_009441	TGG	2	6	175	180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146297767
4	NC_009441	TAT	2	6	206	211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297767
5	NC_009441	TTA	2	6	288	293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297767
6	NC_009441	CCT	2	6	348	353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146297767
7	NC_009441	TGT	2	6	467	472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146297767
8	NC_009441	AGA	2	6	485	490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146297767
9	NC_009441	CAA	2	6	506	511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146297767
10	NC_009441	CCA	2	6	527	532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146297767
11	NC_009441	TAT	2	6	548	553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297767
12	NC_009441	GAA	2	6	675	680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146297767
13	NC_009441	GTT	2	6	708	713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146297767
14	NC_009441	GAC	2	6	714	719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146297767
15	NC_009441	AAT	2	6	753	758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146297767
16	NC_009441	AAC	2	6	783	788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146297767
17	NC_009441	TGA	2	6	815	820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146297767
18	NC_009441	ATT	2	6	960	965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297767
19	NC_009441	AGG	2	6	968	973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146297767
20	NC_009441	ACG	2	6	1111	1116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146297767
21	NC_009441	TAT	2	6	1262	1267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297768
22	NC_009441	ATG	2	6	1289	1294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146297768
23	NC_009441	AAC	2	6	1316	1321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146297768
24	NC_009441	AGA	2	6	1338	1343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146297768
25	NC_009441	CTT	2	6	1382	1387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146297768
26	NC_009441	TTA	2	6	1435	1440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297768
27	NC_009441	TGA	2	6	1590	1595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146297768
28	NC_009441	TGA	2	6	1629	1634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146297768
29	NC_009441	GCA	2	6	1660	1665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146297768
30	NC_009441	AAG	2	6	1700	1705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146297768
31	NC_009441	TGT	2	6	1707	1712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146297768
32	NC_009441	ATT	2	6	1731	1736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297768
33	NC_009441	ATT	2	6	1745	1750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009441	GAA	2	6	1960	1965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146297769
35	NC_009441	GAA	3	9	2023	2031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146297769
36	NC_009441	TAT	2	6	2040	2045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297769
37	NC_009441	ATT	2	6	2081	2086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297769
38	NC_009441	ATG	3	9	2135	2143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146297769
39	NC_009441	CGG	2	6	2256	2261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146297769
40	NC_009441	AAC	2	6	2280	2285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146297769
41	NC_009441	TTG	2	6	2315	2320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146297769
42	NC_009441	ATC	2	6	2464	2469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146297769
43	NC_009441	ATT	2	6	2581	2586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297770
44	NC_009441	GGC	2	6	2632	2637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146297770
45	NC_009441	GTT	2	6	2676	2681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146297770
46	NC_009441	TGT	2	6	2750	2755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146297770
47	NC_009441	TTC	2	6	2837	2842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146297770
48	NC_009441	AAC	2	6	2924	2929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146297770
49	NC_009441	ATT	2	6	2985	2990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297770
50	NC_009441	ATT	2	6	3011	3016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009441	ACA	2	6	3028	3033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009441	TAA	2	6	3147	3152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009441	ATT	2	6	3356	3361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297771
54	NC_009441	TAA	2	6	3668	3673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146297771
55	NC_009441	GGA	2	6	3678	3683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146297771
56	NC_009441	TTG	2	6	3699	3704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146297771
57	NC_009441	GGA	2	6	3711	3716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146297771
58	NC_009441	AAT	2	6	3846	3851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146297771
59	NC_009441	ATT	2	6	3894	3899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297771
60	NC_009441	GAT	2	6	3900	3905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146297771
61	NC_009441	TAT	2	6	4042	4047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297771
62	NC_009441	CTG	2	6	4069	4074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146297771
63	NC_009441	TCA	2	6	4079	4084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146297771
64	NC_009441	TAT	2	6	4214	4219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297771
65	NC_009441	TCT	2	6	4236	4241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146297771
66	NC_009441	ATT	2	6	4351	4356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297771
67	NC_009441	TGT	2	6	4403	4408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146297771
68	NC_009441	CTT	2	6	4456	4461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146297771
69	NC_009441	CAA	2	6	4580	4585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146297771
70	NC_009441	ATC	2	6	4825	4830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146297772
71	NC_009441	TGA	2	6	4837	4842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146297772
72	NC_009441	ATT	2	6	4945	4950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297772
73	NC_009441	TTA	2	6	4981	4986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297772
74	NC_009441	AAG	2	6	5213	5218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146297773
75	NC_009441	TTG	2	6	5245	5250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146297773
76	NC_009441	TTA	2	6	5376	5381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297773
77	NC_009441	GTT	2	6	5481	5486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146297773
78	NC_009441	GAT	2	6	5519	5524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146297773
79	NC_009441	TAT	2	6	5828	5833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297773
80	NC_009441	TTC	2	6	5913	5918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146297774
81	NC_009441	AAC	2	6	5974	5979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146297774
82	NC_009441	TTC	2	6	5990	5995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146297774
83	NC_009441	TTA	2	6	6119	6124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297774
84	NC_009441	GAA	2	6	6148	6153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146297774
85	NC_009441	AAG	2	6	6254	6259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146297774
86	NC_009441	ACA	2	6	6308	6313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146297774
87	NC_009441	TGC	2	6	6490	6495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146297775
88	NC_009441	TGA	2	6	6552	6557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146297775
89	NC_009441	ACG	2	6	6681	6686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146297775
90	NC_009441	ATT	2	6	6692	6697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297775
91	NC_009441	ATC	2	6	6836	6841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146297775
92	NC_009441	AAT	2	6	6842	6847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146297775
93	NC_009441	TCT	2	6	6904	6909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146297775
94	NC_009441	ATT	2	6	6926	6931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297775
95	NC_009441	GAA	2	6	6968	6973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146297775
96	NC_009441	TAT	2	6	7018	7023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297775
97	NC_009441	TCT	2	6	7028	7033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146297775
98	NC_009441	TGT	2	6	7180	7185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146297775
99	NC_009441	CTT	2	6	7299	7304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146297775
100	NC_009441	GAT	2	6	7325	7330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146297775
101	NC_009441	TAA	2	6	7350	7355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146297775
102	NC_009441	CTG	2	6	7461	7466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146297775
103	NC_009441	ATT	2	6	7511	7516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009441	TAT	2	6	7529	7534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009441	GAC	2	6	7591	7596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146297776
106	NC_009441	GGC	2	6	7627	7632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146297776
107	NC_009441	ACA	2	6	7723	7728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146297776
108	NC_009441	GAA	2	6	7795	7800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146297776
109	NC_009441	GCA	2	6	7864	7869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146297776
110	NC_009441	AAC	2	6	8022	8027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146297776
111	NC_009441	AAG	2	6	8097	8102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146297776
112	NC_009441	CAA	2	6	8165	8170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146297776
113	NC_009441	ATT	2	6	8187	8192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297776
114	NC_009441	ATC	2	6	8255	8260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146297776
115	NC_009441	AGC	2	6	8277	8282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146297776
116	NC_009441	TTA	2	6	8324	8329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297776
117	NC_009441	ATG	2	6	8416	8421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146297776
118	NC_009441	ATT	3	9	8670	8678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009441	ATT	2	6	8715	8720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297777
120	NC_009441	AGG	2	6	8729	8734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146297777
121	NC_009441	AAC	2	6	8750	8755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146297777
122	NC_009441	TAT	2	6	8820	8825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297777
123	NC_009441	TAA	2	6	8863	8868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146297777
124	NC_009441	ATT	2	6	8900	8905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297777
125	NC_009441	CGA	2	6	8984	8989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146297777
126	NC_009441	TCG	2	6	9116	9121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146297777
127	NC_009441	AAC	2	6	9182	9187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146297777
128	NC_009441	CAA	2	6	9220	9225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146297777
129	NC_009441	ATT	3	9	9240	9248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297777
130	NC_009441	TTG	2	6	9493	9498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146297778
131	NC_009441	TAT	2	6	9595	9600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297778
132	NC_009441	GAA	2	6	9604	9609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146297778
133	NC_009441	AAC	2	6	9635	9640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146297778
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