MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Metallosphaera sedula DSM 5348 chromosome

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009440	ATATTA	2	12	56617	56628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009440	GCTATA	2	12	99103	99114	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_009440	TGATAA	2	12	232960	232971	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009440	TTTTTA	2	12	283960	283971	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009440	ATTTTA	2	12	309499	309510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009440	TTAAAA	2	12	314031	314042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009440	TCAAAA	2	12	330448	330459	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_009440	TCTACA	2	12	338860	338871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009440	TCTAGT	2	12	343414	343425	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_009440	TAGCGT	2	12	392018	392029	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_009440	TAATTA	2	12	425991	426002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009440	GTGGTT	2	12	457270	457281	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009440	GCTGCA	2	12	458185	458196	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009440	GTACTT	2	12	486504	486515	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_009440	AGTTAA	2	12	503194	503205	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009440	GTTCTT	2	12	638223	638234	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_009440	ATCTTT	2	12	691663	691674	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_009440	TCCTCT	2	12	701279	701290	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_009440	TTAATT	2	12	701302	701313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009440	CTTTTA	2	12	752960	752971	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_009440	GGAAGT	2	12	772732	772743	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009440	CTCACC	2	12	772899	772910	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_009440	AGGGAT	2	12	788739	788750	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009440	CCTTAA	2	12	791239	791250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009440	CAATTT	2	12	899987	899998	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_009440	CTTATA	2	12	916198	916209	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_009440	TAGTTT	2	12	951667	951678	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009440	CAAATC	2	12	973342	973353	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_009440	TAAAAT	2	12	990174	990185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009440	GTAAAG	2	12	992281	992292	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009440	GTCTTA	2	12	1007035	1007046	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_009440	CGAGTA	2	12	1015962	1015973	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_009440	TTGATC	2	12	1027815	1027826	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_009440	TCCTGA	2	12	1064751	1064762	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_009440	AAAGAG	2	12	1087100	1087111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009440	TGGTAG	2	12	1089206	1089217	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009440	TCATTA	2	12	1089403	1089414	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_009440	CTGATG	2	12	1089914	1089925	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_009440	CATTTC	2	12	1104610	1104621	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009440	TCTGAT	2	12	1105312	1105323	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_009440	TTCTTT	2	12	1106858	1106869	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_009440	GAGAAA	2	12	1109588	1109599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009440	CTTCAG	2	12	1112957	1112968	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009440	CCACCT	2	12	1113985	1113996	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_009440	GTTCAT	2	12	1116603	1116614	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_009440	TACGTA	2	12	1154651	1154662	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_009440	CTGAAA	2	12	1155457	1155468	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_009440	TATTTT	2	12	1171544	1171555	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009440	TATAAT	2	12	1177844	1177855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009440	ACATGT	2	12	1188343	1188354	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_009440	TTTTAA	2	12	1207524	1207535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009440	ACTAAA	2	12	1218459	1218470	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_009440	AGTATA	2	12	1266480	1266491	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009440	CCCTCT	2	12	1271193	1271204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_009440	GAATCC	2	12	1287849	1287860	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009440	CGATAT	2	12	1344529	1344540	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_009440	AGCTGG	2	12	1349135	1349146	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_009440	TTATAA	2	12	1350868	1350879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009440	AAGATA	2	12	1368849	1368860	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009440	CGTCAC	2	12	1397098	1397109	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
61	NC_009440	TTCCTA	2	12	1397125	1397136	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009440	TATCCA	2	12	1441843	1441854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009440	CATCAC	2	12	1496528	1496539	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_009440	TTTACT	2	12	1529064	1529075	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_009440	AATATT	2	12	1540199	1540210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009440	TCCATA	2	12	1554609	1554620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_009440	GATAAG	2	12	1609872	1609883	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009440	CGGGGA	2	12	1701441	1701452	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_009440	GGGAGC	2	12	1705571	1705582	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_009440	GAAAGG	2	12	1708478	1708489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009440	ACTTTA	2	12	1713835	1713846	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_009440	CGTAAG	2	12	1739924	1739935	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_009440	GGTGAA	2	12	1777689	1777700	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009440	GTCAAC	2	12	1786106	1786117	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_009440	ACTTCC	2	12	1787230	1787241	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009440	CCCCAC	2	12	1831653	1831664	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
77	NC_009440	TAAGTT	2	12	1831747	1831758	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009440	TAGACA	2	12	1852418	1852429	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_009440	CTTTAT	2	12	1920936	1920947	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_009440	TAAAAA	2	12	2045962	2045973	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009440	GTTCTA	2	12	2052508	2052519	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_009440	AGAGGA	2	12	2160247	2160258	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009440	AGAGGA	2	12	2160271	2160282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.