MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Metallosphaera sedula DSM 5348 chromosome

Total Repeats: 3069

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009440	CTA	2	6	2111961	2111966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_009440	TCT	2	6	2112270	2112275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_009440	ATT	2	6	2120538	2120543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_009440	ATA	2	6	2120646	2120651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_009440	ATA	2	6	2120691	2120696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_009440	TAT	2	6	2120711	2120716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_009440	TAT	2	6	2120720	2120725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_009440	TTC	2	6	2120727	2120732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_009440	TAG	2	6	2121872	2121877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_009440	GTA	2	6	2122245	2122250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_009440	ATT	2	6	2125807	2125812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_009440	TAC	2	6	2132817	2132822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_009440	TAA	2	6	2132850	2132855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_009440	ATT	2	6	2136296	2136301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_009440	ATT	2	6	2137525	2137530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_009440	GAA	2	6	2144772	2144777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_009440	CAC	2	6	2149677	2149682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3018	NC_009440	GGT	2	6	2152580	2152585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_009440	ATA	2	6	2152697	2152702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_009440	AGT	2	6	2154298	2154303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_009440	TTC	2	6	2154380	2154385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_009440	CAT	2	6	2154390	2154395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_009440	GAC	2	6	2154474	2154479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_009440	TAT	2	6	2156537	2156542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_009440	TCT	2	6	2156550	2156555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_009440	AAT	2	6	2158368	2158373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_009440	ATT	2	6	2158389	2158394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_009440	ATG	2	6	2158457	2158462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_009440	AGT	2	6	2158661	2158666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_009440	TCA	2	6	2158692	2158697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_009440	ATT	2	6	2158738	2158743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_009440	GAA	3	9	2158758	2158766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_009440	ATT	2	6	2160076	2160081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_009440	TAT	2	6	2160088	2160093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_009440	TCG	2	6	2160134	2160139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_009440	TAG	2	6	2160144	2160149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_009440	TTC	2	6	2162211	2162216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_009440	TTG	2	6	2162232	2162237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_009440	CGA	2	6	2163419	2163424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_009440	AAC	2	6	2163427	2163432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_009440	TAA	2	6	2167690	2167695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_009440	TCT	2	6	2167772	2167777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_009440	AAT	2	6	2167787	2167792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_009440	TAA	2	6	2167849	2167854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_009440	TTG	2	6	2168488	2168493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_009440	CCA	2	6	2168551	2168556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3047	NC_009440	ATG	2	6	2170238	2170243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_009440	AGA	2	6	2170400	2170405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_009440	TCA	2	6	2176786	2176791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_009440	TAT	2	6	2176850	2176855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_009440	CGT	2	6	2180915	2180920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_009440	TAG	2	6	2181134	2181139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_009440	CCG	2	6	2181162	2181167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3054	NC_009440	CGT	2	6	2181219	2181224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_009440	CAC	2	6	2184804	2184809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3056	NC_009440	TAC	2	6	2185232	2185237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_009440	TAA	2	6	2185268	2185273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_009440	ATT	2	6	2185289	2185294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_009440	CGG	2	6	2185505	2185510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_009440	TCT	2	6	2185527	2185532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_009440	AGG	2	6	2185609	2185614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_009440	TAT	2	6	2185693	2185698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_009440	CGT	2	6	2185761	2185766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_009440	CCG	2	6	2185822	2185827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3065	NC_009440	GGA	2	6	2189093	2189098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_009440	TAG	2	6	2191358	2191363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_009440	AAT	2	6	2191458	2191463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_009440	GAC	2	6	2191476	2191481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_009440	CAG	2	6	2191496	2191501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.