MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Caldicellulosiruptor saccharolyticus DSM 8903 chromosome

Total Repeats: 1372

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009437	CAAAAT	2	12	174	185	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_009437	AAATTA	2	12	190	201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009437	CAAATT	2	12	230	241	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_009437	ATGCAA	2	12	2374	2385	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	146295087
5	NC_009437	GGATAA	2	12	5388	5399	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	346722695
6	NC_009437	GGAAAA	2	12	7416	7427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146295091
7	NC_009437	GATGCA	2	12	7635	7646	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146295091
8	NC_009437	TTACAC	2	12	8230	8241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146295091
9	NC_009437	GATAGC	2	12	9087	9098	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146295091
10	NC_009437	TATAAT	2	12	9238	9249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009437	AGGTTG	2	12	11332	11343	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	146295092
12	NC_009437	TCCTCT	2	12	12219	12230	0 %	50 %	0 %	50 %	146295093
13	NC_009437	ACTGTA	2	12	14188	14199	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	146295095
14	NC_009437	GAAATA	2	12	22604	22615	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009437	ATTGAC	2	12	28293	28304	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	146295101
16	NC_009437	AGATAG	2	12	28714	28725	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	146295101
17	NC_009437	AGATAA	2	12	31992	32003	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	146295106
18	NC_009437	ATATTT	2	12	34069	34080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009437	CACCTC	2	12	36252	36263	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_009437	GCAGTT	2	12	40341	40352	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	146295113
21	NC_009437	CAGGGA	2	12	45092	45103	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	146295117
22	NC_009437	TTTTTG	2	12	50465	50476	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	146295121
23	NC_009437	GGAGAA	2	12	54538	54549	50 %	0 %	50 %	0 %	146295124
24	NC_009437	TAAAAA	2	12	56023	56034	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009437	AAAAGA	2	12	56173	56184	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	146295125
26	NC_009437	AAAACG	2	12	58096	58107	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	146295127
27	NC_009437	GCAAAT	2	12	60216	60227	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_009437	ATTTTT	2	12	60891	60902	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009437	TCTTGT	2	12	62971	62982	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	146295130
30	NC_009437	TATGTT	2	12	63963	63974	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	146295131
31	NC_009437	GTCAAA	2	12	64122	64133	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	146295131
32	NC_009437	TTAGAG	2	12	67292	67303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146295133
33	NC_009437	TCCCTG	2	12	68533	68544	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	146295135
34	NC_009437	AAAACG	2	12	69193	69204	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	146295136
35	NC_009437	TTCTCT	2	12	70802	70813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146295137
36	NC_009437	CTTGAA	2	12	75532	75543	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	146295141
37	NC_009437	GCTTCT	2	12	77863	77874	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	146295144
38	NC_009437	AGTTGA	2	12	81027	81038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146295146
39	NC_009437	AAGAGT	2	12	83613	83624	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	146295149
40	NC_009437	TACAAA	2	12	85583	85594	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	146295150
41	NC_009437	ACCTTG	2	12	86246	86257	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146295151
42	NC_009437	GGCAAA	2	12	86645	86656	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	146295152
43	NC_009437	GAAAAG	2	12	86702	86713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146295152
44	NC_009437	TCTCCT	2	12	91542	91553	0 %	50 %	0 %	50 %	146295157
45	NC_009437	TTTCTT	2	12	91959	91970	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	146295157
46	NC_009437	TTTAAC	2	12	93812	93823	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	146295161
47	NC_009437	TTTCGT	2	12	94714	94725	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	146295161
48	NC_009437	ACATAT	2	12	96148	96159	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	146295163
49	NC_009437	GTTTTA	2	12	96705	96716	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	146295163
50	NC_009437	AAGCAC	2	12	97644	97655	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	146295164
51	NC_009437	CTCAAT	2	12	97790	97801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146295165
52	NC_009437	CCTTCC	2	12	98709	98720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146295165
53	NC_009437	TAAATT	2	12	100072	100083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009437	ATAAAT	2	12	101311	101322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009437	ATTGGC	2	12	101537	101548	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	146295170
56	NC_009437	TTTTTG	2	12	106259	106270	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	146295172
57	NC_009437	TGAAGC	2	12	109675	109686	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146295178
58	NC_009437	TCCTTC	2	12	110235	110246	0 %	50 %	0 %	50 %	146295178
59	NC_009437	AAATAT	2	12	110454	110465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009437	CAAAAT	2	12	111817	111828	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	146295180
61	NC_009437	ATTACC	2	12	118522	118533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146295189
62	NC_009437	GAACTT	2	12	120375	120386	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	146295190
63	NC_009437	TTCCAG	2	12	121382	121393	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	346722700
64	NC_009437	GTTTGA	2	12	123847	123858	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	146295194
65	NC_009437	CTTTTG	2	12	125369	125380	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	146295195
66	NC_009437	TAAAAA	2	12	130105	130116	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009437	AAAGAA	2	12	130118	130129	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009437	GAAAAA	2	12	133441	133452	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009437	GGAAAT	2	12	133487	133498	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	146295202
70	NC_009437	GAACAT	2	12	134493	134504	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	146295202
71	NC_009437	GTTTTT	2	12	136010	136021	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009437	ATTTTT	2	12	138257	138268	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009437	TGGAGT	2	12	144528	144539	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	146295209
74	NC_009437	TCTTGT	2	12	146148	146159	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	146295211
75	NC_009437	TTATAG	2	12	148678	148689	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	146295214
76	NC_009437	CTTATT	2	12	149224	149235	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	346722704
77	NC_009437	TGGCAA	2	12	149983	149994	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146295216
78	NC_009437	AAGCAA	2	12	151368	151379	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	146295217
79	NC_009437	CCCAGC	2	12	151767	151778	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_009437	ATTCCT	2	12	153840	153851	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	146295220
81	NC_009437	TCAAAA	2	12	157365	157376	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_009437	CAGATG	2	12	158690	158701	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146295224
83	NC_009437	TTCCAC	2	12	159583	159594	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	146295225
84	NC_009437	AAAAAG	2	12	162224	162235	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	146295228
85	NC_009437	AGATTG	2	12	162939	162950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146295228
86	NC_009437	GACGCT	2	12	167012	167023	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146295230
87	NC_009437	ATAGAG	2	12	167616	167627	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	146295230
88	NC_009437	TCGTTT	2	12	169770	169781	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	146295231
89	NC_009437	CAGAAA	2	12	170495	170506	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_009437	TGAGGT	2	12	170962	170973	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009437	ACCAAA	2	12	174130	174141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146295234
92	NC_009437	TTAAAG	2	12	174492	174503	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	146295234
93	NC_009437	ATTCTA	2	12	176671	176682	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_009437	ATGATA	2	12	178861	178872	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	146295238
95	NC_009437	AAATTT	2	12	179574	179585	50 %	50 %	0 %	0 %	146295239
96	NC_009437	TCTTCC	2	12	191861	191872	0 %	50 %	0 %	50 %	146295253
97	NC_009437	GTCAAA	2	12	191921	191932	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	146295253
98	NC_009437	CTTGCA	2	12	195479	195490	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146295257
99	NC_009437	GAATAT	2	12	196040	196051	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	146295257
100	NC_009437	CAAGTG	2	12	198362	198373	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146295259
101	NC_009437	TGACAA	2	12	200033	200044	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	146295260
102	NC_009437	TGGAGA	2	12	202141	202152	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	146295262
103	NC_009437	GTTTTT	2	12	202751	202762	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	146295263
104	NC_009437	GGAAAT	2	12	204054	204065	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	146295264
105	NC_009437	AAAGTA	2	12	204773	204784	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	146295265
106	NC_009437	TACCTC	2	12	204875	204886	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	146295265
107	NC_009437	TCAGAA	2	12	205594	205605	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	146295265
108	NC_009437	GTGTGA	2	12	205635	205646	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	146295265
109	NC_009437	TTATAA	2	12	208447	208458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009437	TACTGT	2	12	216216	216227	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	146295274
111	NC_009437	TGAAGT	2	12	221808	221819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146295278
112	NC_009437	CTGCAG	2	12	221994	222005	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146295279
113	NC_009437	AAGATA	2	12	222702	222713	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009437	AATGAA	2	12	223809	223820	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	146295280
115	NC_009437	TTGATT	2	12	223918	223929	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	146295280
116	NC_009437	TATAAT	2	12	230458	230469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009437	CAGTAC	2	12	232921	232932	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	146295293
118	NC_009437	CCTTTG	2	12	237969	237980	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_009437	AAAACC	2	12	239491	239502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_009437	GCTGAG	2	12	242381	242392	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	146295304
121	NC_009437	CAACAT	2	12	244867	244878	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	146295306
122	NC_009437	GATTTT	2	12	246483	246494	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	146295307
123	NC_009437	TAAGAT	2	12	248620	248631	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	146295309
124	NC_009437	AAAGAG	2	12	249720	249731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146295310
125	NC_009437	GCAATT	2	12	251649	251660	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	346722717
126	NC_009437	TGATAA	2	12	253003	253014	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	346722717
127	NC_009437	TTTTGG	2	12	253240	253251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346722717
128	NC_009437	GCATTT	2	12	253482	253493	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	346722717
129	NC_009437	AAACAA	2	12	255538	255549	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	146295316
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131	NC_009437	GACTGT	2	12	262627	262638	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	146295324
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133	NC_009437	AAAGAA	2	12	265009	265020	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	146295327
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149	NC_009437	TTTGGG	2	12	302574	302585	0 %	50 %	50 %	0 %	146295351
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151	NC_009437	GGAGAA	2	12	306958	306969	50 %	0 %	50 %	0 %	146295355
152	NC_009437	GAGATA	2	12	307094	307105	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	146295355
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214	NC_009437	TCCATG	2	12	429884	429895	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146295449
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229	NC_009437	GGGCTG	2	12	466777	466788	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	146295478
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235	NC_009437	AAAACG	2	12	483184	483195	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	146295493
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238	NC_009437	ATTAAA	2	12	486336	486347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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