MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Caldicellulosiruptor saccharolyticus DSM 8903 chromosome

Total Repeats: 2139

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009437	GTCAT	2	10	3103	3112	20 %	40 %	20 %	20 %	146295087
2	NC_009437	TACAT	2	10	3238	3247	40 %	40 %	0 %	20 %	146295087
3	NC_009437	AAGGC	2	10	7515	7524	40 %	0 %	40 %	20 %	146295091
4	NC_009437	AAAAG	2	10	8132	8141	80 %	0 %	20 %	0 %	146295091
5	NC_009437	TGGAA	2	10	8804	8813	40 %	20 %	40 %	0 %	146295091
6	NC_009437	AAAAC	2	10	8892	8901	80 %	0 %	0 %	20 %	146295091
7	NC_009437	AGCCA	2	10	9510	9519	40 %	0 %	20 %	40 %	146295092
8	NC_009437	GGCAG	2	10	10525	10534	20 %	0 %	60 %	20 %	146295092
9	NC_009437	GTTTT	2	10	11183	11192	0 %	80 %	20 %	0 %	146295092
10	NC_009437	GTTAA	2	10	13978	13987	40 %	40 %	20 %	0 %	146295095
11	NC_009437	TTTGC	2	10	15838	15847	0 %	60 %	20 %	20 %	146295096
12	NC_009437	CACAA	2	10	19060	19069	60 %	0 %	0 %	40 %	146295099
13	NC_009437	GATAA	2	10	20710	20719	60 %	20 %	20 %	0 %	146295099
14	NC_009437	TAAAA	2	10	29805	29814	80 %	20 %	0 %	0 %	146295102
15	NC_009437	TTTTC	2	10	30214	30223	0 %	80 %	0 %	20 %	146295103
16	NC_009437	AAGAT	2	10	36580	36589	60 %	20 %	20 %	0 %	146295109
17	NC_009437	CTTTC	2	10	37412	37421	0 %	60 %	0 %	40 %	146295109
18	NC_009437	AACAT	2	10	39322	39331	60 %	20 %	0 %	20 %	146295111
19	NC_009437	CAAGC	2	10	40232	40241	40 %	0 %	20 %	40 %	146295112
20	NC_009437	CTCTT	2	10	42508	42517	0 %	60 %	0 %	40 %	146295115
21	NC_009437	AGAAA	2	10	47161	47170	80 %	0 %	20 %	0 %	146295119
22	NC_009437	TATTT	2	10	47201	47210	20 %	80 %	0 %	0 %	146295119
23	NC_009437	ATGAT	2	10	48455	48464	40 %	40 %	20 %	0 %	146295120
24	NC_009437	TATAA	2	10	48889	48898	60 %	40 %	0 %	0 %	146295120
25	NC_009437	AAACA	2	10	50344	50353	80 %	0 %	0 %	20 %	146295121
26	NC_009437	GCTTA	2	10	50366	50375	20 %	40 %	20 %	20 %	146295121
27	NC_009437	TGAAA	2	10	51502	51511	60 %	20 %	20 %	0 %	146295122
28	NC_009437	GCTTG	2	10	52251	52260	0 %	40 %	40 %	20 %	146295123
29	NC_009437	TGAAG	2	10	56335	56344	40 %	20 %	40 %	0 %	146295125
30	NC_009437	GCTTT	2	10	59775	59784	0 %	60 %	20 %	20 %	146295129
31	NC_009437	ACAGA	2	10	62464	62473	60 %	0 %	20 %	20 %	146295130
32	NC_009437	TGCTT	2	10	62750	62759	0 %	60 %	20 %	20 %	146295130
33	NC_009437	ATCTT	2	10	64634	64643	20 %	60 %	0 %	20 %	146295131
34	NC_009437	AGACT	2	10	66364	66373	40 %	20 %	20 %	20 %	146295132
35	NC_009437	GAGTA	2	10	66475	66484	40 %	20 %	40 %	0 %	146295132
36	NC_009437	CTATG	2	10	67662	67671	20 %	40 %	20 %	20 %	146295134
37	NC_009437	CATAA	2	10	74816	74825	60 %	20 %	0 %	20 %	146295140
38	NC_009437	CTCTT	2	10	79797	79806	0 %	60 %	0 %	40 %	146295145
39	NC_009437	CTTGC	2	10	79868	79877	0 %	40 %	20 %	40 %	146295145
40	NC_009437	GGAGT	2	10	83040	83049	20 %	20 %	60 %	0 %	146295149
41	NC_009437	TCAGA	2	10	85528	85537	40 %	20 %	20 %	20 %	146295150
42	NC_009437	AAAGC	2	10	85607	85616	60 %	0 %	20 %	20 %	146295150
43	NC_009437	AGATG	2	10	86229	86238	40 %	20 %	40 %	0 %	146295151
44	NC_009437	AAGTT	2	10	86489	86498	40 %	40 %	20 %	0 %	146295151
45	NC_009437	AAAAG	2	10	87485	87494	80 %	0 %	20 %	0 %	146295152
46	NC_009437	TCATT	2	10	88841	88850	20 %	60 %	0 %	20 %	146295154
47	NC_009437	TTTTA	2	10	90265	90274	20 %	80 %	0 %	0 %	146295156
48	NC_009437	TCTGC	2	10	91327	91336	0 %	40 %	20 %	40 %	146295157
49	NC_009437	CTCTT	2	10	91393	91402	0 %	60 %	0 %	40 %	146295157
50	NC_009437	TTATG	2	10	92154	92163	20 %	60 %	20 %	0 %	146295157
51	NC_009437	CTTTC	2	10	92591	92600	0 %	60 %	0 %	40 %	146295158
52	NC_009437	GTATT	2	10	94143	94152	20 %	60 %	20 %	0 %	146295161
53	NC_009437	AAAAC	2	10	94787	94796	80 %	0 %	0 %	20 %	146295161
54	NC_009437	GCTTC	2	10	102248	102257	0 %	40 %	20 %	40 %	146295170
55	NC_009437	CAAAC	2	10	103194	103203	60 %	0 %	0 %	40 %	146295170
56	NC_009437	TTTCT	2	10	104732	104741	0 %	80 %	0 %	20 %	146295171
57	NC_009437	AAACA	2	10	106138	106147	80 %	0 %	0 %	20 %	146295172
58	NC_009437	GCTTA	2	10	106160	106169	20 %	40 %	20 %	20 %	146295172
59	NC_009437	AGTAG	2	10	107373	107382	40 %	20 %	40 %	0 %	146295173
60	NC_009437	CAAAA	2	10	107625	107634	80 %	0 %	0 %	20 %	146295174
61	NC_009437	CAAAG	2	10	109398	109407	60 %	0 %	20 %	20 %	146295177
62	NC_009437	TTCCA	2	10	109902	109911	20 %	40 %	0 %	40 %	146295178
63	NC_009437	TTACC	2	10	111063	111072	20 %	40 %	0 %	40 %	146295179
64	NC_009437	AGGAG	2	10	114536	114545	40 %	0 %	60 %	0 %	346722698
65	NC_009437	AAAAG	2	10	114873	114882	80 %	0 %	20 %	0 %	146295185
66	NC_009437	ATTTT	2	10	115081	115090	20 %	80 %	0 %	0 %	146295185
67	NC_009437	AGAGG	2	10	116944	116953	40 %	0 %	60 %	0 %	146295188
68	NC_009437	AAAGA	2	10	117527	117536	80 %	0 %	20 %	0 %	146295188
69	NC_009437	AAAAG	2	10	118722	118731	80 %	0 %	20 %	0 %	146295189
70	NC_009437	ATTTT	2	10	119556	119565	20 %	80 %	0 %	0 %	146295190
71	NC_009437	GTTAA	2	10	119802	119811	40 %	40 %	20 %	0 %	146295190
72	NC_009437	ACAGG	2	10	120347	120356	40 %	0 %	40 %	20 %	146295190
73	NC_009437	CAGAA	2	10	121857	121866	60 %	0 %	20 %	20 %	346722700
74	NC_009437	AGGCA	2	10	123571	123580	40 %	0 %	40 %	20 %	146295194
75	NC_009437	TCCAA	2	10	124263	124272	40 %	20 %	0 %	40 %	146295194
76	NC_009437	ATGGC	2	10	125123	125132	20 %	20 %	40 %	20 %	146295195
77	NC_009437	GCAAA	2	10	126066	126075	60 %	0 %	20 %	20 %	146295195
78	NC_009437	CAATA	2	10	126972	126981	60 %	20 %	0 %	20 %	146295197
79	NC_009437	CCTGC	2	10	129403	129412	0 %	20 %	20 %	60 %	146295198
80	NC_009437	CATGG	2	10	130547	130556	20 %	20 %	40 %	20 %	146295199
81	NC_009437	TTGCA	2	10	132276	132285	20 %	40 %	20 %	20 %	146295200
82	NC_009437	ACTCA	2	10	133218	133227	40 %	20 %	0 %	40 %	146295201
83	NC_009437	GTTTT	2	10	133609	133618	0 %	80 %	20 %	0 %	146295202
84	NC_009437	CATGG	2	10	141093	141102	20 %	20 %	40 %	20 %	146295207
85	NC_009437	TGAAT	2	10	143687	143696	40 %	40 %	20 %	0 %	146295208
86	NC_009437	GAAGA	2	10	144686	144695	60 %	0 %	40 %	0 %	146295209
87	NC_009437	TGATG	2	10	145286	145295	20 %	40 %	40 %	0 %	146295210
88	NC_009437	ACAGA	2	10	145641	145650	60 %	0 %	20 %	20 %	146295211
89	NC_009437	TGCTT	2	10	145927	145936	0 %	60 %	20 %	20 %	146295211
90	NC_009437	ATGGT	2	10	147346	147355	20 %	40 %	40 %	0 %	146295213
91	NC_009437	TATTT	2	10	148096	148105	20 %	80 %	0 %	0 %	146295214
92	NC_009437	TCAGG	2	10	148974	148983	20 %	20 %	40 %	20 %	346722704
93	NC_009437	GCTTT	2	10	151303	151312	0 %	60 %	20 %	20 %	146295217
94	NC_009437	TTTAC	2	10	151482	151491	20 %	60 %	0 %	20 %	146295217
95	NC_009437	TCAGC	2	10	152724	152733	20 %	20 %	20 %	40 %	146295218
96	NC_009437	ATTTT	2	10	154018	154027	20 %	80 %	0 %	0 %	146295220
97	NC_009437	AATAA	2	10	154981	154990	80 %	20 %	0 %	0 %	146295221
98	NC_009437	ATTAA	2	10	155651	155660	60 %	40 %	0 %	0 %	146295221
99	NC_009437	TATCT	2	10	156755	156764	20 %	60 %	0 %	20 %	146295223
100	NC_009437	AGAGA	2	10	160781	160790	60 %	0 %	40 %	0 %	146295226
101	NC_009437	GAGCA	2	10	161711	161720	40 %	0 %	40 %	20 %	146295228
102	NC_009437	GAAAA	2	10	162854	162863	80 %	0 %	20 %	0 %	146295228
103	NC_009437	GTTTT	2	10	163503	163512	0 %	80 %	20 %	0 %	146295228
104	NC_009437	ACACA	2	10	163638	163647	60 %	0 %	0 %	40 %	146295228
105	NC_009437	TTTGA	2	10	164408	164417	20 %	60 %	20 %	0 %	146295228
106	NC_009437	AAAGT	2	10	164537	164546	60 %	20 %	20 %	0 %	146295228
107	NC_009437	AAGAA	2	10	166484	166493	80 %	0 %	20 %	0 %	146295230
108	NC_009437	TAAGA	2	10	167681	167690	60 %	20 %	20 %	0 %	146295230
109	NC_009437	AAAGA	2	10	171745	171754	80 %	0 %	20 %	0 %	146295232
110	NC_009437	GTATT	2	10	171797	171806	20 %	60 %	20 %	0 %	146295232
111	NC_009437	ATATA	2	10	171849	171858	60 %	40 %	0 %	0 %	146295232
112	NC_009437	ATAAA	2	10	171965	171974	80 %	20 %	0 %	0 %	146295232
113	NC_009437	TTATC	2	10	172340	172349	20 %	60 %	0 %	20 %	146295232
114	NC_009437	TGAAT	2	10	172985	172994	40 %	40 %	20 %	0 %	146295233
115	NC_009437	AGGGA	2	10	173304	173313	40 %	0 %	60 %	0 %	146295233
116	NC_009437	GATGT	2	10	174162	174171	20 %	40 %	40 %	0 %	146295234
117	NC_009437	CTAAA	2	10	174279	174288	60 %	20 %	0 %	20 %	146295234
118	NC_009437	ATAAC	2	10	174531	174540	60 %	20 %	0 %	20 %	146295234
119	NC_009437	AGTAA	2	10	175204	175213	60 %	20 %	20 %	0 %	146295235
120	NC_009437	AGAAA	2	10	176652	176661	80 %	0 %	20 %	0 %	346722708
121	NC_009437	TTTAT	2	10	179513	179522	20 %	80 %	0 %	0 %	146295239
122	NC_009437	TAAGA	2	10	179718	179727	60 %	20 %	20 %	0 %	146295239
123	NC_009437	AAAAG	2	10	181630	181639	80 %	0 %	20 %	0 %	146295241
124	NC_009437	CTTGA	2	10	184574	184583	20 %	40 %	20 %	20 %	146295243
125	NC_009437	TTTTA	2	10	186224	186233	20 %	80 %	0 %	0 %	146295246
126	NC_009437	AAAGT	2	10	187064	187073	60 %	20 %	20 %	0 %	346722711
127	NC_009437	GCAAA	2	10	187515	187524	60 %	0 %	20 %	20 %	346722711
128	NC_009437	TATCA	2	10	189507	189516	40 %	40 %	0 %	20 %	346722713
129	NC_009437	AAGAG	2	10	191489	191498	60 %	0 %	40 %	0 %	146295253
130	NC_009437	AAAAG	2	10	194056	194065	80 %	0 %	20 %	0 %	146295255
131	NC_009437	GAAAC	2	10	195621	195630	60 %	0 %	20 %	20 %	146295257
132	NC_009437	AAAAT	2	10	195719	195728	80 %	20 %	0 %	0 %	146295257
133	NC_009437	AGATT	2	10	196976	196985	40 %	40 %	20 %	0 %	146295258
134	NC_009437	TTGAA	2	10	198285	198294	40 %	40 %	20 %	0 %	146295259
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262	NC_009437	AGTTT	2	10	399785	399794	20 %	60 %	20 %	0 %	146295429
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