MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Caldicellulosiruptor saccharolyticus DSM 8903 chromosome

Total Repeats: 1260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009437	TTGA	2	8	82	89	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009437	TTAC	2	8	607	614	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_009437	TACA	2	8	617	624	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009437	TTTA	2	8	2176	2183	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009437	CTTT	2	8	9188	9195	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_009437	TTTC	2	8	9374	9381	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009437	GGAA	2	8	13511	13518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009437	AAAG	2	8	13850	13857	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009437	ATAA	2	8	15426	15433	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009437	TCAA	2	8	21216	21223	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009437	ATGT	2	8	21247	21254	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009437	ATTT	2	8	21281	21288	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009437	TAGT	2	8	21672	21679	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009437	CTTC	2	8	21836	21843	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009437	ACAA	2	8	22362	22369	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009437	CAAA	2	8	22583	22590	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009437	ATTA	2	8	22726	22733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009437	AATT	2	8	23052	23059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009437	AAAC	2	8	23186	23193	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009437	AGCA	2	8	23866	23873	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009437	TGTA	2	8	24218	24225	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009437	AATT	2	8	24669	24676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009437	TATT	2	8	25924	25931	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009437	AAGT	2	8	29547	29554	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009437	GATT	2	8	31335	31342	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009437	ATTT	2	8	31900	31907	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009437	TTTG	2	8	33666	33673	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009437	TTCT	2	8	33981	33988	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_009437	ACAA	2	8	34225	34232	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009437	ATGA	2	8	34260	34267	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009437	GTTG	2	8	34285	34292	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009437	TTGG	2	8	34518	34525	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009437	AAAC	2	8	35037	35044	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009437	GAAA	2	8	35172	35179	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009437	AGCA	2	8	35719	35726	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009437	GTAT	2	8	35966	35973	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009437	TGTA	2	8	36071	36078	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009437	GGTG	2	8	36268	36275	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009437	TTGA	2	8	36300	36307	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009437	AAAT	2	8	36464	36471	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009437	AAAT	2	8	39583	39590	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009437	AGCC	2	8	42253	42260	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_009437	TTTG	2	8	45871	45878	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009437	TAAA	2	8	45888	45895	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009437	AAAT	2	8	46331	46338	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009437	ATTT	2	8	49383	49390	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009437	CATA	2	8	49409	49416	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_009437	AATA	2	8	49514	49521	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009437	TATT	2	8	50578	50585	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009437	ATCA	2	8	50632	50639	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_009437	AAGA	2	8	52848	52855	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009437	AGCC	2	8	53462	53469	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009437	ATAA	2	8	54163	54170	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009437	CAAA	2	8	57222	57229	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_009437	ACAA	2	8	57277	57284	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_009437	GTTT	2	8	60051	60058	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009437	ACAA	2	8	60334	60341	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009437	ACAA	2	8	60862	60869	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_009437	AACT	2	8	61063	61070	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_009437	ACAA	2	8	61191	61198	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009437	CAGA	2	8	72129	72136	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_009437	TGAT	2	8	73386	73393	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009437	AAAT	2	8	73417	73424	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009437	GGGT	2	8	73534	73541	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009437	ATCT	2	8	73640	73647	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009437	CCAC	2	8	73739	73746	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
67	NC_009437	CTTC	2	8	77208	77215	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_009437	ATAG	2	8	77222	77229	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009437	TCGC	2	8	78322	78329	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_009437	AGCC	2	8	79541	79548	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_009437	CTAA	2	8	80138	80145	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_009437	AAAT	2	8	81687	81694	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009437	GCAA	2	8	82477	82484	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_009437	TTTG	2	8	82719	82726	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009437	AATT	2	8	85337	85344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009437	ATAA	2	8	89711	89718	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009437	TCAA	2	8	93081	93088	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_009437	AGCG	2	8	93201	93208	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_009437	CGGC	2	8	97123	97130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_009437	CAAA	2	8	99440	99447	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_009437	ACTC	2	8	101009	101016	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009437	CAAT	2	8	101334	101341	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_009437	AATA	2	8	105308	105315	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009437	TATT	2	8	106372	106379	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009437	CTTT	2	8	107441	107448	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_009437	TAAT	2	8	108394	108401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009437	GGGA	2	8	108424	108431	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009437	TTAT	2	8	109618	109625	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009437	CAAG	2	8	110382	110389	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_009437	TAAA	2	8	110819	110826	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009437	TTCA	2	8	110840	110847	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_009437	CAAA	2	8	112405	112412	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_009437	AGGA	2	8	114768	114775	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009437	TTGA	2	8	118035	118042	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009437	GATT	2	8	118947	118954	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009437	TTTG	2	8	129991	129998	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009437	ACAG	2	8	136421	136428	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_009437	AGGA	2	8	137091	137098	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009437	TGAT	2	8	137223	137230	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009437	AAAG	2	8	137377	137384	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009437	ATGT	2	8	137954	137961	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009437	TTAT	2	8	138387	138394	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009437	TCTT	2	8	139998	140005	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_009437	TAAA	2	8	140113	140120	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009437	AGTT	2	8	143717	143724	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009437	TTAA	2	8	146910	146917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009437	AGGG	2	8	153767	153774	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009437	AAGC	2	8	168418	168425	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_009437	TTGC	2	8	168476	168483	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_009437	AAAG	2	8	168640	168647	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009437	CAAG	2	8	170783	170790	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_009437	ATAC	2	8	170809	170816	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_009437	GGAA	2	8	170896	170903	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009437	AAAG	2	8	170980	170987	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009437	TTGA	2	8	171056	171063	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009437	ATAA	2	8	171138	171145	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009437	AGTT	2	8	171365	171372	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009437	TAAA	2	8	171627	171634	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009437	TAAA	2	8	172698	172705	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009437	ATTA	2	8	175868	175875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009437	AATT	2	8	176025	176032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009437	AAGG	2	8	177171	177178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009437	TTTC	2	8	179345	179352	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_009437	TAAA	2	8	180674	180681	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009437	TAAG	2	8	181010	181017	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009437	TACA	2	8	181706	181713	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_009437	CAGA	2	8	182843	182850	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_009437	TTTG	2	8	187938	187945	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009437	AAGA	2	8	189656	189663	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009437	ATTT	2	8	194550	194557	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009437	ATTG	2	8	194563	194570	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009437	GACA	2	8	194618	194625	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_009437	TACA	2	8	194668	194675	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_009437	AGCT	2	8	204218	204225	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_009437	AGAA	2	8	204595	204602	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009437	TAAA	2	8	207461	207468	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009437	TAAA	2	8	207598	207605	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009437	AAAT	2	8	207636	207643	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009437	ATAA	2	8	208379	208386	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009437	TCCA	2	8	208466	208473	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_009437	AAAG	2	8	216433	216440	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009437	AAAG	2	8	216786	216793	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009437	ATTT	2	8	232308	232315	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009437	TTAA	2	8	235176	235183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009437	AAAT	2	8	237755	237762	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009437	GGCA	2	8	239430	239437	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_009437	CCAT	2	8	239522	239529	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_009437	TAAT	2	8	240348	240355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009437	ATAA	2	8	247815	247822	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009437	ATTT	2	8	251513	251520	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009437	AGGC	2	8	253776	253783	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_009437	TTTG	2	8	254596	254603	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_009437	TAAA	2	8	255814	255821	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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