MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Caldicellulosiruptor saccharolyticus DSM 8903 chromosome

Total Repeats: 34400

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009437	GGA	2	6	671	676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146295086
2	NC_009437	AGG	2	6	682	687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146295086
3	NC_009437	ACA	2	6	730	735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146295086
4	NC_009437	TGA	2	6	767	772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146295086
5	NC_009437	AAG	2	6	946	951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146295086
6	NC_009437	CAA	2	6	967	972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146295086
7	NC_009437	ACA	2	6	1015	1020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146295086
8	NC_009437	TGC	3	9	1034	1042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146295086
9	NC_009437	ACC	2	6	1061	1066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146295086
10	NC_009437	CCA	2	6	1145	1150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146295086
11	NC_009437	GCA	2	6	1221	1226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146295086
12	NC_009437	TGA	2	6	1244	1249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146295086
13	NC_009437	AAG	2	6	1327	1332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146295086
14	NC_009437	GCC	2	6	1397	1402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146295086
15	NC_009437	AGA	2	6	1421	1426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146295086
16	NC_009437	AGA	2	6	1769	1774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146295086
17	NC_009437	ATC	2	6	1781	1786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146295086
18	NC_009437	AAG	2	6	1787	1792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146295086
19	NC_009437	CAA	2	6	1940	1945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146295086
20	NC_009437	AAC	2	6	2006	2011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146295086
21	NC_009437	TGT	2	6	2235	2240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146295087
22	NC_009437	ATA	2	6	2261	2266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146295087
23	NC_009437	CTG	2	6	2282	2287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146295087
24	NC_009437	CAA	2	6	2294	2299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146295087
25	NC_009437	AGA	2	6	2337	2342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146295087
26	NC_009437	AGC	2	6	2418	2423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146295087
27	NC_009437	ATA	2	6	2485	2490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146295087
28	NC_009437	AGA	2	6	2522	2527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146295087
29	NC_009437	GCA	2	6	2608	2613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146295087
30	NC_009437	GAT	2	6	2818	2823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146295087
31	NC_009437	ATA	2	6	2833	2838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146295087
32	NC_009437	GAA	2	6	2845	2850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146295087
33	NC_009437	CAA	2	6	2978	2983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146295087
34	NC_009437	CAG	2	6	2996	3001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146295087
35	NC_009437	ATG	2	6	3091	3096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146295087
36	NC_009437	GAA	2	6	3133	3138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146295087
37	NC_009437	GGA	2	6	3223	3228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146295087
38	NC_009437	AGC	2	6	3272	3277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146295087
39	NC_009437	GAT	2	6	3357	3362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146295088
40	NC_009437	CTT	2	6	3472	3477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146295088
41	NC_009437	TCA	2	6	3533	3538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146295088
42	NC_009437	TAT	2	6	3602	3607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146295088
43	NC_009437	AAT	2	6	3636	3641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146295088
44	NC_009437	GAA	2	6	3651	3656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146295088
45	NC_009437	CGA	2	6	3748	3753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146295088
46	NC_009437	TGA	2	6	3827	3832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146295088
47	NC_009437	ATA	2	6	3871	3876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146295088
48	NC_009437	CAA	2	6	3959	3964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146295088
49	NC_009437	CAT	2	6	4031	4036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146295088
50	NC_009437	AAG	2	6	4066	4071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146295088
51	NC_009437	GAT	2	6	4123	4128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146295088
52	NC_009437	GAT	2	6	4252	4257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146295088
53	NC_009437	TGT	2	6	4469	4474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146295089
54	NC_009437	CTT	2	6	4488	4493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146295089
55	NC_009437	TTG	2	6	4573	4578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146295089
56	NC_009437	GAT	2	6	4587	4592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146295089
57	NC_009437	CAA	3	9	4660	4668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146295089
58	NC_009437	ACT	2	6	4708	4713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146295089
59	NC_009437	ACA	2	6	4784	4789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	346722695
60	NC_009437	TCA	2	6	4900	4905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346722695
61	NC_009437	TTG	2	6	4920	4925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346722695
62	NC_009437	GTA	2	6	5069	5074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346722695
63	NC_009437	TGT	2	6	5155	5160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346722695
64	NC_009437	TGC	2	6	5349	5354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722695
65	NC_009437	TGA	2	6	5407	5412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346722695
66	NC_009437	ACA	2	6	5607	5612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	346722695
67	NC_009437	CAA	2	6	5616	5621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	346722695
68	NC_009437	GCT	2	6	5654	5659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722695
69	NC_009437	GCA	2	6	5864	5869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722695
70	NC_009437	AGA	2	6	5875	5880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346722695
71	NC_009437	ATA	2	6	5903	5908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	346722695
72	NC_009437	GCA	2	6	5924	5929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722695
73	NC_009437	GAG	2	6	5939	5944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	346722695
74	NC_009437	TTG	2	6	6060	6065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346722695
75	NC_009437	GGT	2	6	6080	6085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722695
76	NC_009437	CTT	2	6	6320	6325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	346722695
77	NC_009437	CCA	2	6	6386	6391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346722695
78	NC_009437	AGA	2	6	6517	6522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346722695
79	NC_009437	AGG	2	6	6551	6556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	346722695
80	NC_009437	AAG	2	6	6637	6642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346722695
81	NC_009437	AAG	2	6	6751	6756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146295091
82	NC_009437	AGA	2	6	6846	6851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146295091
83	NC_009437	TGC	2	6	6956	6961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146295091
84	NC_009437	TTG	2	6	7015	7020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146295091
85	NC_009437	GCT	2	6	7062	7067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146295091
86	NC_009437	CAA	2	6	7246	7251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146295091
87	NC_009437	AAT	2	6	7340	7345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146295091
88	NC_009437	ATC	2	6	7377	7382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146295091
89	NC_009437	CAA	2	6	7447	7452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146295091
90	NC_009437	AAG	2	6	7600	7605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146295091
91	NC_009437	AAT	2	6	7700	7705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146295091
92	NC_009437	TAC	2	6	7764	7769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146295091
93	NC_009437	TCA	2	6	7902	7907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146295091
94	NC_009437	AGA	3	9	8027	8035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146295091
95	NC_009437	CTT	2	6	8046	8051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146295091
96	NC_009437	GAT	2	6	8054	8059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146295091
97	NC_009437	ATT	2	6	8106	8111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146295091
98	NC_009437	AAG	2	6	8182	8187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146295091
99	NC_009437	GAA	3	9	8193	8201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146295091
100	NC_009437	AGA	2	6	8287	8292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146295091
101	NC_009437	CAA	2	6	8320	8325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146295091
102	NC_009437	TTG	2	6	8338	8343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146295091
103	NC_009437	CAA	2	6	8359	8364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146295091
104	NC_009437	TCA	2	6	8366	8371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146295091
105	NC_009437	AAG	2	6	8530	8535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146295091
106	NC_009437	TGA	2	6	8542	8547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146295091
107	NC_009437	ACA	2	6	8601	8606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146295091
108	NC_009437	TGT	2	6	8714	8719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146295091
109	NC_009437	ATG	2	6	8731	8736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146295091
110	NC_009437	AAG	2	6	8867	8872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146295091
111	NC_009437	GTG	2	6	8902	8907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146295091
112	NC_009437	TTG	2	6	8953	8958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146295091
113	NC_009437	ATG	2	6	8974	8979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146295091
114	NC_009437	GAA	2	6	9052	9057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146295091
115	NC_009437	GAA	2	6	9525	9530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146295092
116	NC_009437	TAA	2	6	9564	9569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146295092
117	NC_009437	ACT	2	6	9704	9709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146295092
118	NC_009437	TGA	2	6	9738	9743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146295092
119	NC_009437	TGA	2	6	9786	9791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146295092
120	NC_009437	AGA	2	6	9833	9838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146295092
121	NC_009437	GAA	2	6	9865	9870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146295092
122	NC_009437	AGA	2	6	9960	9965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146295092
123	NC_009437	TTA	2	6	10014	10019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146295092
124	NC_009437	TAT	2	6	10168	10173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146295092
125	NC_009437	ACA	2	6	10181	10186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146295092
126	NC_009437	TAA	2	6	10266	10271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146295092
127	NC_009437	TTG	2	6	10313	10318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146295092
128	NC_009437	ATT	2	6	10478	10483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146295092
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130	NC_009437	ATG	2	6	10595	10600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146295092
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