MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA05

Total Repeats: 219

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009433	TTC	2	6	5	10	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009433	CCG	2	6	164	169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280385
3	NC_009433	CGC	2	6	211	216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280385
4	NC_009433	CAC	2	6	273	278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280385
5	NC_009433	AGA	2	6	286	291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146280385
6	NC_009433	CTA	2	6	359	364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280385
7	NC_009433	CGG	2	6	403	408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280385
8	NC_009433	TCG	2	6	425	430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280385
9	NC_009433	GAT	2	6	461	466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280385
10	NC_009433	TGA	2	6	473	478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280385
11	NC_009433	GGC	2	6	488	493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280385
12	NC_009433	TTC	2	6	496	501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280385
13	NC_009433	GCG	2	6	521	526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280385
14	NC_009433	GCG	2	6	727	732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280385
15	NC_009433	TTC	3	9	763	771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280385
16	NC_009433	AGC	2	6	933	938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009433	CGC	2	6	967	972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_009433	CTC	2	6	1122	1127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_009433	GCC	2	6	1140	1145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_009433	AGT	2	6	1242	1247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009433	GTC	2	6	1350	1355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009433	AGA	2	6	1446	1451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009433	CAT	2	6	1493	1498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009433	CCA	2	6	1501	1506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_009433	GAG	2	6	1570	1575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009433	GCC	2	6	1626	1631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_009433	AGT	2	6	1634	1639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009433	AGA	2	6	1643	1648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009433	TCA	2	6	1693	1698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009433	GAT	2	6	1734	1739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009433	CCT	2	6	1915	1920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_009433	GCC	2	6	1930	1935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_009433	TTC	2	6	1942	1947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009433	GAA	2	6	2005	2010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009433	ATC	2	6	2219	2224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280386
36	NC_009433	GGC	2	6	2231	2236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280386
37	NC_009433	GCC	2	6	2255	2260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280386
38	NC_009433	TCG	2	6	2274	2279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280386
39	NC_009433	GAC	2	6	2291	2296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280386
40	NC_009433	TGT	2	6	2346	2351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146280386
41	NC_009433	GGC	3	9	2358	2366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280386
42	NC_009433	GTC	2	6	2426	2431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280386
43	NC_009433	GGA	2	6	2440	2445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280386
44	NC_009433	CGC	2	6	2556	2561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280386
45	NC_009433	CGG	2	6	2681	2686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280387
46	NC_009433	CGG	2	6	2737	2742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280387
47	NC_009433	CTG	3	9	2833	2841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280387
48	NC_009433	ACG	2	6	2876	2881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280387
49	NC_009433	CTG	2	6	2940	2945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280387
50	NC_009433	TCA	2	6	2972	2977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280387
51	NC_009433	ATC	2	6	2998	3003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280387
52	NC_009433	GTG	2	6	3016	3021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280387
53	NC_009433	CAT	2	6	3054	3059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280387
54	NC_009433	CGC	2	6	3076	3081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280387
55	NC_009433	GCC	2	6	3132	3137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280387
56	NC_009433	ACC	2	6	3341	3346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280387
57	NC_009433	CAC	2	6	3527	3532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_009433	GAG	2	6	3639	3644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009433	CAG	2	6	3655	3660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009433	TCA	2	6	3662	3667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009433	GCG	2	6	3726	3731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280388
62	NC_009433	AGC	2	6	3764	3769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280388
63	NC_009433	ATC	2	6	3778	3783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280388
64	NC_009433	GGA	2	6	3792	3797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280388
65	NC_009433	GCC	2	6	3818	3823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280388
66	NC_009433	CTG	2	6	3928	3933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280388
67	NC_009433	GAC	2	6	3934	3939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280388
68	NC_009433	AGC	2	6	4082	4087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280388
69	NC_009433	CGG	2	6	4089	4094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280388
70	NC_009433	CTT	3	9	4378	4386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280389
71	NC_009433	GGC	2	6	4404	4409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280389
72	NC_009433	GGA	2	6	4446	4451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280389
73	NC_009433	CCG	2	6	4505	4510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280389
74	NC_009433	GAT	2	6	4557	4562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280389
75	NC_009433	TTG	2	6	4622	4627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146280389
76	NC_009433	AAG	2	6	4696	4701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009433	CTG	2	6	4771	4776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280390
78	NC_009433	TTC	2	6	4810	4815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280390
79	NC_009433	CGT	2	6	4856	4861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280390
80	NC_009433	GCC	2	6	4875	4880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280390
81	NC_009433	CAT	2	6	4890	4895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280390
82	NC_009433	GGA	2	6	4975	4980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280390
83	NC_009433	CGT	2	6	5030	5035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280390
84	NC_009433	TCT	2	6	5039	5044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280390
85	NC_009433	CGT	2	6	5159	5164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280390
86	NC_009433	CCT	2	6	5200	5205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146280390
87	NC_009433	GGC	2	6	5244	5249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280390
88	NC_009433	GCG	2	6	5301	5306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280390
89	NC_009433	GCG	2	6	5364	5369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280391
90	NC_009433	GCA	2	6	5404	5409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280391
91	NC_009433	GGC	2	6	5522	5527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280391
92	NC_009433	CCG	2	6	5535	5540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280391
93	NC_009433	TGC	2	6	5786	5791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280391
94	NC_009433	GCG	2	6	5799	5804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280391
95	NC_009433	GAA	2	6	5936	5941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146280391
96	NC_009433	CAA	2	6	5961	5966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146280391
97	NC_009433	CGC	2	6	5998	6003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280391
98	NC_009433	ACC	2	6	6111	6116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280391
99	NC_009433	CGG	2	6	6119	6124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280391
100	NC_009433	GTC	2	6	6146	6151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280391
101	NC_009433	GCC	2	6	6185	6190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280391
102	NC_009433	AGC	2	6	6198	6203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280391
103	NC_009433	GTG	2	6	6210	6215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280391
104	NC_009433	TCG	2	6	6216	6221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280391
105	NC_009433	CAG	2	6	6278	6283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280391
106	NC_009433	CAG	2	6	6410	6415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280391
107	NC_009433	TCT	2	6	6472	6477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280391
108	NC_009433	CAC	2	6	6536	6541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280391
109	NC_009433	GCA	2	6	6593	6598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280391
110	NC_009433	ACC	2	6	6621	6626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280391
111	NC_009433	TCG	2	6	6697	6702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280391
112	NC_009433	TCT	2	6	6703	6708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280391
113	NC_009433	CGG	4	12	6727	6738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280391
114	NC_009433	CTC	2	6	6746	6751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146280391
115	NC_009433	AGC	2	6	6822	6827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280391
116	NC_009433	ATC	2	6	6852	6857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280391
117	NC_009433	ACC	2	6	6873	6878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280391
118	NC_009433	GCC	2	6	6909	6914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280391
119	NC_009433	CAA	2	6	6990	6995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_009433	TCT	2	6	7024	7029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280392
121	NC_009433	CAG	2	6	7073	7078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280392
122	NC_009433	GTG	2	6	7119	7124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280392
123	NC_009433	CAG	2	6	7196	7201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280392
124	NC_009433	AGA	2	6	7234	7239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146280392
125	NC_009433	CGC	2	6	7243	7248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280392
126	NC_009433	CTG	2	6	7271	7276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280392
127	NC_009433	CGC	2	6	7321	7326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280392
128	NC_009433	CCG	2	6	7556	7561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280393
129	NC_009433	CAG	2	6	7564	7569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280393
130	NC_009433	CAG	2	6	7600	7605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280393
131	NC_009433	ACC	2	6	7634	7639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280393
132	NC_009433	CGA	2	6	7671	7676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280393
133	NC_009433	TCT	2	6	7683	7688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280393
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.