MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA04

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009432	GCGCCC	2	12	648	659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280353
2	NC_009432	GTGAAC	2	12	734	745	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146280353
3	NC_009432	AGCTGG	2	12	1264	1275	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	146280354
4	NC_009432	GCCGCG	2	12	1866	1877	0 %	0 %	50 %	50 %	146280354
5	NC_009432	GCTCTC	2	12	1985	1996	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	146280354
6	NC_009432	CCTTCT	2	12	11768	11779	0 %	50 %	0 %	50 %	146280363
7	NC_009432	GCGAGC	2	12	11908	11919	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	146280363
8	NC_009432	CGAAGT	2	12	12764	12775	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146280363
9	NC_009432	GTCAGC	2	12	12976	12987	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146280363
10	NC_009432	CAGCTC	2	12	14309	14320	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	146280364
11	NC_009432	TGTTAT	2	12	15609	15620	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	146280365
12	NC_009432	CAGGCG	2	12	15786	15797	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	146280365
13	NC_009432	TCGAAC	2	12	17006	17017	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	146280367
14	NC_009432	CGGATG	2	12	17126	17137	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	146280367
15	NC_009432	GCCACC	2	12	17441	17452	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	146280367
16	NC_009432	GTGATC	2	12	18089	18100	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	146280368
17	NC_009432	GGCCAT	2	12	18382	18393	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146280368
18	NC_009432	CGCCTG	2	12	19104	19115	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	146280370
19	NC_009432	GTTCTC	2	12	19371	19382	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	146280370
20	NC_009432	AGGTCG	2	12	19872	19883	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	146280371
21	NC_009432	ACCTCG	2	12	21645	21656	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	146280371
22	NC_009432	ATGAGC	2	12	22545	22556	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146280373
23	NC_009432	CGCGGC	2	12	22628	22639	0 %	0 %	50 %	50 %	146280373
24	NC_009432	TGCGAT	2	12	25946	25957	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	146280376
25	NC_009432	ATTGGG	2	12	28092	28103	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	146280378
26	NC_009432	CCCGCA	2	12	31205	31216	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	146280381
27	NC_009432	CGCGAG	2	12	31531	31542	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	146280381

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.