MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA04

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009432	CTGCG	2	10	837	846	0 %	20 %	40 %	40 %	146280353
2	NC_009432	CTTGG	2	10	999	1008	0 %	40 %	40 %	20 %	146280354
3	NC_009432	AGGGG	2	10	1031	1040	20 %	0 %	80 %	0 %	146280354
4	NC_009432	CCTGT	2	10	1083	1092	0 %	40 %	20 %	40 %	146280354
5	NC_009432	ATGGC	2	10	1366	1375	20 %	20 %	40 %	20 %	146280354
6	NC_009432	GGCCG	2	10	2092	2101	0 %	0 %	60 %	40 %	146280354
7	NC_009432	CGGCT	2	10	5469	5478	0 %	20 %	40 %	40 %	146280356
8	NC_009432	ATCGA	2	10	9024	9033	40 %	20 %	20 %	20 %	146280360
9	NC_009432	GCCTC	2	10	10563	10572	0 %	20 %	20 %	60 %	146280362
10	NC_009432	CGCGG	2	10	11668	11677	0 %	0 %	60 %	40 %	146280362
11	NC_009432	TCGGC	2	10	11683	11692	0 %	20 %	40 %	40 %	146280362
12	NC_009432	GCTCC	2	10	12156	12165	0 %	20 %	20 %	60 %	146280363
13	NC_009432	GCGCG	2	10	13067	13076	0 %	0 %	60 %	40 %	146280363
14	NC_009432	CGAGC	2	10	14092	14101	20 %	0 %	40 %	40 %	146280364
15	NC_009432	GGTGC	2	10	14579	14588	0 %	20 %	60 %	20 %	146280364
16	NC_009432	TCCGC	2	10	17851	17860	0 %	20 %	20 %	60 %	146280368
17	NC_009432	TCGCG	2	10	18786	18795	0 %	20 %	40 %	40 %	146280369
18	NC_009432	CGCGA	2	10	22238	22247	20 %	0 %	40 %	40 %	146280372
19	NC_009432	TACCG	2	10	24477	24486	20 %	20 %	20 %	40 %	146280375
20	NC_009432	GCGCT	2	10	24612	24621	0 %	20 %	40 %	40 %	146280375
21	NC_009432	GCGCG	2	10	26798	26807	0 %	0 %	60 %	40 %	146280377
22	NC_009432	GGGGC	2	10	27866	27875	0 %	0 %	80 %	20 %	146280378
23	NC_009432	AAGGC	2	10	31220	31229	40 %	0 %	40 %	20 %	146280381
24	NC_009432	AAGGC	2	10	31589	31598	40 %	0 %	40 %	20 %	146280381

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.