MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA04

Total Repeats: 106

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009432	GCAA	2	8	148	155	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009432	GCTG	2	8	427	434	0 %	25 %	50 %	25 %	146280353
3	NC_009432	CGAC	2	8	580	587	25 %	0 %	25 %	50 %	146280353
4	NC_009432	CCAG	2	8	670	677	25 %	0 %	25 %	50 %	146280353
5	NC_009432	GCCA	2	8	1163	1170	25 %	0 %	25 %	50 %	146280354
6	NC_009432	TGGA	2	8	1335	1342	25 %	25 %	50 %	0 %	146280354
7	NC_009432	GCCG	2	8	1794	1801	0 %	0 %	50 %	50 %	146280354
8	NC_009432	CCAA	2	8	2220	2227	50 %	0 %	0 %	50 %	146280355
9	NC_009432	TAGA	2	8	2485	2492	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009432	AAGA	2	8	2669	2676	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009432	AAGG	2	8	2894	2901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009432	CAAG	2	8	3794	3801	50 %	0 %	25 %	25 %	146280356
13	NC_009432	GCTA	2	8	3834	3841	25 %	25 %	25 %	25 %	146280356
14	NC_009432	ATGG	2	8	4144	4151	25 %	25 %	50 %	0 %	146280356
15	NC_009432	GACG	2	8	4734	4741	25 %	0 %	50 %	25 %	146280356
16	NC_009432	ACAG	2	8	5288	5295	50 %	0 %	25 %	25 %	146280356
17	NC_009432	TCGA	2	8	6133	6140	25 %	25 %	25 %	25 %	146280357
18	NC_009432	ACGA	2	8	6260	6267	50 %	0 %	25 %	25 %	146280357
19	NC_009432	TGGT	2	8	6444	6451	0 %	50 %	50 %	0 %	146280357
20	NC_009432	TGAT	2	8	6551	6558	25 %	50 %	25 %	0 %	146280357
21	NC_009432	CTTT	2	8	7078	7085	0 %	75 %	0 %	25 %	146280358
22	NC_009432	GATC	2	8	7184	7191	25 %	25 %	25 %	25 %	146280358
23	NC_009432	GGAC	2	8	8179	8186	25 %	0 %	50 %	25 %	146280359
24	NC_009432	CGAC	2	8	8393	8400	25 %	0 %	25 %	50 %	146280359
25	NC_009432	TATC	2	8	8471	8478	25 %	50 %	0 %	25 %	146280359
26	NC_009432	AGCC	2	8	8747	8754	25 %	0 %	25 %	50 %	146280359
27	NC_009432	TAAA	2	8	9474	9481	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009432	CGTC	2	8	9529	9536	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009432	ATGG	2	8	10135	10142	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009432	CACG	2	8	10346	10353	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009432	TCGC	2	8	10394	10401	0 %	25 %	25 %	50 %	146280362
32	NC_009432	ATCA	2	8	10433	10440	50 %	25 %	0 %	25 %	146280362
33	NC_009432	TGCG	2	8	10781	10788	0 %	25 %	50 %	25 %	146280362
34	NC_009432	GGCC	2	8	11446	11453	0 %	0 %	50 %	50 %	146280362
35	NC_009432	CCTT	2	8	11842	11849	0 %	50 %	0 %	50 %	146280363
36	NC_009432	CGGG	2	8	12140	12147	0 %	0 %	75 %	25 %	146280363
37	NC_009432	GCTC	2	8	12293	12300	0 %	25 %	25 %	50 %	146280363
38	NC_009432	AGGC	2	8	12563	12570	25 %	0 %	50 %	25 %	146280363
39	NC_009432	GGTG	2	8	13187	13194	0 %	25 %	75 %	0 %	146280363
40	NC_009432	AGCC	2	8	13253	13260	25 %	0 %	25 %	50 %	146280363
41	NC_009432	GCCG	2	8	13554	13561	0 %	0 %	50 %	50 %	146280363
42	NC_009432	CGGC	2	8	14046	14053	0 %	0 %	50 %	50 %	146280364
43	NC_009432	GGGC	2	8	14764	14771	0 %	0 %	75 %	25 %	146280364
44	NC_009432	GCGA	2	8	14895	14902	25 %	0 %	50 %	25 %	146280364
45	NC_009432	CGGC	2	8	15201	15208	0 %	0 %	50 %	50 %	146280365
46	NC_009432	CGGC	2	8	15690	15697	0 %	0 %	50 %	50 %	146280365
47	NC_009432	GGCT	2	8	15814	15821	0 %	25 %	50 %	25 %	146280365
48	NC_009432	CGGC	2	8	16029	16036	0 %	0 %	50 %	50 %	146280365
49	NC_009432	GGTC	2	8	16354	16361	0 %	25 %	50 %	25 %	146280366
50	NC_009432	GCCG	2	8	16394	16401	0 %	0 %	50 %	50 %	146280366
51	NC_009432	GCAG	2	8	16882	16889	25 %	0 %	50 %	25 %	146280366
52	NC_009432	CCGT	2	8	17348	17355	0 %	25 %	25 %	50 %	146280367
53	NC_009432	GGCC	2	8	17821	17828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009432	CGCC	2	8	18042	18049	0 %	0 %	25 %	75 %	146280368
55	NC_009432	CCGC	2	8	18425	18432	0 %	0 %	25 %	75 %	146280368
56	NC_009432	CCCA	2	8	18476	18483	25 %	0 %	0 %	75 %	146280368
57	NC_009432	GGCT	2	8	18690	18697	0 %	25 %	50 %	25 %	146280368
58	NC_009432	CTCG	2	8	18796	18803	0 %	25 %	25 %	50 %	146280369
59	NC_009432	GCCG	2	8	19047	19054	0 %	0 %	50 %	50 %	146280370
60	NC_009432	GTCG	2	8	19265	19272	0 %	25 %	50 %	25 %	146280370
61	NC_009432	GGAT	2	8	19788	19795	25 %	25 %	50 %	0 %	146280371
62	NC_009432	GGTC	2	8	20164	20171	0 %	25 %	50 %	25 %	146280371
63	NC_009432	CGGG	2	8	21332	21339	0 %	0 %	75 %	25 %	146280371
64	NC_009432	CGGT	2	8	21432	21439	0 %	25 %	50 %	25 %	146280371
65	NC_009432	ATGG	2	8	21440	21447	25 %	25 %	50 %	0 %	146280371
66	NC_009432	GCCG	2	8	21487	21494	0 %	0 %	50 %	50 %	146280371
67	NC_009432	GACG	2	8	21670	21677	25 %	0 %	50 %	25 %	146280371
68	NC_009432	AGCC	2	8	22530	22537	25 %	0 %	25 %	50 %	146280373
69	NC_009432	GGGC	2	8	22847	22854	0 %	0 %	75 %	25 %	146280374
70	NC_009432	TGCC	2	8	22929	22936	0 %	25 %	25 %	50 %	146280374
71	NC_009432	CCAG	2	8	23054	23061	25 %	0 %	25 %	50 %	146280374
72	NC_009432	TCGA	2	8	23098	23105	25 %	25 %	25 %	25 %	146280374
73	NC_009432	AGGC	2	8	23291	23298	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_009432	GGGC	2	8	23925	23932	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
75	NC_009432	GCAG	2	8	24757	24764	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_009432	AGCA	2	8	24890	24897	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009432	CGGC	3	12	25378	25389	0 %	0 %	50 %	50 %	146280376
78	NC_009432	CGAT	2	8	25597	25604	25 %	25 %	25 %	25 %	146280376
79	NC_009432	TCCA	2	8	26245	26252	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_009432	CTCG	2	8	26884	26891	0 %	25 %	25 %	50 %	146280377
81	NC_009432	GGCG	2	8	27100	27107	0 %	0 %	75 %	25 %	146280377
82	NC_009432	CGCT	2	8	27621	27628	0 %	25 %	25 %	50 %	146280378
83	NC_009432	TGCC	2	8	28281	28288	0 %	25 %	25 %	50 %	146280378
84	NC_009432	TTGC	2	8	28919	28926	0 %	50 %	25 %	25 %	146280379
85	NC_009432	CGCC	2	8	28972	28979	0 %	0 %	25 %	75 %	146280379
86	NC_009432	TGAG	2	8	29703	29710	25 %	25 %	50 %	0 %	146280379
87	NC_009432	TGCC	2	8	30027	30034	0 %	25 %	25 %	50 %	146280380
88	NC_009432	TCTT	2	8	30215	30222	0 %	75 %	0 %	25 %	146280380
89	NC_009432	GCAG	2	8	30854	30861	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_009432	GCGG	2	8	30946	30953	0 %	0 %	75 %	25 %	146280381
91	NC_009432	AGGC	2	8	31280	31287	25 %	0 %	50 %	25 %	146280381
92	NC_009432	TGGC	2	8	31385	31392	0 %	25 %	50 %	25 %	146280381
93	NC_009432	CGGG	2	8	31910	31917	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
94	NC_009432	GCAG	2	8	32171	32178	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_009432	AGCG	2	8	32925	32932	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_009432	GGCA	2	8	32979	32986	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_009432	CGCC	2	8	33264	33271	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
98	NC_009432	TGGA	2	8	33539	33546	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009432	ATCG	2	8	33924	33931	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_009432	TGTA	2	8	33955	33962	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009432	ATGT	2	8	33966	33973	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009432	AGGC	2	8	34316	34323	25 %	0 %	50 %	25 %	146280382
103	NC_009432	GCCG	2	8	35213	35220	0 %	0 %	50 %	50 %	146280383
104	NC_009432	CGAT	2	8	35659	35666	25 %	25 %	25 %	25 %	146280383
105	NC_009432	CGGC	2	8	35683	35690	0 %	0 %	50 %	50 %	146280383
106	NC_009432	CAGC	2	8	35888	35895	25 %	0 %	25 %	50 %	146280383

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.