MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA04

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009432	GCAA	2	8	148	155	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009432	TAGA	2	8	2485	2492	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009432	AAGA	2	8	2669	2676	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009432	AAGG	2	8	2894	2901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009432	TAAA	2	8	9474	9481	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009432	CGTC	2	8	9529	9536	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009432	ATGG	2	8	10135	10142	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009432	CACG	2	8	10346	10353	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009432	GGCC	2	8	17821	17828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009432	AGGC	2	8	23291	23298	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009432	GGGC	2	8	23925	23932	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009432	GCAG	2	8	24757	24764	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009432	AGCA	2	8	24890	24897	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_009432	TCCA	2	8	26245	26252	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009432	GCAG	2	8	30854	30861	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009432	CGGG	2	8	31910	31917	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009432	GCAG	2	8	32171	32178	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009432	AGCG	2	8	32925	32932	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009432	GGCA	2	8	32979	32986	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009432	CGCC	2	8	33264	33271	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
21	NC_009432	TGGA	2	8	33539	33546	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009432	ATCG	2	8	33924	33931	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_009432	TGTA	2	8	33955	33962	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009432	ATGT	2	8	33966	33973	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.