MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA04

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009432	CAG	2	6	49	54	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009432	TCC	2	6	80	85	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_009432	CTT	2	6	161	166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009432	GCG	2	6	2141	2146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009432	CTG	2	6	2150	2155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009432	ATC	2	6	2494	2499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_009432	TGG	2	6	2505	2510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009432	GGA	2	6	2553	2558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009432	GAC	2	6	2566	2571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009432	CAG	2	6	2752	2757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009432	AAG	2	6	2837	2842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009432	AAG	2	6	2918	2923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009432	GGT	2	6	2984	2989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009432	CGA	2	6	3002	3007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009432	CGA	2	6	3089	3094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009432	ATT	2	6	6606	6611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009432	GCT	2	6	6636	6641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_009432	CTG	2	6	6685	6690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009432	TGG	2	6	6751	6756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009432	GCC	2	6	9488	9493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_009432	CGG	2	6	10093	10098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009432	GCG	2	6	10121	10126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009432	CCT	2	6	10203	10208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_009432	CGT	3	9	10243	10251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009432	GTC	2	6	10280	10285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009432	GGT	2	6	10336	10341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009432	TTC	2	6	17647	17652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009432	TCG	2	6	17678	17683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_009432	GGA	2	6	17700	17705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009432	CGT	2	6	17727	17732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009432	GCT	2	6	17733	17738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009432	GCC	2	6	17743	17748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_009432	AGA	2	6	17767	17772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009432	ATG	2	6	17773	17778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009432	ACG	2	6	23332	23337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009432	AGA	2	6	23362	23367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009432	CGC	2	6	23426	23431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_009432	CGG	2	6	23556	23561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009432	CGC	2	6	23688	23693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_009432	TGG	2	6	23998	24003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009432	GAG	2	6	24006	24011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009432	TCG	2	6	24079	24084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009432	CTC	2	6	24088	24093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_009432	AAC	2	6	24734	24739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009432	CAC	2	6	24765	24770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_009432	GCC	2	6	24935	24940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_009432	ATT	2	6	26202	26207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009432	TGC	2	6	26232	26237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009432	GAG	2	6	26330	26335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009432	ACG	2	6	26439	26444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_009432	GCG	2	6	26492	26497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009432	GGC	2	6	26506	26511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009432	CTG	2	6	29711	29716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009432	GCA	2	6	29729	29734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009432	AAC	2	6	29760	29765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009432	AGG	2	6	29877	29882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009432	ATC	2	6	29902	29907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009432	CCG	2	6	29949	29954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_009432	TCC	2	6	30883	30888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_009432	CGC	2	6	31951	31956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_009432	TCC	2	6	32200	32205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_009432	GAA	2	6	32226	32231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009432	TTC	2	6	32304	32309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009432	GGA	2	6	32345	32350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009432	CAG	2	6	32448	32453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009432	GGC	2	6	32459	32464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_009432	CGC	2	6	32468	32473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_009432	CGG	2	6	32510	32515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009432	CGC	2	6	32585	32590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_009432	GAT	2	6	32669	32674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009432	GAC	2	6	32691	32696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_009432	GCG	2	6	32773	32778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009432	CCG	2	6	32831	32836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_009432	TAT	2	6	33161	33166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009432	CGC	2	6	33184	33189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_009432	CGG	2	6	33336	33341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_009432	CGG	2	6	33346	33351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009432	GCG	2	6	33375	33380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009432	TGG	2	6	33384	33389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009432	CGC	2	6	33415	33420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_009432	CGG	2	6	33434	33439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_009432	CGG	2	6	33580	33585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_009432	CCG	2	6	33708	33713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_009432	CGC	2	6	33805	33810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_009432	CCG	2	6	33812	33817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_009432	CGG	2	6	33827	33832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_009432	GGC	2	6	33833	33838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_009432	CCA	2	6	33901	33906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_009432	GAA	2	6	34215	34220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009432	CGG	2	6	36102	36107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009432	GTC	3	9	36109	36117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.