MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA04

Total Repeats: 486

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009432	GCC	2	6	514	519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280353
2	NC_009432	GCT	2	6	520	525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280353
3	NC_009432	GCG	2	6	535	540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280353
4	NC_009432	GCC	2	6	566	571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280353
5	NC_009432	GCG	3	9	632	640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280353
6	NC_009432	GAG	2	6	806	811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280353
7	NC_009432	TTC	2	6	852	857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280353
8	NC_009432	CGC	2	6	865	870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280353
9	NC_009432	GCC	2	6	873	878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280353
10	NC_009432	AGG	2	6	992	997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280354
11	NC_009432	CGC	2	6	1128	1133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280354
12	NC_009432	GTG	2	6	1146	1151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280354
13	NC_009432	GGC	2	6	1229	1234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280354
14	NC_009432	GCC	2	6	1314	1319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280354
15	NC_009432	ACG	2	6	1348	1353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280354
16	NC_009432	TCT	2	6	1408	1413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280354
17	NC_009432	GGC	2	6	1486	1491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280354
18	NC_009432	ATG	2	6	1564	1569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280354
19	NC_009432	CGC	2	6	1689	1694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280354
20	NC_009432	CGG	2	6	1761	1766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280354
21	NC_009432	AGC	2	6	1810	1815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280354
22	NC_009432	GCG	2	6	1838	1843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280354
23	NC_009432	GCC	2	6	1857	1862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280354
24	NC_009432	CAT	2	6	2282	2287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280355
25	NC_009432	CGA	2	6	3245	3250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280356
26	NC_009432	GCG	2	6	3289	3294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280356
27	NC_009432	TGG	2	6	3441	3446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280356
28	NC_009432	GAG	2	6	3543	3548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280356
29	NC_009432	AGC	2	6	3565	3570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280356
30	NC_009432	TCT	2	6	3584	3589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280356
31	NC_009432	GCC	3	9	3604	3612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280356
32	NC_009432	GCT	2	6	3626	3631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280356
33	NC_009432	AGC	2	6	3760	3765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280356
34	NC_009432	AGC	2	6	3822	3827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280356
35	NC_009432	GGC	2	6	3892	3897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280356
36	NC_009432	GCC	2	6	3963	3968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280356
37	NC_009432	CGC	2	6	3982	3987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280356
38	NC_009432	GGA	2	6	4010	4015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280356
39	NC_009432	GCC	2	6	4233	4238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280356
40	NC_009432	GGA	2	6	4277	4282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280356
41	NC_009432	GCT	2	6	4339	4344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280356
42	NC_009432	ATG	2	6	4513	4518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280356
43	NC_009432	CTT	2	6	4527	4532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280356
44	NC_009432	TAG	2	6	4546	4551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280356
45	NC_009432	CCG	2	6	4780	4785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280356
46	NC_009432	TAC	2	6	4806	4811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280356
47	NC_009432	TCT	2	6	4848	4853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280356
48	NC_009432	CCT	2	6	4871	4876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146280356
49	NC_009432	TCT	2	6	5075	5080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280356
50	NC_009432	CTG	2	6	5145	5150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280356
51	NC_009432	CAT	2	6	5216	5221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280356
52	NC_009432	AAG	2	6	5235	5240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146280356
53	NC_009432	CGA	3	9	5390	5398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280356
54	NC_009432	TCG	2	6	5428	5433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280356
55	NC_009432	TCG	2	6	6096	6101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280357
56	NC_009432	GAA	2	6	6103	6108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146280357
57	NC_009432	CGA	2	6	6111	6116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280357
58	NC_009432	GTC	2	6	6145	6150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280357
59	NC_009432	GGC	2	6	6298	6303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280357
60	NC_009432	CAT	2	6	6325	6330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280357
61	NC_009432	TGC	2	6	6333	6338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280357
62	NC_009432	GCG	2	6	6349	6354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280357
63	NC_009432	ATC	2	6	6382	6387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280357
64	NC_009432	GAG	2	6	6406	6411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280357
65	NC_009432	CCA	2	6	6519	6524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280357
66	NC_009432	TTA	2	6	6840	6845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146280358
67	NC_009432	TAT	2	6	6878	6883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146280358
68	NC_009432	TCG	2	6	6889	6894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280358
69	NC_009432	CTT	3	9	6908	6916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280358
70	NC_009432	ATG	2	6	6971	6976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280358
71	NC_009432	GAG	2	6	7101	7106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280358
72	NC_009432	CTA	2	6	7244	7249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280358
73	NC_009432	GTC	3	9	7251	7259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280358
74	NC_009432	AGC	2	6	7305	7310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280358
75	NC_009432	TCC	2	6	7313	7318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146280358
76	NC_009432	CAA	2	6	7334	7339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146280358
77	NC_009432	TCG	2	6	7495	7500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280359
78	NC_009432	GCC	2	6	7567	7572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280359
79	NC_009432	CCG	2	6	7576	7581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280359
80	NC_009432	GGC	2	6	7620	7625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280359
81	NC_009432	CGC	2	6	7643	7648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280359
82	NC_009432	CGA	2	6	7694	7699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280359
83	NC_009432	ACG	2	6	7705	7710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280359
84	NC_009432	GCC	2	6	7741	7746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280359
85	NC_009432	CGA	3	9	7874	7882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280359
86	NC_009432	GGC	2	6	7981	7986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280359
87	NC_009432	CGC	2	6	8008	8013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280359
88	NC_009432	GCC	2	6	8014	8019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280359
89	NC_009432	GTC	2	6	8064	8069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280359
90	NC_009432	TGC	2	6	8129	8134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280359
91	NC_009432	CGG	2	6	8202	8207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280359
92	NC_009432	GCA	2	6	8312	8317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280359
93	NC_009432	GTC	2	6	8358	8363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280359
94	NC_009432	GAC	2	6	8373	8378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280359
95	NC_009432	TGG	2	6	8525	8530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280359
96	NC_009432	GAT	2	6	8559	8564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280359
97	NC_009432	TGA	2	6	8609	8614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280359
98	NC_009432	ATG	2	6	8738	8743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280359
99	NC_009432	CAC	2	6	8984	8989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280360
100	NC_009432	CGA	2	6	8990	8995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280360
101	NC_009432	GCC	2	6	9011	9016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280360
102	NC_009432	GGC	2	6	9151	9156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280360
103	NC_009432	ACG	3	9	9180	9188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280360
104	NC_009432	TGT	2	6	9205	9210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146280360
105	NC_009432	CTT	2	6	9253	9258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280360
106	NC_009432	CTG	2	6	9314	9319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280360
107	NC_009432	CGG	2	6	9363	9368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280360
108	NC_009432	CGC	2	6	9734	9739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280361
109	NC_009432	CAC	2	6	9770	9775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280361
110	NC_009432	CCG	2	6	9802	9807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280361
111	NC_009432	CTG	2	6	9866	9871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280361
112	NC_009432	ATC	3	9	9878	9886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280361
113	NC_009432	AGC	2	6	9900	9905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280361
114	NC_009432	CTG	2	6	9959	9964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280361
115	NC_009432	GTT	2	6	10386	10391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146280362
116	NC_009432	CGC	2	6	10604	10609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280362
117	NC_009432	GGC	2	6	10643	10648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280362
118	NC_009432	CGG	3	9	10845	10853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280362
119	NC_009432	CAT	2	6	10870	10875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280362
120	NC_009432	TTC	2	6	10962	10967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280362
121	NC_009432	CGC	3	9	11008	11016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280362
122	NC_009432	GCT	2	6	11315	11320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280362
123	NC_009432	GCC	2	6	11344	11349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280362
124	NC_009432	CGG	2	6	11430	11435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280362
125	NC_009432	GCG	2	6	11481	11486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280362
126	NC_009432	CGG	2	6	11518	11523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280362
127	NC_009432	ATG	2	6	11553	11558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280362
128	NC_009432	TGA	2	6	11614	11619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280362
129	NC_009432	CGG	2	6	11707	11712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280362
130	NC_009432	TGG	2	6	11746	11751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280362
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254	NC_009432	CCG	2	6	17867	17872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280368
255	NC_009432	GCC	2	6	17878	17883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280368
256	NC_009432	CCG	2	6	17885	17890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280368
257	NC_009432	GCC	2	6	17893	17898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280368
258	NC_009432	CGA	2	6	17913	17918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280368
259	NC_009432	GAA	2	6	17979	17984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146280368
260	NC_009432	GAA	3	9	17986	17994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146280368
261	NC_009432	GGC	2	6	18025	18030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280368
262	NC_009432	CGG	2	6	18033	18038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280368
263	NC_009432	GGT	2	6	18061	18066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280368
264	NC_009432	CAG	2	6	18115	18120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280368
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266	NC_009432	CAC	2	6	18256	18261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280368
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268	NC_009432	TGC	2	6	18327	18332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280368
269	NC_009432	CCT	2	6	18354	18359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146280368
270	NC_009432	GAT	2	6	18520	18525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280368
271	NC_009432	ATG	2	6	18605	18610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280368
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273	NC_009432	GCT	2	6	18661	18666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280368
274	NC_009432	GCA	2	6	18720	18725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280368
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279	NC_009432	ATG	2	6	19019	19024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280370
280	NC_009432	GCC	2	6	19026	19031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280370
281	NC_009432	GCC	2	6	19075	19080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280370
282	NC_009432	GCT	2	6	19094	19099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280370
283	NC_009432	CGC	2	6	19116	19121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280370
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285	NC_009432	GCA	2	6	19163	19168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280370
286	NC_009432	CCT	2	6	19208	19213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146280370
287	NC_009432	CTG	2	6	19236	19241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280370
288	NC_009432	CCA	2	6	19258	19263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280370
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371	NC_009432	GCC	2	6	24595	24600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280375
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377	NC_009432	CGG	2	6	25277	25282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280376
378	NC_009432	GCG	2	6	25406	25411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280376
379	NC_009432	CGG	2	6	25428	25433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280376
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381	NC_009432	CCG	2	6	25491	25496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280376
382	NC_009432	GCC	2	6	25512	25517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280376
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