MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA04

Total Repeats: 99

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009432	CT	3	6	86	91	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009432	GC	3	6	1132	1137	0 %	0 %	50 %	50 %	146280354
3	NC_009432	CG	3	6	1458	1463	0 %	0 %	50 %	50 %	146280354
4	NC_009432	GA	6	12	2368	2379	50 %	0 %	50 %	0 %	146280355
5	NC_009432	CG	3	6	2703	2708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009432	GC	3	6	2726	2731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009432	AG	3	6	2791	2796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009432	CG	3	6	3111	3116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009432	GC	3	6	3144	3149	0 %	0 %	50 %	50 %	146280356
10	NC_009432	GC	3	6	3194	3199	0 %	0 %	50 %	50 %	146280356
11	NC_009432	GC	3	6	3684	3689	0 %	0 %	50 %	50 %	146280356
12	NC_009432	CT	3	6	4178	4183	0 %	50 %	0 %	50 %	146280356
13	NC_009432	TG	3	6	4258	4263	0 %	50 %	50 %	0 %	146280356
14	NC_009432	GC	3	6	4772	4777	0 %	0 %	50 %	50 %	146280356
15	NC_009432	AT	3	6	4855	4860	50 %	50 %	0 %	0 %	146280356
16	NC_009432	GC	3	6	5900	5905	0 %	0 %	50 %	50 %	146280357
17	NC_009432	GC	3	6	6161	6166	0 %	0 %	50 %	50 %	146280357
18	NC_009432	GC	3	6	6493	6498	0 %	0 %	50 %	50 %	146280357
19	NC_009432	TC	3	6	6815	6820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009432	AG	3	6	7142	7147	50 %	0 %	50 %	0 %	146280358
21	NC_009432	GC	3	6	8133	8138	0 %	0 %	50 %	50 %	146280359
22	NC_009432	GA	3	6	8299	8304	50 %	0 %	50 %	0 %	146280359
23	NC_009432	CG	3	6	8436	8441	0 %	0 %	50 %	50 %	146280359
24	NC_009432	CG	3	6	9519	9524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_009432	TC	3	6	9928	9933	0 %	50 %	0 %	50 %	146280361
26	NC_009432	GC	3	6	10400	10405	0 %	0 %	50 %	50 %	146280362
27	NC_009432	CG	3	6	10461	10466	0 %	0 %	50 %	50 %	146280362
28	NC_009432	GC	3	6	10608	10613	0 %	0 %	50 %	50 %	146280362
29	NC_009432	GC	3	6	10818	10823	0 %	0 %	50 %	50 %	146280362
30	NC_009432	CG	3	6	10937	10942	0 %	0 %	50 %	50 %	146280362
31	NC_009432	CG	3	6	11127	11132	0 %	0 %	50 %	50 %	146280362
32	NC_009432	CG	3	6	11246	11251	0 %	0 %	50 %	50 %	146280362
33	NC_009432	GC	3	6	13546	13551	0 %	0 %	50 %	50 %	146280363
34	NC_009432	CG	3	6	13579	13584	0 %	0 %	50 %	50 %	146280363
35	NC_009432	CG	3	6	13896	13901	0 %	0 %	50 %	50 %	146280364
36	NC_009432	GC	3	6	14031	14036	0 %	0 %	50 %	50 %	146280364
37	NC_009432	CG	3	6	14952	14957	0 %	0 %	50 %	50 %	146280365
38	NC_009432	GC	3	6	15102	15107	0 %	0 %	50 %	50 %	146280365
39	NC_009432	CG	3	6	15646	15651	0 %	0 %	50 %	50 %	146280365
40	NC_009432	CG	4	8	15713	15720	0 %	0 %	50 %	50 %	146280365
41	NC_009432	CG	3	6	16299	16304	0 %	0 %	50 %	50 %	146280366
42	NC_009432	CG	3	6	16495	16500	0 %	0 %	50 %	50 %	146280366
43	NC_009432	CG	3	6	16531	16536	0 %	0 %	50 %	50 %	146280366
44	NC_009432	CG	3	6	16672	16677	0 %	0 %	50 %	50 %	146280366
45	NC_009432	GC	3	6	17317	17322	0 %	0 %	50 %	50 %	146280367
46	NC_009432	CG	3	6	17549	17554	0 %	0 %	50 %	50 %	146280367
47	NC_009432	CG	4	8	18822	18829	0 %	0 %	50 %	50 %	146280369
48	NC_009432	CG	3	6	18893	18898	0 %	0 %	50 %	50 %	146280369
49	NC_009432	GA	3	6	19276	19281	50 %	0 %	50 %	0 %	146280370
50	NC_009432	GA	3	6	19699	19704	50 %	0 %	50 %	0 %	146280370
51	NC_009432	CG	3	6	20052	20057	0 %	0 %	50 %	50 %	146280371
52	NC_009432	GC	3	6	20442	20447	0 %	0 %	50 %	50 %	146280371
53	NC_009432	GC	3	6	20611	20616	0 %	0 %	50 %	50 %	146280371
54	NC_009432	GC	3	6	20664	20669	0 %	0 %	50 %	50 %	146280371
55	NC_009432	CG	4	8	21022	21029	0 %	0 %	50 %	50 %	146280371
56	NC_009432	CG	3	6	21165	21170	0 %	0 %	50 %	50 %	146280371
57	NC_009432	GC	3	6	22171	22176	0 %	0 %	50 %	50 %	146280372
58	NC_009432	CG	3	6	22502	22507	0 %	0 %	50 %	50 %	146280373
59	NC_009432	CG	3	6	22949	22954	0 %	0 %	50 %	50 %	146280374
60	NC_009432	CG	4	8	23126	23133	0 %	0 %	50 %	50 %	146280374
61	NC_009432	CG	3	6	23172	23177	0 %	0 %	50 %	50 %	146280374
62	NC_009432	GC	4	8	23433	23440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_009432	CA	3	6	23796	23801	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_009432	CG	3	6	23832	23837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009432	TC	3	6	24284	24289	0 %	50 %	0 %	50 %	146280375
66	NC_009432	CG	3	6	24791	24796	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009432	CG	3	6	25212	25217	0 %	0 %	50 %	50 %	146280376
68	NC_009432	GC	3	6	25565	25570	0 %	0 %	50 %	50 %	146280376
69	NC_009432	GC	3	6	26070	26075	0 %	0 %	50 %	50 %	146280376
70	NC_009432	TC	3	6	26614	26619	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_009432	TC	3	6	26627	26632	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_009432	TG	3	6	26865	26870	0 %	50 %	50 %	0 %	146280377
73	NC_009432	CG	3	6	27125	27130	0 %	0 %	50 %	50 %	146280377
74	NC_009432	GC	3	6	27812	27817	0 %	0 %	50 %	50 %	146280378
75	NC_009432	AG	3	6	29367	29372	50 %	0 %	50 %	0 %	146280379
76	NC_009432	GC	3	6	29492	29497	0 %	0 %	50 %	50 %	146280379
77	NC_009432	CT	3	6	29973	29978	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_009432	GC	4	8	30126	30133	0 %	0 %	50 %	50 %	146280380
79	NC_009432	CG	3	6	30737	30742	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_009432	CG	3	6	30794	30799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_009432	CG	4	8	31074	31081	0 %	0 %	50 %	50 %	146280381
82	NC_009432	GC	3	6	31167	31172	0 %	0 %	50 %	50 %	146280381
83	NC_009432	CG	3	6	31481	31486	0 %	0 %	50 %	50 %	146280381
84	NC_009432	CG	3	6	31648	31653	0 %	0 %	50 %	50 %	146280381
85	NC_009432	CG	3	6	31786	31791	0 %	0 %	50 %	50 %	146280381
86	NC_009432	CG	3	6	31798	31803	0 %	0 %	50 %	50 %	146280381
87	NC_009432	CG	3	6	32052	32057	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_009432	CG	3	6	32111	32116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_009432	GC	3	6	32475	32480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_009432	GC	3	6	32589	32594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_009432	GC	3	6	33239	33244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_009432	GC	3	6	33659	33664	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_009432	CG	3	6	33871	33876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_009432	CG	4	8	34003	34010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_009432	GC	3	6	34136	34141	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_009432	CG	3	6	35425	35430	0 %	0 %	50 %	50 %	146280383
97	NC_009432	GA	3	6	35995	36000	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009432	GC	3	6	36042	36047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_009432	GC	3	6	36095	36100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.