MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA03

Total Repeats: 140

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009431	GCGCA	2	10	53	62	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_009431	GCGGG	2	10	292	301	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
3	NC_009431	GGGCC	2	10	355	364	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4	NC_009431	GCGCG	2	10	505	514	0 %	0 %	60 %	40 %	146280243
5	NC_009431	CTCGG	2	10	869	878	0 %	20 %	40 %	40 %	146280243
6	NC_009431	GCGCC	2	10	1475	1484	0 %	0 %	40 %	60 %	146280243
7	NC_009431	TCGGC	2	10	1728	1737	0 %	20 %	40 %	40 %	146280243
8	NC_009431	GATGC	2	10	2180	2189	20 %	20 %	40 %	20 %	146280243
9	NC_009431	CCGCC	2	10	2331	2340	0 %	0 %	20 %	80 %	146280243
10	NC_009431	GGTCT	2	10	2732	2741	0 %	40 %	40 %	20 %	146280243
11	NC_009431	AGGCC	2	10	3213	3222	20 %	0 %	40 %	40 %	146280243
12	NC_009431	CGACG	2	10	3271	3280	20 %	0 %	40 %	40 %	146280243
13	NC_009431	GGTCC	2	10	3974	3983	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_009431	AGATC	2	10	4210	4219	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_009431	GCCGT	2	10	4449	4458	0 %	20 %	40 %	40 %	146280244
16	NC_009431	CCAGG	2	10	8277	8286	20 %	0 %	40 %	40 %	146280246
17	NC_009431	GCCGC	2	10	8521	8530	0 %	0 %	40 %	60 %	146280246
18	NC_009431	CGTGA	2	10	10360	10369	20 %	20 %	40 %	20 %	146280248
19	NC_009431	CCAGC	2	10	10612	10621	20 %	0 %	20 %	60 %	146280248
20	NC_009431	GCGCG	2	10	11741	11750	0 %	0 %	60 %	40 %	146280249
21	NC_009431	GGCGC	2	10	12207	12216	0 %	0 %	60 %	40 %	146280250
22	NC_009431	CATGC	2	10	12702	12711	20 %	20 %	20 %	40 %	146280250
23	NC_009431	GGCGC	2	10	13628	13637	0 %	0 %	60 %	40 %	146280251
24	NC_009431	AGCCC	2	10	13736	13745	20 %	0 %	20 %	60 %	146280251
25	NC_009431	GCCGG	2	10	16381	16390	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
26	NC_009431	GCTCG	2	10	16545	16554	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_009431	CTTGT	2	10	17077	17086	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_009431	ACGCG	2	10	18730	18739	20 %	0 %	40 %	40 %	146280257
29	NC_009431	ATGCC	2	10	19385	19394	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_009431	GGCGT	2	10	20259	20268	0 %	20 %	60 %	20 %	146280259
31	NC_009431	TGCGC	2	10	23390	23399	0 %	20 %	40 %	40 %	146280263
32	NC_009431	GCCCC	2	10	24072	24081	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
33	NC_009431	CCGGC	2	10	24117	24126	0 %	0 %	40 %	60 %	146280264
34	NC_009431	AGCGC	2	10	26773	26782	20 %	0 %	40 %	40 %	146280265
35	NC_009431	GGTCC	2	10	27039	27048	0 %	20 %	40 %	40 %	146280266
36	NC_009431	GCGGG	2	10	27353	27362	0 %	0 %	80 %	20 %	146280266
37	NC_009431	AGAGC	2	10	27627	27636	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_009431	CGGCG	2	10	28312	28321	0 %	0 %	60 %	40 %	146280267
39	NC_009431	GCCAC	2	10	28889	28898	20 %	0 %	20 %	60 %	146280268
40	NC_009431	TCGCC	2	10	29604	29613	0 %	20 %	20 %	60 %	146280268
41	NC_009431	CCCGG	2	10	32874	32883	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
42	NC_009431	CGGCG	2	10	32886	32895	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
43	NC_009431	CCCGG	2	10	33151	33160	0 %	0 %	40 %	60 %	146280270
44	NC_009431	ATCGC	2	10	33188	33197	20 %	20 %	20 %	40 %	146280270
45	NC_009431	AGCGC	2	10	33234	33243	20 %	0 %	40 %	40 %	146280270
46	NC_009431	CGAGA	2	10	33736	33745	40 %	0 %	40 %	20 %	146280270
47	NC_009431	ACCCG	2	10	34097	34106	20 %	0 %	20 %	60 %	146280270
48	NC_009431	GCCGC	2	10	34144	34153	0 %	0 %	40 %	60 %	146280270
49	NC_009431	CGCGG	2	10	34229	34238	0 %	0 %	60 %	40 %	146280271
50	NC_009431	CCGAC	2	10	34263	34272	20 %	0 %	20 %	60 %	146280271
51	NC_009431	CCCGG	2	10	34827	34836	0 %	0 %	40 %	60 %	146280272
52	NC_009431	GACCT	2	10	36010	36019	20 %	20 %	20 %	40 %	146280273
53	NC_009431	CGATG	2	10	36072	36081	20 %	20 %	40 %	20 %	146280273
54	NC_009431	GATCG	2	10	38236	38245	20 %	20 %	40 %	20 %	146280275
55	NC_009431	CGGAC	2	10	38476	38485	20 %	0 %	40 %	40 %	146280275
56	NC_009431	GCGCA	2	10	39458	39467	20 %	0 %	40 %	40 %	146280275
57	NC_009431	GGGCG	2	10	44069	44078	0 %	0 %	80 %	20 %	146280277
58	NC_009431	CGGTC	2	10	45550	45559	0 %	20 %	40 %	40 %	146280278
59	NC_009431	GGACA	2	10	45971	45980	40 %	0 %	40 %	20 %	146280278
60	NC_009431	TGCCT	2	10	46732	46741	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_009431	CGGAG	2	10	46878	46887	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
62	NC_009431	GCGCA	2	10	47120	47129	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
63	NC_009431	GATCC	2	10	48004	48013	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_009431	CGTTC	2	10	49064	49073	0 %	40 %	20 %	40 %	146280281
65	NC_009431	CACCG	2	10	49074	49083	20 %	0 %	20 %	60 %	146280281
66	NC_009431	CCGCG	2	10	50558	50567	0 %	0 %	40 %	60 %	146280281
67	NC_009431	CTGCA	2	10	52203	52212	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_009431	GAGCA	2	10	53400	53409	40 %	0 %	40 %	20 %	146280287
69	NC_009431	GTGCG	2	10	54132	54141	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
70	NC_009431	TAGCC	2	10	55522	55531	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_009431	GAACC	2	10	55807	55816	40 %	0 %	20 %	40 %	146280291
72	NC_009431	GCGGG	2	10	55907	55916	0 %	0 %	80 %	20 %	146280292
73	NC_009431	GCATG	2	10	56940	56949	20 %	20 %	40 %	20 %	146280293
74	NC_009431	GACGA	2	10	57072	57081	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_009431	CGCTG	2	10	57752	57761	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_009431	CTGAA	2	10	59307	59316	40 %	20 %	20 %	20 %	146280296
77	NC_009431	TCTGT	2	10	63162	63171	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_009431	CGCGC	2	10	64380	64389	0 %	0 %	40 %	60 %	146280301
79	NC_009431	GCTGC	2	10	67700	67709	0 %	20 %	40 %	40 %	146280305
80	NC_009431	GGCGA	2	10	67781	67790	20 %	0 %	60 %	20 %	146280305
81	NC_009431	CGCAG	2	10	68165	68174	20 %	0 %	40 %	40 %	146280305
82	NC_009431	GCGCG	2	10	68940	68949	0 %	0 %	60 %	40 %	146280306
83	NC_009431	AGCGC	2	10	69318	69327	20 %	0 %	40 %	40 %	146280306
84	NC_009431	GGCGC	2	10	71406	71415	0 %	0 %	60 %	40 %	146280309
85	NC_009431	TTCCG	2	10	72426	72435	0 %	40 %	20 %	40 %	146280310
86	NC_009431	GCCGA	2	10	74337	74346	20 %	0 %	40 %	40 %	146280312
87	NC_009431	TGCCG	2	10	74614	74623	0 %	20 %	40 %	40 %	146280312
88	NC_009431	GTGCC	2	10	74839	74848	0 %	20 %	40 %	40 %	146280312
89	NC_009431	GGCTG	2	10	74917	74926	0 %	20 %	60 %	20 %	146280312
90	NC_009431	GCGCG	2	10	77748	77757	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
91	NC_009431	CGCGC	2	10	78818	78827	0 %	0 %	40 %	60 %	146280315
92	NC_009431	GCGCC	2	10	83382	83391	0 %	0 %	40 %	60 %	146280319
93	NC_009431	CCCGG	2	10	84120	84129	0 %	0 %	40 %	60 %	146280320
94	NC_009431	CGCGC	2	10	84195	84204	0 %	0 %	40 %	60 %	146280320
95	NC_009431	AAACC	2	10	84729	84738	60 %	0 %	0 %	40 %	146280322
96	NC_009431	CTCTG	2	10	85086	85095	0 %	40 %	20 %	40 %	146280322
97	NC_009431	TGACC	2	10	85104	85113	20 %	20 %	20 %	40 %	146280322
98	NC_009431	CGCGG	2	10	85461	85470	0 %	0 %	60 %	40 %	146280322
99	NC_009431	GCGGG	2	10	85515	85524	0 %	0 %	80 %	20 %	146280322
100	NC_009431	GATCG	2	10	85816	85825	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_009431	TGGCT	2	10	86072	86081	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_009431	GCAGC	2	10	86274	86283	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
103	NC_009431	GCGAG	2	10	86569	86578	20 %	0 %	60 %	20 %	146280324
104	NC_009431	CCGGC	2	10	87008	87017	0 %	0 %	40 %	60 %	146280324
105	NC_009431	GGGCC	2	10	87608	87617	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
106	NC_009431	CTCGC	2	10	88038	88047	0 %	20 %	20 %	60 %	146280325
107	NC_009431	GATCA	2	10	89544	89553	40 %	20 %	20 %	20 %	146280327
108	NC_009431	GCGCC	2	10	90444	90453	0 %	0 %	40 %	60 %	146280328
109	NC_009431	CCAGA	2	10	90721	90730	40 %	0 %	20 %	40 %	146280328
110	NC_009431	CGCGG	2	10	90913	90922	0 %	0 %	60 %	40 %	146280328
111	NC_009431	CATGG	2	10	92622	92631	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_009431	GATCG	2	10	92953	92962	20 %	20 %	40 %	20 %	146280330
113	NC_009431	CGAGG	2	10	92980	92989	20 %	0 %	60 %	20 %	146280330
114	NC_009431	ACGGC	2	10	93744	93753	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
115	NC_009431	CGCGG	2	10	94580	94589	0 %	0 %	60 %	40 %	146280331
116	NC_009431	GCGAC	2	10	95176	95185	20 %	0 %	40 %	40 %	146280331
117	NC_009431	CCACC	2	10	95252	95261	20 %	0 %	0 %	80 %	146280331
118	NC_009431	TCAGG	2	10	96078	96087	20 %	20 %	40 %	20 %	146280332
119	NC_009431	CGGGG	2	10	97568	97577	0 %	0 %	80 %	20 %	146280333
120	NC_009431	CGGAT	2	10	97877	97886	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_009431	CGCCC	2	10	102231	102240	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
122	NC_009431	GCGGA	2	10	102248	102257	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
123	NC_009431	CGGGG	2	10	103856	103865	0 %	0 %	80 %	20 %	146280338
124	NC_009431	CACCG	2	10	103950	103959	20 %	0 %	20 %	60 %	146280338
125	NC_009431	GGACG	2	10	105450	105459	20 %	0 %	60 %	20 %	146280340
126	NC_009431	CGGGC	2	10	105952	105961	0 %	0 %	60 %	40 %	146280341
127	NC_009431	TCGCC	2	10	107231	107240	0 %	20 %	20 %	60 %	146280342
128	NC_009431	GGGCG	2	10	107352	107361	0 %	0 %	80 %	20 %	146280342
129	NC_009431	CGGCG	2	10	108334	108343	0 %	0 %	60 %	40 %	146280343
130	NC_009431	GCCGG	2	10	110660	110669	0 %	0 %	60 %	40 %	146280346
131	NC_009431	CGGCG	2	10	111430	111439	0 %	0 %	60 %	40 %	146280346
132	NC_009431	ACCGC	2	10	111963	111972	20 %	0 %	20 %	60 %	146280347
133	NC_009431	CGGCT	2	10	111993	112002	0 %	20 %	40 %	40 %	146280347
134	NC_009431	TCCTG	2	10	113407	113416	0 %	40 %	20 %	40 %	146280347
135	NC_009431	CGGGC	2	10	115344	115353	0 %	0 %	60 %	40 %	146280348
136	NC_009431	CGGGG	2	10	116035	116044	0 %	0 %	80 %	20 %	146280348
137	NC_009431	CGGGC	2	10	118136	118145	0 %	0 %	60 %	40 %	146280349
138	NC_009431	GCGGG	2	10	118475	118484	0 %	0 %	80 %	20 %	146280349
139	NC_009431	CCGCG	2	10	120103	120112	0 %	0 %	40 %	60 %	146280350
140	NC_009431	GGCGC	2	10	121611	121620	0 %	0 %	60 %	40 %	146280351

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.