MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA03

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009431	GCGCA	2	10	53	62	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_009431	GCGGG	2	10	292	301	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
3	NC_009431	GGGCC	2	10	355	364	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4	NC_009431	GGTCC	2	10	3974	3983	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_009431	AGATC	2	10	4210	4219	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_009431	GCCGG	2	10	16381	16390	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7	NC_009431	GCTCG	2	10	16545	16554	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_009431	CTTGT	2	10	17077	17086	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_009431	ATGCC	2	10	19385	19394	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_009431	GCCCC	2	10	24072	24081	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
11	NC_009431	AGAGC	2	10	27627	27636	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_009431	CCCGG	2	10	32874	32883	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13	NC_009431	CGGCG	2	10	32886	32895	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14	NC_009431	TGCCT	2	10	46732	46741	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_009431	CGGAG	2	10	46878	46887	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_009431	GCGCA	2	10	47120	47129	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_009431	GATCC	2	10	48004	48013	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_009431	CTGCA	2	10	52203	52212	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_009431	GTGCG	2	10	54132	54141	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_009431	TAGCC	2	10	55522	55531	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_009431	GACGA	2	10	57072	57081	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_009431	CGCTG	2	10	57752	57761	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_009431	TCTGT	2	10	63162	63171	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_009431	GCGCG	2	10	77748	77757	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
25	NC_009431	GATCG	2	10	85816	85825	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_009431	TGGCT	2	10	86072	86081	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_009431	GCAGC	2	10	86274	86283	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_009431	GGGCC	2	10	87608	87617	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
29	NC_009431	CATGG	2	10	92622	92631	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_009431	ACGGC	2	10	93744	93753	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_009431	CGGAT	2	10	97877	97886	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_009431	CGCCC	2	10	102231	102240	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
33	NC_009431	GCGGA	2	10	102248	102257	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.