MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA03

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009431	CCGC	2	8	29	36	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2	NC_009431	CGGC	2	8	99	106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009431	CGCC	2	8	108	115	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_009431	GGTC	2	8	4105	4112	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009431	GCCG	2	8	7139	7146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009431	TCGT	2	8	7519	7526	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009431	CCGG	2	8	7683	7690	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009431	CGGT	2	8	7762	7769	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_009431	GGCC	2	8	7906	7913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009431	GCAT	2	8	8073	8080	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009431	GGCA	2	8	9821	9828	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009431	GAGG	2	8	14065	14072	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009431	CATC	2	8	15485	15492	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009431	GCAA	2	8	16802	16809	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009431	GACA	2	8	17191	17198	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009431	TCGA	2	8	17297	17304	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009431	CTTC	2	8	17937	17944	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_009431	TGGC	2	8	17951	17958	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009431	GGAA	2	8	18027	18034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009431	GCAA	2	8	18078	18085	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009431	GGGC	2	8	19302	19309	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009431	GGCA	2	8	19507	19514	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_009431	CCTG	2	8	19908	19915	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009431	CCGG	2	8	23942	23949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_009431	CCGG	2	8	23979	23986	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009431	CCGG	2	8	24016	24023	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009431	CCGG	2	8	24047	24054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009431	GGCG	2	8	24055	24062	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29	NC_009431	CGGC	2	8	26120	26127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009431	CCGG	2	8	27646	27653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009431	TCAT	2	8	28597	28604	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_009431	GGCA	2	8	32917	32924	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009431	GGGT	2	8	34166	34173	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009431	CCTC	2	8	34196	34203	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
35	NC_009431	GCGT	2	8	35010	35017	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009431	CACC	2	8	35218	35225	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
37	NC_009431	CGCC	2	8	37049	37056	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38	NC_009431	GCCT	2	8	40862	40869	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009431	CCGT	2	8	46816	46823	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009431	GGGC	2	8	47001	47008	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009431	CGCC	2	8	47916	47923	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
42	NC_009431	GCGG	2	8	48118	48125	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009431	AGGC	2	8	50890	50897	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009431	CACG	2	8	57617	57624	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009431	GACG	2	8	58920	58927	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009431	GGCA	2	8	61290	61297	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009431	TGCC	2	8	66036	66043	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_009431	CCAC	2	8	68692	68699	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
49	NC_009431	CGCC	2	8	72210	72217	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
50	NC_009431	TTCG	2	8	75248	75255	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_009431	GGCG	2	8	75297	75304	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
52	NC_009431	GCCG	2	8	75418	75425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009431	CGCC	2	8	75758	75765	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
54	NC_009431	CGGC	2	8	76367	76374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_009431	TGCC	2	8	76721	76728	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009431	CTTG	2	8	76730	76737	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_009431	CCGG	2	8	77919	77926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009431	GGCC	2	8	81439	81446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_009431	GCCC	2	8	86143	86150	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
60	NC_009431	AGCA	2	8	86175	86182	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009431	CGGG	2	8	87442	87449	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
62	NC_009431	CCCG	2	8	90286	90293	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
63	NC_009431	CCGG	2	8	93670	93677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_009431	GCGG	2	8	95773	95780	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
65	NC_009431	TCCG	2	8	95896	95903	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_009431	GCGG	2	8	97190	97197	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
67	NC_009431	GATG	2	8	102195	102202	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009431	CGAC	2	8	105098	105105	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_009431	GCCC	2	8	107613	107620	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.