MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA03

Total Repeats: 296

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009431	CGGG	2	8	831	838	0 %	0 %	75 %	25 %	146280243
2	NC_009431	CCGG	2	8	1031	1038	0 %	0 %	50 %	50 %	146280243
3	NC_009431	CGGC	2	8	1128	1135	0 %	0 %	50 %	50 %	146280243
4	NC_009431	CCGC	2	8	1227	1234	0 %	0 %	25 %	75 %	146280243
5	NC_009431	GGCG	2	8	1426	1433	0 %	0 %	75 %	25 %	146280243
6	NC_009431	CGGG	2	8	1658	1665	0 %	0 %	75 %	25 %	146280243
7	NC_009431	GCCC	2	8	2200	2207	0 %	0 %	25 %	75 %	146280243
8	NC_009431	CGGG	2	8	2358	2365	0 %	0 %	75 %	25 %	146280243
9	NC_009431	CGAC	2	8	2679	2686	25 %	0 %	25 %	50 %	146280243
10	NC_009431	CAGC	2	8	2893	2900	25 %	0 %	25 %	50 %	146280243
11	NC_009431	GCCG	2	8	3673	3680	0 %	0 %	50 %	50 %	146280243
12	NC_009431	ACGG	2	8	4477	4484	25 %	0 %	50 %	25 %	146280244
13	NC_009431	GCCC	2	8	4698	4705	0 %	0 %	25 %	75 %	146280244
14	NC_009431	GGTC	2	8	5869	5876	0 %	25 %	50 %	25 %	146280245
15	NC_009431	CACG	2	8	6316	6323	25 %	0 %	25 %	50 %	146280245
16	NC_009431	CCCG	2	8	8425	8432	0 %	0 %	25 %	75 %	146280246
17	NC_009431	CAGC	2	8	8984	8991	25 %	0 %	25 %	50 %	146280247
18	NC_009431	CCGA	2	8	9000	9007	25 %	0 %	25 %	50 %	146280247
19	NC_009431	GCGT	2	8	9040	9047	0 %	25 %	50 %	25 %	146280247
20	NC_009431	GCCC	2	8	10005	10012	0 %	0 %	25 %	75 %	146280248
21	NC_009431	GGCC	2	8	10506	10513	0 %	0 %	50 %	50 %	146280248
22	NC_009431	AGCC	2	8	10553	10560	25 %	0 %	25 %	50 %	146280248
23	NC_009431	GCTG	2	8	10925	10932	0 %	25 %	50 %	25 %	146280249
24	NC_009431	TCGC	2	8	10959	10966	0 %	25 %	25 %	50 %	146280249
25	NC_009431	TCGT	2	8	11772	11779	0 %	50 %	25 %	25 %	146280249
26	NC_009431	GCCG	2	8	12406	12413	0 %	0 %	50 %	50 %	146280250
27	NC_009431	GCCA	2	8	12534	12541	25 %	0 %	25 %	50 %	146280250
28	NC_009431	GCCA	2	8	12645	12652	25 %	0 %	25 %	50 %	146280250
29	NC_009431	GCCG	2	8	12969	12976	0 %	0 %	50 %	50 %	146280250
30	NC_009431	GGAC	2	8	14472	14479	25 %	0 %	50 %	25 %	146280252
31	NC_009431	CAGG	2	8	14827	14834	25 %	0 %	50 %	25 %	146280253
32	NC_009431	GACG	2	8	15722	15729	25 %	0 %	50 %	25 %	146280254
33	NC_009431	GCGG	2	8	15811	15818	0 %	0 %	75 %	25 %	146280254
34	NC_009431	GCCT	2	8	15903	15910	0 %	25 %	25 %	50 %	146280254
35	NC_009431	TCGC	2	8	16035	16042	0 %	25 %	25 %	50 %	146280254
36	NC_009431	CGGC	2	8	16178	16185	0 %	0 %	50 %	50 %	146280254
37	NC_009431	CGCC	2	8	16222	16229	0 %	0 %	25 %	75 %	146280254
38	NC_009431	GAAC	2	8	16978	16985	50 %	0 %	25 %	25 %	146280255
39	NC_009431	CGGC	2	8	17606	17613	0 %	0 %	50 %	50 %	146280256
40	NC_009431	TGCC	2	8	18311	18318	0 %	25 %	25 %	50 %	146280257
41	NC_009431	CCGC	2	8	18516	18523	0 %	0 %	25 %	75 %	146280257
42	NC_009431	CCGG	2	8	18783	18790	0 %	0 %	50 %	50 %	146280257
43	NC_009431	GGCC	2	8	19966	19973	0 %	0 %	50 %	50 %	146280259
44	NC_009431	TGGC	2	8	20976	20983	0 %	25 %	50 %	25 %	146280260
45	NC_009431	CGCT	2	8	21244	21251	0 %	25 %	25 %	50 %	146280260
46	NC_009431	CGCA	2	8	21494	21501	25 %	0 %	25 %	50 %	146280261
47	NC_009431	GCCG	2	8	22163	22170	0 %	0 %	50 %	50 %	146280261
48	NC_009431	CCGT	2	8	22225	22232	0 %	25 %	25 %	50 %	146280261
49	NC_009431	CTGG	2	8	22248	22255	0 %	25 %	50 %	25 %	146280262
50	NC_009431	ACCT	2	8	22282	22289	25 %	25 %	0 %	50 %	146280262
51	NC_009431	CTTC	2	8	22516	22523	0 %	50 %	0 %	50 %	146280262
52	NC_009431	TCCT	2	8	22669	22676	0 %	50 %	0 %	50 %	146280262
53	NC_009431	GGGC	2	8	23058	23065	0 %	0 %	75 %	25 %	146280262
54	NC_009431	CGGG	2	8	23126	23133	0 %	0 %	75 %	25 %	146280262
55	NC_009431	TTCT	2	8	23137	23144	0 %	75 %	0 %	25 %	146280262
56	NC_009431	CGCC	2	8	23497	23504	0 %	0 %	25 %	75 %	146280263
57	NC_009431	CGGG	2	8	23581	23588	0 %	0 %	75 %	25 %	146280263
58	NC_009431	GCGG	2	8	23705	23712	0 %	0 %	75 %	25 %	146280263
59	NC_009431	CGCC	2	8	23827	23834	0 %	0 %	25 %	75 %	146280263
60	NC_009431	GCCG	2	8	24993	25000	0 %	0 %	50 %	50 %	146280264
61	NC_009431	CGGT	2	8	25006	25013	0 %	25 %	50 %	25 %	146280264
62	NC_009431	GCCA	2	8	25417	25424	25 %	0 %	25 %	50 %	146280264
63	NC_009431	CGGC	2	8	25595	25602	0 %	0 %	50 %	50 %	146280264
64	NC_009431	CCGA	2	8	25771	25778	25 %	0 %	25 %	50 %	146280264
65	NC_009431	ACAT	2	8	25849	25856	50 %	25 %	0 %	25 %	146280264
66	NC_009431	CCGG	2	8	26412	26419	0 %	0 %	50 %	50 %	146280265
67	NC_009431	GCCG	2	8	26762	26769	0 %	0 %	50 %	50 %	146280265
68	NC_009431	GAGG	2	8	27498	27505	25 %	0 %	75 %	0 %	146280266
69	NC_009431	GACC	2	8	28165	28172	25 %	0 %	25 %	50 %	146280267
70	NC_009431	TCGC	2	8	28388	28395	0 %	25 %	25 %	50 %	146280267
71	NC_009431	GGCG	2	8	28749	28756	0 %	0 %	75 %	25 %	146280268
72	NC_009431	GGGT	2	8	29048	29055	0 %	25 %	75 %	0 %	146280268
73	NC_009431	GGTC	2	8	29489	29496	0 %	25 %	50 %	25 %	146280268
74	NC_009431	ACCG	2	8	30178	30185	25 %	0 %	25 %	50 %	146280268
75	NC_009431	CTGG	2	8	30709	30716	0 %	25 %	50 %	25 %	146280269
76	NC_009431	GCCG	2	8	30740	30747	0 %	0 %	50 %	50 %	146280269
77	NC_009431	TCGA	2	8	31001	31008	25 %	25 %	25 %	25 %	146280269
78	NC_009431	CGGC	2	8	31668	31675	0 %	0 %	50 %	50 %	146280269
79	NC_009431	CGTC	2	8	32266	32273	0 %	25 %	25 %	50 %	146280269
80	NC_009431	TGGA	2	8	32393	32400	25 %	25 %	50 %	0 %	146280269
81	NC_009431	CCTC	2	8	33101	33108	0 %	25 %	0 %	75 %	146280270
82	NC_009431	ACCG	2	8	33219	33226	25 %	0 %	25 %	50 %	146280270
83	NC_009431	CCGG	2	8	33765	33772	0 %	0 %	50 %	50 %	146280270
84	NC_009431	CGCC	2	8	34329	34336	0 %	0 %	25 %	75 %	146280271
85	NC_009431	GGCG	2	8	34497	34504	0 %	0 %	75 %	25 %	146280271
86	NC_009431	CTGG	2	8	34707	34714	0 %	25 %	50 %	25 %	146280272
87	NC_009431	GCCC	2	8	34764	34771	0 %	0 %	25 %	75 %	146280272
88	NC_009431	CAGC	2	8	34792	34799	25 %	0 %	25 %	50 %	146280272
89	NC_009431	GTCG	2	8	35394	35401	0 %	25 %	50 %	25 %	146280273
90	NC_009431	CATC	2	8	35451	35458	25 %	25 %	0 %	50 %	146280273
91	NC_009431	GACG	2	8	35847	35854	25 %	0 %	50 %	25 %	146280273
92	NC_009431	CAGC	2	8	36177	36184	25 %	0 %	25 %	50 %	146280273
93	NC_009431	CGAA	2	8	36188	36195	50 %	0 %	25 %	25 %	146280273
94	NC_009431	CGGC	2	8	37246	37253	0 %	0 %	50 %	50 %	146280274
95	NC_009431	GGCC	2	8	37711	37718	0 %	0 %	50 %	50 %	146280274
96	NC_009431	CCGC	2	8	39080	39087	0 %	0 %	25 %	75 %	146280275
97	NC_009431	CGCT	2	8	39386	39393	0 %	25 %	25 %	50 %	146280275
98	NC_009431	TCGA	2	8	39404	39411	25 %	25 %	25 %	25 %	146280275
99	NC_009431	GCGT	2	8	39687	39694	0 %	25 %	50 %	25 %	146280275
100	NC_009431	GCGG	2	8	39895	39902	0 %	0 %	75 %	25 %	146280275
101	NC_009431	CGGC	2	8	40245	40252	0 %	0 %	50 %	50 %	146280275
102	NC_009431	CCTG	2	8	40392	40399	0 %	25 %	25 %	50 %	146280275
103	NC_009431	CGCC	2	8	40708	40715	0 %	0 %	25 %	75 %	146280275
104	NC_009431	GCCG	2	8	40764	40771	0 %	0 %	50 %	50 %	146280275
105	NC_009431	CGCC	2	8	40772	40779	0 %	0 %	25 %	75 %	146280275
106	NC_009431	GGCG	2	8	41201	41208	0 %	0 %	75 %	25 %	146280276
107	NC_009431	CCGC	2	8	41231	41238	0 %	0 %	25 %	75 %	146280276
108	NC_009431	GCGA	2	8	41356	41363	25 %	0 %	50 %	25 %	146280276
109	NC_009431	CGTC	2	8	41738	41745	0 %	25 %	25 %	50 %	146280276
110	NC_009431	CGCA	2	8	41769	41776	25 %	0 %	25 %	50 %	146280276
111	NC_009431	GCCC	2	8	41925	41932	0 %	0 %	25 %	75 %	146280276
112	NC_009431	TGGG	2	8	41974	41981	0 %	25 %	75 %	0 %	146280276
113	NC_009431	CCGG	2	8	42368	42375	0 %	0 %	50 %	50 %	146280276
114	NC_009431	CGGC	2	8	42646	42653	0 %	0 %	50 %	50 %	146280277
115	NC_009431	CGGG	2	8	43310	43317	0 %	0 %	75 %	25 %	146280277
116	NC_009431	CGCC	2	8	43589	43596	0 %	0 %	25 %	75 %	146280277
117	NC_009431	GACC	2	8	43598	43605	25 %	0 %	25 %	50 %	146280277
118	NC_009431	CTGG	2	8	44582	44589	0 %	25 %	50 %	25 %	146280277
119	NC_009431	CCGG	2	8	44911	44918	0 %	0 %	50 %	50 %	146280278
120	NC_009431	TCGC	2	8	45369	45376	0 %	25 %	25 %	50 %	146280278
121	NC_009431	TGCG	2	8	45666	45673	0 %	25 %	50 %	25 %	146280278
122	NC_009431	AGGT	2	8	45849	45856	25 %	25 %	50 %	0 %	146280278
123	NC_009431	CGGG	2	8	46379	46386	0 %	0 %	75 %	25 %	146280279
124	NC_009431	ACCG	2	8	48164	48171	25 %	0 %	25 %	50 %	146280280
125	NC_009431	TGCG	2	8	48962	48969	0 %	25 %	50 %	25 %	146280281
126	NC_009431	TCTG	2	8	49231	49238	0 %	50 %	25 %	25 %	146280281
127	NC_009431	CTTC	2	8	49541	49548	0 %	50 %	0 %	50 %	146280281
128	NC_009431	CCGA	2	8	49555	49562	25 %	0 %	25 %	50 %	146280281
129	NC_009431	CCGG	2	8	49769	49776	0 %	0 %	50 %	50 %	146280281
130	NC_009431	CATC	2	8	50442	50449	25 %	25 %	0 %	50 %	146280281
131	NC_009431	TCGG	2	8	51628	51635	0 %	25 %	50 %	25 %	146280283
132	NC_009431	CAGC	2	8	51810	51817	25 %	0 %	25 %	50 %	146280284
133	NC_009431	ACCG	2	8	52782	52789	25 %	0 %	25 %	50 %	146280285
134	NC_009431	TTGA	2	8	52944	52951	25 %	50 %	25 %	0 %	146280286
135	NC_009431	CGGC	2	8	53164	53171	0 %	0 %	50 %	50 %	146280286
136	NC_009431	CAGG	2	8	53551	53558	25 %	0 %	50 %	25 %	146280287
137	NC_009431	GCTG	2	8	53762	53769	0 %	25 %	50 %	25 %	146280287
138	NC_009431	CTCC	2	8	54492	54499	0 %	25 %	0 %	75 %	146280288
139	NC_009431	TCGG	2	8	55028	55035	0 %	25 %	50 %	25 %	146280289
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.