MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA02

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009430	GTCCC	2	10	10325	10334	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_009430	TCCGC	2	10	11341	11350	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3	NC_009430	GCGCG	2	10	17640	17649	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4	NC_009430	GGACA	2	10	21533	21542	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_009430	CGGGG	2	10	25694	25703	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
6	NC_009430	GGGGC	2	10	27176	27185	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
7	NC_009430	GCATC	2	10	37761	37770	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_009430	CGCGG	2	10	40306	40315	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9	NC_009430	TGTCC	2	10	40941	40950	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_009430	TCCCC	2	10	44287	44296	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
11	NC_009430	TCGTG	2	10	55258	55267	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_009430	CTCGT	2	10	55740	55749	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_009430	GATCA	2	10	56408	56417	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_009430	TTGAA	2	10	58327	58336	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009430	ATGTG	2	10	58549	58558	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009430	CTCAT	2	10	58956	58965	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_009430	ATCCC	2	10	59464	59473	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
18	NC_009430	GCCCG	2	10	87199	87208	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
19	NC_009430	GCGTC	2	10	103612	103621	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_009430	TCCCT	2	10	150300	150309	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
21	NC_009430	CGGGC	2	10	151870	151879	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
22	NC_009430	CCCTC	2	10	163413	163422	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
23	NC_009430	GCCGC	2	10	163444	163453	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
24	NC_009430	CCGCG	2	10	163555	163564	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
25	NC_009430	CCCGG	2	10	166038	166047	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
26	NC_009430	CGCGC	2	10	166113	166122	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
27	NC_009430	AAACC	2	10	166652	166661	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_009430	GCGCC	2	10	172320	172329	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
29	NC_009430	GGATG	2	10	185819	185828	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009430	CGGCC	2	10	186586	186595	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
31	NC_009430	TCGGT	2	10	197601	197610	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_009430	CTGCC	2	10	201454	201463	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
33	NC_009430	CAGCT	2	10	202491	202500	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_009430	CCGGG	2	10	209414	209423	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
35	NC_009430	GGCCG	2	10	213024	213033	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
36	NC_009430	CCTGC	2	10	228981	228990	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
37	NC_009430	CTCGC	2	10	233782	233791	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
38	NC_009430	GCGGA	2	10	233890	233899	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
39	NC_009430	CTTCC	2	10	245088	245097	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
40	NC_009430	ATCCG	2	10	248743	248752	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_009430	CGGGG	2	10	249904	249913	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
42	NC_009430	AACGA	2	10	262662	262671	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_009430	TCATT	2	10	263639	263648	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_009430	GGCGC	2	10	273398	273407	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
45	NC_009430	GGCAA	2	10	275136	275145	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_009430	AGTCT	2	10	280854	280863	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_009430	TTCCC	2	10	284897	284906	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
48	NC_009430	CGGTC	2	10	286068	286077	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_009430	CTGCC	2	10	288110	288119	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.