MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA02

Total Repeats: 228

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009430	CCGAT	2	10	488	497	20 %	20 %	20 %	40 %	146279974
2	NC_009430	CCGGA	2	10	1481	1490	20 %	0 %	40 %	40 %	146279976
3	NC_009430	GGGGT	2	10	1640	1649	0 %	20 %	80 %	0 %	146279977
4	NC_009430	GCCCC	2	10	3586	3595	0 %	0 %	20 %	80 %	146279978
5	NC_009430	GCCCC	2	10	4019	4028	0 %	0 %	20 %	80 %	146279979
6	NC_009430	GGCCT	2	10	4687	4696	0 %	20 %	40 %	40 %	146279979
7	NC_009430	CCGAG	2	10	5590	5599	20 %	0 %	40 %	40 %	146279980
8	NC_009430	GGCCC	2	10	5805	5814	0 %	0 %	40 %	60 %	146279980
9	NC_009430	CCGGG	2	10	5973	5982	0 %	0 %	60 %	40 %	146279980
10	NC_009430	GCCCG	2	10	8140	8149	0 %	0 %	40 %	60 %	146279982
11	NC_009430	GCCCC	2	10	8634	8643	0 %	0 %	20 %	80 %	146279983
12	NC_009430	CGTCC	2	10	9174	9183	0 %	20 %	20 %	60 %	146279984
13	NC_009430	CGGCC	2	10	9455	9464	0 %	0 %	40 %	60 %	146279984
14	NC_009430	GCCGC	2	10	10264	10273	0 %	0 %	40 %	60 %	146279985
15	NC_009430	CATCA	2	10	14795	14804	40 %	20 %	0 %	40 %	146279992
16	NC_009430	CGCGC	2	10	16563	16572	0 %	0 %	40 %	60 %	146279993
17	NC_009430	CAGCT	2	10	18028	18037	20 %	20 %	20 %	40 %	146279995
18	NC_009430	GCGCG	2	10	18607	18616	0 %	0 %	60 %	40 %	146279995
19	NC_009430	CGGGC	2	10	19781	19790	0 %	0 %	60 %	40 %	146279996
20	NC_009430	CATCG	2	10	19889	19898	20 %	20 %	20 %	40 %	146279996
21	NC_009430	CGGTC	2	10	20392	20401	0 %	20 %	40 %	40 %	146279996
22	NC_009430	GGGCG	2	10	20909	20918	0 %	0 %	80 %	20 %	146279996
23	NC_009430	GCGCG	2	10	20971	20980	0 %	0 %	60 %	40 %	146279996
24	NC_009430	TCGCG	2	10	23557	23566	0 %	20 %	40 %	40 %	146279999
25	NC_009430	CCGGC	2	10	23794	23803	0 %	0 %	40 %	60 %	146279999
26	NC_009430	CGGCT	2	10	27920	27929	0 %	20 %	40 %	40 %	146280002
27	NC_009430	ACCGC	2	10	28345	28354	20 %	0 %	20 %	60 %	146280003
28	NC_009430	GCCCG	2	10	28626	28635	0 %	0 %	40 %	60 %	146280003
29	NC_009430	CACGG	2	10	30417	30426	20 %	0 %	40 %	40 %	146280004
30	NC_009430	CGCTG	2	10	30643	30652	0 %	20 %	40 %	40 %	146280004
31	NC_009430	TCTGG	2	10	30875	30884	0 %	40 %	40 %	20 %	146280004
32	NC_009430	CGGCA	2	10	33687	33696	20 %	0 %	40 %	40 %	146280005
33	NC_009430	GCGTC	2	10	33699	33708	0 %	20 %	40 %	40 %	146280005
34	NC_009430	TGCCG	2	10	34322	34331	0 %	20 %	40 %	40 %	146280006
35	NC_009430	GTCCG	2	10	36557	36566	0 %	20 %	40 %	40 %	146280007
36	NC_009430	TCCGA	2	10	38725	38734	20 %	20 %	20 %	40 %	146280009
37	NC_009430	GCATC	2	10	39521	39530	20 %	20 %	20 %	40 %	146280010
38	NC_009430	TTCCG	2	10	40913	40922	0 %	40 %	20 %	40 %	146280011
39	NC_009430	GCCCG	2	10	42845	42854	0 %	0 %	40 %	60 %	146280015
40	NC_009430	AGGAC	2	10	43099	43108	40 %	0 %	40 %	20 %	146280015
41	NC_009430	GCGCC	2	10	43509	43518	0 %	0 %	40 %	60 %	146280015
42	NC_009430	GCGGG	2	10	45184	45193	0 %	0 %	80 %	20 %	146280016
43	NC_009430	CTTCT	2	10	45853	45862	0 %	60 %	0 %	40 %	146280017
44	NC_009430	CGCGG	2	10	47314	47323	0 %	0 %	60 %	40 %	146280018
45	NC_009430	CGGAG	2	10	47994	48003	20 %	0 %	60 %	20 %	146280018
46	NC_009430	CCGCG	2	10	48209	48218	0 %	0 %	40 %	60 %	146280018
47	NC_009430	CCACG	2	10	48802	48811	20 %	0 %	20 %	60 %	146280019
48	NC_009430	GACCA	2	10	49283	49292	40 %	0 %	20 %	40 %	146280019
49	NC_009430	TGCTC	2	10	50869	50878	0 %	40 %	20 %	40 %	146280021
50	NC_009430	GGCGA	2	10	51237	51246	20 %	0 %	60 %	20 %	146280021
51	NC_009430	CGCGG	2	10	52120	52129	0 %	0 %	60 %	40 %	146280022
52	NC_009430	CCCGC	2	10	52672	52681	0 %	0 %	20 %	80 %	146280022
53	NC_009430	CCCTG	2	10	53008	53017	0 %	20 %	20 %	60 %	146280022
54	NC_009430	CGCTC	2	10	61196	61205	0 %	20 %	20 %	60 %	146280025
55	NC_009430	CAGCG	2	10	61733	61742	20 %	0 %	40 %	40 %	146280026
56	NC_009430	CGGGT	2	10	62231	62240	0 %	20 %	60 %	20 %	146280026
57	NC_009430	AGGCG	2	10	64632	64641	20 %	0 %	60 %	20 %	146280030
58	NC_009430	AGGGC	2	10	64670	64679	20 %	0 %	60 %	20 %	146280030
59	NC_009430	GCGCG	2	10	66197	66206	0 %	0 %	60 %	40 %	146280032
60	NC_009430	AGAGG	2	10	66656	66665	40 %	0 %	60 %	0 %	146280032
61	NC_009430	ACCCG	2	10	67803	67812	20 %	0 %	20 %	60 %	146280034
62	NC_009430	CGCTG	2	10	68301	68310	0 %	20 %	40 %	40 %	146280034
63	NC_009430	TGCGG	2	10	72594	72603	0 %	20 %	60 %	20 %	146280037
64	NC_009430	CGCGC	2	10	73078	73087	0 %	0 %	40 %	60 %	146280037
65	NC_009430	CGACG	2	10	73787	73796	20 %	0 %	40 %	40 %	146280037
66	NC_009430	GCGCC	2	10	73910	73919	0 %	0 %	40 %	60 %	146280037
67	NC_009430	AAGGC	2	10	74514	74523	40 %	0 %	40 %	20 %	146280038
68	NC_009430	GCCTT	2	10	75387	75396	0 %	40 %	20 %	40 %	146280039
69	NC_009430	TCGGC	2	10	76396	76405	0 %	20 %	40 %	40 %	146280040
70	NC_009430	GCCTT	2	10	76953	76962	0 %	40 %	20 %	40 %	146280041
71	NC_009430	CCGAC	2	10	77797	77806	20 %	0 %	20 %	60 %	146280041
72	NC_009430	CACGC	2	10	77978	77987	20 %	0 %	20 %	60 %	146280041
73	NC_009430	TCCGC	2	10	78427	78436	0 %	20 %	20 %	60 %	146280041
74	NC_009430	CTCGC	2	10	81019	81028	0 %	20 %	20 %	60 %	146280044
75	NC_009430	GACGG	2	10	81277	81286	20 %	0 %	60 %	20 %	146280044
76	NC_009430	GATCG	2	10	81432	81441	20 %	20 %	40 %	20 %	146280045
77	NC_009430	GCGGT	2	10	81591	81600	0 %	20 %	60 %	20 %	146280045
78	NC_009430	AGCTG	2	10	82144	82153	20 %	20 %	40 %	20 %	146280045
79	NC_009430	TGCCT	2	10	82252	82261	0 %	40 %	20 %	40 %	146280045
80	NC_009430	GCGCC	2	10	83771	83780	0 %	0 %	40 %	60 %	146280047
81	NC_009430	GCCGG	2	10	83934	83943	0 %	0 %	60 %	40 %	146280047
82	NC_009430	GGGGC	2	10	86177	86186	0 %	0 %	80 %	20 %	146280048
83	NC_009430	TGCCC	2	10	86475	86484	0 %	20 %	20 %	60 %	146280048
84	NC_009430	GCGCG	2	10	86639	86648	0 %	0 %	60 %	40 %	146280048
85	NC_009430	GCGAT	2	10	86651	86660	20 %	20 %	40 %	20 %	146280048
86	NC_009430	GCGCC	2	10	86828	86837	0 %	0 %	40 %	60 %	146280048
87	NC_009430	CTGCG	2	10	87647	87656	0 %	20 %	40 %	40 %	146280049
88	NC_009430	GCTGC	2	10	88452	88461	0 %	20 %	40 %	40 %	146280050
89	NC_009430	CGGGG	2	10	88694	88703	0 %	0 %	80 %	20 %	146280050
90	NC_009430	GGCGC	2	10	88967	88976	0 %	0 %	60 %	40 %	146280050
91	NC_009430	CGGCC	2	10	89094	89103	0 %	0 %	40 %	60 %	146280050
92	NC_009430	GGCCG	2	10	89921	89930	0 %	0 %	60 %	40 %	146280050
93	NC_009430	GGACG	2	10	90584	90593	20 %	0 %	60 %	20 %	146280051
94	NC_009430	GGCTG	2	10	90619	90628	0 %	20 %	60 %	20 %	146280051
95	NC_009430	CCGGG	2	10	90890	90899	0 %	0 %	60 %	40 %	146280051
96	NC_009430	GGCCG	2	10	91947	91956	0 %	0 %	60 %	40 %	146280052
97	NC_009430	GTCTG	2	10	92835	92844	0 %	40 %	40 %	20 %	146280052
98	NC_009430	CGGCC	2	10	93963	93972	0 %	0 %	40 %	60 %	146280052
99	NC_009430	GGCCC	2	10	94589	94598	0 %	0 %	40 %	60 %	146280053
100	NC_009430	CGCGC	2	10	95012	95021	0 %	0 %	40 %	60 %	146280053
101	NC_009430	TGCGC	2	10	96596	96605	0 %	20 %	40 %	40 %	146280053
102	NC_009430	CGATG	2	10	96899	96908	20 %	20 %	40 %	20 %	146280053
103	NC_009430	CCCCG	2	10	97660	97669	0 %	0 %	20 %	80 %	146280054
104	NC_009430	CCCGG	2	10	98189	98198	0 %	0 %	40 %	60 %	146280055
105	NC_009430	CGGCC	2	10	99147	99156	0 %	0 %	40 %	60 %	146280055
106	NC_009430	GGGGC	2	10	99177	99186	0 %	0 %	80 %	20 %	146280055
107	NC_009430	GGGCC	2	10	99438	99447	0 %	0 %	60 %	40 %	146280055
108	NC_009430	CTGGC	2	10	99454	99463	0 %	20 %	40 %	40 %	146280055
109	NC_009430	TGCGC	2	10	100731	100740	0 %	20 %	40 %	40 %	146280057
110	NC_009430	TGCCC	2	10	101310	101319	0 %	20 %	20 %	60 %	146280057
111	NC_009430	GGACC	2	10	102374	102383	20 %	0 %	40 %	40 %	146280058
112	NC_009430	GCGCC	2	10	103935	103944	0 %	0 %	40 %	60 %	146280059
113	NC_009430	GACCG	2	10	104283	104292	20 %	0 %	40 %	40 %	146280060
114	NC_009430	CGCGG	2	10	105777	105786	0 %	0 %	60 %	40 %	146280061
115	NC_009430	GCACC	2	10	110384	110393	20 %	0 %	20 %	60 %	146280066
116	NC_009430	GCCCC	2	10	111079	111088	0 %	0 %	20 %	80 %	146280066
117	NC_009430	CGCCC	2	10	111245	111254	0 %	0 %	20 %	80 %	146280066
118	NC_009430	GGACG	2	10	114053	114062	20 %	0 %	60 %	20 %	146280067
119	NC_009430	CGGGG	2	10	115719	115728	0 %	0 %	80 %	20 %	146280067
120	NC_009430	GGGCC	2	10	119597	119606	0 %	0 %	60 %	40 %	146280069
121	NC_009430	CCGGA	2	10	121347	121356	20 %	0 %	40 %	40 %	146280071
122	NC_009430	CCGGG	2	10	122471	122480	0 %	0 %	60 %	40 %	146280072
123	NC_009430	AGCGG	2	10	122609	122618	20 %	0 %	60 %	20 %	146280072
124	NC_009430	GCCGG	2	10	123544	123553	0 %	0 %	60 %	40 %	146280072
125	NC_009430	GCCCG	3	15	125110	125124	0 %	0 %	40 %	60 %	146280073
126	NC_009430	CGCGG	2	10	125902	125911	0 %	0 %	60 %	40 %	146280073
127	NC_009430	CTCGC	2	10	127429	127438	0 %	20 %	20 %	60 %	146280075
128	NC_009430	GCCGC	2	10	127531	127540	0 %	0 %	40 %	60 %	146280075
129	NC_009430	GGCCG	2	10	127659	127668	0 %	0 %	60 %	40 %	146280075
130	NC_009430	AGCCG	2	10	127778	127787	20 %	0 %	40 %	40 %	146280076
131	NC_009430	GATCT	2	10	129818	129827	20 %	40 %	20 %	20 %	146280077
132	NC_009430	GCGCT	2	10	130157	130166	0 %	20 %	40 %	40 %	146280077
133	NC_009430	TGCGC	2	10	130945	130954	0 %	20 %	40 %	40 %	146280078
134	NC_009430	TGATC	2	10	132276	132285	20 %	40 %	20 %	20 %	146280079
135	NC_009430	CCCGG	2	10	137468	137477	0 %	0 %	40 %	60 %	146280086
136	NC_009430	CCTCG	2	10	138508	138517	0 %	20 %	20 %	60 %	146280087
137	NC_009430	GACGG	2	10	143972	143981	20 %	0 %	60 %	20 %	146280093
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175	NC_009430	GGCGA	2	10	217729	217738	20 %	0 %	60 %	20 %	146280173
176	NC_009430	CCGGC	2	10	217815	217824	0 %	0 %	40 %	60 %	146280173
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179	NC_009430	CCTGA	2	10	221139	221148	20 %	20 %	20 %	40 %	146280175
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.