MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA02

Total Repeats: 881

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009430	CGGC	2	8	84	91	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009430	CGGG	2	8	230	237	0 %	0 %	75 %	25 %	146279974
3	NC_009430	GGGC	2	8	676	683	0 %	0 %	75 %	25 %	146279975
4	NC_009430	GGCG	2	8	1057	1064	0 %	0 %	75 %	25 %	146279975
5	NC_009430	GCCA	2	8	1104	1111	25 %	0 %	25 %	50 %	146279975
6	NC_009430	GACC	2	8	1400	1407	25 %	0 %	25 %	50 %	146279976
7	NC_009430	CCCG	2	8	1864	1871	0 %	0 %	25 %	75 %	146279977
8	NC_009430	CCGG	2	8	2014	2021	0 %	0 %	50 %	50 %	146279977
9	NC_009430	CGGC	2	8	2528	2535	0 %	0 %	50 %	50 %	146279977
10	NC_009430	GCCC	2	8	2667	2674	0 %	0 %	25 %	75 %	146279977
11	NC_009430	CCGC	2	8	2961	2968	0 %	0 %	25 %	75 %	146279977
12	NC_009430	CGGG	2	8	3389	3396	0 %	0 %	75 %	25 %	146279978
13	NC_009430	GGGC	2	8	3744	3751	0 %	0 %	75 %	25 %	146279978
14	NC_009430	AGCG	2	8	4624	4631	25 %	0 %	50 %	25 %	146279979
15	NC_009430	GCCC	2	8	5167	5174	0 %	0 %	25 %	75 %	146279979
16	NC_009430	GCCG	2	8	5193	5200	0 %	0 %	50 %	50 %	146279979
17	NC_009430	GCCG	2	8	5321	5328	0 %	0 %	50 %	50 %	146279980
18	NC_009430	AAGG	2	8	5759	5766	50 %	0 %	50 %	0 %	146279980
19	NC_009430	GCCC	2	8	5838	5845	0 %	0 %	25 %	75 %	146279980
20	NC_009430	GCCG	2	8	5846	5853	0 %	0 %	50 %	50 %	146279980
21	NC_009430	GGTG	2	8	6943	6950	0 %	25 %	75 %	0 %	146279982
22	NC_009430	CCCG	2	8	7150	7157	0 %	0 %	25 %	75 %	146279982
23	NC_009430	GATC	2	8	7531	7538	25 %	25 %	25 %	25 %	146279982
24	NC_009430	GCGG	2	8	7678	7685	0 %	0 %	75 %	25 %	146279982
25	NC_009430	CGGC	2	8	7774	7781	0 %	0 %	50 %	50 %	146279982
26	NC_009430	CCGG	2	8	8445	8452	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009430	CGGG	2	8	8479	8486	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009430	GCGG	3	12	9144	9155	0 %	0 %	75 %	25 %	146279984
29	NC_009430	GCCC	2	8	9268	9275	0 %	0 %	25 %	75 %	146279984
30	NC_009430	CGCC	2	8	9397	9404	0 %	0 %	25 %	75 %	146279984
31	NC_009430	GCCG	2	8	9779	9786	0 %	0 %	50 %	50 %	146279985
32	NC_009430	GTCG	2	8	10115	10122	0 %	25 %	50 %	25 %	146279985
33	NC_009430	CTGT	2	8	10380	10387	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009430	CCCG	2	8	10742	10749	0 %	0 %	25 %	75 %	146279986
35	NC_009430	GAGC	2	8	10952	10959	25 %	0 %	50 %	25 %	146279986
36	NC_009430	GAGC	2	8	11003	11010	25 %	0 %	50 %	25 %	146279986
37	NC_009430	CCGG	2	8	11107	11114	0 %	0 %	50 %	50 %	146279986
38	NC_009430	CCCG	2	8	11299	11306	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_009430	CCCA	2	8	11583	11590	25 %	0 %	0 %	75 %	146279987
40	NC_009430	CATC	2	8	11627	11634	25 %	25 %	0 %	50 %	146279987
41	NC_009430	TCGA	2	8	11871	11878	25 %	25 %	25 %	25 %	146279987
42	NC_009430	ATCT	2	8	11919	11926	25 %	50 %	0 %	25 %	146279987
43	NC_009430	GGCG	2	8	12104	12111	0 %	0 %	75 %	25 %	146279987
44	NC_009430	CCGG	2	8	12617	12624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009430	CAAG	2	8	12695	12702	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009430	GGGC	2	8	12728	12735	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009430	GCTG	2	8	12906	12913	0 %	25 %	50 %	25 %	146279988
48	NC_009430	GCCC	2	8	13205	13212	0 %	0 %	25 %	75 %	146279989
49	NC_009430	CCCG	2	8	13479	13486	0 %	0 %	25 %	75 %	146279990
50	NC_009430	GGGC	2	8	13512	13519	0 %	0 %	75 %	25 %	146279990
51	NC_009430	CCAC	2	8	14175	14182	25 %	0 %	0 %	75 %	146279992
52	NC_009430	TGCG	2	8	14466	14473	0 %	25 %	50 %	25 %	146279992
53	NC_009430	CACC	2	8	14713	14720	25 %	0 %	0 %	75 %	146279992
54	NC_009430	CGCC	2	8	14946	14953	0 %	0 %	25 %	75 %	146279992
55	NC_009430	TGGG	2	8	15347	15354	0 %	25 %	75 %	0 %	146279992
56	NC_009430	GCGG	2	8	15529	15536	0 %	0 %	75 %	25 %	146279992
57	NC_009430	CGGG	2	8	16054	16061	0 %	0 %	75 %	25 %	146279992
58	NC_009430	TGGT	2	8	16124	16131	0 %	50 %	50 %	0 %	146279992
59	NC_009430	GCCA	2	8	16370	16377	25 %	0 %	25 %	50 %	146279992
60	NC_009430	CAGA	2	8	16420	16427	50 %	0 %	25 %	25 %	146279992
61	NC_009430	TCGA	2	8	16690	16697	25 %	25 %	25 %	25 %	146279993
62	NC_009430	CTCG	2	8	17371	17378	0 %	25 %	25 %	50 %	146279994
63	NC_009430	CGCC	2	8	17416	17423	0 %	0 %	25 %	75 %	146279994
64	NC_009430	GACC	2	8	17425	17432	25 %	0 %	25 %	50 %	146279994
65	NC_009430	GCTG	2	8	17544	17551	0 %	25 %	50 %	25 %	146279994
66	NC_009430	TGCG	2	8	18217	18224	0 %	25 %	50 %	25 %	146279995
67	NC_009430	GAGC	2	8	18450	18457	25 %	0 %	50 %	25 %	146279995
68	NC_009430	GATG	2	8	18546	18553	25 %	25 %	50 %	0 %	146279995
69	NC_009430	GCCG	2	8	18557	18564	0 %	0 %	50 %	50 %	146279995
70	NC_009430	GGGC	2	8	18752	18759	0 %	0 %	75 %	25 %	146279995
71	NC_009430	GTCC	3	12	18813	18824	0 %	25 %	25 %	50 %	146279996
72	NC_009430	TTGC	2	8	18929	18936	0 %	50 %	25 %	25 %	146279996
73	NC_009430	GCGG	2	8	20058	20065	0 %	0 %	75 %	25 %	146279996
74	NC_009430	CGCC	2	8	20639	20646	0 %	0 %	25 %	75 %	146279996
75	NC_009430	GGGC	2	8	21079	21086	0 %	0 %	75 %	25 %	146279996
76	NC_009430	TGCC	2	8	22222	22229	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_009430	GCAG	2	8	22329	22336	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_009430	AGCC	2	8	22458	22465	25 %	0 %	25 %	50 %	146279998
79	NC_009430	GAAA	2	8	22957	22964	75 %	0 %	25 %	0 %	146279998
80	NC_009430	GAAC	2	8	23244	23251	50 %	0 %	25 %	25 %	146279999
81	NC_009430	TTCA	2	8	23829	23836	25 %	50 %	0 %	25 %	146279999
82	NC_009430	TCGA	2	8	24478	24485	25 %	25 %	25 %	25 %	146279999
83	NC_009430	GCAG	2	8	24958	24965	25 %	0 %	50 %	25 %	146280000
84	NC_009430	ATAC	2	8	25160	25167	50 %	25 %	0 %	25 %	146280000
85	NC_009430	CGTT	2	8	25770	25777	0 %	50 %	25 %	25 %	146280001
86	NC_009430	CGCC	2	8	26167	26174	0 %	0 %	25 %	75 %	146280001
87	NC_009430	TTCC	2	8	26681	26688	0 %	50 %	0 %	50 %	146280001
88	NC_009430	GACG	2	8	27331	27338	25 %	0 %	50 %	25 %	146280002
89	NC_009430	CTGC	2	8	27683	27690	0 %	25 %	25 %	50 %	146280002
90	NC_009430	CGAT	2	8	28432	28439	25 %	25 %	25 %	25 %	146280003
91	NC_009430	CTGA	2	8	28815	28822	25 %	25 %	25 %	25 %	146280003
92	NC_009430	TCGT	2	8	28866	28873	0 %	50 %	25 %	25 %	146280003
93	NC_009430	TCGC	2	8	29770	29777	0 %	25 %	25 %	50 %	146280004
94	NC_009430	TCGA	2	8	30585	30592	25 %	25 %	25 %	25 %	146280004
95	NC_009430	CGAC	2	8	30832	30839	25 %	0 %	25 %	50 %	146280004
96	NC_009430	GGCT	2	8	31370	31377	0 %	25 %	50 %	25 %	146280004
97	NC_009430	GCTG	2	8	31420	31427	0 %	25 %	50 %	25 %	146280004
98	NC_009430	TCCG	2	8	31754	31761	0 %	25 %	25 %	50 %	146280004
99	NC_009430	GGTC	2	8	31979	31986	0 %	25 %	50 %	25 %	146280004
100	NC_009430	CGAG	2	8	32021	32028	25 %	0 %	50 %	25 %	146280004
101	NC_009430	ATCG	2	8	32228	32235	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_009430	CTGG	2	8	32531	32538	0 %	25 %	50 %	25 %	146280005
103	NC_009430	TTCG	2	8	33294	33301	0 %	50 %	25 %	25 %	146280005
104	NC_009430	GATC	2	8	34063	34070	25 %	25 %	25 %	25 %	146280005
105	NC_009430	ACGT	2	8	34202	34209	25 %	25 %	25 %	25 %	146280006
106	NC_009430	CCCG	2	8	34279	34286	0 %	0 %	25 %	75 %	146280006
107	NC_009430	GAAG	2	8	35278	35285	50 %	0 %	50 %	0 %	146280006
108	NC_009430	TGGC	2	8	35623	35630	0 %	25 %	50 %	25 %	146280007
109	NC_009430	TCCG	2	8	36139	36146	0 %	25 %	25 %	50 %	146280007
110	NC_009430	CGGC	2	8	36237	36244	0 %	0 %	50 %	50 %	146280007
111	NC_009430	GCGG	2	8	36250	36257	0 %	0 %	75 %	25 %	146280007
112	NC_009430	TCGC	2	8	36347	36354	0 %	25 %	25 %	50 %	146280007
113	NC_009430	CCCG	2	8	36791	36798	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
114	NC_009430	CGGC	2	8	37300	37307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_009430	CGGC	2	8	37882	37889	0 %	0 %	50 %	50 %	146280008
116	NC_009430	TCGG	2	8	38745	38752	0 %	25 %	50 %	25 %	146280009
117	NC_009430	GGCG	2	8	39024	39031	0 %	0 %	75 %	25 %	146280009
118	NC_009430	CCTC	2	8	39045	39052	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
119	NC_009430	TGGC	2	8	39333	39340	0 %	25 %	50 %	25 %	146280010
120	NC_009430	CTGG	2	8	39896	39903	0 %	25 %	50 %	25 %	146280010
121	NC_009430	GCTG	2	8	40051	40058	0 %	25 %	50 %	25 %	146280010
122	NC_009430	CCCG	2	8	40144	40151	0 %	0 %	25 %	75 %	146280010
123	NC_009430	CGAA	2	8	40167	40174	50 %	0 %	25 %	25 %	146280010
124	NC_009430	CTGA	2	8	40346	40353	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_009430	CCGC	2	8	40809	40816	0 %	0 %	25 %	75 %	146280011
126	NC_009430	CGCC	2	8	40951	40958	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
127	NC_009430	GCGG	2	8	41656	41663	0 %	0 %	75 %	25 %	146280013
128	NC_009430	CGCA	2	8	41911	41918	25 %	0 %	25 %	50 %	146280013
129	NC_009430	CGGC	2	8	41977	41984	0 %	0 %	50 %	50 %	146280013
130	NC_009430	GCTG	2	8	42147	42154	0 %	25 %	50 %	25 %	146280013
131	NC_009430	CGCC	2	8	42328	42335	0 %	0 %	25 %	75 %	146280013
132	NC_009430	CGGC	2	8	42637	42644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_009430	GCCC	2	8	42652	42659	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
134	NC_009430	CGGC	2	8	42793	42800	0 %	0 %	50 %	50 %	146280015
135	NC_009430	CCGG	2	8	43036	43043	0 %	0 %	50 %	50 %	146280015
136	NC_009430	CCGA	2	8	43053	43060	25 %	0 %	25 %	50 %	146280015
137	NC_009430	CGCC	2	8	43363	43370	0 %	0 %	25 %	75 %	146280015
138	NC_009430	CCGG	2	8	43557	43564	0 %	0 %	50 %	50 %	146280015
139	NC_009430	CGGC	2	8	43642	43649	0 %	0 %	50 %	50 %	146280015
140	NC_009430	CGGG	2	8	44213	44220	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
141	NC_009430	CCGG	2	8	44225	44232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_009430	ATTT	2	8	44274	44281	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009430	CGCT	2	8	44349	44356	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_009430	ATCC	2	8	44433	44440	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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146	NC_009430	CGGC	2	8	44889	44896	0 %	0 %	50 %	50 %	146280016
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