MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA01

Total Repeats: 634

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009429	TCGGG	2	10	537	546	0 %	20 %	60 %	20 %	146279171
2	NC_009429	CCGGG	2	10	2361	2370	0 %	0 %	60 %	40 %	146279172
3	NC_009429	GCCCG	2	10	3209	3218	0 %	0 %	40 %	60 %	146279173
4	NC_009429	CCTGG	2	10	3617	3626	0 %	20 %	40 %	40 %	146279173
5	NC_009429	CGGCC	2	10	3818	3827	0 %	0 %	40 %	60 %	146279173
6	NC_009429	GCCGA	2	10	8740	8749	20 %	0 %	40 %	40 %	146279178
7	NC_009429	CGATT	2	10	11164	11173	20 %	40 %	20 %	20 %	146279181
8	NC_009429	GTCCG	2	10	12212	12221	0 %	20 %	40 %	40 %	146279182
9	NC_009429	TGGTA	2	10	12434	12443	20 %	40 %	40 %	0 %	146279182
10	NC_009429	TGGCG	2	10	13779	13788	0 %	20 %	60 %	20 %	146279185
11	NC_009429	GCCTG	2	10	15814	15823	0 %	20 %	40 %	40 %	146279186
12	NC_009429	AGGCG	2	10	15910	15919	20 %	0 %	60 %	20 %	146279186
13	NC_009429	GCTGG	2	10	16729	16738	0 %	20 %	60 %	20 %	146279186
14	NC_009429	CGCGA	2	10	16889	16898	20 %	0 %	40 %	40 %	146279186
15	NC_009429	CGCGC	2	10	17803	17812	0 %	0 %	40 %	60 %	146279187
16	NC_009429	CGCGA	2	10	19878	19887	20 %	0 %	40 %	40 %	146279189
17	NC_009429	GCGCG	2	10	24562	24571	0 %	0 %	60 %	40 %	146279193
18	NC_009429	GGCCC	2	10	29721	29730	0 %	0 %	40 %	60 %	146279198
19	NC_009429	CGCGG	2	10	31135	31144	0 %	0 %	60 %	40 %	146279199
20	NC_009429	GTCCC	2	10	31406	31415	0 %	20 %	20 %	60 %	146279200
21	NC_009429	GGGGC	2	10	31589	31598	0 %	0 %	80 %	20 %	146279200
22	NC_009429	GCCGC	2	10	34475	34484	0 %	0 %	40 %	60 %	146279202
23	NC_009429	TGGGC	2	10	36960	36969	0 %	20 %	60 %	20 %	146279206
24	NC_009429	GGGCA	2	10	37087	37096	20 %	0 %	60 %	20 %	146279206
25	NC_009429	GCGCC	2	10	39119	39128	0 %	0 %	40 %	60 %	146279208
26	NC_009429	ACCTG	2	10	39307	39316	20 %	20 %	20 %	40 %	146279208
27	NC_009429	GACCG	2	10	39639	39648	20 %	0 %	40 %	40 %	146279208
28	NC_009429	GACGG	2	10	40162	40171	20 %	0 %	60 %	20 %	146279209
29	NC_009429	TGACG	2	10	42329	42338	20 %	20 %	40 %	20 %	146279211
30	NC_009429	CGGCA	2	10	44823	44832	20 %	0 %	40 %	40 %	146279212
31	NC_009429	TGGCC	2	10	45066	45075	0 %	20 %	40 %	40 %	146279213
32	NC_009429	CGCGG	2	10	47225	47234	0 %	0 %	60 %	40 %	146279215
33	NC_009429	CGCGG	2	10	47336	47345	0 %	0 %	60 %	40 %	146279215
34	NC_009429	GGGGC	2	10	47426	47435	0 %	0 %	80 %	20 %	146279215
35	NC_009429	CCGAT	2	10	47995	48004	20 %	20 %	20 %	40 %	146279215
36	NC_009429	GGCCG	2	10	51655	51664	0 %	0 %	60 %	40 %	146279218
37	NC_009429	CGCCC	2	10	51826	51835	0 %	0 %	20 %	80 %	146279219
38	NC_009429	CCCGA	2	10	52686	52695	20 %	0 %	20 %	60 %	146279221
39	NC_009429	TCGGC	2	10	54871	54880	0 %	20 %	40 %	40 %	146279223
40	NC_009429	ACGCC	2	10	56013	56022	20 %	0 %	20 %	60 %	146279225
41	NC_009429	ACCTG	2	10	56163	56172	20 %	20 %	20 %	40 %	146279225
42	NC_009429	CCGCT	2	10	57179	57188	0 %	20 %	20 %	60 %	146279226
43	NC_009429	CGGGC	2	10	57627	57636	0 %	0 %	60 %	40 %	146279226
44	NC_009429	TGGCG	2	10	58065	58074	0 %	20 %	60 %	20 %	146279226
45	NC_009429	CCCGG	2	10	58752	58761	0 %	0 %	40 %	60 %	146279227
46	NC_009429	GCCGA	2	10	59271	59280	20 %	0 %	40 %	40 %	146279228
47	NC_009429	GACCG	2	10	59836	59845	20 %	0 %	40 %	40 %	146279229
48	NC_009429	GAAAA	2	10	59905	59914	80 %	0 %	20 %	0 %	146279229
49	NC_009429	CGACC	2	10	60159	60168	20 %	0 %	20 %	60 %	146279230
50	NC_009429	GCGCA	2	10	60922	60931	20 %	0 %	40 %	40 %	146279230
51	NC_009429	TGCGG	2	10	62146	62155	0 %	20 %	60 %	20 %	146279232
52	NC_009429	ATCGC	2	10	63342	63351	20 %	20 %	20 %	40 %	146279234
53	NC_009429	CGCTC	2	10	63367	63376	0 %	20 %	20 %	60 %	146279234
54	NC_009429	AGGGC	2	10	65553	65562	20 %	0 %	60 %	20 %	146279236
55	NC_009429	GGCGC	2	10	65586	65595	0 %	0 %	60 %	40 %	146279236
56	NC_009429	CATCT	2	10	65646	65655	20 %	40 %	0 %	40 %	146279237
57	NC_009429	ACCTG	2	10	66688	66697	20 %	20 %	20 %	40 %	146279237
58	NC_009429	GGCTG	2	10	67252	67261	0 %	20 %	60 %	20 %	146279237
59	NC_009429	TGCGG	2	10	67737	67746	0 %	20 %	60 %	20 %	146279237
60	NC_009429	CCGGC	2	10	70580	70589	0 %	0 %	40 %	60 %	146279239
61	NC_009429	GTCCG	2	10	71873	71882	0 %	20 %	40 %	40 %	146279240
62	NC_009429	GCGCA	2	10	72058	72067	20 %	0 %	40 %	40 %	146279240
63	NC_009429	CGGGC	2	10	75221	75230	0 %	0 %	60 %	40 %	146279244
64	NC_009429	CGGCC	2	10	75394	75403	0 %	0 %	40 %	60 %	146279244
65	NC_009429	GGCCG	2	10	75959	75968	0 %	0 %	60 %	40 %	146279245
66	NC_009429	ATGGA	2	10	76183	76192	40 %	20 %	40 %	0 %	146279245
67	NC_009429	CCGCC	2	10	76416	76425	0 %	0 %	20 %	80 %	146279245
68	NC_009429	CGGAT	2	10	79576	79585	20 %	20 %	40 %	20 %	146279247
69	NC_009429	CGCGC	2	10	80105	80114	0 %	0 %	40 %	60 %	146279247
70	NC_009429	CGGCG	2	10	80455	80464	0 %	0 %	60 %	40 %	146279247
71	NC_009429	AAGGC	2	10	83619	83628	40 %	0 %	40 %	20 %	146279250
72	NC_009429	CGGGG	2	10	83752	83761	0 %	0 %	80 %	20 %	146279251
73	NC_009429	GCCGC	2	10	84031	84040	0 %	0 %	40 %	60 %	146279251
74	NC_009429	CGCAG	2	10	84953	84962	20 %	0 %	40 %	40 %	146279252
75	NC_009429	GCGGG	2	10	85381	85390	0 %	0 %	80 %	20 %	146279252
76	NC_009429	TGCAC	2	10	86445	86454	20 %	20 %	20 %	40 %	146279253
77	NC_009429	GGGCC	2	10	87792	87801	0 %	0 %	60 %	40 %	146279253
78	NC_009429	GGCGC	2	10	88001	88010	0 %	0 %	60 %	40 %	146279254
79	NC_009429	CGGCG	2	10	88611	88620	0 %	0 %	60 %	40 %	146279255
80	NC_009429	CGGGG	2	10	93683	93692	0 %	0 %	80 %	20 %	146279259
81	NC_009429	GGCGG	2	10	94502	94511	0 %	0 %	80 %	20 %	146279260
82	NC_009429	GATGG	2	10	96687	96696	20 %	20 %	60 %	0 %	146279263
83	NC_009429	CGAGC	2	10	98238	98247	20 %	0 %	40 %	40 %	146279265
84	NC_009429	GCGCC	2	10	99578	99587	0 %	0 %	40 %	60 %	146279266
85	NC_009429	GCCGG	2	10	100605	100614	0 %	0 %	60 %	40 %	146279268
86	NC_009429	GTCGC	2	10	101492	101501	0 %	20 %	40 %	40 %	146279269
87	NC_009429	GGCTC	2	10	101602	101611	0 %	20 %	40 %	40 %	146279269
88	NC_009429	CGCCC	2	10	101735	101744	0 %	0 %	20 %	80 %	146279269
89	NC_009429	CGGCG	2	10	101778	101787	0 %	0 %	60 %	40 %	146279269
90	NC_009429	GGTCA	2	10	102757	102766	20 %	20 %	40 %	20 %	146279270
91	NC_009429	CGATG	2	10	104454	104463	20 %	20 %	40 %	20 %	146279270
92	NC_009429	CGCGC	2	10	105207	105216	0 %	0 %	40 %	60 %	146279271
93	NC_009429	GCCGC	2	10	105288	105297	0 %	0 %	40 %	60 %	146279271
94	NC_009429	CTCCG	2	10	105563	105572	0 %	20 %	20 %	60 %	146279271
95	NC_009429	CGGCC	2	10	105989	105998	0 %	0 %	40 %	60 %	146279271
96	NC_009429	CGCGG	2	10	107056	107065	0 %	0 %	60 %	40 %	146279272
97	NC_009429	CCGGG	2	10	107164	107173	0 %	0 %	60 %	40 %	146279272
98	NC_009429	GGCGC	2	10	107432	107441	0 %	0 %	60 %	40 %	146279272
99	NC_009429	GCGTC	2	10	108448	108457	0 %	20 %	40 %	40 %	146279273
100	NC_009429	GACGA	2	10	108547	108556	40 %	0 %	40 %	20 %	146279273
101	NC_009429	GCTGC	2	10	108810	108819	0 %	20 %	40 %	40 %	146279273
102	NC_009429	CCGCG	2	10	108915	108924	0 %	0 %	40 %	60 %	146279273
103	NC_009429	CCGCG	2	10	109179	109188	0 %	0 %	40 %	60 %	146279273
104	NC_009429	CGGCG	2	10	109248	109257	0 %	0 %	60 %	40 %	146279273
105	NC_009429	CAGGA	2	10	109345	109354	40 %	0 %	40 %	20 %	146279273
106	NC_009429	TTCCG	2	10	110242	110251	0 %	40 %	20 %	40 %	146279274
107	NC_009429	CCCGA	2	10	111944	111953	20 %	0 %	20 %	60 %	146279276
108	NC_009429	CGGTA	2	10	112293	112302	20 %	20 %	40 %	20 %	146279276
109	NC_009429	GCGCC	2	10	115715	115724	0 %	0 %	40 %	60 %	146279278
110	NC_009429	TGGCG	2	10	116440	116449	0 %	20 %	60 %	20 %	146279279
111	NC_009429	CCGCA	2	10	117074	117083	20 %	0 %	20 %	60 %	146279279
112	NC_009429	TGCGC	2	10	117271	117280	0 %	20 %	40 %	40 %	146279279
113	NC_009429	TCGGT	2	10	119055	119064	0 %	40 %	40 %	20 %	146279281
114	NC_009429	ATCGC	2	10	121953	121962	20 %	20 %	20 %	40 %	146279283
115	NC_009429	GCGTC	2	10	122185	122194	0 %	20 %	40 %	40 %	146279284
116	NC_009429	GGCTG	2	10	122967	122976	0 %	20 %	60 %	20 %	146279285
117	NC_009429	GCCCG	2	10	123680	123689	0 %	0 %	40 %	60 %	146279285
118	NC_009429	GGGGC	2	10	126480	126489	0 %	0 %	80 %	20 %	146279288
119	NC_009429	GGCGC	2	10	126809	126818	0 %	0 %	60 %	40 %	146279288
120	NC_009429	CGGCC	2	10	128296	128305	0 %	0 %	40 %	60 %	146279290
121	NC_009429	GCGGG	2	10	128822	128831	0 %	0 %	80 %	20 %	146279291
122	NC_009429	GGGGC	2	10	129099	129108	0 %	0 %	80 %	20 %	146279291
123	NC_009429	ATCCC	2	10	130593	130602	20 %	20 %	0 %	60 %	146279292
124	NC_009429	CGCGG	2	10	130740	130749	0 %	0 %	60 %	40 %	146279293
125	NC_009429	GGCCA	2	10	130819	130828	20 %	0 %	40 %	40 %	146279293
126	NC_009429	CCGCG	2	10	133471	133480	0 %	0 %	40 %	60 %	146279296
127	NC_009429	CCCGA	2	10	135615	135624	20 %	0 %	20 %	60 %	146279297
128	NC_009429	GGCCG	2	10	135638	135647	0 %	0 %	60 %	40 %	146279297
129	NC_009429	TGGGC	2	10	141323	141332	0 %	20 %	60 %	20 %	146279301
130	NC_009429	CGGCG	2	10	141468	141477	0 %	0 %	60 %	40 %	146279301
131	NC_009429	AGAGC	2	10	143369	143378	40 %	0 %	40 %	20 %	146279304
132	NC_009429	CGTCA	2	10	144243	144252	20 %	20 %	20 %	40 %	146279304
133	NC_009429	TCGGG	2	10	147363	147372	0 %	20 %	60 %	20 %	146279306
134	NC_009429	GCAAG	2	10	147396	147405	40 %	0 %	40 %	20 %	146279306
135	NC_009429	CCGAG	2	10	147831	147840	20 %	0 %	40 %	40 %	146279307
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263	NC_009429	CGGCC	2	10	325040	325049	0 %	0 %	40 %	60 %	146279471
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