MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA01

Total Repeats: 358

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009429	CGCC	2	8	1706	1713	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2	NC_009429	GCCC	2	8	1778	1785	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_009429	CCGG	2	8	2709	2716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009429	TCCG	2	8	2823	2830	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009429	GGCG	2	8	4131	4138	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6	NC_009429	CCGG	2	8	5655	5662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009429	GCCG	2	8	6322	6329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009429	CGGC	2	8	10308	10315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009429	CCGG	2	8	18208	18215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009429	TTCC	2	8	18544	18551	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009429	CGCT	2	8	19159	19166	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_009429	CGGC	2	8	21154	21161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009429	TGGA	2	8	30823	30830	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009429	CGGC	2	8	34503	34510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009429	CCGC	2	8	34522	34529	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16	NC_009429	GGTA	2	8	41679	41686	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009429	GCCC	2	8	45271	45278	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18	NC_009429	AGCG	2	8	45974	45981	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009429	GGCG	2	8	48091	48098	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009429	CCGG	2	8	48168	48175	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009429	GGAC	2	8	49998	50005	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009429	GACG	2	8	52477	52484	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_009429	TCCT	2	8	52790	52797	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009429	GCCC	2	8	59944	59951	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_009429	GGAA	2	8	61027	61034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009429	CAGC	2	8	64119	64126	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009429	GGCG	2	8	70388	70395	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009429	CCGG	2	8	73471	73478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009429	CCCA	2	8	92145	92152	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
30	NC_009429	GTCC	2	8	92965	92972	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009429	GATG	2	8	93306	93313	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009429	TGGG	2	8	95673	95680	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009429	GGAG	2	8	95983	95990	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009429	CCCG	2	8	96766	96773	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
35	NC_009429	CTGA	2	8	96814	96821	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009429	CCCG	2	8	99020	99027	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
37	NC_009429	CGGC	2	8	102103	102110	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009429	GCCC	2	8	102134	102141	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_009429	GGCC	2	8	102499	102506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009429	GCCG	2	8	112963	112970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009429	TCCG	2	8	115787	115794	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009429	AGTC	2	8	115799	115806	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009429	GCAA	2	8	116090	116097	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009429	CCTT	2	8	121138	121145	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009429	GGCC	2	8	123988	123995	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009429	CGCC	2	8	124983	124990	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
47	NC_009429	CCCG	2	8	127920	127927	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
48	NC_009429	CGGG	2	8	127942	127949	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009429	GCCG	2	8	134289	134296	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009429	CCGG	2	8	134308	134315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009429	TCAG	2	8	137728	137735	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_009429	GACG	2	8	138002	138009	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009429	GGCA	2	8	138317	138324	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_009429	GCTC	2	8	138385	138392	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_009429	CCGT	2	8	157330	157337	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009429	GCCC	2	8	169206	169213	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
57	NC_009429	CTGG	2	8	173445	173452	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009429	GCCC	2	8	175827	175834	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
59	NC_009429	GCAG	2	8	176750	176757	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_009429	TCAA	2	8	176780	176787	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009429	GCCG	2	8	181213	181220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_009429	TGGC	2	8	181221	181228	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_009429	GGCT	2	8	181263	181270	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_009429	CGGG	2	8	181290	181297	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
65	NC_009429	CCGC	2	8	181300	181307	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
66	NC_009429	CTCG	2	8	181659	181666	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009429	GCCG	2	8	182341	182348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_009429	GCCC	2	8	182381	182388	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
69	NC_009429	GCCG	2	8	183118	183125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_009429	CGAC	2	8	190287	190294	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_009429	CCTC	2	8	190907	190914	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
72	NC_009429	CCCG	2	8	192019	192026	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
73	NC_009429	GGCT	2	8	192430	192437	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_009429	CCCG	2	8	192763	192770	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
75	NC_009429	ATCC	2	8	192856	192863	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009429	TCGG	2	8	197289	197296	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009429	GGCG	2	8	197432	197439	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
78	NC_009429	GCCG	2	8	197472	197479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_009429	GACC	2	8	197690	197697	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_009429	GGGC	2	8	197834	197841	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
81	NC_009429	TCTG	2	8	201977	201984	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_009429	GCCT	2	8	204396	204403	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_009429	GCCA	2	8	204473	204480	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_009429	GCTG	2	8	207673	207680	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_009429	ATCC	2	8	207851	207858	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_009429	CCGC	2	8	211758	211765	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
87	NC_009429	CCCG	2	8	212646	212653	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
88	NC_009429	TGCG	2	8	214695	214702	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_009429	GCCG	2	8	219211	219218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_009429	GCCC	2	8	248107	248114	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
91	NC_009429	GCAA	2	8	252718	252725	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_009429	GTGG	2	8	252740	252747	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009429	TCAT	2	8	259020	259027	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_009429	TGGT	2	8	259136	259143	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009429	CGGT	2	8	260374	260381	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_009429	GCTG	2	8	260443	260450	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_009429	CGTT	2	8	260463	260470	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_009429	ACGG	2	8	262002	262009	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_009429	GCGG	2	8	262045	262052	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
100	NC_009429	TCGG	2	8	262809	262816	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_009429	GTCG	2	8	263318	263325	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_009429	GACG	2	8	263671	263678	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_009429	CCGC	2	8	266227	266234	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
104	NC_009429	ATGG	2	8	269262	269269	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009429	TGCC	2	8	270362	270369	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_009429	CGCC	2	8	270457	270464	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
107	NC_009429	GCAT	2	8	287202	287209	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_009429	CCGA	2	8	288155	288162	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_009429	TTCG	2	8	292894	292901	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_009429	CGCC	2	8	293698	293705	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
111	NC_009429	CGGT	2	8	293739	293746	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_009429	CGCC	2	8	293758	293765	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
113	NC_009429	CGGG	2	8	310148	310155	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
114	NC_009429	GCCC	2	8	310320	310327	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
115	NC_009429	GCCG	2	8	311085	311092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_009429	CGGC	2	8	314676	314683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_009429	CCGC	2	8	315012	315019	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
118	NC_009429	GGCC	2	8	326361	326368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_009429	CGCC	2	8	326403	326410	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
120	NC_009429	CGGG	2	8	326459	326466	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
121	NC_009429	CCAT	2	8	327879	327886	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_009429	GCGG	2	8	332384	332391	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
123	NC_009429	GCGG	2	8	332558	332565	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
124	NC_009429	CCAA	2	8	333291	333298	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_009429	GGGC	2	8	335899	335906	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
126	NC_009429	ACAG	2	8	335978	335985	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_009429	TCAT	2	8	338535	338542	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_009429	GATG	2	8	338559	338566	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009429	GGGC	2	8	338678	338685	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
130	NC_009429	CTTC	2	8	353604	353611	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_009429	ACTG	2	8	356764	356771	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_009429	GCCA	2	8	363321	363328	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_009429	GCCA	2	8	363582	363589	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_009429	TGCG	2	8	365518	365525	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_009429	CCGC	2	8	366797	366804	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
136	NC_009429	GGCC	2	8	368659	368666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_009429	CGTC	2	8	369443	369450	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_009429	CGGG	2	8	369589	369596	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
139	NC_009429	CCGC	2	8	369786	369793	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
140	NC_009429	GGCC	2	8	369847	369854	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_009429	CGGG	2	8	369991	369998	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
142	NC_009429	ATCG	2	8	381727	381734	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_009429	CCCG	2	8	384035	384042	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
144	NC_009429	GCCG	2	8	384151	384158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_009429	GGGT	2	8	384948	384955	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009429	CGAC	2	8	385049	385056	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_009429	AGCG	2	8	385095	385102	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_009429	AGGA	2	8	387958	387965	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009429	CGTC	2	8	389154	389161	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_009429	CGGC	2	8	394114	394121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_009429	GTCG	2	8	394593	394600	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_009429	CCCG	2	8	395715	395722	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
153	NC_009429	GCTC	2	8	396011	396018	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
154	NC_009429	GGCT	2	8	397546	397553	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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182	NC_009429	TCCC	2	8	436525	436532	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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196	NC_009429	CGGC	2	8	487692	487699	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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353	NC_009429	GGCA	2	8	842530	842537	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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355	NC_009429	CTTG	2	8	852846	852853	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.