MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA01

Total Repeats: 15055

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009429	GGC	2	6	19	24	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009429	CGC	2	6	171	176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_009429	CCT	2	6	283	288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146279171
4	NC_009429	GGC	2	6	436	441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279171
5	NC_009429	GAG	2	6	452	457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279171
6	NC_009429	CGC	2	6	464	469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279171
7	NC_009429	CAA	2	6	580	585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146279171
8	NC_009429	TGG	2	6	654	659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146279171
9	NC_009429	TCG	2	6	720	725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279171
10	NC_009429	GAC	2	6	857	862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279171
11	NC_009429	CGC	2	6	877	882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279171
12	NC_009429	GGT	2	6	931	936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146279171
13	NC_009429	TCT	2	6	954	959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146279171
14	NC_009429	GCG	2	6	1188	1193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279171
15	NC_009429	TCA	2	6	1197	1202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279171
16	NC_009429	CCG	2	6	1203	1208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279171
17	NC_009429	GAG	2	6	1274	1279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279171
18	NC_009429	CGC	2	6	1363	1368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279171
19	NC_009429	GCC	2	6	1370	1375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279171
20	NC_009429	GTG	3	9	1472	1480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146279171
21	NC_009429	CGG	2	6	1482	1487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279171
22	NC_009429	GAG	2	6	1538	1543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279171
23	NC_009429	CGC	2	6	1566	1571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279171
24	NC_009429	TGC	2	6	1629	1634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279171
25	NC_009429	CGC	2	6	1669	1674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279171
26	NC_009429	GCC	2	6	1718	1723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_009429	CTT	2	6	1748	1753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009429	GAG	3	9	1849	1857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009429	CGG	2	6	1911	1916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279172
30	NC_009429	CGG	2	6	1954	1959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279172
31	NC_009429	GCG	2	6	1961	1966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279172
32	NC_009429	GCG	2	6	1983	1988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279172
33	NC_009429	ACG	2	6	2039	2044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279172
34	NC_009429	CGA	2	6	2163	2168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279172
35	NC_009429	CAC	2	6	2194	2199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279172
36	NC_009429	GAC	2	6	2203	2208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279172
37	NC_009429	ACG	2	6	2219	2224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279172
38	NC_009429	CGG	2	6	2229	2234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279172
39	NC_009429	GGC	2	6	2269	2274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279172
40	NC_009429	ACG	2	6	2285	2290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279172
41	NC_009429	CGG	2	6	2301	2306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279172
42	NC_009429	CAC	2	6	2341	2346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279172
43	NC_009429	CGG	2	6	2373	2378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279172
44	NC_009429	GGC	2	6	2401	2406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279172
45	NC_009429	CGG	2	6	2407	2412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279172
46	NC_009429	CGG	2	6	2421	2426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279172
47	NC_009429	AGC	2	6	2481	2486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279172
48	NC_009429	GCG	3	9	2490	2498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279172
49	NC_009429	CGG	2	6	2538	2543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279172
50	NC_009429	CAG	2	6	2546	2551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279172
51	NC_009429	GCG	2	6	2553	2558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279172
52	NC_009429	GCC	2	6	2567	2572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279172
53	NC_009429	CCA	2	6	2595	2600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279172
54	NC_009429	GAA	2	6	2618	2623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146279172
55	NC_009429	CGA	2	6	2647	2652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279172
56	NC_009429	GCC	2	6	2654	2659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279172
57	NC_009429	GCG	2	6	2717	2722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009429	GCC	3	9	2726	2734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_009429	GTG	2	6	2833	2838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009429	GAT	2	6	2873	2878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009429	CCG	2	6	3007	3012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279173
62	NC_009429	GGC	2	6	3056	3061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279173
63	NC_009429	GCC	2	6	3165	3170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279173
64	NC_009429	TCC	2	6	3196	3201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146279173
65	NC_009429	GCG	2	6	3219	3224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279173
66	NC_009429	CGC	2	6	3230	3235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279173
67	NC_009429	TCC	2	6	3272	3277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146279173
68	NC_009429	GGC	2	6	3406	3411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279173
69	NC_009429	CGG	2	6	3445	3450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279173
70	NC_009429	GGC	2	6	3557	3562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279173
71	NC_009429	GGC	2	6	3692	3697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279173
72	NC_009429	GAC	2	6	3755	3760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279173
73	NC_009429	GCT	2	6	3784	3789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279173
74	NC_009429	GCT	2	6	3830	3835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279173
75	NC_009429	CGC	3	9	3913	3921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279173
76	NC_009429	TGG	2	6	3925	3930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146279173
77	NC_009429	GCT	2	6	3998	4003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279173
78	NC_009429	CAT	2	6	4010	4015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279173
79	NC_009429	GGC	2	6	4100	4105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279173
80	NC_009429	ATC	2	6	4173	4178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279174
81	NC_009429	CGA	2	6	4267	4272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279174
82	NC_009429	GAT	3	9	4370	4378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279174
83	NC_009429	CGG	2	6	4443	4448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_009429	GAC	2	6	4544	4549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279175
85	NC_009429	AGA	2	6	4612	4617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146279175
86	NC_009429	GAT	2	6	4844	4849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279175
87	NC_009429	GAC	2	6	4889	4894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279175
88	NC_009429	TGA	2	6	4909	4914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279175
89	NC_009429	CAG	2	6	4925	4930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279175
90	NC_009429	CCG	2	6	4943	4948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279175
91	NC_009429	CTT	2	6	4979	4984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146279175
92	NC_009429	AGA	2	6	5023	5028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146279175
93	NC_009429	AGG	2	6	5043	5048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279175
94	NC_009429	GTG	3	9	5076	5084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146279175
95	NC_009429	CCG	2	6	5107	5112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279175
96	NC_009429	CAT	2	6	5167	5172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279175
97	NC_009429	CAG	2	6	5426	5431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279175
98	NC_009429	ATC	2	6	5436	5441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279175
99	NC_009429	ATG	2	6	5478	5483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279175
100	NC_009429	CGA	2	6	5524	5529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279175
101	NC_009429	CGC	2	6	5665	5670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_009429	GGC	2	6	5676	5681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009429	CGG	2	6	5702	5707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_009429	CTG	2	6	5710	5715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_009429	TCG	2	6	5723	5728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_009429	GCC	2	6	5738	5743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_009429	CGG	2	6	5771	5776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_009429	ATG	2	6	5880	5885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279176
109	NC_009429	TGA	2	6	5999	6004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279176
110	NC_009429	GAT	2	6	6045	6050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279176
111	NC_009429	CGG	2	6	6107	6112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279176
112	NC_009429	CAG	2	6	6174	6179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279176
113	NC_009429	GGC	2	6	6265	6270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_009429	GCC	2	6	6374	6379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279177
115	NC_009429	CGG	2	6	6450	6455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279177
116	NC_009429	CCG	2	6	6458	6463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279177
117	NC_009429	CTG	2	6	6534	6539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279177
118	NC_009429	GAT	2	6	6624	6629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279177
119	NC_009429	GCC	2	6	6693	6698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279177
120	NC_009429	CGA	2	6	6710	6715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279177
121	NC_009429	AGC	2	6	6850	6855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279177
122	NC_009429	CCA	2	6	6954	6959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279177
123	NC_009429	CGA	2	6	7130	7135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279177
124	NC_009429	GTA	2	6	7188	7193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279177
125	NC_009429	GCC	2	6	7194	7199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279177
126	NC_009429	AGC	2	6	7225	7230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279177
127	NC_009429	CGC	2	6	7306	7311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279177
128	NC_009429	GCC	2	6	7320	7325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279177
129	NC_009429	AGC	2	6	7513	7518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279177
130	NC_009429	CGG	2	6	7520	7525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279177
131	NC_009429	GCG	2	6	7617	7622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279177
132	NC_009429	CCT	2	6	7634	7639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146279177
133	NC_009429	ACC	3	9	7807	7815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279177
134	NC_009429	CGG	2	6	7853	7858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279177
135	NC_009429	GGC	2	6	7872	7877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279177
136	NC_009429	CGC	4	12	7962	7973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279177
137	NC_009429	GGC	2	6	8018	8023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279177
138	NC_009429	GCC	2	6	8068	8073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279177
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140	NC_009429	CCG	2	6	8149	8154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279177
141	NC_009429	TCG	2	6	8194	8199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279177
142	NC_009429	GGC	2	6	8205	8210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279177
143	NC_009429	TGA	3	9	8303	8311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279177
144	NC_009429	GCA	2	6	8405	8410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279177
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146	NC_009429	CGG	2	6	8435	8440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279177
147	NC_009429	GCG	2	6	8451	8456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279177
148	NC_009429	GCA	2	6	8600	8605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279178
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153	NC_009429	TCG	2	6	9087	9092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279179
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158	NC_009429	TCG	2	6	9225	9230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279179
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172	NC_009429	GGA	2	6	10320	10325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
173	NC_009429	GTG	2	6	10484	10489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146279181
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250	NC_009429	GAC	2	6	15967	15972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279186
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412	NC_009429	TGA	2	6	24537	24542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279193
413	NC_009429	GCT	2	6	24598	24603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279193
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443	NC_009429	GAG	2	6	25903	25908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279194
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452	NC_009429	GCC	3	9	26292	26300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279195
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457	NC_009429	CGG	2	6	26495	26500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279195
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470	NC_009429	CGG	2	6	26902	26907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279195
471	NC_009429	CGC	2	6	26933	26938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279195
472	NC_009429	CAT	2	6	26945	26950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279195
473	NC_009429	CGA	2	6	26975	26980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279195
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484	NC_009429	CCT	2	6	27863	27868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146279197
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493	NC_009429	GTC	2	6	28032	28037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279197
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495	NC_009429	CCG	2	6	28058	28063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279197
496	NC_009429	CGC	2	6	28076	28081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279197
497	NC_009429	TCG	2	6	28177	28182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279197
498	NC_009429	GGC	2	6	28409	28414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279197
499	NC_009429	CAC	2	6	28425	28430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279197
500	NC_009429	TCG	2	6	28432	28437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279197

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