MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 chromosome

Total Repeats: 2634

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009428	TGGCG	2	10	973	982	0 %	20 %	60 %	20 %	146276060
2	NC_009428	TGGGC	2	10	1330	1339	0 %	20 %	60 %	20 %	146276060
3	NC_009428	ACCAC	2	10	2121	2130	40 %	0 %	0 %	60 %	146276060
4	NC_009428	GGCTG	2	10	4691	4700	0 %	20 %	60 %	20 %	146276063
5	NC_009428	GCGCT	2	10	4772	4781	0 %	20 %	40 %	40 %	146276063
6	NC_009428	CGGGA	2	10	4815	4824	20 %	0 %	60 %	20 %	146276063
7	NC_009428	CCGGG	2	10	7018	7027	0 %	0 %	60 %	40 %	146276064
8	NC_009428	CGATG	2	10	8091	8100	20 %	20 %	40 %	20 %	146276065
9	NC_009428	GCGAC	2	10	10303	10312	20 %	0 %	40 %	40 %	146276067
10	NC_009428	TCTGG	2	10	13247	13256	0 %	40 %	40 %	20 %	146276069
11	NC_009428	CGCGC	2	10	13645	13654	0 %	0 %	40 %	60 %	146276070
12	NC_009428	CGGCA	2	10	14041	14050	20 %	0 %	40 %	40 %	146276070
13	NC_009428	GCACC	2	10	14628	14637	20 %	0 %	20 %	60 %	146276070
14	NC_009428	GGTCG	2	10	16125	16134	0 %	20 %	60 %	20 %	146276071
15	NC_009428	CCTGA	2	10	17592	17601	20 %	20 %	20 %	40 %	146276072
16	NC_009428	GCGCC	2	10	17618	17627	0 %	0 %	40 %	60 %	146276072
17	NC_009428	CGTGG	2	10	18918	18927	0 %	20 %	60 %	20 %	146276072
18	NC_009428	CGCGG	2	10	18982	18991	0 %	0 %	60 %	40 %	146276072
19	NC_009428	CGGGT	2	10	19069	19078	0 %	20 %	60 %	20 %	146276072
20	NC_009428	GCCGG	2	10	19281	19290	0 %	0 %	60 %	40 %	146276072
21	NC_009428	GCCGG	2	10	21857	21866	0 %	0 %	60 %	40 %	146276072
22	NC_009428	GATCA	2	10	22453	22462	40 %	20 %	20 %	20 %	146276073
23	NC_009428	GCCGC	2	10	25635	25644	0 %	0 %	40 %	60 %	146276074
24	NC_009428	CGGCG	2	10	26918	26927	0 %	0 %	60 %	40 %	146276075
25	NC_009428	ACCGG	2	10	28378	28387	20 %	0 %	40 %	40 %	146276077
26	NC_009428	GGCTT	2	10	29162	29171	0 %	40 %	40 %	20 %	146276078
27	NC_009428	CCCGC	2	10	29476	29485	0 %	0 %	20 %	80 %	146276078
28	NC_009428	GGCCT	2	10	29509	29518	0 %	20 %	40 %	40 %	146276078
29	NC_009428	CCACA	2	10	29949	29958	40 %	0 %	0 %	60 %	146276078
30	NC_009428	CCGAA	2	10	30214	30223	40 %	0 %	20 %	40 %	146276079
31	NC_009428	GCCGC	2	10	31603	31612	0 %	0 %	40 %	60 %	146276080
32	NC_009428	GCGCG	2	10	32159	32168	0 %	0 %	60 %	40 %	146276081
33	NC_009428	GATCA	2	10	32911	32920	40 %	20 %	20 %	20 %	146276082
34	NC_009428	GCCGC	2	10	34741	34750	0 %	0 %	40 %	60 %	146276084
35	NC_009428	CCGGA	2	10	35408	35417	20 %	0 %	40 %	40 %	146276085
36	NC_009428	CCTGC	2	10	35632	35641	0 %	20 %	20 %	60 %	146276085
37	NC_009428	CGGCG	2	10	35722	35731	0 %	0 %	60 %	40 %	146276085
38	NC_009428	CCGGA	2	10	35978	35987	20 %	0 %	40 %	40 %	146276085
39	NC_009428	CCTGG	2	10	39158	39167	0 %	20 %	40 %	40 %	146276088
40	NC_009428	GGCCG	2	10	39366	39375	0 %	0 %	60 %	40 %	146276088
41	NC_009428	CTGGT	2	10	40140	40149	0 %	40 %	40 %	20 %	146276088
42	NC_009428	TGGGC	2	10	40537	40546	0 %	20 %	60 %	20 %	146276089
43	NC_009428	TCGCC	2	10	41377	41386	0 %	20 %	20 %	60 %	146276089
44	NC_009428	CCGGC	2	10	42152	42161	0 %	0 %	40 %	60 %	146276090
45	NC_009428	TGCGC	2	10	43219	43228	0 %	20 %	40 %	40 %	146276091
46	NC_009428	GAGGC	2	10	44799	44808	20 %	0 %	60 %	20 %	146276093
47	NC_009428	GCATC	2	10	45632	45641	20 %	20 %	20 %	40 %	146276094
48	NC_009428	ATGCG	2	10	47096	47105	20 %	20 %	40 %	20 %	146276096
49	NC_009428	GCGCG	2	10	47252	47261	0 %	0 %	60 %	40 %	146276096
50	NC_009428	CCGGC	2	10	47336	47345	0 %	0 %	40 %	60 %	146276096
51	NC_009428	TTCTG	2	10	48268	48277	0 %	60 %	20 %	20 %	146276097
52	NC_009428	CGAGC	2	10	48564	48573	20 %	0 %	40 %	40 %	146276098
53	NC_009428	GGCCG	2	10	49581	49590	0 %	0 %	60 %	40 %	146276098
54	NC_009428	CGTGG	2	10	50093	50102	0 %	20 %	60 %	20 %	146276099
55	NC_009428	TGCGG	2	10	51981	51990	0 %	20 %	60 %	20 %	146276101
56	NC_009428	GGCCG	2	10	52117	52126	0 %	0 %	60 %	40 %	146276101
57	NC_009428	GTGCG	2	10	52158	52167	0 %	20 %	60 %	20 %	146276101
58	NC_009428	TTCGC	2	10	52980	52989	0 %	40 %	20 %	40 %	146276102
59	NC_009428	GGGGC	2	10	55791	55800	0 %	0 %	80 %	20 %	146276106
60	NC_009428	GGACG	2	10	55923	55932	20 %	0 %	60 %	20 %	146276106
61	NC_009428	GGCGA	2	10	55963	55972	20 %	0 %	60 %	20 %	146276106
62	NC_009428	CGGCG	2	10	57629	57638	0 %	0 %	60 %	40 %	146276108
63	NC_009428	CGCGG	2	10	59996	60005	0 %	0 %	60 %	40 %	146276109
64	NC_009428	GATCG	2	10	64383	64392	20 %	20 %	40 %	20 %	146276113
65	NC_009428	CTCGG	2	10	66236	66245	0 %	20 %	40 %	40 %	146276115
66	NC_009428	GCGCA	2	10	66771	66780	20 %	0 %	40 %	40 %	146276116
67	NC_009428	TGGCG	2	10	67265	67274	0 %	20 %	60 %	20 %	146276117
68	NC_009428	CGGCG	2	10	68172	68181	0 %	0 %	60 %	40 %	146276118
69	NC_009428	CCGCG	2	10	68446	68455	0 %	0 %	40 %	60 %	146276118
70	NC_009428	GGGCC	2	10	68629	68638	0 %	0 %	60 %	40 %	146276118
71	NC_009428	AGATC	2	10	70504	70513	40 %	20 %	20 %	20 %	146276120
72	NC_009428	GCTGG	2	10	72345	72354	0 %	20 %	60 %	20 %	146276122
73	NC_009428	CGACT	2	10	72622	72631	20 %	20 %	20 %	40 %	146276122
74	NC_009428	GGGCG	2	10	73395	73404	0 %	0 %	80 %	20 %	146276123
75	NC_009428	AGATC	2	10	75106	75115	40 %	20 %	20 %	20 %	146276124
76	NC_009428	GGGCG	2	10	77560	77569	0 %	0 %	80 %	20 %	146276129
77	NC_009428	CGGCG	2	10	78296	78305	0 %	0 %	60 %	40 %	146276130
78	NC_009428	GGCGG	2	10	80106	80115	0 %	0 %	80 %	20 %	146276131
79	NC_009428	GGCCG	2	10	80277	80286	0 %	0 %	60 %	40 %	146276131
80	NC_009428	GGGCG	2	10	80609	80618	0 %	0 %	80 %	20 %	146276131
81	NC_009428	GCATG	2	10	80900	80909	20 %	20 %	40 %	20 %	146276132
82	NC_009428	CCGAG	2	10	81660	81669	20 %	0 %	40 %	40 %	146276132
83	NC_009428	TCGGC	2	10	85117	85126	0 %	20 %	40 %	40 %	146276134
84	NC_009428	TCGAG	2	10	86896	86905	20 %	20 %	40 %	20 %	146276134
85	NC_009428	TGCCG	2	10	93304	93313	0 %	20 %	40 %	40 %	146276142
86	NC_009428	GCCGC	2	10	95168	95177	0 %	0 %	40 %	60 %	146276144
87	NC_009428	TGGCG	2	10	95210	95219	0 %	20 %	60 %	20 %	146276144
88	NC_009428	ACCGG	2	10	95696	95705	20 %	0 %	40 %	40 %	146276145
89	NC_009428	GCCGC	2	10	96509	96518	0 %	0 %	40 %	60 %	146276145
90	NC_009428	GCGAA	2	10	103927	103936	40 %	0 %	40 %	20 %	146276155
91	NC_009428	AGATC	2	10	104678	104687	40 %	20 %	20 %	20 %	146276156
92	NC_009428	AACGG	2	10	105108	105117	40 %	0 %	40 %	20 %	146276157
93	NC_009428	CAGCA	2	10	105245	105254	40 %	0 %	20 %	40 %	146276158
94	NC_009428	TCGCA	2	10	105809	105818	20 %	20 %	20 %	40 %	146276159
95	NC_009428	GCTGC	2	10	105975	105984	0 %	20 %	40 %	40 %	146276159
96	NC_009428	CGGCG	2	10	106598	106607	0 %	0 %	60 %	40 %	146276160
97	NC_009428	GCGCC	2	10	106760	106769	0 %	0 %	40 %	60 %	146276160
98	NC_009428	GCCCT	2	10	107500	107509	0 %	20 %	20 %	60 %	146276161
99	NC_009428	TCGCC	2	10	108125	108134	0 %	20 %	20 %	60 %	146276161
100	NC_009428	CGGAC	2	10	108486	108495	20 %	0 %	40 %	40 %	146276161
101	NC_009428	GGCGC	2	10	111742	111751	0 %	0 %	60 %	40 %	146276167
102	NC_009428	TCGTT	2	10	112148	112157	0 %	60 %	20 %	20 %	146276167
103	NC_009428	TCGTT	2	10	112170	112179	0 %	60 %	20 %	20 %	146276167
104	NC_009428	AGACG	2	10	116051	116060	40 %	0 %	40 %	20 %	146276171
105	NC_009428	TCATG	2	10	117457	117466	20 %	40 %	20 %	20 %	146276172
106	NC_009428	GCCTG	2	10	117729	117738	0 %	20 %	40 %	40 %	146276172
107	NC_009428	GCGCC	2	10	121796	121805	0 %	0 %	40 %	60 %	146276175
108	NC_009428	CGCCC	2	10	122695	122704	0 %	0 %	20 %	80 %	146276175
109	NC_009428	CGGAG	2	10	126400	126409	20 %	0 %	60 %	20 %	146276179
110	NC_009428	TTGCG	2	10	129348	129357	0 %	40 %	40 %	20 %	146276182
111	NC_009428	GGCCT	2	10	129422	129431	0 %	20 %	40 %	40 %	146276182
112	NC_009428	GCCAT	2	10	131574	131583	20 %	20 %	20 %	40 %	146276184
113	NC_009428	GCACG	2	10	132171	132180	20 %	0 %	40 %	40 %	146276184
114	NC_009428	GCCGT	2	10	133770	133779	0 %	20 %	40 %	40 %	146276187
115	NC_009428	TGGCG	2	10	134866	134875	0 %	20 %	60 %	20 %	146276188
116	NC_009428	GCGAG	2	10	134910	134919	20 %	0 %	60 %	20 %	146276188
117	NC_009428	GCGCC	2	10	135489	135498	0 %	0 %	40 %	60 %	146276188
118	NC_009428	CGAGG	2	10	137437	137446	20 %	0 %	60 %	20 %	146276192
119	NC_009428	GGCGA	2	10	138223	138232	20 %	0 %	60 %	20 %	146276193
120	NC_009428	GCGAA	2	10	138416	138425	40 %	0 %	40 %	20 %	146276193
121	NC_009428	CCGCA	2	10	139166	139175	20 %	0 %	20 %	60 %	146276194
122	NC_009428	CCGCG	2	10	139462	139471	0 %	0 %	40 %	60 %	146276194
123	NC_009428	GAGCC	2	10	143231	143240	20 %	0 %	40 %	40 %	146276198
124	NC_009428	GGCGG	2	10	144013	144022	0 %	0 %	80 %	20 %	146276199
125	NC_009428	GAACA	2	10	144466	144475	60 %	0 %	20 %	20 %	146276200
126	NC_009428	GCTGT	2	10	145104	145113	0 %	40 %	40 %	20 %	146276200
127	NC_009428	CGGGG	2	10	153308	153317	0 %	0 %	80 %	20 %	146276208
128	NC_009428	GGGCG	2	10	154275	154284	0 %	0 %	80 %	20 %	146276209
129	NC_009428	CCGCC	2	10	155599	155608	0 %	0 %	20 %	80 %	146276212
130	NC_009428	GCACC	2	10	155710	155719	20 %	0 %	20 %	60 %	146276212
131	NC_009428	CAGGG	2	10	156490	156499	20 %	0 %	60 %	20 %	146276214
132	NC_009428	GGGCA	2	10	162410	162419	20 %	0 %	60 %	20 %	146276218
133	NC_009428	GCGCT	2	10	162458	162467	0 %	20 %	40 %	40 %	146276218
134	NC_009428	CCATT	2	10	163084	163093	20 %	40 %	0 %	40 %	146276219
135	NC_009428	CGGGG	2	10	163544	163553	0 %	0 %	80 %	20 %	146276219
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252	NC_009428	GCCAT	2	10	301118	301127	20 %	20 %	20 %	40 %	146276359
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257	NC_009428	GGACA	2	10	304096	304105	40 %	0 %	40 %	20 %	146276362
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259	NC_009428	CGACC	2	10	308626	308635	20 %	0 %	20 %	60 %	146276368
260	NC_009428	GGCCG	2	10	314156	314165	0 %	0 %	60 %	40 %	146276372
261	NC_009428	CTGGA	2	10	314811	314820	20 %	20 %	40 %	20 %	146276373
262	NC_009428	CCGCG	2	10	317312	317321	0 %	0 %	40 %	60 %	146276375
263	NC_009428	GCGAG	2	10	318076	318085	20 %	0 %	60 %	20 %	146276375
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