MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444 plasmid pNL2

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009427	CCGTC	2	10	7287	7296	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_009427	GAGGT	2	10	7408	7417	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009427	ACGGG	2	10	48549	48558	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_009427	TTCGC	2	10	55792	55801	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_009427	TTCGA	2	10	68461	68470	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_009427	GCCCC	2	10	68538	68547	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
7	NC_009427	TCCCC	2	10	73842	73851	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
8	NC_009427	GGAGG	2	10	145784	145793	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009427	CGAAA	2	10	165375	165384	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_009427	ATGTC	2	10	166635	166644	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_009427	TTCTA	2	10	195779	195788	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_009427	TAGGG	2	10	206591	206600	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009427	GCGGA	2	10	213604	213613	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_009427	GGAAG	2	10	243192	243201	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009427	CGGGG	2	10	243216	243225	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
16	NC_009427	TCAAT	2	10	243748	243757	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_009427	CTTGT	2	10	256316	256325	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_009427	TCGTT	2	10	259276	259285	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_009427	CCCGG	2	10	262243	262252	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
20	NC_009427	CATTC	2	10	263639	263648	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_009427	GGCTT	2	10	305231	305240	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_009427	GTTGC	2	10	305635	305644	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_009427	GCGCA	2	10	342835	342844	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_009427	CGGGC	2	10	467423	467432	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
25	NC_009427	GCTCC	2	10	484967	484976	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.