MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444 plasmid pNL2

Total Repeats: 421

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009427	ATCGA	2	10	124	133	40 %	20 %	20 %	20 %	146275627
2	NC_009427	CGGAC	2	10	1010	1019	20 %	0 %	40 %	40 %	146275627
3	NC_009427	CGGCA	2	10	2243	2252	20 %	0 %	40 %	40 %	146275628
4	NC_009427	ACCGC	2	10	3645	3654	20 %	0 %	20 %	60 %	146275629
5	NC_009427	AGCGA	2	10	4058	4067	40 %	0 %	40 %	20 %	146275629
6	NC_009427	CGATG	2	10	5156	5165	20 %	20 %	40 %	20 %	146275630
7	NC_009427	CCGGC	2	10	5410	5419	0 %	0 %	40 %	60 %	146275630
8	NC_009427	CCGCG	2	10	6898	6907	0 %	0 %	40 %	60 %	146275631
9	NC_009427	AAGGC	2	10	8242	8251	40 %	0 %	40 %	20 %	146275632
10	NC_009427	TCCGC	2	10	8551	8560	0 %	20 %	20 %	60 %	146275633
11	NC_009427	CGCGC	2	10	9632	9641	0 %	0 %	40 %	60 %	146275635
12	NC_009427	GCGCC	2	10	10508	10517	0 %	0 %	40 %	60 %	146275635
13	NC_009427	GGGCA	2	10	15267	15276	20 %	0 %	60 %	20 %	146275639
14	NC_009427	CGGCG	2	10	15404	15413	0 %	0 %	60 %	40 %	146275639
15	NC_009427	GCGCA	2	10	15864	15873	20 %	0 %	40 %	40 %	146275640
16	NC_009427	CGGAC	2	10	16754	16763	20 %	0 %	40 %	40 %	146275641
17	NC_009427	GACAA	2	10	17271	17280	60 %	0 %	20 %	20 %	146275642
18	NC_009427	GCCTT	2	10	19391	19400	0 %	40 %	20 %	40 %	146275644
19	NC_009427	TCGCC	2	10	19812	19821	0 %	20 %	20 %	60 %	146275644
20	NC_009427	GGTGC	2	10	22217	22226	0 %	20 %	60 %	20 %	146275647
21	NC_009427	CGATC	2	10	22696	22705	20 %	20 %	20 %	40 %	146275648
22	NC_009427	CCGGC	2	10	22941	22950	0 %	0 %	40 %	60 %	146275648
23	NC_009427	GCGCG	2	10	23629	23638	0 %	0 %	60 %	40 %	146275649
24	NC_009427	CGGAC	2	10	24373	24382	20 %	0 %	40 %	40 %	146275649
25	NC_009427	TCGAT	2	10	26182	26191	20 %	40 %	20 %	20 %	146275651
26	NC_009427	GGCGA	2	10	26277	26286	20 %	0 %	60 %	20 %	146275651
27	NC_009427	GCGCC	2	10	27059	27068	0 %	0 %	40 %	60 %	146275652
28	NC_009427	CCGTC	2	10	32297	32306	0 %	20 %	20 %	60 %	146275657
29	NC_009427	CGAGG	2	10	32707	32716	20 %	0 %	60 %	20 %	146275658
30	NC_009427	GCACC	2	10	32854	32863	20 %	0 %	20 %	60 %	146275658
31	NC_009427	GCGCG	2	10	33015	33024	0 %	0 %	60 %	40 %	146275658
32	NC_009427	TCGCC	2	10	33333	33342	0 %	20 %	20 %	60 %	146275658
33	NC_009427	GGCGA	2	10	33846	33855	20 %	0 %	60 %	20 %	146275659
34	NC_009427	CGGCG	2	10	35109	35118	0 %	0 %	60 %	40 %	146275661
35	NC_009427	CGGCG	2	10	36157	36166	0 %	0 %	60 %	40 %	146275662
36	NC_009427	GCGCG	2	10	37387	37396	0 %	0 %	60 %	40 %	146275663
37	NC_009427	GACCG	2	10	40380	40389	20 %	0 %	40 %	40 %	146275664
38	NC_009427	CCGCC	2	10	43600	43609	0 %	0 %	20 %	80 %	146275667
39	NC_009427	TGCCC	2	10	44600	44609	0 %	20 %	20 %	60 %	146275668
40	NC_009427	GATCG	2	10	44633	44642	20 %	20 %	40 %	20 %	146275668
41	NC_009427	CGCCC	2	10	45829	45838	0 %	0 %	20 %	80 %	146275669
42	NC_009427	CGGCC	2	10	46620	46629	0 %	0 %	40 %	60 %	146275670
43	NC_009427	CGAGC	2	10	47362	47371	20 %	0 %	40 %	40 %	146275671
44	NC_009427	TCGCC	2	10	47901	47910	0 %	20 %	20 %	60 %	146275671
45	NC_009427	GGGCC	2	10	49131	49140	0 %	0 %	60 %	40 %	146275672
46	NC_009427	GCCCT	2	10	49485	49494	0 %	20 %	20 %	60 %	146275673
47	NC_009427	CGCGC	2	10	50889	50898	0 %	0 %	40 %	60 %	146275674
48	NC_009427	TGCCG	2	10	52356	52365	0 %	20 %	40 %	40 %	146275676
49	NC_009427	CCCGA	2	10	52684	52693	20 %	0 %	20 %	60 %	146275677
50	NC_009427	AGGCG	2	10	53278	53287	20 %	0 %	60 %	20 %	146275678
51	NC_009427	CGACG	2	10	54805	54814	20 %	0 %	40 %	40 %	146275678
52	NC_009427	CGCGG	2	10	55429	55438	0 %	0 %	60 %	40 %	146275678
53	NC_009427	GGCGC	2	10	55607	55616	0 %	0 %	60 %	40 %	146275678
54	NC_009427	CGGTG	2	10	55690	55699	0 %	20 %	60 %	20 %	146275678
55	NC_009427	GCGCC	2	10	57283	57292	0 %	0 %	40 %	60 %	146275679
56	NC_009427	CAGCG	2	10	57633	57642	20 %	0 %	40 %	40 %	146275679
57	NC_009427	GCCCG	2	10	58118	58127	0 %	0 %	40 %	60 %	146275679
58	NC_009427	AACGT	2	10	58149	58158	40 %	20 %	20 %	20 %	146275679
59	NC_009427	CGGCG	2	10	59873	59882	0 %	0 %	60 %	40 %	146275681
60	NC_009427	ATCGA	2	10	62043	62052	40 %	20 %	20 %	20 %	146275685
61	NC_009427	GCTCG	2	10	63073	63082	0 %	20 %	40 %	40 %	146275686
62	NC_009427	CGGCG	2	10	64266	64275	0 %	0 %	60 %	40 %	146275688
63	NC_009427	GCACG	2	10	64713	64722	20 %	0 %	40 %	40 %	146275689
64	NC_009427	GTAGC	2	10	65078	65087	20 %	20 %	40 %	20 %	146275689
65	NC_009427	GCCGC	2	10	65790	65799	0 %	0 %	40 %	60 %	146275690
66	NC_009427	AGGCC	2	10	66178	66187	20 %	0 %	40 %	40 %	146275691
67	NC_009427	GAGCG	2	10	67327	67336	20 %	0 %	60 %	20 %	146275692
68	NC_009427	CGGCC	2	10	68360	68369	0 %	0 %	40 %	60 %	146275694
69	NC_009427	CGTCA	2	10	69992	70001	20 %	20 %	20 %	40 %	146275695
70	NC_009427	AGCGG	2	10	72991	73000	20 %	0 %	60 %	20 %	146275697
71	NC_009427	CACCG	2	10	74347	74356	20 %	0 %	20 %	60 %	146275699
72	NC_009427	CGCGC	2	10	77249	77258	0 %	0 %	40 %	60 %	146275700
73	NC_009427	CGGCG	2	10	78580	78589	0 %	0 %	60 %	40 %	146275702
74	NC_009427	TCGGC	2	10	78963	78972	0 %	20 %	40 %	40 %	146275702
75	NC_009427	TCGCG	2	10	80221	80230	0 %	20 %	40 %	40 %	146275703
76	NC_009427	GGACC	2	10	80254	80263	20 %	0 %	40 %	40 %	146275703
77	NC_009427	CCCGC	2	10	80449	80458	0 %	0 %	20 %	80 %	146275703
78	NC_009427	GCCGC	2	10	81155	81164	0 %	0 %	40 %	60 %	146275705
79	NC_009427	GCGCC	2	10	88922	88931	0 %	0 %	40 %	60 %	146275712
80	NC_009427	GGTCA	2	10	89736	89745	20 %	20 %	40 %	20 %	146275713
81	NC_009427	CCGCC	2	10	90519	90528	0 %	0 %	20 %	80 %	146275714
82	NC_009427	CGGCG	2	10	91171	91180	0 %	0 %	60 %	40 %	146275714
83	NC_009427	GCCGG	2	10	91922	91931	0 %	0 %	60 %	40 %	146275714
84	NC_009427	CGACG	2	10	95687	95696	20 %	0 %	40 %	40 %	146275717
85	NC_009427	GCGAG	2	10	96566	96575	20 %	0 %	60 %	20 %	146275719
86	NC_009427	TCGCG	2	10	97748	97757	0 %	20 %	40 %	40 %	146275719
87	NC_009427	GGCCA	2	10	99453	99462	20 %	0 %	40 %	40 %	146275719
88	NC_009427	CACGG	2	10	100297	100306	20 %	0 %	40 %	40 %	146275719
89	NC_009427	CGCGG	2	10	102610	102619	0 %	0 %	60 %	40 %	146275720
90	NC_009427	TCCGC	2	10	103619	103628	0 %	20 %	20 %	60 %	146275721
91	NC_009427	GCCGC	2	10	103665	103674	0 %	0 %	40 %	60 %	146275721
92	NC_009427	GGCGC	2	10	103798	103807	0 %	0 %	60 %	40 %	146275721
93	NC_009427	CTGCT	2	10	103974	103983	0 %	40 %	20 %	40 %	146275722
94	NC_009427	GGCCA	2	10	104357	104366	20 %	0 %	40 %	40 %	146275723
95	NC_009427	GCGCG	2	10	107320	107329	0 %	0 %	60 %	40 %	146275727
96	NC_009427	CGAGA	2	10	107366	107375	40 %	0 %	40 %	20 %	146275727
97	NC_009427	TCGCC	2	10	109641	109650	0 %	20 %	20 %	60 %	146275728
98	NC_009427	GACCG	2	10	110679	110688	20 %	0 %	40 %	40 %	146275729
99	NC_009427	ATCGC	2	10	110740	110749	20 %	20 %	20 %	40 %	146275729
100	NC_009427	CGCAG	2	10	114655	114664	20 %	0 %	40 %	40 %	146275731
101	NC_009427	GTCCG	2	10	116748	116757	0 %	20 %	40 %	40 %	146275733
102	NC_009427	CGCGC	2	10	116918	116927	0 %	0 %	40 %	60 %	146275733
103	NC_009427	TGGCC	2	10	118102	118111	0 %	20 %	40 %	40 %	146275734
104	NC_009427	GACCG	2	10	118268	118277	20 %	0 %	40 %	40 %	146275734
105	NC_009427	GTCAT	2	10	119274	119283	20 %	40 %	20 %	20 %	146275734
106	NC_009427	GATCG	2	10	120961	120970	20 %	20 %	40 %	20 %	146275736
107	NC_009427	CACGG	2	10	121303	121312	20 %	0 %	40 %	40 %	146275736
108	NC_009427	ACGCG	2	10	122820	122829	20 %	0 %	40 %	40 %	146275738
109	NC_009427	CCCCG	2	10	122917	122926	0 %	0 %	20 %	80 %	146275738
110	NC_009427	TCCGC	2	10	124952	124961	0 %	20 %	20 %	60 %	146275739
111	NC_009427	GCGCG	2	10	127201	127210	0 %	0 %	60 %	40 %	146275742
112	NC_009427	CGCGC	2	10	127427	127436	0 %	0 %	40 %	60 %	146275742
113	NC_009427	CGGCG	2	10	127525	127534	0 %	0 %	60 %	40 %	146275742
114	NC_009427	GCGCG	2	10	129209	129218	0 %	0 %	60 %	40 %	146275743
115	NC_009427	CGCCC	2	10	130070	130079	0 %	0 %	20 %	80 %	146275745
116	NC_009427	CTTCG	2	10	131927	131936	0 %	40 %	20 %	40 %	146275746
117	NC_009427	GCGCC	2	10	135081	135090	0 %	0 %	40 %	60 %	146275747
118	NC_009427	TGCCG	2	10	135256	135265	0 %	20 %	40 %	40 %	146275747
119	NC_009427	GCGAT	2	10	135455	135464	20 %	20 %	40 %	20 %	146275748
120	NC_009427	GCCGG	2	10	135517	135526	0 %	0 %	60 %	40 %	146275748
121	NC_009427	CATGG	2	10	136486	136495	20 %	20 %	40 %	20 %	146275748
122	NC_009427	CACTG	2	10	137031	137040	20 %	20 %	20 %	40 %	146275748
123	NC_009427	GCGCC	2	10	137741	137750	0 %	0 %	40 %	60 %	146275749
124	NC_009427	CGGCC	2	10	138179	138188	0 %	0 %	40 %	60 %	146275749
125	NC_009427	CAACA	2	10	139791	139800	60 %	0 %	0 %	40 %	146275750
126	NC_009427	CTTCG	2	10	140563	140572	0 %	40 %	20 %	40 %	146275751
127	NC_009427	CTCGC	2	10	140936	140945	0 %	20 %	20 %	60 %	146275751
128	NC_009427	ACGAC	2	10	141840	141849	40 %	0 %	20 %	40 %	146275751
129	NC_009427	TCGAC	2	10	143929	143938	20 %	20 %	20 %	40 %	146275753
130	NC_009427	CTGCC	2	10	148425	148434	0 %	20 %	20 %	60 %	146275757
131	NC_009427	GCGCG	2	10	151035	151044	0 %	0 %	60 %	40 %	146275759
132	NC_009427	CCTCG	2	10	151990	151999	0 %	20 %	20 %	60 %	146275760
133	NC_009427	GCACC	2	10	153242	153251	20 %	0 %	20 %	60 %	146275761
134	NC_009427	CTGCG	2	10	153922	153931	0 %	20 %	40 %	40 %	146275762
135	NC_009427	GCGAT	2	10	156190	156199	20 %	20 %	40 %	20 %	146275765
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394	NC_009427	GCTGG	2	10	457574	457583	0 %	20 %	60 %	20 %	146276027
395	NC_009427	GGCGC	2	10	460355	460364	0 %	0 %	60 %	40 %	146276029
396	NC_009427	ATGCC	2	10	462571	462580	20 %	20 %	20 %	40 %	146276031
397	NC_009427	CATCG	2	10	462633	462642	20 %	20 %	20 %	40 %	146276031
398	NC_009427	TGGTC	2	10	463592	463601	0 %	40 %	40 %	20 %	146276033
399	NC_009427	CGGGC	2	10	464564	464573	0 %	0 %	60 %	40 %	146276034
400	NC_009427	GCGCG	2	10	465268	465277	0 %	0 %	60 %	40 %	146276035
401	NC_009427	AGCGC	2	10	465934	465943	20 %	0 %	40 %	40 %	146276036
402	NC_009427	CGCGC	2	10	467173	467182	0 %	0 %	40 %	60 %	146276036
403	NC_009427	CGCCA	2	10	468179	468188	20 %	0 %	20 %	60 %	146276037
404	NC_009427	GCGCC	2	10	468192	468201	0 %	0 %	40 %	60 %	146276037
405	NC_009427	GCGCG	2	10	468706	468715	0 %	0 %	60 %	40 %	146276038
406	NC_009427	TCGGG	2	10	475727	475736	0 %	20 %	60 %	20 %	146276043
407	NC_009427	CTGCG	2	10	476096	476105	0 %	20 %	40 %	40 %	146276044
408	NC_009427	GCCCC	2	10	476613	476622	0 %	0 %	20 %	80 %	146276045
409	NC_009427	CCTGC	2	10	478037	478046	0 %	20 %	20 %	60 %	146276047
410	NC_009427	CTGCC	2	10	479149	479158	0 %	20 %	20 %	60 %	146276049
411	NC_009427	CGGTC	2	10	480448	480457	0 %	20 %	40 %	40 %	146276050
412	NC_009427	ATGGC	2	10	481199	481208	20 %	20 %	40 %	20 %	146276051
413	NC_009427	TGCCG	2	10	481715	481724	0 %	20 %	40 %	40 %	146276052
414	NC_009427	TGATC	2	10	482240	482249	20 %	40 %	20 %	20 %	146276052
415	NC_009427	GGCGA	2	10	482716	482725	20 %	0 %	60 %	20 %	146276053
416	NC_009427	CGGCG	2	10	483191	483200	0 %	0 %	60 %	40 %	146276053
417	NC_009427	ATGGC	2	10	483269	483278	20 %	20 %	40 %	20 %	146276053
418	NC_009427	CATCG	2	10	483498	483507	20 %	20 %	20 %	40 %	146276053
419	NC_009427	CAGCG	2	10	483832	483841	20 %	0 %	40 %	40 %	146276054
420	NC_009427	CCGGT	2	10	485599	485608	0 %	20 %	40 %	40 %	146276056
421	NC_009427	ATCGC	2	10	485853	485862	20 %	20 %	20 %	40 %	146276056

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.