MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444 plasmid pNL2

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009427	AACG	2	8	2647	2654	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009427	GGCG	2	8	8909	8916	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3	NC_009427	GGCG	2	8	17198	17205	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009427	ACCG	2	8	21172	21179	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009427	TCGA	2	8	23516	23523	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_009427	GGCA	2	8	27289	27296	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009427	CAAT	2	8	43091	43098	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009427	CTAT	2	8	43110	43117	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_009427	GGAC	2	8	52648	52655	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009427	TCCC	2	8	61209	61216	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11	NC_009427	GCGG	2	8	61253	61260	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009427	CAAT	2	8	65605	65612	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009427	CGCC	2	8	73007	73014	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_009427	AGGA	2	8	73817	73824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009427	ACGA	2	8	76282	76289	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009427	GATA	2	8	76377	76384	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009427	CGGA	2	8	80817	80824	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009427	GCGG	2	8	84343	84350	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009427	CGGG	2	8	93676	93683	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009427	ACGG	2	8	124343	124350	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009427	AATA	2	8	131279	131286	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009427	TCCC	2	8	134378	134385	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
23	NC_009427	TGTC	2	8	144878	144885	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009427	CCGG	2	8	144934	144941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_009427	GGCT	2	8	145694	145701	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009427	TCCC	2	8	150148	150155	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
27	NC_009427	CAAC	2	8	156056	156063	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009427	AGTG	2	8	161361	161368	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009427	CTTT	2	8	165406	165413	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009427	CCCA	2	8	167439	167446	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
31	NC_009427	AAGG	2	8	178985	178992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009427	GCAG	2	8	181328	181335	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009427	CGCT	2	8	181465	181472	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009427	CGAT	2	8	181597	181604	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_009427	CAGC	2	8	181619	181626	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009427	TCCT	2	8	183927	183934	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009427	AGGA	2	8	190548	190555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009427	CCGG	2	8	193475	193482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009427	CGAA	2	8	195769	195776	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_009427	ACGG	2	8	195793	195800	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009427	TGGC	2	8	199615	199622	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009427	CTCC	2	8	199750	199757	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
43	NC_009427	CCCG	2	8	206575	206582	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
44	NC_009427	AAGC	2	8	209032	209039	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009427	CCCA	2	8	209304	209311	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
46	NC_009427	CGGA	2	8	210745	210752	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009427	CCGA	2	8	224795	224802	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_009427	CTCG	2	8	246065	246072	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_009427	CGCC	2	8	256395	256402	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
50	NC_009427	TGCC	2	8	256425	256432	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009427	CCCG	2	8	260983	260990	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
52	NC_009427	AATC	2	8	261605	261612	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009427	GCCC	2	8	266563	266570	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
54	NC_009427	CTTT	2	8	276006	276013	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_009427	GACC	2	8	276246	276253	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009427	ATTA	2	8	280430	280437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009427	TTGA	2	8	288236	288243	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009427	GGGC	2	8	297830	297837	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
59	NC_009427	GCCC	2	8	297845	297852	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
60	NC_009427	CGTT	2	8	300281	300288	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009427	TGAC	2	8	309427	309434	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_009427	TCTG	2	8	318202	318209	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_009427	GTCA	2	8	342850	342857	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_009427	TCCT	2	8	342953	342960	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009427	ACTT	2	8	346099	346106	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009427	CAGG	2	8	349712	349719	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_009427	GGCA	2	8	362179	362186	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_009427	TCCC	2	8	364518	364525	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
69	NC_009427	GCAG	2	8	372896	372903	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_009427	AATC	2	8	372995	373002	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_009427	TCAA	2	8	379221	379228	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_009427	TTTC	2	8	379300	379307	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_009427	CGCA	2	8	388314	388321	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_009427	GCCT	2	8	429494	429501	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_009427	GACC	2	8	429523	429530	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009427	GGAC	2	8	436799	436806	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009427	ATCC	2	8	471660	471667	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_009427	CCGC	2	8	478061	478068	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
79	NC_009427	TGCC	2	8	486016	486023	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.