MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444 plasmid pNL1

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009426	CCGG	2	8	3911	3918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009426	CCCG	2	8	4737	4744	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_009426	TAAA	2	8	11794	11801	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009426	TCGC	2	8	12254	12261	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009426	CCGA	2	8	12598	12605	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009426	GGCA	2	8	13121	13128	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009426	ACCG	2	8	13315	13322	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009426	CAGC	2	8	13719	13726	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009426	CCGG	2	8	13916	13923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009426	CAGC	2	8	14200	14207	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009426	CCGC	2	8	15647	15654	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12	NC_009426	TTGC	2	8	17597	17604	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009426	GGTA	2	8	32559	32566	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009426	CGGC	2	8	45636	45643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009426	CAAC	2	8	51466	51473	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_009426	ATCC	2	8	52137	52144	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009426	CAGG	2	8	52188	52195	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009426	TGCG	2	8	58789	58796	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009426	TTGA	2	8	69995	70002	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009426	ATCG	3	12	80149	80160	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009426	ACCA	2	8	84526	84533	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_009426	ACTC	2	8	94030	94037	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009426	GGCA	2	8	99536	99543	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009426	AGCG	2	8	100004	100011	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_009426	AGGG	2	8	100054	100061	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009426	GAAC	2	8	100068	100075	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_009426	ACCG	2	8	100272	100279	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009426	GTCG	2	8	102340	102347	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_009426	TCGA	2	8	102461	102468	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009426	GGGA	2	8	102765	102772	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009426	TGGC	2	8	114921	114928	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_009426	TCGA	2	8	118772	118779	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009426	GGGA	2	8	125961	125968	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009426	CCAG	2	8	133838	133845	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009426	TGGC	2	8	133994	134001	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009426	CCTG	2	8	142102	142109	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009426	TCAT	2	8	153704	153711	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009426	CCTA	2	8	156648	156655	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009426	CCTC	2	8	157764	157771	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
40	NC_009426	CGAG	2	8	159146	159153	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009426	CCAT	2	8	159196	159203	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009426	CCGA	2	8	160981	160988	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_009426	AGCC	2	8	161640	161647	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_009426	CGAC	2	8	161682	161689	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009426	CTGC	2	8	161807	161814	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009426	GGTT	2	8	162408	162415	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009426	CTGG	2	8	162676	162683	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_009426	GGCG	2	8	162730	162737	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009426	CGGT	2	8	162755	162762	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_009426	CCCG	2	8	162919	162926	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.