MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444 plasmid pNL1

Total Repeats: 407

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009426	ATGC	2	8	73	80	25 %	25 %	25 %	25 %	146275444
2	NC_009426	GTGC	2	8	1016	1023	0 %	25 %	50 %	25 %	146275444
3	NC_009426	CGGC	2	8	1206	1213	0 %	0 %	50 %	50 %	146275445
4	NC_009426	CATC	2	8	1237	1244	25 %	25 %	0 %	50 %	146275445
5	NC_009426	AGCC	2	8	1500	1507	25 %	0 %	25 %	50 %	146275445
6	NC_009426	CCGT	2	8	2236	2243	0 %	25 %	25 %	50 %	146275446
7	NC_009426	CAGC	2	8	2446	2453	25 %	0 %	25 %	50 %	146275446
8	NC_009426	GCCT	2	8	2551	2558	0 %	25 %	25 %	50 %	146275446
9	NC_009426	CCGC	2	8	2697	2704	0 %	0 %	25 %	75 %	146275446
10	NC_009426	CCTG	2	8	2851	2858	0 %	25 %	25 %	50 %	146275447
11	NC_009426	TCGA	2	8	3149	3156	25 %	25 %	25 %	25 %	146275447
12	NC_009426	ATCG	2	8	3190	3197	25 %	25 %	25 %	25 %	146275447
13	NC_009426	CCTT	2	8	3722	3729	0 %	50 %	0 %	50 %	146275447
14	NC_009426	TCGC	2	8	4297	4304	0 %	25 %	25 %	50 %	146275448
15	NC_009426	TTGC	2	8	4930	4937	0 %	50 %	25 %	25 %	146275449
16	NC_009426	CCCG	2	8	5327	5334	0 %	0 %	25 %	75 %	146275449
17	NC_009426	GCGG	2	8	5643	5650	0 %	0 %	75 %	25 %	146275449
18	NC_009426	GAAG	2	8	5795	5802	50 %	0 %	50 %	0 %	146275449
19	NC_009426	GGGC	2	8	5850	5857	0 %	0 %	75 %	25 %	146275449
20	NC_009426	AGCC	2	8	5909	5916	25 %	0 %	25 %	50 %	146275449
21	NC_009426	TCGC	2	8	6391	6398	0 %	25 %	25 %	50 %	146275450
22	NC_009426	ACCG	2	8	6838	6845	25 %	0 %	25 %	50 %	146275450
23	NC_009426	GAGC	2	8	6976	6983	25 %	0 %	50 %	25 %	146275450
24	NC_009426	TCGA	2	8	7359	7366	25 %	25 %	25 %	25 %	146275450
25	NC_009426	CCAG	2	8	8081	8088	25 %	0 %	25 %	50 %	146275451
26	NC_009426	CTGG	2	8	8463	8470	0 %	25 %	50 %	25 %	146275451
27	NC_009426	GTCG	2	8	8673	8680	0 %	25 %	50 %	25 %	146275451
28	NC_009426	GGCA	2	8	8818	8825	25 %	0 %	50 %	25 %	146275451
29	NC_009426	GATG	2	8	9096	9103	25 %	25 %	50 %	0 %	146275451
30	NC_009426	GGCT	2	8	9395	9402	0 %	25 %	50 %	25 %	146275452
31	NC_009426	AAGG	2	8	9900	9907	50 %	0 %	50 %	0 %	146275453
32	NC_009426	GATC	2	8	10081	10088	25 %	25 %	25 %	25 %	146275453
33	NC_009426	GATG	2	8	10925	10932	25 %	25 %	50 %	0 %	146275453
34	NC_009426	GACC	2	8	11437	11444	25 %	0 %	25 %	50 %	146275454
35	NC_009426	GGCG	2	8	14531	14538	0 %	0 %	75 %	25 %	146275455
36	NC_009426	CTGG	2	8	14570	14577	0 %	25 %	50 %	25 %	146275455
37	NC_009426	CACC	2	8	14939	14946	25 %	0 %	0 %	75 %	146275455
38	NC_009426	ACCA	2	8	15342	15349	50 %	0 %	0 %	50 %	146275455
39	NC_009426	GCTG	2	8	15574	15581	0 %	25 %	50 %	25 %	146275455
40	NC_009426	TTTC	2	8	15680	15687	0 %	75 %	0 %	25 %	146275456
41	NC_009426	ATTC	2	8	16142	16149	25 %	50 %	0 %	25 %	146275456
42	NC_009426	ACCC	2	8	16170	16177	25 %	0 %	0 %	75 %	146275456
43	NC_009426	CCGC	2	8	16978	16985	0 %	0 %	25 %	75 %	146275457
44	NC_009426	CAGA	2	8	18229	18236	50 %	0 %	25 %	25 %	146275458
45	NC_009426	CGGC	2	8	18549	18556	0 %	0 %	50 %	50 %	146275458
46	NC_009426	GGCG	2	8	19606	19613	0 %	0 %	75 %	25 %	146275460
47	NC_009426	TCCT	2	8	20152	20159	0 %	50 %	0 %	50 %	146275461
48	NC_009426	CCAT	2	8	20913	20920	25 %	25 %	0 %	50 %	146275462
49	NC_009426	CATA	2	8	21367	21374	50 %	25 %	0 %	25 %	146275462
50	NC_009426	GATC	2	8	22272	22279	25 %	25 %	25 %	25 %	146275463
51	NC_009426	GGTC	2	8	22335	22342	0 %	25 %	50 %	25 %	146275463
52	NC_009426	TCAG	2	8	22409	22416	25 %	25 %	25 %	25 %	146275464
53	NC_009426	GCCA	2	8	22563	22570	25 %	0 %	25 %	50 %	146275464
54	NC_009426	ACCG	2	8	22613	22620	25 %	0 %	25 %	50 %	146275464
55	NC_009426	CGAA	2	8	23906	23913	50 %	0 %	25 %	25 %	146275465
56	NC_009426	GCCG	2	8	24018	24025	0 %	0 %	50 %	50 %	146275465
57	NC_009426	GCTT	2	8	24549	24556	0 %	50 %	25 %	25 %	146275465
58	NC_009426	CCGG	2	8	25797	25804	0 %	0 %	50 %	50 %	146275467
59	NC_009426	AGAT	2	8	27262	27269	50 %	25 %	25 %	0 %	146275469
60	NC_009426	GAGC	2	8	27695	27702	25 %	0 %	50 %	25 %	146275469
61	NC_009426	AGCG	2	8	29261	29268	25 %	0 %	50 %	25 %	146275471
62	NC_009426	ATGG	2	8	29311	29318	25 %	25 %	50 %	0 %	146275471
63	NC_009426	ACGA	2	8	30598	30605	50 %	0 %	25 %	25 %	146275473
64	NC_009426	CGTG	2	8	30750	30757	0 %	25 %	50 %	25 %	146275473
65	NC_009426	GCCC	2	8	30815	30822	0 %	0 %	25 %	75 %	146275473
66	NC_009426	GCCA	2	8	30928	30935	25 %	0 %	25 %	50 %	146275473
67	NC_009426	GCCA	2	8	30994	31001	25 %	0 %	25 %	50 %	146275473
68	NC_009426	AAGG	2	8	31046	31053	50 %	0 %	50 %	0 %	146275474
69	NC_009426	GCGT	2	8	31731	31738	0 %	25 %	50 %	25 %	146275474
70	NC_009426	GTCG	2	8	32670	32677	0 %	25 %	50 %	25 %	146275475
71	NC_009426	GTTG	2	8	33443	33450	0 %	50 %	50 %	0 %	146275475
72	NC_009426	CAAA	2	8	33617	33624	75 %	0 %	0 %	25 %	146275476
73	NC_009426	GCCC	2	8	33690	33697	0 %	0 %	25 %	75 %	146275476
74	NC_009426	GATG	2	8	35165	35172	25 %	25 %	50 %	0 %	146275478
75	NC_009426	CAAG	2	8	35489	35496	50 %	0 %	25 %	25 %	146275478
76	NC_009426	CCAG	2	8	35957	35964	25 %	0 %	25 %	50 %	146275479
77	NC_009426	GATC	2	8	36067	36074	25 %	25 %	25 %	25 %	146275479
78	NC_009426	CGCC	2	8	36153	36160	0 %	0 %	25 %	75 %	146275479
79	NC_009426	CTCA	2	8	36573	36580	25 %	25 %	0 %	50 %	146275480
80	NC_009426	CCGA	2	8	37065	37072	25 %	0 %	25 %	50 %	146275480
81	NC_009426	ACCG	2	8	37184	37191	25 %	0 %	25 %	50 %	146275480
82	NC_009426	GGCG	2	8	37626	37633	0 %	0 %	75 %	25 %	146275480
83	NC_009426	GGCA	2	8	38264	38271	25 %	0 %	50 %	25 %	146275480
84	NC_009426	CCGA	2	8	39392	39399	25 %	0 %	25 %	50 %	146275481
85	NC_009426	ACAA	2	8	39830	39837	75 %	0 %	0 %	25 %	146275481
86	NC_009426	GTTC	2	8	39904	39911	0 %	50 %	25 %	25 %	146275481
87	NC_009426	GCCA	2	8	40209	40216	25 %	0 %	25 %	50 %	146275481
88	NC_009426	CCGG	2	8	40638	40645	0 %	0 %	50 %	50 %	146275481
89	NC_009426	CCGA	2	8	40679	40686	25 %	0 %	25 %	50 %	146275481
90	NC_009426	CTAC	2	8	41340	41347	25 %	25 %	0 %	50 %	146275482
91	NC_009426	CTGG	2	8	41497	41504	0 %	25 %	50 %	25 %	146275482
92	NC_009426	GGCG	2	8	41707	41714	0 %	0 %	75 %	25 %	146275482
93	NC_009426	GCTC	2	8	41842	41849	0 %	25 %	25 %	50 %	146275482
94	NC_009426	CAAC	2	8	42365	42372	50 %	0 %	0 %	50 %	146275482
95	NC_009426	GTTC	2	8	43108	43115	0 %	50 %	25 %	25 %	146275483
96	NC_009426	CGCC	2	8	43816	43823	0 %	0 %	25 %	75 %	146275484
97	NC_009426	CACC	2	8	45468	45475	25 %	0 %	0 %	75 %	146275485
98	NC_009426	CGGG	2	8	45718	45725	0 %	0 %	75 %	25 %	146275486
99	NC_009426	CGGT	2	8	46087	46094	0 %	25 %	50 %	25 %	146275486
100	NC_009426	GCCG	2	8	47431	47438	0 %	0 %	50 %	50 %	146275487
101	NC_009426	TGCC	2	8	48398	48405	0 %	25 %	25 %	50 %	146275487
102	NC_009426	CGAT	2	8	48410	48417	25 %	25 %	25 %	25 %	146275487
103	NC_009426	CCCG	2	8	48477	48484	0 %	0 %	25 %	75 %	146275487
104	NC_009426	GGTG	2	8	48489	48496	0 %	25 %	75 %	0 %	146275487
105	NC_009426	GCAG	2	8	48640	48647	25 %	0 %	50 %	25 %	146275488
106	NC_009426	GATC	2	8	48822	48829	25 %	25 %	25 %	25 %	146275489
107	NC_009426	GCTG	2	8	49317	49324	0 %	25 %	50 %	25 %	146275489
108	NC_009426	GCTC	2	8	49724	49731	0 %	25 %	25 %	50 %	146275489
109	NC_009426	GACC	2	8	50169	50176	25 %	0 %	25 %	50 %	146275489
110	NC_009426	CCGA	3	12	50575	50586	25 %	0 %	25 %	50 %	146275490
111	NC_009426	CCAA	2	8	52570	52577	50 %	0 %	0 %	50 %	146275491
112	NC_009426	ACTG	2	8	53468	53475	25 %	25 %	25 %	25 %	146275492
113	NC_009426	CGCC	2	8	53610	53617	0 %	0 %	25 %	75 %	146275492
114	NC_009426	CTGG	2	8	54484	54491	0 %	25 %	50 %	25 %	146275493
115	NC_009426	CTGG	2	8	54712	54719	0 %	25 %	50 %	25 %	146275494
116	NC_009426	TGCG	2	8	54828	54835	0 %	25 %	50 %	25 %	146275494
117	NC_009426	CCGG	2	8	55277	55284	0 %	0 %	50 %	50 %	146275494
118	NC_009426	CGGC	2	8	56240	56247	0 %	0 %	50 %	50 %	146275495
119	NC_009426	CAGT	2	8	56614	56621	25 %	25 %	25 %	25 %	146275496
120	NC_009426	AGCA	2	8	56879	56886	50 %	0 %	25 %	25 %	146275496
121	NC_009426	AGGA	2	8	57481	57488	50 %	0 %	50 %	0 %	146275496
122	NC_009426	ATCG	2	8	59252	59259	25 %	25 %	25 %	25 %	146275498
123	NC_009426	TGCC	2	8	59914	59921	0 %	25 %	25 %	50 %	146275498
124	NC_009426	CCAG	2	8	60418	60425	25 %	0 %	25 %	50 %	146275499
125	NC_009426	ATGC	2	8	60551	60558	25 %	25 %	25 %	25 %	146275499
126	NC_009426	GGGC	2	8	60752	60759	0 %	0 %	75 %	25 %	146275499
127	NC_009426	GCCG	2	8	60799	60806	0 %	0 %	50 %	50 %	146275499
128	NC_009426	GGCC	2	8	61748	61755	0 %	0 %	50 %	50 %	146275500
129	NC_009426	GGTC	2	8	61931	61938	0 %	25 %	50 %	25 %	146275500
130	NC_009426	TGAT	2	8	62237	62244	25 %	50 %	25 %	0 %	146275500
131	NC_009426	GATC	2	8	62923	62930	25 %	25 %	25 %	25 %	146275502
132	NC_009426	AACC	2	8	63347	63354	50 %	0 %	0 %	50 %	146275503
133	NC_009426	CGGT	2	8	63568	63575	0 %	25 %	50 %	25 %	146275503
134	NC_009426	AGGT	2	8	63913	63920	25 %	25 %	50 %	0 %	146275503
135	NC_009426	GGCA	2	8	63999	64006	25 %	0 %	50 %	25 %	146275503
136	NC_009426	GCTC	2	8	64596	64603	0 %	25 %	25 %	50 %	146275504
137	NC_009426	CCTT	2	8	64745	64752	0 %	50 %	0 %	50 %	146275504
138	NC_009426	CTTT	2	8	65155	65162	0 %	75 %	0 %	25 %	146275505
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.