MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444 plasmid pNL1

Total Repeats: 2645

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009426	TCG	3	9	88	96	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275444
2	NC_009426	TCG	2	6	130	135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275444
3	NC_009426	GCC	2	6	140	145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275444
4	NC_009426	ACG	2	6	293	298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275444
5	NC_009426	GCA	2	6	307	312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275444
6	NC_009426	GCC	2	6	378	383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275444
7	NC_009426	CTC	2	6	462	467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146275444
8	NC_009426	CGA	2	6	638	643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275444
9	NC_009426	TCA	2	6	652	657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146275444
10	NC_009426	CGA	2	6	794	799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275444
11	NC_009426	CAG	2	6	849	854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275444
12	NC_009426	TCT	2	6	1039	1044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009426	CCA	2	6	1170	1175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146275445
14	NC_009426	TCG	2	6	1407	1412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275445
15	NC_009426	AAT	2	6	1462	1467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146275445
16	NC_009426	CAG	2	6	1544	1549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275445
17	NC_009426	TGG	2	6	1582	1587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146275445
18	NC_009426	CAG	2	6	1801	1806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275446
19	NC_009426	TCG	2	6	1847	1852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275446
20	NC_009426	TGG	2	6	1856	1861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146275446
21	NC_009426	TGA	2	6	1923	1928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146275446
22	NC_009426	GCC	2	6	2103	2108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275446
23	NC_009426	GCC	2	6	2113	2118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275446
24	NC_009426	CGC	2	6	2140	2145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275446
25	NC_009426	GCA	2	6	2148	2153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275446
26	NC_009426	CGT	2	6	2169	2174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275446
27	NC_009426	AGC	2	6	2225	2230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275446
28	NC_009426	AGA	2	6	2340	2345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146275446
29	NC_009426	TTG	2	6	2480	2485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146275446
30	NC_009426	TGC	2	6	2511	2516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275446
31	NC_009426	CAC	2	6	2545	2550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146275446
32	NC_009426	GCC	2	6	2711	2716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275446
33	NC_009426	GTT	2	6	2753	2758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146275446
34	NC_009426	GCC	2	6	2932	2937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275447
35	NC_009426	TGT	2	6	2967	2972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146275447
36	NC_009426	CGC	2	6	3013	3018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275447
37	NC_009426	CGC	2	6	3063	3068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275447
38	NC_009426	GCG	2	6	3080	3085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275447
39	NC_009426	CGC	2	6	3129	3134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275447
40	NC_009426	GTA	2	6	3178	3183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146275447
41	NC_009426	GCA	2	6	3198	3203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275447
42	NC_009426	CGC	2	6	3223	3228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275447
43	NC_009426	GCA	2	6	3237	3242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275447
44	NC_009426	CAC	2	6	3425	3430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146275447
45	NC_009426	CGG	2	6	3546	3551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275447
46	NC_009426	CGA	2	6	3555	3560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275447
47	NC_009426	GCT	2	6	3674	3679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275447
48	NC_009426	GCG	2	6	3701	3706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275447
49	NC_009426	CAG	3	9	3768	3776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275447
50	NC_009426	CAG	2	6	3778	3783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275447
51	NC_009426	AGC	2	6	3997	4002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275448
52	NC_009426	ACC	2	6	4268	4273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146275448
53	NC_009426	GAA	2	6	4274	4279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146275448
54	NC_009426	TCG	2	6	4281	4286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275448
55	NC_009426	TGC	2	6	4322	4327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275448
56	NC_009426	TGC	2	6	4335	4340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275448
57	NC_009426	GGC	2	6	4433	4438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275448
58	NC_009426	GGC	2	6	4441	4446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275448
59	NC_009426	GGA	2	6	4474	4479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146275448
60	NC_009426	CGG	2	6	4510	4515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275448
61	NC_009426	GCC	2	6	4649	4654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275448
62	NC_009426	CGC	2	6	4669	4674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275448
63	NC_009426	GCC	2	6	4810	4815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275449
64	NC_009426	GAA	2	6	4911	4916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146275449
65	NC_009426	CCG	2	6	5122	5127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275449
66	NC_009426	AAG	2	6	5128	5133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146275449
67	NC_009426	CGG	2	6	5156	5161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275449
68	NC_009426	CGA	2	6	5198	5203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275449
69	NC_009426	CCA	2	6	5291	5296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146275449
70	NC_009426	CGC	2	6	5357	5362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275449
71	NC_009426	CGC	2	6	5381	5386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275449
72	NC_009426	GAT	2	6	5532	5537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146275449
73	NC_009426	GGC	2	6	5613	5618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275449
74	NC_009426	ACC	2	6	5652	5657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146275449
75	NC_009426	GGT	2	6	5658	5663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146275449
76	NC_009426	CAG	2	6	5664	5669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275449
77	NC_009426	CGC	2	6	5718	5723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275449
78	NC_009426	GGC	2	6	5772	5777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275449
79	NC_009426	CCT	2	6	5837	5842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146275449
80	NC_009426	GCC	2	6	5867	5872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275449
81	NC_009426	TTC	2	6	5877	5882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146275449
82	NC_009426	ATA	2	6	6055	6060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009426	CAG	2	6	6227	6232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275450
84	NC_009426	CGA	2	6	6247	6252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275450
85	NC_009426	TCG	2	6	6337	6342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275450
86	NC_009426	CGT	2	6	6400	6405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275450
87	NC_009426	CAG	2	6	6410	6415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275450
88	NC_009426	CCA	2	6	6427	6432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146275450
89	NC_009426	CAG	2	6	6473	6478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275450
90	NC_009426	CAG	2	6	6554	6559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275450
91	NC_009426	GCG	2	6	6589	6594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275450
92	NC_009426	TGC	2	6	6683	6688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275450
93	NC_009426	GCC	2	6	6818	6823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275450
94	NC_009426	GGC	2	6	6851	6856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275450
95	NC_009426	CGC	2	6	6923	6928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275450
96	NC_009426	CAG	2	6	7025	7030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275450
97	NC_009426	CAT	2	6	7114	7119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146275450
98	NC_009426	GCG	2	6	7141	7146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275450
99	NC_009426	GGC	2	6	7211	7216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275450
100	NC_009426	ATG	2	6	7248	7253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146275450
101	NC_009426	CGC	2	6	7352	7357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275450
102	NC_009426	AGA	2	6	7561	7566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146275450
103	NC_009426	GGC	2	6	7603	7608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275450
104	NC_009426	CTG	2	6	7841	7846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_009426	GCT	2	6	8057	8062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275451
106	NC_009426	GCT	2	6	8396	8401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275451
107	NC_009426	AGA	2	6	8510	8515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146275451
108	NC_009426	GCG	2	6	8558	8563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275451
109	NC_009426	GGC	2	6	8601	8606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275451
110	NC_009426	GCT	2	6	8871	8876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275451
111	NC_009426	ATC	2	6	8903	8908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146275451
112	NC_009426	ACG	2	6	9035	9040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275451
113	NC_009426	CGC	2	6	9162	9167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275451
114	NC_009426	CCG	2	6	9204	9209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275451
115	NC_009426	ATG	2	6	9223	9228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146275451
116	NC_009426	ACA	2	6	9257	9262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146275451
117	NC_009426	GCT	2	6	9370	9375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275452
118	NC_009426	CGC	2	6	9471	9476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275452
119	NC_009426	TCC	2	6	9574	9579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146275452
120	NC_009426	CCG	2	6	9589	9594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275452
121	NC_009426	CCG	2	6	9705	9710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275452
122	NC_009426	GGC	2	6	9737	9742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275452
123	NC_009426	GCT	2	6	9748	9753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275452
124	NC_009426	TGC	2	6	9786	9791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275452
125	NC_009426	ATT	2	6	9877	9882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146275453
126	NC_009426	CCG	2	6	9917	9922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275453
127	NC_009426	GAG	3	9	9948	9956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146275453
128	NC_009426	GAC	2	6	10031	10036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275453
129	NC_009426	TCG	2	6	10060	10065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275453
130	NC_009426	CCG	2	6	10195	10200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275453
131	NC_009426	ACG	2	6	10234	10239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275453
132	NC_009426	GGT	2	6	10366	10371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146275453
133	NC_009426	GGC	2	6	10401	10406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275453
134	NC_009426	GGC	2	6	10419	10424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275453
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159	NC_009426	TGG	2	6	12351	12356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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255	NC_009426	CGC	2	6	19041	19046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275458
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257	NC_009426	ACC	2	6	19283	19288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146275459
258	NC_009426	CCA	2	6	19317	19322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146275459
259	NC_009426	CGA	2	6	19381	19386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275459
260	NC_009426	TGG	2	6	19395	19400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146275459
261	NC_009426	TCT	2	6	19423	19428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146275460
262	NC_009426	GCG	6	18	19444	19461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275460
263	NC_009426	GCA	2	6	19468	19473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275460
264	NC_009426	GCA	2	6	19564	19569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275460
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271	NC_009426	CGA	2	6	19942	19947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275461
272	NC_009426	GAT	2	6	20008	20013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146275461
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274	NC_009426	GCA	2	6	20057	20062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275461
275	NC_009426	TCA	2	6	20088	20093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146275461
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278	NC_009426	GAT	2	6	20459	20464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146275462
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280	NC_009426	CGA	2	6	20506	20511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275462
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288	NC_009426	TCA	3	9	21022	21030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146275462
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332	NC_009426	ACC	2	6	24214	24219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146275465
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374	NC_009426	GAT	2	6	26987	26992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
375	NC_009426	CAG	2	6	27038	27043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
376	NC_009426	GAA	2	6	27081	27086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
377	NC_009426	GCC	2	6	27154	27159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275469
378	NC_009426	CGC	2	6	27554	27559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275469
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380	NC_009426	CAG	2	6	27946	27951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275470
381	NC_009426	TCA	3	9	28179	28187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146275470
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383	NC_009426	CGA	2	6	28398	28403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275471
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