MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Yersinia pestis Pestoides F chromosome

Total Repeats: 2910

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009381	ACTGG	2	10	174	183	20 %	20 %	40 %	20 %	145597325
2	NC_009381	ATTTT	2	10	2112	2121	20 %	80 %	0 %	0 %	145597326
3	NC_009381	TCCAG	2	10	8838	8847	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_009381	GAACC	2	10	8994	9003	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_009381	ATTTT	2	10	11123	11132	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009381	ATTTT	2	10	17910	17919	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009381	GTCCA	2	10	19773	19782	20 %	20 %	20 %	40 %	145597340
8	NC_009381	CGTAA	2	10	20130	20139	40 %	20 %	20 %	20 %	145597340
9	NC_009381	GAAAA	2	10	20780	20789	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009381	TCTGT	2	10	21250	21259	0 %	60 %	20 %	20 %	145597341
11	NC_009381	CCATT	2	10	25511	25520	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_009381	TTCGT	2	10	25892	25901	0 %	60 %	20 %	20 %	145597346
13	NC_009381	GGTGA	2	10	26602	26611	20 %	20 %	60 %	0 %	145597347
14	NC_009381	CGGCC	2	10	26694	26703	0 %	0 %	40 %	60 %	145597347
15	NC_009381	GGGTT	2	10	27591	27600	0 %	40 %	60 %	0 %	145597347
16	NC_009381	AATAC	2	10	35094	35103	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_009381	AAAGA	2	10	35930	35939	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009381	TAAAA	2	10	36403	36412	80 %	20 %	0 %	0 %	145597354
19	NC_009381	TTTTA	2	10	40032	40041	20 %	80 %	0 %	0 %	145597357
20	NC_009381	GCACC	2	10	40222	40231	20 %	0 %	20 %	60 %	145597357
21	NC_009381	AATAG	2	10	40604	40613	60 %	20 %	20 %	0 %	145597357
22	NC_009381	CCAGG	2	10	42528	42537	20 %	0 %	40 %	40 %	145597359
23	NC_009381	TGGGC	2	10	43348	43357	0 %	20 %	60 %	20 %	145597359
24	NC_009381	GGTTG	2	10	45553	45562	0 %	40 %	60 %	0 %	145597361
25	NC_009381	CGAAC	2	10	47474	47483	40 %	0 %	20 %	40 %	145597363
26	NC_009381	CCCGC	2	10	47939	47948	0 %	0 %	20 %	80 %	145597363
27	NC_009381	TATTT	2	10	52457	52466	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009381	TTATT	2	10	52689	52698	20 %	80 %	0 %	0 %	145597367
29	NC_009381	GGCAA	2	10	54863	54872	40 %	0 %	40 %	20 %	145597369
30	NC_009381	TTAGT	2	10	55274	55283	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009381	TCCAG	2	10	56829	56838	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_009381	GAACC	2	10	56985	56994	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_009381	TTTTG	2	10	57790	57799	0 %	80 %	20 %	0 %	145597371
34	NC_009381	TTCAC	2	10	60953	60962	20 %	40 %	0 %	40 %	145597374
35	NC_009381	GCATT	2	10	68908	68917	20 %	40 %	20 %	20 %	145597379
36	NC_009381	CGCGG	2	10	71650	71659	0 %	0 %	60 %	40 %	145597382
37	NC_009381	CACTT	2	10	72229	72238	20 %	40 %	0 %	40 %	145597382
38	NC_009381	GCGCA	2	10	74211	74220	20 %	0 %	40 %	40 %	145597384
39	NC_009381	CTAAA	2	10	79384	79393	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_009381	CTAGC	2	10	83459	83468	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_009381	AGGTT	2	10	84623	84632	20 %	40 %	40 %	0 %	145597392
42	NC_009381	CATCC	2	10	85674	85683	20 %	20 %	0 %	60 %	145597392
43	NC_009381	GCCCG	2	10	87049	87058	0 %	0 %	40 %	60 %	145597394
44	NC_009381	GGACC	2	10	88317	88326	20 %	0 %	40 %	40 %	145597394
45	NC_009381	GCTCA	2	10	90288	90297	20 %	20 %	20 %	40 %	145597395
46	NC_009381	TTGGC	2	10	90603	90612	0 %	40 %	40 %	20 %	145597396
47	NC_009381	TTGAG	2	10	93140	93149	20 %	40 %	40 %	0 %	145597400
48	NC_009381	GGCGG	2	10	93941	93950	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
49	NC_009381	TGGCT	2	10	95105	95114	0 %	40 %	40 %	20 %	145597402
50	NC_009381	ATTTT	2	10	103969	103978	20 %	80 %	0 %	0 %	145597411
51	NC_009381	GTGCG	2	10	103979	103988	0 %	20 %	60 %	20 %	145597411
52	NC_009381	TGGTG	2	10	107530	107539	0 %	40 %	60 %	0 %	145597412
53	NC_009381	AATGA	2	10	109136	109145	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009381	AGCTG	2	10	113162	113171	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_009381	CCATA	2	10	113469	113478	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_009381	AATTG	2	10	119128	119137	40 %	40 %	20 %	0 %	145597419
57	NC_009381	TGCCA	2	10	119481	119490	20 %	20 %	20 %	40 %	145597420
58	NC_009381	TTGAA	2	10	119833	119842	40 %	40 %	20 %	0 %	145597420
59	NC_009381	TAATT	2	10	122439	122448	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009381	CTTCC	2	10	123700	123709	0 %	40 %	0 %	60 %	145597424
61	NC_009381	GACCA	2	10	124776	124785	40 %	0 %	20 %	40 %	145597425
62	NC_009381	CGGTA	2	10	127440	127449	20 %	20 %	40 %	20 %	145597428
63	NC_009381	GCAAG	2	10	127779	127788	40 %	0 %	40 %	20 %	145597428
64	NC_009381	TACGT	2	10	128674	128683	20 %	40 %	20 %	20 %	145597430
65	NC_009381	CGTTG	2	10	128950	128959	0 %	40 %	40 %	20 %	145597430
66	NC_009381	GCTGA	2	10	129335	129344	20 %	20 %	40 %	20 %	145597430
67	NC_009381	GCACC	2	10	129999	130008	20 %	0 %	20 %	60 %	145597431
68	NC_009381	ATGGC	2	10	134164	134173	20 %	20 %	40 %	20 %	145597433
69	NC_009381	GGCAT	2	10	136129	136138	20 %	20 %	40 %	20 %	145597435
70	NC_009381	AAGTT	2	10	138376	138385	40 %	40 %	20 %	0 %	145597438
71	NC_009381	ACTCT	2	10	139473	139482	20 %	40 %	0 %	40 %	145597439
72	NC_009381	GGGCA	2	10	140646	140655	20 %	0 %	60 %	20 %	145597441
73	NC_009381	CAGCT	2	10	140994	141003	20 %	20 %	20 %	40 %	145597442
74	NC_009381	TCTGG	2	10	143003	143012	0 %	40 %	40 %	20 %	145597446
75	NC_009381	TCGTA	2	10	143874	143883	20 %	40 %	20 %	20 %	145597446
76	NC_009381	AATTA	2	10	147910	147919	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009381	GGAAT	2	10	149153	149162	40 %	20 %	40 %	0 %	145597453
78	NC_009381	TGCAG	2	10	149892	149901	20 %	20 %	40 %	20 %	145597454
79	NC_009381	AAGGT	2	10	152448	152457	40 %	20 %	40 %	0 %	145597459
80	NC_009381	AATTT	2	10	152753	152762	40 %	60 %	0 %	0 %	145597460
81	NC_009381	GTAAA	2	10	153755	153764	60 %	20 %	20 %	0 %	145597463
82	NC_009381	CCCGT	2	10	154737	154746	0 %	20 %	20 %	60 %	145597465
83	NC_009381	GCTTT	2	10	157815	157824	0 %	60 %	20 %	20 %	145597471
84	NC_009381	TTGGG	2	10	159483	159492	0 %	40 %	60 %	0 %	145597473
85	NC_009381	GCGCT	2	10	159563	159572	0 %	20 %	40 %	40 %	145597473
86	NC_009381	CGATC	2	10	161172	161181	20 %	20 %	20 %	40 %	145597475
87	NC_009381	TTAAC	2	10	163234	163243	40 %	40 %	0 %	20 %	145597479
88	NC_009381	TGCCC	2	10	165015	165024	0 %	20 %	20 %	60 %	145597480
89	NC_009381	CTGGG	2	10	167276	167285	0 %	20 %	60 %	20 %	145597482
90	NC_009381	GTAAT	2	10	167940	167949	40 %	40 %	20 %	0 %	145597483
91	NC_009381	CGATT	2	10	171370	171379	20 %	40 %	20 %	20 %	145597488
92	NC_009381	CTTGG	2	10	171498	171507	0 %	40 %	40 %	20 %	145597488
93	NC_009381	AATAG	2	10	171911	171920	60 %	20 %	20 %	0 %	145597489
94	NC_009381	AGGCT	2	10	176300	176309	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_009381	ATTTG	2	10	179879	179888	20 %	60 %	20 %	0 %	145597490
96	NC_009381	CTTCC	2	10	179990	179999	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
97	NC_009381	ATTTT	2	10	180526	180535	20 %	80 %	0 %	0 %	145597492
98	NC_009381	TGGTG	2	10	182837	182846	0 %	40 %	60 %	0 %	145597493
99	NC_009381	TTACC	2	10	184520	184529	20 %	40 %	0 %	40 %	145597494
100	NC_009381	AGATG	2	10	185034	185043	40 %	20 %	40 %	0 %	145597494
101	NC_009381	GTCTG	2	10	188868	188877	0 %	40 %	40 %	20 %	145597496
102	NC_009381	CTTTT	2	10	190755	190764	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_009381	TTTAC	2	10	193346	193355	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_009381	ATTTT	2	10	193601	193610	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009381	TGAAT	2	10	193730	193739	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009381	GTGTT	2	10	196724	196733	0 %	60 %	40 %	0 %	145601174
107	NC_009381	TATTT	2	10	201267	201276	20 %	80 %	0 %	0 %	145597499
108	NC_009381	TTCTA	2	10	201353	201362	20 %	60 %	0 %	20 %	145597499
109	NC_009381	AAGTT	2	10	204070	204079	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009381	AATCC	2	10	205439	205448	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_009381	TCCCC	2	10	205811	205820	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
112	NC_009381	TGCCT	2	10	209200	209209	0 %	40 %	20 %	40 %	145597506
113	NC_009381	AAAGA	2	10	211674	211683	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009381	AAGCA	2	10	211824	211833	60 %	0 %	20 %	20 %	145597509
115	NC_009381	CTTAC	2	10	213117	213126	20 %	40 %	0 %	40 %	145597510
116	NC_009381	GCTTT	2	10	214444	214453	0 %	60 %	20 %	20 %	145597512
117	NC_009381	CAGCG	2	10	214659	214668	20 %	0 %	40 %	40 %	145597512
118	NC_009381	TCCAG	2	10	216621	216630	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_009381	GAACC	2	10	216777	216786	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_009381	GCCTC	2	10	219176	219185	0 %	20 %	20 %	60 %	145597517
121	NC_009381	AGCAA	2	10	221875	221884	60 %	0 %	20 %	20 %	145597519
122	NC_009381	TGTGC	2	10	222232	222241	0 %	40 %	40 %	20 %	145597520
123	NC_009381	CTGTG	2	10	223327	223336	0 %	40 %	40 %	20 %	145597521
124	NC_009381	CGTTG	2	10	225505	225514	0 %	40 %	40 %	20 %	145597522
125	NC_009381	CACGC	2	10	226953	226962	20 %	0 %	20 %	60 %	145597524
126	NC_009381	TCCTC	2	10	227863	227872	0 %	40 %	0 %	60 %	145597524
127	NC_009381	AGTGG	2	10	231084	231093	20 %	20 %	60 %	0 %	145597525
128	NC_009381	TGGCC	2	10	232111	232120	0 %	20 %	40 %	40 %	145597526
129	NC_009381	GGCCC	2	10	233485	233494	0 %	0 %	40 %	60 %	145597528
130	NC_009381	AATGA	2	10	240587	240596	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009381	GACAG	2	10	244101	244110	40 %	0 %	40 %	20 %	145597536
132	NC_009381	CGGGC	2	10	247399	247408	0 %	0 %	60 %	40 %	145597538
133	NC_009381	GCTGG	2	10	253607	253616	0 %	20 %	60 %	20 %	145597542
134	NC_009381	ACAGC	2	10	254513	254522	40 %	0 %	20 %	40 %	145597544
135	NC_009381	CTGCC	2	10	256435	256444	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
136	NC_009381	CTGAA	2	10	257672	257681	40 %	20 %	20 %	20 %	145597547
137	NC_009381	CTGCA	2	10	259229	259238	20 %	20 %	20 %	40 %	145597548
138	NC_009381	GGGGC	2	10	259301	259310	0 %	0 %	80 %	20 %	145597548
139	NC_009381	CAACC	2	10	259493	259502	40 %	0 %	0 %	60 %	145597548
140	NC_009381	TGCTC	2	10	260578	260587	0 %	40 %	20 %	40 %	145597550
141	NC_009381	GGGCT	2	10	260666	260675	0 %	20 %	60 %	20 %	145597550
142	NC_009381	GCTTG	2	10	262404	262413	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_009381	CCGTT	2	10	269050	269059	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NC_009381	CAGTA	2	10	270144	270153	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_009381	TTTAC	2	10	272182	272191	20 %	60 %	0 %	20 %	145597558
146	NC_009381	GTGAT	2	10	273200	273209	20 %	40 %	40 %	0 %	145597559
147	NC_009381	TGGGG	2	10	273437	273446	0 %	20 %	80 %	0 %	145597559
148	NC_009381	TGGGG	2	10	273664	273673	0 %	20 %	80 %	0 %	145597559
149	NC_009381	GCGGA	2	10	274084	274093	20 %	0 %	60 %	20 %	145597560
150	NC_009381	AGGAT	2	10	276303	276312	40 %	20 %	40 %	0 %	145597562
151	NC_009381	CAAGC	2	10	276345	276354	40 %	0 %	20 %	40 %	145597562
152	NC_009381	GCATT	2	10	283313	283322	20 %	40 %	20 %	20 %	145597570
153	NC_009381	TGGTG	2	10	285915	285924	0 %	40 %	60 %	0 %	145597573
154	NC_009381	TTAAC	2	10	288309	288318	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
155	NC_009381	CATCT	2	10	290057	290066	20 %	40 %	0 %	40 %	145597577
156	NC_009381	AGAAA	2	10	293868	293877	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
157	NC_009381	CAATT	2	10	294803	294812	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
158	NC_009381	ATCAA	2	10	295284	295293	60 %	20 %	0 %	20 %	145597581
159	NC_009381	ATGTG	2	10	298151	298160	20 %	40 %	40 %	0 %	145597584
160	NC_009381	AGTCC	2	10	298579	298588	20 %	20 %	20 %	40 %	145597585
161	NC_009381	GATAA	2	10	302244	302253	60 %	20 %	20 %	0 %	145597587
162	NC_009381	ATTTT	2	10	303069	303078	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_009381	GGTAT	2	10	303978	303987	20 %	40 %	40 %	0 %	145597588
164	NC_009381	CACAC	2	10	308346	308355	40 %	0 %	0 %	60 %	145597593
165	NC_009381	TGAGT	2	10	309242	309251	20 %	40 %	40 %	0 %	145597593
166	NC_009381	GGCTC	2	10	311178	311187	0 %	20 %	40 %	40 %	145597593
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170	NC_009381	GGTGT	2	10	319847	319856	0 %	40 %	60 %	0 %	145597597
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172	NC_009381	AGTGA	2	10	324379	324388	40 %	20 %	40 %	0 %	145597601
173	NC_009381	CAGAT	2	10	324499	324508	40 %	20 %	20 %	20 %	145597601
174	NC_009381	TGCCA	2	10	325954	325963	20 %	20 %	20 %	40 %	145597601
175	NC_009381	AGCCA	2	10	327219	327228	40 %	0 %	20 %	40 %	145597602
176	NC_009381	ATTTA	2	10	328332	328341	40 %	60 %	0 %	0 %	145597602
177	NC_009381	TATAA	2	10	333415	333424	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_009381	ATTCA	2	10	334698	334707	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
179	NC_009381	CTGAA	2	10	336780	336789	40 %	20 %	20 %	20 %	145597609
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181	NC_009381	CTTTA	2	10	337235	337244	20 %	60 %	0 %	20 %	145597609
182	NC_009381	GTGCT	2	10	339897	339906	0 %	40 %	40 %	20 %	145597612
183	NC_009381	TGATA	2	10	342883	342892	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
184	NC_009381	CTAAC	2	10	343879	343888	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
185	NC_009381	CATGG	2	10	344162	344171	20 %	20 %	40 %	20 %	145597617
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189	NC_009381	AATGA	2	10	345236	345245	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
190	NC_009381	ATATC	2	10	345321	345330	40 %	40 %	0 %	20 %	145597619
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197	NC_009381	CGTAA	2	10	357882	357891	40 %	20 %	20 %	20 %	145597633
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220	NC_009381	TTTGC	2	10	393699	393708	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
221	NC_009381	TTTGC	2	10	393812	393821	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
222	NC_009381	GGGTC	2	10	395041	395050	0 %	20 %	60 %	20 %	145597666
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241	NC_009381	CATGT	2	10	423184	423193	20 %	40 %	20 %	20 %	145597690
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243	NC_009381	ATTTT	2	10	429062	429071	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
244	NC_009381	TAATT	2	10	429186	429195	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
245	NC_009381	CGTAA	2	10	429487	429496	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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254	NC_009381	GCCCA	2	10	443688	443697	20 %	0 %	20 %	60 %	145597703
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256	NC_009381	CTCTG	2	10	447069	447078	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
257	NC_009381	ATCGT	2	10	448297	448306	20 %	40 %	20 %	20 %	145597705
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262	NC_009381	GATGA	2	10	459467	459476	40 %	20 %	40 %	0 %	145597713
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266	NC_009381	CCGCT	2	10	463224	463233	0 %	20 %	20 %	60 %	145597715
267	NC_009381	ACGCC	2	10	463695	463704	20 %	0 %	20 %	60 %	145597715
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