MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis Pestoides F chromosome

Total Repeats: 8976

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009381	CTTA	2	8	216	223	25 %	50 %	0 %	25 %	145597325
2	NC_009381	CAGC	2	8	308	315	25 %	0 %	25 %	50 %	145597325
3	NC_009381	TTGG	2	8	875	882	0 %	50 %	50 %	0 %	145597325
4	NC_009381	GATT	2	8	1083	1090	25 %	50 %	25 %	0 %	145597325
5	NC_009381	GCCC	2	8	1228	1235	0 %	0 %	25 %	75 %	145597325
6	NC_009381	AACC	2	8	1269	1276	50 %	0 %	0 %	50 %	145597325
7	NC_009381	GCCT	2	8	1280	1287	0 %	25 %	25 %	50 %	145597325
8	NC_009381	TGAC	2	8	2445	2452	25 %	25 %	25 %	25 %	145597326
9	NC_009381	GCCA	2	8	2483	2490	25 %	0 %	25 %	50 %	145597326
10	NC_009381	CTTG	2	8	2543	2550	0 %	50 %	25 %	25 %	145597327
11	NC_009381	CGCA	2	8	2621	2628	25 %	0 %	25 %	50 %	145597327
12	NC_009381	GCAG	2	8	2868	2875	25 %	0 %	50 %	25 %	145597327
13	NC_009381	GCGG	2	8	3577	3584	0 %	0 %	75 %	25 %	145597327
14	NC_009381	TCAA	2	8	4408	4415	50 %	25 %	0 %	25 %	145597328
15	NC_009381	GTTG	2	8	4872	4879	0 %	50 %	50 %	0 %	145597328
16	NC_009381	GCGG	2	8	5086	5093	0 %	0 %	75 %	25 %	145597328
17	NC_009381	CTGG	2	8	5527	5534	0 %	25 %	50 %	25 %	145597328
18	NC_009381	GATT	2	8	5691	5698	25 %	50 %	25 %	0 %	145597328
19	NC_009381	ATGG	2	8	6462	6469	25 %	25 %	50 %	0 %	145597329
20	NC_009381	GCGG	2	8	7013	7020	0 %	0 %	75 %	25 %	145597329
21	NC_009381	GCTG	2	8	7043	7050	0 %	25 %	50 %	25 %	145597329
22	NC_009381	AGCC	2	8	9833	9840	25 %	0 %	25 %	50 %	145597331
23	NC_009381	CTCA	2	8	10335	10342	25 %	25 %	0 %	50 %	145597332
24	NC_009381	TGGC	2	8	10493	10500	0 %	25 %	50 %	25 %	145597332
25	NC_009381	AGAT	2	8	10990	10997	50 %	25 %	25 %	0 %	145597332
26	NC_009381	TTGC	2	8	11606	11613	0 %	50 %	25 %	25 %	145597333
27	NC_009381	GCTG	2	8	11832	11839	0 %	25 %	50 %	25 %	145597334
28	NC_009381	GATG	2	8	11893	11900	25 %	25 %	50 %	0 %	145597334
29	NC_009381	GTCA	2	8	14664	14671	25 %	25 %	25 %	25 %	145597338
30	NC_009381	ATCG	2	8	14763	14770	25 %	25 %	25 %	25 %	145597338
31	NC_009381	GCCA	2	8	14948	14955	25 %	0 %	25 %	50 %	145597338
32	NC_009381	TGTT	2	8	15373	15380	0 %	75 %	25 %	0 %	145597338
33	NC_009381	CGGA	2	8	15446	15453	25 %	0 %	50 %	25 %	145597338
34	NC_009381	TATT	2	8	15973	15980	25 %	75 %	0 %	0 %	145597339
35	NC_009381	ATTC	2	8	16075	16082	25 %	50 %	0 %	25 %	145597339
36	NC_009381	CCCG	2	8	16396	16403	0 %	0 %	25 %	75 %	145597339
37	NC_009381	ATCA	2	8	16591	16598	50 %	25 %	0 %	25 %	145597339
38	NC_009381	AAAT	2	8	16795	16802	75 %	25 %	0 %	0 %	145597339
39	NC_009381	CATC	2	8	17181	17188	25 %	25 %	0 %	50 %	145597339
40	NC_009381	TGAC	2	8	18687	18694	25 %	25 %	25 %	25 %	145597340
41	NC_009381	CCGC	2	8	18800	18807	0 %	0 %	25 %	75 %	145597340
42	NC_009381	GCCA	2	8	22430	22437	25 %	0 %	25 %	50 %	145597342
43	NC_009381	AGCA	2	8	22967	22974	50 %	0 %	25 %	25 %	145597342
44	NC_009381	CCGC	2	8	23335	23342	0 %	0 %	25 %	75 %	145597343
45	NC_009381	CGCC	2	8	23632	23639	0 %	0 %	25 %	75 %	145597343
46	NC_009381	GCCC	2	8	24261	24268	0 %	0 %	25 %	75 %	145597344
47	NC_009381	CCCA	2	8	25670	25677	25 %	0 %	0 %	75 %	145597346
48	NC_009381	CCTG	2	8	25682	25689	0 %	25 %	25 %	50 %	145597346
49	NC_009381	CCGA	2	8	25744	25751	25 %	0 %	25 %	50 %	145597346
50	NC_009381	TACT	2	8	25986	25993	25 %	50 %	0 %	25 %	145597346
51	NC_009381	CTGC	2	8	26275	26282	0 %	25 %	25 %	50 %	145597346
52	NC_009381	GGCA	2	8	26868	26875	25 %	0 %	50 %	25 %	145597347
53	NC_009381	CGTC	2	8	26946	26953	0 %	25 %	25 %	50 %	145597347
54	NC_009381	ATCA	2	8	27144	27151	50 %	25 %	0 %	25 %	145597347
55	NC_009381	GACC	2	8	27480	27487	25 %	0 %	25 %	50 %	145597347
56	NC_009381	CGCC	2	8	27723	27730	0 %	0 %	25 %	75 %	145597347
57	NC_009381	TGAA	2	8	27764	27771	50 %	25 %	25 %	0 %	145597347
58	NC_009381	GCTG	2	8	29052	29059	0 %	25 %	50 %	25 %	145597348
59	NC_009381	ATCA	2	8	29309	29316	50 %	25 %	0 %	25 %	145597348
60	NC_009381	GGCT	2	8	30510	30517	0 %	25 %	50 %	25 %	145597349
61	NC_009381	GTTG	2	8	30845	30852	0 %	50 %	50 %	0 %	145597349
62	NC_009381	GGCT	2	8	30868	30875	0 %	25 %	50 %	25 %	145597349
63	NC_009381	ATTT	2	8	31161	31168	25 %	75 %	0 %	0 %	145597349
64	NC_009381	TAAG	2	8	32257	32264	50 %	25 %	25 %	0 %	145597349
65	NC_009381	GCCA	2	8	33026	33033	25 %	0 %	25 %	50 %	145597350
66	NC_009381	GAAA	2	8	34738	34745	75 %	0 %	25 %	0 %	145597352
67	NC_009381	AAGA	2	8	34853	34860	75 %	0 %	25 %	0 %	145597352
68	NC_009381	AATT	2	8	35282	35289	50 %	50 %	0 %	0 %	145597353
69	NC_009381	AGAT	2	8	35346	35353	50 %	25 %	25 %	0 %	145597353
70	NC_009381	ATAC	2	8	35407	35414	50 %	25 %	0 %	25 %	145597353
71	NC_009381	CCGT	2	8	36453	36460	0 %	25 %	25 %	50 %	145597354
72	NC_009381	CCCG	2	8	37181	37188	0 %	0 %	25 %	75 %	145597355
73	NC_009381	TCAT	2	8	37292	37299	25 %	50 %	0 %	25 %	145597355
74	NC_009381	ATTG	2	8	37365	37372	25 %	50 %	25 %	0 %	145597355
75	NC_009381	TCAT	2	8	37568	37575	25 %	50 %	0 %	25 %	145597355
76	NC_009381	CCAG	2	8	39212	39219	25 %	0 %	25 %	50 %	145597356
77	NC_009381	CGCC	2	8	40067	40074	0 %	0 %	25 %	75 %	145597357
78	NC_009381	GACC	2	8	40366	40373	25 %	0 %	25 %	50 %	145597357
79	NC_009381	GCCA	2	8	40746	40753	25 %	0 %	25 %	50 %	145597357
80	NC_009381	AAAG	2	8	41268	41275	75 %	0 %	25 %	0 %	145597358
81	NC_009381	ACCA	2	8	41694	41701	50 %	0 %	0 %	50 %	145597359
82	NC_009381	CTGA	2	8	42414	42421	25 %	25 %	25 %	25 %	145597359
83	NC_009381	TACC	2	8	42491	42498	25 %	25 %	0 %	50 %	145597359
84	NC_009381	GCTG	2	8	42946	42953	0 %	25 %	50 %	25 %	145597359
85	NC_009381	CCGG	2	8	43287	43294	0 %	0 %	50 %	50 %	145597359
86	NC_009381	GTTT	2	8	43555	43562	0 %	75 %	25 %	0 %	145597359
87	NC_009381	ATGT	2	8	44793	44800	25 %	50 %	25 %	0 %	145597360
88	NC_009381	ATGA	2	8	45371	45378	50 %	25 %	25 %	0 %	145597361
89	NC_009381	GCCA	2	8	46276	46283	25 %	0 %	25 %	50 %	145597362
90	NC_009381	GCAA	2	8	47366	47373	50 %	0 %	25 %	25 %	145597363
91	NC_009381	CAGG	2	8	47440	47447	25 %	0 %	50 %	25 %	145597363
92	NC_009381	GGTT	2	8	47903	47910	0 %	50 %	50 %	0 %	145597363
93	NC_009381	AACC	2	8	48942	48949	50 %	0 %	0 %	50 %	145597364
94	NC_009381	ATAA	2	8	49224	49231	75 %	25 %	0 %	0 %	145597364
95	NC_009381	GGGC	2	8	49677	49684	0 %	0 %	75 %	25 %	145597364
96	NC_009381	TGAT	2	8	49738	49745	25 %	50 %	25 %	0 %	145597364
97	NC_009381	GGAG	2	8	49757	49764	25 %	0 %	75 %	0 %	145597364
98	NC_009381	GTGG	2	8	49780	49787	0 %	25 %	75 %	0 %	145597364
99	NC_009381	GCCA	2	8	51706	51713	25 %	0 %	25 %	50 %	145597366
100	NC_009381	TTTC	2	8	52640	52647	0 %	75 %	0 %	25 %	145597367
101	NC_009381	TTTC	2	8	52874	52881	0 %	75 %	0 %	25 %	145597367
102	NC_009381	CTTG	2	8	53190	53197	0 %	50 %	25 %	25 %	145597367
103	NC_009381	AGGC	2	8	54455	54462	25 %	0 %	50 %	25 %	145597369
104	NC_009381	CAAT	2	8	54700	54707	50 %	25 %	0 %	25 %	145597369
105	NC_009381	AAAG	2	8	54881	54888	75 %	0 %	25 %	0 %	145597369
106	NC_009381	CTGG	2	8	55042	55049	0 %	25 %	50 %	25 %	145597369
107	NC_009381	CTGG	2	8	57225	57232	0 %	25 %	50 %	25 %	145597371
108	NC_009381	CGCT	2	8	57353	57360	0 %	25 %	25 %	50 %	145597371
109	NC_009381	AATA	2	8	57644	57651	75 %	25 %	0 %	0 %	145597371
110	NC_009381	GCCC	2	8	58313	58320	0 %	0 %	25 %	75 %	145597372
111	NC_009381	GCCA	2	8	58432	58439	25 %	0 %	25 %	50 %	145597372
112	NC_009381	AGTA	2	8	58917	58924	50 %	25 %	25 %	0 %	145597373
113	NC_009381	TGAG	2	8	59759	59766	25 %	25 %	50 %	0 %	145597374
114	NC_009381	TCTG	2	8	60005	60012	0 %	50 %	25 %	25 %	145597374
115	NC_009381	TCTG	2	8	60200	60207	0 %	50 %	25 %	25 %	145597374
116	NC_009381	CTGC	2	8	60933	60940	0 %	25 %	25 %	50 %	145597374
117	NC_009381	GCCA	2	8	60983	60990	25 %	0 %	25 %	50 %	145597374
118	NC_009381	AAAC	2	8	61318	61325	75 %	0 %	0 %	25 %	145597374
119	NC_009381	TGGC	2	8	61490	61497	0 %	25 %	50 %	25 %	145597374
120	NC_009381	CCAG	2	8	61505	61512	25 %	0 %	25 %	50 %	145597374
121	NC_009381	AATA	2	8	61897	61904	75 %	25 %	0 %	0 %	145597374
122	NC_009381	TTAA	2	8	62126	62133	50 %	50 %	0 %	0 %	145597374
123	NC_009381	TGGA	2	8	62223	62230	25 %	25 %	50 %	0 %	145597374
124	NC_009381	TAAT	2	8	62794	62801	50 %	50 %	0 %	0 %	145597375
125	NC_009381	CAAG	2	8	63119	63126	50 %	0 %	25 %	25 %	145597375
126	NC_009381	ACCC	2	8	63495	63502	25 %	0 %	0 %	75 %	145597375
127	NC_009381	AACA	2	8	63720	63727	75 %	0 %	0 %	25 %	145597375
128	NC_009381	AAAT	2	8	63896	63903	75 %	25 %	0 %	0 %	145597375
129	NC_009381	GTTG	2	8	63937	63944	0 %	50 %	50 %	0 %	145597375
130	NC_009381	TGAT	2	8	63973	63980	25 %	50 %	25 %	0 %	145597375
131	NC_009381	TCAG	2	8	64717	64724	25 %	25 %	25 %	25 %	145597375
132	NC_009381	GTTA	2	8	65741	65748	25 %	50 %	25 %	0 %	145597376
133	NC_009381	TTGG	2	8	66905	66912	0 %	50 %	50 %	0 %	145597376
134	NC_009381	TAAT	2	8	67392	67399	50 %	50 %	0 %	0 %	145597377
135	NC_009381	GCCA	2	8	67600	67607	25 %	0 %	25 %	50 %	145597377
136	NC_009381	AGCC	2	8	69101	69108	25 %	0 %	25 %	50 %	145597379
137	NC_009381	CTGG	2	8	69395	69402	0 %	25 %	50 %	25 %	145597379
138	NC_009381	GCTG	2	8	70369	70376	0 %	25 %	50 %	25 %	145597381
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