MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis Pestoides F chromosome

Total Repeats: 49673

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009381	CCG	2	6	29	34	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597325
2	NC_009381	GCA	2	6	51	56	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597325
3	NC_009381	TTG	2	6	440	445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597325
4	NC_009381	GCC	2	6	475	480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597325
5	NC_009381	GGT	2	6	502	507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597325
6	NC_009381	AAT	2	6	664	669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597325
7	NC_009381	TAT	2	6	691	696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597325
8	NC_009381	TTA	2	6	712	717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597325
9	NC_009381	GAT	2	6	721	726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597325
10	NC_009381	AAG	2	6	758	763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597325
11	NC_009381	CAG	2	6	802	807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597325
12	NC_009381	CCA	2	6	904	909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597325
13	NC_009381	GAA	2	6	939	944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597325
14	NC_009381	TTG	2	6	1114	1119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597325
15	NC_009381	ATA	2	6	1148	1153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597325
16	NC_009381	TGG	2	6	1305	1310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597325
17	NC_009381	AGA	2	6	1383	1388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597325
18	NC_009381	TCC	2	6	1414	1419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145597325
19	NC_009381	TTG	2	6	1523	1528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597326
20	NC_009381	TGG	2	6	1584	1589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597326
21	NC_009381	TTA	2	6	1882	1887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597326
22	NC_009381	TGG	2	6	2050	2055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597326
23	NC_009381	TAA	2	6	2086	2091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597326
24	NC_009381	CGC	2	6	2159	2164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597326
25	NC_009381	GAA	2	6	2173	2178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597326
26	NC_009381	GTG	2	6	2262	2267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597326
27	NC_009381	TAA	2	6	2308	2313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597326
28	NC_009381	GAA	2	6	2324	2329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597326
29	NC_009381	AGA	2	6	2332	2337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597326
30	NC_009381	GTC	2	6	2504	2509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597326
31	NC_009381	GTA	2	6	2524	2529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597326
32	NC_009381	CGA	2	6	2638	2643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597327
33	NC_009381	GGC	2	6	2762	2767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597327
34	NC_009381	TTA	2	6	3069	3074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597327
35	NC_009381	AGC	2	6	3175	3180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597327
36	NC_009381	CGC	2	6	3185	3190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597327
37	NC_009381	ATC	2	6	3240	3245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597327
38	NC_009381	GCG	2	6	3297	3302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597327
39	NC_009381	GTT	2	6	3395	3400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597327
40	NC_009381	CCG	2	6	3439	3444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597327
41	NC_009381	AGA	2	6	3494	3499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597327
42	NC_009381	GCC	2	6	3631	3636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597327
43	NC_009381	CTC	2	6	3822	3827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145597328
44	NC_009381	TGA	2	6	3894	3899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597328
45	NC_009381	CAC	2	6	3913	3918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597328
46	NC_009381	GAT	2	6	4021	4026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597328
47	NC_009381	GCA	2	6	4072	4077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597328
48	NC_009381	TCA	2	6	4082	4087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597328
49	NC_009381	CGG	2	6	4140	4145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597328
50	NC_009381	GTT	2	6	4168	4173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597328
51	NC_009381	GTG	2	6	4270	4275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597328
52	NC_009381	ACT	2	6	4297	4302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597328
53	NC_009381	AGA	2	6	4440	4445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597328
54	NC_009381	GGT	2	6	4462	4467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597328
55	NC_009381	TTG	2	6	4478	4483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597328
56	NC_009381	CCA	2	6	4535	4540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597328
57	NC_009381	TGG	2	6	4635	4640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597328
58	NC_009381	AAG	2	6	4700	4705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597328
59	NC_009381	TGA	2	6	4740	4745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597328
60	NC_009381	TGT	2	6	4767	4772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597328
61	NC_009381	TCT	2	6	4828	4833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597328
62	NC_009381	CGG	2	6	4844	4849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597328
63	NC_009381	TGA	2	6	4859	4864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597328
64	NC_009381	TTG	2	6	4885	4890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597328
65	NC_009381	GTT	3	9	5328	5336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597328
66	NC_009381	CTT	2	6	5340	5345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597328
67	NC_009381	ATT	2	6	5365	5370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597328
68	NC_009381	GAA	2	6	5415	5420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597328
69	NC_009381	GAT	3	9	5446	5454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597328
70	NC_009381	AGA	2	6	5576	5581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597328
71	NC_009381	AAG	2	6	5651	5656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597328
72	NC_009381	TGG	2	6	5702	5707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597328
73	NC_009381	GCA	2	6	5735	5740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597328
74	NC_009381	GTG	2	6	5752	5757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597328
75	NC_009381	TGG	2	6	5853	5858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597328
76	NC_009381	CGT	2	6	5938	5943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597328
77	NC_009381	CGT	2	6	6082	6087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597328
78	NC_009381	TGC	2	6	6089	6094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597328
79	NC_009381	CGC	2	6	6117	6122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597328
80	NC_009381	ACT	2	6	6136	6141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597328
81	NC_009381	TCG	2	6	6165	6170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597328
82	NC_009381	TGC	3	9	6521	6529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597329
83	NC_009381	ATT	2	6	6625	6630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597329
84	NC_009381	AAC	2	6	6639	6644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597329
85	NC_009381	GGC	2	6	6662	6667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597329
86	NC_009381	CAA	2	6	6788	6793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597329
87	NC_009381	TGA	3	9	6895	6903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597329
88	NC_009381	TGA	2	6	6905	6910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597329
89	NC_009381	ATG	2	6	6939	6944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597329
90	NC_009381	TAT	2	6	6971	6976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597329
91	NC_009381	ATT	2	6	7244	7249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597329
92	NC_009381	TAA	2	6	7714	7719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597330
93	NC_009381	CTT	2	6	7767	7772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597330
94	NC_009381	GAA	2	6	7803	7808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597330
95	NC_009381	CTT	2	6	7940	7945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597330
96	NC_009381	TGC	2	6	7998	8003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597330
97	NC_009381	AAT	2	6	8025	8030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597330
98	NC_009381	ATT	2	6	8034	8039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597330
99	NC_009381	CCA	2	6	8170	8175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597330
100	NC_009381	CCG	2	6	8202	8207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597330
101	NC_009381	TCA	2	6	8234	8239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597330
102	NC_009381	CTT	2	6	8273	8278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597330
103	NC_009381	GTC	2	6	8324	8329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597330
104	NC_009381	TCA	2	6	8368	8373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597330
105	NC_009381	ATA	2	6	8400	8405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597330
106	NC_009381	TGA	2	6	9350	9355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597331
107	NC_009381	CCA	2	6	9420	9425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597331
108	NC_009381	CGG	2	6	9453	9458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597331
109	NC_009381	CCG	2	6	9492	9497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597331
110	NC_009381	GTG	3	9	9554	9562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597331
111	NC_009381	GTG	2	6	9605	9610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597331
112	NC_009381	CTC	2	6	9649	9654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145597331
113	NC_009381	GGC	2	6	9690	9695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597331
114	NC_009381	TCA	2	6	9699	9704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597331
115	NC_009381	CAT	2	6	9889	9894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597331
116	NC_009381	GGC	2	6	10040	10045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597331
117	NC_009381	AAT	2	6	10091	10096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597331
118	NC_009381	ACC	2	6	10204	10209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597332
119	NC_009381	CGG	2	6	10268	10273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597332
120	NC_009381	ATC	2	6	10282	10287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597332
121	NC_009381	ACC	2	6	10404	10409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597332
122	NC_009381	CCT	2	6	10445	10450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145597332
123	NC_009381	TGG	2	6	10484	10489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597332
124	NC_009381	CCA	4	12	10567	10578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597332
125	NC_009381	CAA	2	6	10583	10588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597332
126	NC_009381	GCT	2	6	10607	10612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597332
127	NC_009381	TTG	2	6	10692	10697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597332
128	NC_009381	GCG	2	6	10702	10707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597332
129	NC_009381	CGG	2	6	10712	10717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597332
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131	NC_009381	TGC	2	6	10969	10974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597332
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