MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Pestoides F plasmid MT

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009378	CTAC	3	12	2009	2020	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009378	CCAA	2	8	2710	2717	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009378	ACTT	2	8	5867	5874	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009378	AAAG	2	8	5889	5896	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009378	TTAC	2	8	23171	23178	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_009378	TAGG	2	8	26605	26612	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009378	TACT	4	16	32145	32160	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009378	ATTT	2	8	35181	35188	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009378	ATAA	3	12	35334	35345	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009378	TATT	2	8	37130	37137	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009378	AAAG	2	8	37674	37681	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009378	GGTG	2	8	38323	38330	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009378	ACCT	2	8	44147	44154	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009378	TAAG	2	8	48834	48841	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009378	TCGT	2	8	50377	50384	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009378	TGTT	2	8	51097	51104	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009378	GCGT	2	8	51161	51168	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009378	GTTT	2	8	51576	51583	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009378	ACCA	2	8	51801	51808	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009378	AATG	2	8	53125	53132	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009378	TGAA	2	8	53390	53397	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009378	TGGT	2	8	53545	53552	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009378	TTAT	2	8	54621	54628	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009378	AGTA	2	8	56653	56660	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009378	CGAG	2	8	60158	60165	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009378	TACT	2	8	60182	60189	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_009378	GAAA	2	8	60680	60687	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009378	GAAG	2	8	60706	60713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009378	TCGT	2	8	67176	67183	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009378	AGTA	2	8	67218	67225	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009378	TAGG	2	8	69712	69719	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009378	GAAA	2	8	70112	70119	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009378	CACT	2	8	71692	71699	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009378	GAAA	2	8	71964	71971	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009378	AGGG	2	8	71981	71988	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009378	TTTA	2	8	76479	76486	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009378	CTTG	2	8	76523	76530	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009378	AGCC	2	8	77716	77723	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009378	GCTG	2	8	77798	77805	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_009378	AACC	2	8	77834	77841	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009378	TAAG	2	8	78074	78081	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009378	CCTG	2	8	78465	78472	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_009378	TACT	2	8	80768	80775	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009378	TAAG	2	8	81669	81676	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009378	CCTT	2	8	89706	89713	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009378	TGAG	2	8	89932	89939	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009378	ACAG	2	8	97797	97804	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_009378	GTAC	2	8	98235	98242	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009378	CAGG	2	8	98318	98325	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_009378	GTCA	2	8	112194	112201	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_009378	CTCA	2	8	114479	114486	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009378	TTGG	2	8	114612	114619	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009378	TCCT	2	8	115808	115815	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009378	TCAT	2	8	116026	116033	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_009378	GCCC	2	8	116085	116092	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
56	NC_009378	GATA	2	8	118977	118984	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009378	GCAA	2	8	119078	119085	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009378	CAGG	2	8	119129	119136	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_009378	GCTG	2	8	119190	119197	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_009378	CATA	2	8	122687	122694	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009378	CCTG	2	8	125256	125263	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_009378	ATCT	2	8	126051	126058	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_009378	TTTG	2	8	128307	128314	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009378	AATG	2	8	130030	130037	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009378	CCAG	2	8	130757	130764	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_009378	TCGC	2	8	133295	133302	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009378	CTGC	2	8	134007	134014	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.