MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis Pestoides F plasmid CD

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009377	AATCTT	2	12	8011	8022	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	145597110
2	NC_009377	CATTCA	2	12	10746	10757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597114
3	NC_009377	GCTCCT	2	12	13936	13947	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	145597118
4	NC_009377	TCAATT	2	12	14535	14546	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	145597120
5	NC_009377	GCAAAA	2	12	17661	17672	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	145597125
6	NC_009377	AGTAAC	2	12	23028	23039	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	145597132
7	NC_009377	ACGTTA	2	12	23321	23332	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	145597133
8	NC_009377	AGTTCT	2	12	29775	29786	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	145597140
9	NC_009377	GTTCTT	2	12	30903	30914	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	145597141
10	NC_009377	TCATCT	2	12	30938	30949	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	145597141
11	NC_009377	ATCTTG	2	12	36241	36252	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	145597148
12	NC_009377	GTTTAA	2	12	40580	40591	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	145597153
13	NC_009377	AAATGT	2	12	48468	48479	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	145597163
14	NC_009377	TGGAAA	2	12	52156	52167	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	145597167
15	NC_009377	GACATC	2	12	54176	54187	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	145597171
16	NC_009377	ATAGAT	2	12	57614	57625	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	145597175
17	NC_009377	CAATTG	2	12	69142	69153	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	145597187
18	NC_009377	TTTCCA	2	12	70221	70232	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	145597189
19	NC_009377	TGGAAA	2	12	71371	71382	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	145597191

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.