MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis Pestoides F plasmid CD

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009377	GGCGA	2	10	1592	1601	20 %	0 %	60 %	20 %	145597106
2	NC_009377	TGCGC	2	10	2099	2108	0 %	20 %	40 %	40 %	145597107
3	NC_009377	AGCCA	2	10	5530	5539	40 %	0 %	20 %	40 %	145597109
4	NC_009377	CATGG	2	10	5792	5801	20 %	20 %	40 %	20 %	145597109
5	NC_009377	ATCCA	2	10	6303	6312	40 %	20 %	0 %	40 %	145597109
6	NC_009377	TTTGA	2	10	12534	12543	20 %	60 %	20 %	0 %	145597117
7	NC_009377	GCGCT	2	10	13172	13181	0 %	20 %	40 %	40 %	145597117
8	NC_009377	ACCTT	2	10	13572	13581	20 %	40 %	0 %	40 %	145597118
9	NC_009377	CGAAC	2	10	13921	13930	40 %	0 %	20 %	40 %	145597118
10	NC_009377	CATTC	2	10	19218	19227	20 %	40 %	0 %	40 %	145597128
11	NC_009377	GCAAT	2	10	19459	19468	40 %	20 %	20 %	20 %	145597128
12	NC_009377	ATTCA	2	10	20193	20202	40 %	40 %	0 %	20 %	145597131
13	NC_009377	ACTTT	2	10	20428	20437	20 %	60 %	0 %	20 %	145597131
14	NC_009377	GGAAT	2	10	20636	20645	40 %	20 %	40 %	0 %	145597131
15	NC_009377	CCGTA	2	10	21587	21596	20 %	20 %	20 %	40 %	145597132
16	NC_009377	GAGAC	2	10	22748	22757	40 %	0 %	40 %	20 %	145597132
17	NC_009377	ACCAA	2	10	22804	22813	60 %	0 %	0 %	40 %	145597132
18	NC_009377	GCTTG	2	10	23939	23948	0 %	40 %	40 %	20 %	145597134
19	NC_009377	GCTCT	2	10	26690	26699	0 %	40 %	20 %	40 %	145597135
20	NC_009377	AACAA	2	10	27592	27601	80 %	0 %	0 %	20 %	145597136
21	NC_009377	GTGAA	2	10	27901	27910	40 %	20 %	40 %	0 %	145597137
22	NC_009377	GATGC	2	10	35481	35490	20 %	20 %	40 %	20 %	145597148
23	NC_009377	GATGG	2	10	35754	35763	20 %	20 %	60 %	0 %	145597148
24	NC_009377	CCTGC	2	10	35775	35784	0 %	20 %	20 %	60 %	145597148
25	NC_009377	ACTCT	2	10	39009	39018	20 %	40 %	0 %	40 %	145597152
26	NC_009377	CGCGG	2	10	39617	39626	0 %	0 %	60 %	40 %	145597153
27	NC_009377	GCATC	2	10	39861	39870	20 %	20 %	20 %	40 %	145597153
28	NC_009377	CAAGC	2	10	48510	48519	40 %	0 %	20 %	40 %	145597163
29	NC_009377	ATTGG	2	10	51503	51512	20 %	40 %	40 %	0 %	145597166
30	NC_009377	CCAAA	2	10	54112	54121	60 %	0 %	0 %	40 %	145597171
31	NC_009377	GGCTG	2	10	55588	55597	0 %	20 %	60 %	20 %	145597172
32	NC_009377	AAGGT	2	10	60523	60532	40 %	20 %	40 %	0 %	145597179
33	NC_009377	GATGA	2	10	67008	67017	40 %	20 %	40 %	0 %	145597185

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.