MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis Pestoides F plasmid CD

Total Repeats: 143

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009377	GGAT	2	8	783	790	25 %	25 %	50 %	0 %	145597104
2	NC_009377	ACTG	2	8	1010	1017	25 %	25 %	25 %	25 %	145597104
3	NC_009377	TTCA	2	8	1303	1310	25 %	50 %	0 %	25 %	145597105
4	NC_009377	CAGA	2	8	1363	1370	50 %	0 %	25 %	25 %	145597105
5	NC_009377	TGGC	2	8	1496	1503	0 %	25 %	50 %	25 %	145597106
6	NC_009377	TACC	2	8	2132	2139	25 %	25 %	0 %	50 %	145597107
7	NC_009377	GATG	2	8	2309	2316	25 %	25 %	50 %	0 %	145597107
8	NC_009377	GATG	2	8	5842	5849	25 %	25 %	50 %	0 %	145597109
9	NC_009377	ATCG	2	8	6811	6818	25 %	25 %	25 %	25 %	145597109
10	NC_009377	AAAT	2	8	7817	7824	75 %	25 %	0 %	0 %	145597110
11	NC_009377	GGAT	2	8	7917	7924	25 %	25 %	50 %	0 %	145597110
12	NC_009377	AATA	2	8	7993	8000	75 %	25 %	0 %	0 %	145597110
13	NC_009377	TCTG	2	8	9542	9549	0 %	50 %	25 %	25 %	145597112
14	NC_009377	GACC	2	8	9627	9634	25 %	0 %	25 %	50 %	145597112
15	NC_009377	CGTG	2	8	9761	9768	0 %	25 %	50 %	25 %	145597112
16	NC_009377	TCCG	2	8	9850	9857	0 %	25 %	25 %	50 %	145597112
17	NC_009377	CAGC	2	8	10016	10023	25 %	0 %	25 %	50 %	145597113
18	NC_009377	TTAC	2	8	10994	11001	25 %	50 %	0 %	25 %	145597114
19	NC_009377	ATGA	2	8	11601	11608	50 %	25 %	25 %	0 %	145597114
20	NC_009377	ATAA	2	8	12085	12092	75 %	25 %	0 %	0 %	145597115
21	NC_009377	TCCA	2	8	12289	12296	25 %	25 %	0 %	50 %	145597116
22	NC_009377	TCTG	2	8	12509	12516	0 %	50 %	25 %	25 %	145597117
23	NC_009377	CTGA	2	8	12708	12715	25 %	25 %	25 %	25 %	145597117
24	NC_009377	TGAG	2	8	12959	12966	25 %	25 %	50 %	0 %	145597117
25	NC_009377	CAGC	2	8	13454	13461	25 %	0 %	25 %	50 %	145597118
26	NC_009377	GAAT	2	8	13966	13973	50 %	25 %	25 %	0 %	145597118
27	NC_009377	GCGA	2	8	14021	14028	25 %	0 %	50 %	25 %	145597118
28	NC_009377	CGTT	2	8	14345	14352	0 %	50 %	25 %	25 %	145597119
29	NC_009377	GACA	2	8	15170	15177	50 %	0 %	25 %	25 %	145597121
30	NC_009377	ACCT	2	8	16461	16468	25 %	25 %	0 %	50 %	145597123
31	NC_009377	CCTG	2	8	16579	16586	0 %	25 %	25 %	50 %	145597123
32	NC_009377	AGCG	2	8	16962	16969	25 %	0 %	50 %	25 %	145597123
33	NC_009377	AGCC	2	8	17168	17175	25 %	0 %	25 %	50 %	145597124
34	NC_009377	AGTG	2	8	17227	17234	25 %	25 %	50 %	0 %	145597124
35	NC_009377	TCAC	2	8	17714	17721	25 %	25 %	0 %	50 %	145597125
36	NC_009377	CTTC	2	8	18255	18262	0 %	50 %	0 %	50 %	145597125
37	NC_009377	CAGC	2	8	18489	18496	25 %	0 %	25 %	50 %	145597126
38	NC_009377	TTTA	2	8	18784	18791	25 %	75 %	0 %	0 %	145597127
39	NC_009377	ATAA	2	8	18801	18808	75 %	25 %	0 %	0 %	145597127
40	NC_009377	ATTT	2	8	19352	19359	25 %	75 %	0 %	0 %	145597128
41	NC_009377	TTTG	2	8	19714	19721	0 %	75 %	25 %	0 %	145597129
42	NC_009377	ATTT	2	8	19808	19815	25 %	75 %	0 %	0 %	145597129
43	NC_009377	TTAG	2	8	19931	19938	25 %	50 %	25 %	0 %	145597130
44	NC_009377	AAAG	2	8	20875	20882	75 %	0 %	25 %	0 %	145597131
45	NC_009377	AGAA	2	8	21153	21160	75 %	0 %	25 %	0 %	145597131
46	NC_009377	ATCA	2	8	21959	21966	50 %	25 %	0 %	25 %	145597132
47	NC_009377	ATCA	2	8	22076	22083	50 %	25 %	0 %	25 %	145597132
48	NC_009377	TCGC	2	8	22500	22507	0 %	25 %	25 %	50 %	145597132
49	NC_009377	GCCA	2	8	22666	22673	25 %	0 %	25 %	50 %	145597132
50	NC_009377	TATT	2	8	23169	23176	25 %	75 %	0 %	0 %	145597133
51	NC_009377	GACT	2	8	23990	23997	25 %	25 %	25 %	25 %	145597134
52	NC_009377	TCGC	2	8	24076	24083	0 %	25 %	25 %	50 %	145597134
53	NC_009377	GCAA	2	8	24287	24294	50 %	0 %	25 %	25 %	145597134
54	NC_009377	GCTT	2	8	26170	26177	0 %	50 %	25 %	25 %	145597135
55	NC_009377	GATT	2	8	26512	26519	25 %	50 %	25 %	0 %	145597135
56	NC_009377	GGGT	2	8	26851	26858	0 %	25 %	75 %	0 %	145597135
57	NC_009377	CAAT	2	8	27417	27424	50 %	25 %	0 %	25 %	145597136
58	NC_009377	GGTT	2	8	27488	27495	0 %	50 %	50 %	0 %	145597136
59	NC_009377	ACTC	2	8	28134	28141	25 %	25 %	0 %	50 %	145597138
60	NC_009377	AGTG	2	8	28740	28747	25 %	25 %	50 %	0 %	145597139
61	NC_009377	ATTT	2	8	28868	28875	25 %	75 %	0 %	0 %	145597139
62	NC_009377	TTCC	2	8	30621	30628	0 %	50 %	0 %	50 %	145597140
63	NC_009377	CTGC	2	8	31245	31252	0 %	25 %	25 %	50 %	145597141
64	NC_009377	AAGC	2	8	31253	31260	50 %	0 %	25 %	25 %	145597141
65	NC_009377	AAGC	2	8	32108	32115	50 %	0 %	25 %	25 %	145597142
66	NC_009377	AAAG	2	8	32206	32213	75 %	0 %	25 %	0 %	145597142
67	NC_009377	CACC	2	8	32348	32355	25 %	0 %	0 %	75 %	145597142
68	NC_009377	GTAA	2	8	32498	32505	50 %	25 %	25 %	0 %	145597142
69	NC_009377	TGAG	2	8	33153	33160	25 %	25 %	50 %	0 %	145597143
70	NC_009377	TACC	2	8	33445	33452	25 %	25 %	0 %	50 %	145597143
71	NC_009377	GTGA	2	8	33656	33663	25 %	25 %	50 %	0 %	145597143
72	NC_009377	CGAT	2	8	33934	33941	25 %	25 %	25 %	25 %	145597144
73	NC_009377	TGAG	2	8	33970	33977	25 %	25 %	50 %	0 %	145597144
74	NC_009377	AAGC	2	8	34496	34503	50 %	0 %	25 %	25 %	145597146
75	NC_009377	AGTC	2	8	34608	34615	25 %	25 %	25 %	25 %	145597146
76	NC_009377	GGTT	2	8	34754	34761	0 %	50 %	50 %	0 %	145597147
77	NC_009377	AAAG	2	8	35577	35584	75 %	0 %	25 %	0 %	145597148
78	NC_009377	TGAT	2	8	36157	36164	25 %	50 %	25 %	0 %	145597148
79	NC_009377	CGTG	2	8	36371	36378	0 %	25 %	50 %	25 %	145597148
80	NC_009377	AATT	2	8	36628	36635	50 %	50 %	0 %	0 %	145597148
81	NC_009377	GCTC	2	8	37462	37469	0 %	25 %	25 %	50 %	145597149
82	NC_009377	CAAC	2	8	38191	38198	50 %	0 %	0 %	50 %	145597151
83	NC_009377	TTCA	2	8	38840	38847	25 %	50 %	0 %	25 %	145597151
84	NC_009377	TCCT	2	8	38944	38951	0 %	50 %	0 %	50 %	145597152
85	NC_009377	GCCC	2	8	39454	39461	0 %	0 %	25 %	75 %	145597153
86	NC_009377	GCCA	2	8	39557	39564	25 %	0 %	25 %	50 %	145597153
87	NC_009377	GCTT	2	8	39676	39683	0 %	50 %	25 %	25 %	145597153
88	NC_009377	CAAG	2	8	39841	39848	50 %	0 %	25 %	25 %	145597153
89	NC_009377	TGGC	2	8	39880	39887	0 %	25 %	50 %	25 %	145597153
90	NC_009377	AAGC	2	8	40379	40386	50 %	0 %	25 %	25 %	145597153
91	NC_009377	AATA	2	8	40609	40616	75 %	25 %	0 %	0 %	145597154
92	NC_009377	AGAC	2	8	40620	40627	50 %	0 %	25 %	25 %	145597154
93	NC_009377	AGAA	2	8	41367	41374	75 %	0 %	25 %	0 %	145597154
94	NC_009377	TTGA	2	8	41462	41469	25 %	50 %	25 %	0 %	145597154
95	NC_009377	TGGC	2	8	42667	42674	0 %	25 %	50 %	25 %	145597155
96	NC_009377	AAAT	2	8	45882	45889	75 %	25 %	0 %	0 %	145597160
97	NC_009377	CATT	2	8	45949	45956	25 %	50 %	0 %	25 %	145597160
98	NC_009377	CAAA	2	8	48362	48369	75 %	0 %	0 %	25 %	145597163
99	NC_009377	GTTG	2	8	48375	48382	0 %	50 %	50 %	0 %	145597163
100	NC_009377	CGCC	2	8	49038	49045	0 %	0 %	25 %	75 %	145597164
101	NC_009377	GTCG	2	8	50856	50863	0 %	25 %	50 %	25 %	145597165
102	NC_009377	GGTG	2	8	50894	50901	0 %	25 %	75 %	0 %	145597165
103	NC_009377	CCGG	2	8	51754	51761	0 %	0 %	50 %	50 %	145597166
104	NC_009377	GCAG	2	8	52181	52188	25 %	0 %	50 %	25 %	145597167
105	NC_009377	GCTG	2	8	52428	52435	0 %	25 %	50 %	25 %	145597168
106	NC_009377	TCCA	2	8	54063	54070	25 %	25 %	0 %	50 %	145597171
107	NC_009377	ATGG	2	8	54203	54210	25 %	25 %	50 %	0 %	145597171
108	NC_009377	TTGA	2	8	54234	54241	25 %	50 %	25 %	0 %	145597171
109	NC_009377	AGTC	2	8	54502	54509	25 %	25 %	25 %	25 %	145597171
110	NC_009377	AGTC	2	8	54744	54751	25 %	25 %	25 %	25 %	145597171
111	NC_009377	TGGA	2	8	54756	54763	25 %	25 %	50 %	0 %	145597171
112	NC_009377	TGAC	2	8	54817	54824	25 %	25 %	25 %	25 %	145597171
113	NC_009377	AATT	2	8	55018	55025	50 %	50 %	0 %	0 %	145597172
114	NC_009377	GCTT	2	8	55090	55097	0 %	50 %	25 %	25 %	145597172
115	NC_009377	GGAA	2	8	55145	55152	50 %	0 %	50 %	0 %	145597172
116	NC_009377	TGGT	2	8	55398	55405	0 %	50 %	50 %	0 %	145597172
117	NC_009377	TTTC	2	8	55857	55864	0 %	75 %	0 %	25 %	145597172
118	NC_009377	ATCT	2	8	56478	56485	25 %	50 %	0 %	25 %	145597173
119	NC_009377	ATCC	2	8	56540	56547	25 %	25 %	0 %	50 %	145597173
120	NC_009377	GGCT	2	8	58280	58287	0 %	25 %	50 %	25 %	145597176
121	NC_009377	AAAT	2	8	58430	58437	75 %	25 %	0 %	0 %	145597176
122	NC_009377	CTTA	2	8	58830	58837	25 %	50 %	0 %	25 %	145597177
123	NC_009377	GCGG	2	8	59192	59199	0 %	0 %	75 %	25 %	145597178
124	NC_009377	TGAC	2	8	59245	59252	25 %	25 %	25 %	25 %	145597178
125	NC_009377	GAAC	2	8	59937	59944	50 %	0 %	25 %	25 %	145597179
126	NC_009377	GCCA	2	8	59975	59982	25 %	0 %	25 %	50 %	145597179
127	NC_009377	CTGG	2	8	60922	60929	0 %	25 %	50 %	25 %	145597179
128	NC_009377	ATCG	2	8	61256	61263	25 %	25 %	25 %	25 %	145597180
129	NC_009377	TCTG	2	8	62659	62666	0 %	50 %	25 %	25 %	145597182
130	NC_009377	GACC	2	8	62744	62751	25 %	0 %	25 %	50 %	145597182
131	NC_009377	CGTG	2	8	62878	62885	0 %	25 %	50 %	25 %	145597182
132	NC_009377	AGCC	2	8	62980	62987	25 %	0 %	25 %	50 %	145597182
133	NC_009377	TGGA	2	8	64797	64804	25 %	25 %	50 %	0 %	145597184
134	NC_009377	CCCT	2	8	64929	64936	0 %	25 %	0 %	75 %	145597184
135	NC_009377	GACA	2	8	66821	66828	50 %	0 %	25 %	25 %	145597185
136	NC_009377	GGCT	2	8	67102	67109	0 %	25 %	50 %	25 %	145597185
137	NC_009377	ACGT	2	8	67547	67554	25 %	25 %	25 %	25 %	145597185
138	NC_009377	TAAG	2	8	68950	68957	50 %	25 %	25 %	0 %	145597187
139	NC_009377	AAAG	2	8	69275	69282	75 %	0 %	25 %	0 %	145597187
140	NC_009377	GTAA	2	8	69510	69517	50 %	25 %	25 %	0 %	145597187
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143	NC_009377	GCAG	2	8	71396	71403	25 %	0 %	50 %	25 %	145597191

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.